MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 36584

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
36501	NC_014251	TCA	2	6	2077359	2077364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503771
36502	NC_014251	GTC	2	6	2077514	2077519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503771
36503	NC_014251	ACC	2	6	2077526	2077531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298503771
36504	NC_014251	CTT	2	6	2077647	2077652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503771
36505	NC_014251	TCT	2	6	2077736	2077741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503771
36506	NC_014251	TC	3	6	2077766	2077771	0 %	50 %	0 %	50 %	298503772
36507	NC_014251	CTGA	2	8	2077811	2077818	25 %	25 %	25 %	25 %	298503772
36508	NC_014251	ACTT	2	8	2077823	2077830	25 %	50 %	0 %	25 %	298503772
36509	NC_014251	AAAGC	2	10	2077887	2077896	60 %	0 %	20 %	20 %	298503772
36510	NC_014251	CAT	2	6	2077903	2077908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503772
36511	NC_014251	TAAG	2	8	2077952	2077959	50 %	25 %	25 %	0 %	298503772
36512	NC_014251	TGA	2	6	2077981	2077986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503772
36513	NC_014251	ATCT	2	8	2078261	2078268	25 %	50 %	0 %	25 %	298503772
36514	NC_014251	CTT	2	6	2078383	2078388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503772
36515	NC_014251	TCA	2	6	2078428	2078433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503772
36516	NC_014251	CAA	2	6	2078512	2078517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298503772
36517	NC_014251	TACG	2	8	2078563	2078570	25 %	25 %	25 %	25 %	298503772
36518	NC_014251	GGAAA	2	10	2078594	2078603	60 %	0 %	40 %	0 %	298503772
36519	NC_014251	CAA	2	6	2078629	2078634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298503772
36520	NC_014251	TTA	2	6	2078704	2078709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298503772
36521	NC_014251	CTG	2	6	2078907	2078912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503773
36522	NC_014251	A	6	6	2078913	2078918	100 %	0 %	0 %	0 %	298503773
36523	NC_014251	TAAA	2	8	2078923	2078930	75 %	25 %	0 %	0 %	298503773
36524	NC_014251	AAG	2	6	2078963	2078968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503773
36525	NC_014251	AGA	2	6	2079086	2079091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298503773
36526	NC_014251	AG	3	6	2079126	2079131	50 %	0 %	50 %	0 %	298503773
36527	NC_014251	AAC	2	6	2079247	2079252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298503773
36528	NC_014251	AAT	2	6	2079267	2079272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503773
36529	NC_014251	GATA	2	8	2079296	2079303	50 %	25 %	25 %	0 %	298503773
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36531	NC_014251	CAT	2	6	2079403	2079408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503773
36532	NC_014251	GT	3	6	2079465	2079470	0 %	50 %	50 %	0 %	298503773
36533	NC_014251	GATA	2	8	2079474	2079481	50 %	25 %	25 %	0 %	298503773
36534	NC_014251	A	7	7	2079486	2079492	100 %	0 %	0 %	0 %	298503773
36535	NC_014251	ATA	2	6	2079529	2079534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298503773
36536	NC_014251	CAA	2	6	2079635	2079640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298503774
36537	NC_014251	ATT	2	6	2079647	2079652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298503774
36538	NC_014251	ACT	2	6	2079723	2079728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503774
36539	NC_014251	AGGA	2	8	2079800	2079807	50 %	0 %	50 %	0 %	298503774
36540	NC_014251	CGT	2	6	2079848	2079853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503774
36541	NC_014251	GT	3	6	2079900	2079905	0 %	50 %	50 %	0 %	298503774
36542	NC_014251	A	7	7	2080026	2080032	100 %	0 %	0 %	0 %	298503774
36543	NC_014251	GAAA	2	8	2080064	2080071	75 %	0 %	25 %	0 %	298503774
36544	NC_014251	TTG	2	6	2080118	2080123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503774
36545	NC_014251	GATA	2	8	2080174	2080181	50 %	25 %	25 %	0 %	298503774
36546	NC_014251	GAAA	2	8	2080186	2080193	75 %	0 %	25 %	0 %	298503774
36547	NC_014251	GAGG	2	8	2080240	2080247	25 %	0 %	75 %	0 %	298503774
36548	NC_014251	TGT	2	6	2080349	2080354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298503774
36549	NC_014251	ACG	2	6	2080519	2080524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298503775
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36551	NC_014251	GAT	2	6	2080644	2080649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503775
36552	NC_014251	CT	3	6	2080652	2080657	0 %	50 %	0 %	50 %	298503775
36553	NC_014251	TTC	2	6	2080661	2080666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503775
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36555	NC_014251	TCT	2	6	2080851	2080856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298503776
36556	NC_014251	ATC	2	6	2081353	2081358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503777
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36559	NC_014251	T	6	6	2081443	2081448	0 %	100 %	0 %	0 %	298503777
36560	NC_014251	CGC	2	6	2081502	2081507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298503777
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36564	NC_014251	TTTC	2	8	2081667	2081674	0 %	75 %	0 %	25 %	298503777
36565	NC_014251	GCAA	2	8	2081803	2081810	50 %	0 %	25 %	25 %	298503777
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36568	NC_014251	A	6	6	2082034	2082039	100 %	0 %	0 %	0 %	298503777
36569	NC_014251	TAC	2	6	2082048	2082053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503777
36570	NC_014251	TCCC	2	8	2082102	2082109	0 %	25 %	0 %	75 %	298503777
36571	NC_014251	CT	3	6	2082163	2082168	0 %	50 %	0 %	50 %	298503777
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36575	NC_014251	TCA	2	6	2082331	2082336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298503777
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36583	NC_014251	CGT	2	6	2082664	2082669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298503777
36584	NC_014251	ATG	2	6	2082672	2082677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298503777

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.