MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 36584

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014251	TCA	2	6	199279	199284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501705
3502	NC_014251	ATA	2	6	199356	199361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501705
3503	NC_014251	AAAT	2	8	199375	199382	75 %	25 %	0 %	0 %	298501705
3504	NC_014251	ATGA	2	8	199389	199396	50 %	25 %	25 %	0 %	298501705
3505	NC_014251	ACC	2	6	199407	199412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501705
3506	NC_014251	CTT	2	6	199426	199431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501705
3507	NC_014251	A	6	6	199432	199437	100 %	0 %	0 %	0 %	298501705
3508	NC_014251	TAA	2	6	199446	199451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501705
3509	NC_014251	T	6	6	199459	199464	0 %	100 %	0 %	0 %	298501705
3510	NC_014251	T	6	6	199523	199528	0 %	100 %	0 %	0 %	298501706
3511	NC_014251	TTC	2	6	199595	199600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501706
3512	NC_014251	CT	3	6	199610	199615	0 %	50 %	0 %	50 %	298501706
3513	NC_014251	TTC	2	6	199685	199690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501706
3514	NC_014251	GTA	2	6	199763	199768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501706
3515	NC_014251	ATC	2	6	199832	199837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501706
3516	NC_014251	AGT	2	6	199865	199870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501706
3517	NC_014251	TGAT	2	8	199917	199924	25 %	50 %	25 %	0 %	298501706
3518	NC_014251	CAT	2	6	199958	199963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501706
3519	NC_014251	TGC	2	6	200066	200071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501706
3520	NC_014251	TC	4	8	200119	200126	0 %	50 %	0 %	50 %	298501706
3521	NC_014251	AATGG	2	10	200205	200214	40 %	20 %	40 %	0 %	298501707
3522	NC_014251	CAA	3	9	200240	200248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501707
3523	NC_014251	TCAT	2	8	200265	200272	25 %	50 %	0 %	25 %	298501707
3524	NC_014251	A	6	6	200439	200444	100 %	0 %	0 %	0 %	298501708
3525	NC_014251	CTA	2	6	200497	200502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501708
3526	NC_014251	ACG	2	6	200522	200527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501708
3527	NC_014251	TAA	2	6	200533	200538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501708
3528	NC_014251	TGC	2	6	200811	200816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501710
3529	NC_014251	AAG	3	9	200836	200844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501710
3530	NC_014251	TCC	2	6	200858	200863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501710
3531	NC_014251	CAC	2	6	201013	201018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501710
3532	NC_014251	ACC	2	6	201053	201058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501710
3533	NC_014251	TCA	2	6	201062	201067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501710
3534	NC_014251	TGA	2	6	201075	201080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501710
3535	NC_014251	T	6	6	201097	201102	0 %	100 %	0 %	0 %	298501710
3536	NC_014251	TTC	2	6	201106	201111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501710
3537	NC_014251	ATC	2	6	201178	201183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501710
3538	NC_014251	ATAATG	2	12	201215	201226	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	298501710
3539	NC_014251	TCA	2	6	201329	201334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501710
3540	NC_014251	CTT	2	6	201387	201392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501710
3541	NC_014251	GGA	2	6	201410	201415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298501710
3542	NC_014251	GGCT	2	8	201429	201436	0 %	25 %	50 %	25 %	298501710
3543	NC_014251	ACTC	2	8	201453	201460	25 %	25 %	0 %	50 %	298501710
3544	NC_014251	TCA	2	6	201488	201493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501710
3545	NC_014251	CTGA	2	8	201594	201601	25 %	25 %	25 %	25 %	298501710
3546	NC_014251	GCG	2	6	201604	201609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298501710
3547	NC_014251	GGT	2	6	201745	201750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501710
3548	NC_014251	CTT	2	6	201798	201803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501710
3549	NC_014251	CCAT	2	8	201836	201843	25 %	25 %	0 %	50 %	298501710
3550	NC_014251	ATTT	2	8	201897	201904	25 %	75 %	0 %	0 %	298501710
3551	NC_014251	TGC	2	6	201913	201918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501710
3552	NC_014251	GAC	2	6	201957	201962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501710
3553	NC_014251	TTC	2	6	202090	202095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501710
3554	NC_014251	ACG	2	6	202114	202119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501710
3555	NC_014251	TGC	2	6	202126	202131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501710
3556	NC_014251	TTC	2	6	202156	202161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501710
3557	NC_014251	GTG	2	6	202166	202171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501710
3558	NC_014251	AATC	2	8	202239	202246	50 %	25 %	0 %	25 %	298501710
3559	NC_014251	ATG	2	6	202262	202267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501710
3560	NC_014251	TCT	2	6	202304	202309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501710
3561	NC_014251	TGA	2	6	202320	202325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501710
3562	NC_014251	TAT	2	6	202326	202331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501710
3563	NC_014251	TTC	2	6	202339	202344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501710
3564	NC_014251	CAC	2	6	202350	202355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501710
3565	NC_014251	TCA	2	6	202380	202385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501710
3566	NC_014251	CAC	2	6	202431	202436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501710
3567	NC_014251	CCAA	2	8	202493	202500	50 %	0 %	0 %	50 %	298501710
3568	NC_014251	GTT	2	6	202507	202512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501710
3569	NC_014251	CCGA	2	8	202561	202568	25 %	0 %	25 %	50 %	298501710
