MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 36584

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014251	A	7	7	55345	55351	100 %	0 %	0 %	0 %	298501566
1002	NC_014251	TCA	2	6	55358	55363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501566
1003	NC_014251	GATA	2	8	55398	55405	50 %	25 %	25 %	0 %	298501566
1004	NC_014251	TTC	2	6	55417	55422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501566
1005	NC_014251	AGT	2	6	55536	55541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501566
1006	NC_014251	ATG	2	6	55603	55608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501566
1007	NC_014251	TAA	2	6	55620	55625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501566
1008	NC_014251	TCAAAT	2	12	55635	55646	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	298501566
1009	NC_014251	GGAT	2	8	55709	55716	25 %	25 %	50 %	0 %	298501566
1010	NC_014251	CAA	2	6	55725	55730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501566
1011	NC_014251	TGATT	2	10	55736	55745	20 %	60 %	20 %	0 %	298501566
1012	NC_014251	ATT	2	6	55777	55782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501566
1013	NC_014251	AAATA	2	10	55855	55864	80 %	20 %	0 %	0 %	298501566
1014	NC_014251	CTA	2	6	55884	55889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501566
1015	NC_014251	ATC	2	6	55909	55914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501566
1016	NC_014251	AAT	2	6	55950	55955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501566
1017	NC_014251	ACAA	2	8	56033	56040	75 %	0 %	0 %	25 %	298501566
1018	NC_014251	TAA	2	6	56080	56085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501566
1019	NC_014251	TAC	2	6	56103	56108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501566
1020	NC_014251	TAC	2	6	62179	62184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501567
1021	NC_014251	TGT	2	6	62191	62196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501567
1022	NC_014251	TC	3	6	62253	62258	0 %	50 %	0 %	50 %	298501567
1023	NC_014251	T	6	6	62307	62312	0 %	100 %	0 %	0 %	298501567
1024	NC_014251	TTC	2	6	62591	62596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501568
1025	NC_014251	CCA	2	6	62600	62605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501568
1026	NC_014251	TTATA	2	10	62641	62650	40 %	60 %	0 %	0 %	298501568
1027	NC_014251	CAT	2	6	62654	62659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501568
1028	NC_014251	CCA	2	6	62736	62741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501568
1029	NC_014251	GGT	2	6	62745	62750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501568
1030	NC_014251	GCC	2	6	62817	62822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298501568
1031	NC_014251	TCT	2	6	62889	62894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501568
1032	NC_014251	ACA	2	6	62910	62915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501568
1033	NC_014251	CTT	2	6	62968	62973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501568
1034	NC_014251	ATT	2	6	62997	63002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501568
1035	NC_014251	TTTA	2	8	63011	63018	25 %	75 %	0 %	0 %	298501569
1036	NC_014251	CAAG	2	8	63068	63075	50 %	0 %	25 %	25 %	298501569
1037	NC_014251	ATC	2	6	63216	63221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501569
1038	NC_014251	GAA	2	6	63324	63329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501569
1039	NC_014251	GTCA	2	8	63405	63412	25 %	25 %	25 %	25 %	298501569
1040	NC_014251	T	6	6	63504	63509	0 %	100 %	0 %	0 %	298501569
1041	NC_014251	GCT	2	6	63520	63525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501569
1042	NC_014251	TCA	2	6	63547	63552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501569
1043	NC_014251	TTC	2	6	63567	63572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501569
1044	NC_014251	GA	3	6	63575	63580	50 %	0 %	50 %	0 %	298501569
1045	NC_014251	CAC	2	6	63593	63598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501569
1046	NC_014251	CCAA	2	8	63606	63613	50 %	0 %	0 %	50 %	298501569
1047	NC_014251	CTTT	2	8	63653	63660	0 %	75 %	0 %	25 %	298501569
1048	NC_014251	CTT	2	6	63708	63713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501569
1049	NC_014251	CCAA	2	8	63765	63772	50 %	0 %	0 %	50 %	298501569
1050	NC_014251	GA	3	6	63836	63841	50 %	0 %	50 %	0 %	298501569
1051	NC_014251	AAC	2	6	63864	63869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501569
1052	NC_014251	TCTT	2	8	63895	63902	0 %	75 %	0 %	25 %	298501569
1053	NC_014251	CAC	2	6	63917	63922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501569
1054	NC_014251	GAT	2	6	64014	64019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501569
1055	NC_014251	CTG	2	6	64022	64027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501569
1056	NC_014251	GCT	2	6	64048	64053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501569
1057	NC_014251	TCT	2	6	64057	64062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501569
1058	NC_014251	GTG	2	6	64094	64099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501569
1059	NC_014251	CTT	2	6	64112	64117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501569