3570	NC_014251	ACC	2	6	202630	202635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501710
3571	NC_014251	CAT	2	6	202657	202662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501710
3572	NC_014251	TGGCGT	2	12	202700	202711	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	298501710
3573	NC_014251	TTC	2	6	202747	202752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501710
3574	NC_014251	CGA	2	6	202760	202765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501710
3575	NC_014251	AGC	2	6	202768	202773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501710
3576	NC_014251	TCTT	2	8	202787	202794	0 %	75 %	0 %	25 %	298501710
3577	NC_014251	CAT	2	6	202848	202853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501710
3578	NC_014251	TCA	2	6	202925	202930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501710
3579	NC_014251	ACG	2	6	202945	202950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501710
3580	NC_014251	TCAG	2	8	202997	203004	25 %	25 %	25 %	25 %	298501710
3581	NC_014251	CAA	2	6	203098	203103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501710
3582	NC_014251	CATT	2	8	203165	203172	25 %	50 %	0 %	25 %	298501710
3583	NC_014251	TCTA	2	8	203207	203214	25 %	50 %	0 %	25 %	298501711
3584	NC_014251	CTT	2	6	203215	203220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501711
3585	NC_014251	AAC	2	6	203249	203254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501711
3586	NC_014251	CTT	2	6	203260	203265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501711
3587	NC_014251	TCA	2	6	203320	203325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501711
3588	NC_014251	TGAC	2	8	203370	203377	25 %	25 %	25 %	25 %	298501711
3589	NC_014251	AGC	2	6	203397	203402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501711
3590	NC_014251	ATG	2	6	203417	203422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501711
3591	NC_014251	CCA	2	6	203463	203468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501711
3592	NC_014251	AAC	2	6	203540	203545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501711
3593	NC_014251	CT	4	8	203665	203672	0 %	50 %	0 %	50 %	298501711
3594	NC_014251	ACCTTG	2	12	203677	203688	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	298501711
3595	NC_014251	TAT	2	6	203695	203700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501711
3596	NC_014251	CCT	2	6	203927	203932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501712
3597	NC_014251	TGA	2	6	203945	203950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501712
3598	NC_014251	GTT	2	6	203956	203961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501712
3599	NC_014251	TCATC	2	10	204014	204023	20 %	40 %	0 %	40 %	298501712
3600	NC_014251	AGGT	2	8	204070	204077	25 %	25 %	50 %	0 %	298501712
3601	NC_014251	TTC	2	6	204303	204308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501712
3602	NC_014251	CTGA	2	8	204329	204336	25 %	25 %	25 %	25 %	298501712
3603	NC_014251	GATTA	2	10	204354	204363	40 %	40 %	20 %	0 %	298501712
3604	NC_014251	GGT	2	6	204369	204374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501712
3605	NC_014251	ATT	2	6	204499	204504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501712
3606	NC_014251	TGTC	2	8	204529	204536	0 %	50 %	25 %	25 %	298501713
3607	NC_014251	TCT	2	6	204540	204545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501713
3608	NC_014251	TGA	2	6	204703	204708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501713
3609	NC_014251	CTT	2	6	204721	204726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501713
3610	NC_014251	T	6	6	204755	204760	0 %	100 %	0 %	0 %	298501713
3611	NC_014251	CTT	3	9	204784	204792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501713
3612	NC_014251	GTT	2	6	204812	204817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501713
3613	NC_014251	GAT	2	6	204821	204826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501713
3614	NC_014251	TAG	2	6	204837	204842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501713
3615	NC_014251	GTA	2	6	204923	204928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501713
3616	NC_014251	TTGAGT	2	12	204970	204981	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	298501713
3617	NC_014251	ACCA	2	8	205088	205095	50 %	0 %	0 %	50 %	298501713
3618	NC_014251	GA	3	6	205129	205134	50 %	0 %	50 %	0 %	298501713
3619	NC_014251	CAA	2	6	205156	205161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501713
3620	NC_014251	AGA	2	6	205262	205267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501713
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3622	NC_014251	CTT	2	6	205309	205314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501713
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3741	NC_014251	ACT	2	6	210942	210947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501720
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3987	NC_014251	ATC	2	6	223512	223517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501735
3988	NC_014251	CTTC	2	8	223539	223546	0 %	50 %	0 %	50 %	298501735
3989	NC_014251	TCCAC	2	10	223554	223563	20 %	20 %	0 %	60 %	298501735
3990	NC_014251	CGT	2	6	223589	223594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501735
3991	NC_014251	ATC	2	6	223595	223600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501735
3992	NC_014251	TAA	2	6	223685	223690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501735
3993	NC_014251	GTT	2	6	223725	223730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501735
3994	NC_014251	GAAAA	2	10	223746	223755	80 %	0 %	20 %	0 %	298501735
3995	NC_014251	A	6	6	223774	223779	100 %	0 %	0 %	0 %	298501735
3996	NC_014251	TTG	2	6	223790	223795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501735
3997	NC_014251	A	6	6	223919	223924	100 %	0 %	0 %	0 %	298501735
3998	NC_014251	AATA	2	8	223949	223956	75 %	25 %	0 %	0 %	298501735
3999	NC_014251	TTA	2	6	223995	224000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501735
4000	NC_014251	CAT	2	6	224027	224032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501735

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