1060	NC_014251	GCGTTC	2	12	64119	64130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501569
1061	NC_014251	CTT	2	6	64142	64147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501569
1062	NC_014251	CCA	2	6	64363	64368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501569
1063	NC_014251	GC	3	6	64374	64379	0 %	0 %	50 %	50 %	298501569
1064	NC_014251	GTA	2	6	64421	64426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501569
1065	NC_014251	TTC	2	6	64626	64631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501570
1066	NC_014251	AAG	2	6	64647	64652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501570
1067	NC_014251	TGGT	2	8	64686	64693	0 %	50 %	50 %	0 %	298501570
1068	NC_014251	GAA	2	6	64743	64748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501570
1069	NC_014251	TG	3	6	64821	64826	0 %	50 %	50 %	0 %	298501570
1070	NC_014251	AAG	2	6	64830	64835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501570
1071	NC_014251	T	6	6	64851	64856	0 %	100 %	0 %	0 %	298501570
1072	NC_014251	TCT	2	6	64906	64911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501570
1073	NC_014251	CTT	2	6	64985	64990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501570
1074	NC_014251	AGTG	2	8	65005	65012	25 %	25 %	50 %	0 %	298501570
1075	NC_014251	CCA	2	6	65091	65096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501570
1076	NC_014251	TGC	2	6	65280	65285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501570
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1081	NC_014251	GTT	2	6	65497	65502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501570
1082	NC_014251	TTC	2	6	65622	65627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501570
1083	NC_014251	TTTG	2	8	65629	65636	0 %	75 %	25 %	0 %	298501570
1084	NC_014251	AAG	2	6	65659	65664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501570
1085	NC_014251	TGC	2	6	65670	65675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501570
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1088	NC_014251	TTC	2	6	65769	65774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501570
1089	NC_014251	AAG	2	6	65809	65814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501570
1090	NC_014251	CTG	3	9	65852	65860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501570
1091	NC_014251	CAA	2	6	65897	65902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501570
1092	NC_014251	AAT	2	6	65921	65926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501570
1093	NC_014251	TTC	2	6	65947	65952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501570
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1096	NC_014251	T	7	7	66004	66010	0 %	100 %	0 %	0 %	298501571
1097	NC_014251	A	6	6	66078	66083	100 %	0 %	0 %	0 %	298501571
1098	NC_014251	AGAA	2	8	66088	66095	75 %	0 %	25 %	0 %	298501571
1099	NC_014251	TTCA	2	8	66121	66128	25 %	50 %	0 %	25 %	298501572
1100	NC_014251	AAT	2	6	66140	66145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501572
1101	NC_014251	TCT	2	6	66158	66163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501572
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1103	NC_014251	CTTT	2	8	66323	66330	0 %	75 %	0 %	25 %	298501572
1104	NC_014251	CCA	2	6	66345	66350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501572
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1106	NC_014251	TTGA	2	8	66421	66428	25 %	50 %	25 %	0 %	298501572
1107	NC_014251	CCA	2	6	66434	66439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501572
1108	NC_014251	CTTC	2	8	66504	66511	0 %	50 %	0 %	50 %	298501572
1109	NC_014251	ATC	2	6	66550	66555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501572
1110	NC_014251	TC	3	6	66573	66578	0 %	50 %	0 %	50 %	298501572
1111	NC_014251	CCT	2	6	66605	66610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501572
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1116	NC_014251	TATCA	2	10	66838	66847	40 %	40 %	0 %	20 %	298501572
1117	NC_014251	ATTG	2	8	66957	66964	25 %	50 %	25 %	0 %	298501573
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1126	NC_014251	TGA	2	6	67524	67529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501573
1127	NC_014251	ATA	2	6	67535	67540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501573
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1131	NC_014251	ATA	2	6	67796	67801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501573
1132	NC_014251	GTA	2	6	67807	67812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501573
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1155	NC_014251	T	6	6	69629	69634	0 %	100 %	0 %	0 %	298501575
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1247	NC_014251	CGA	2	6	75036	75041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501578
1248	NC_014251	GCTGAA	2	12	75100	75111	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	298501578
1249	NC_014251	GAA	2	6	75130	75135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501578
1250	NC_014251	GC	3	6	75136	75141	0 %	0 %	50 %	50 %	298501578
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