MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 36584

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014251	CGA	2	6	27866	27871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501532
502	NC_014251	TTC	2	6	27940	27945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501532
503	NC_014251	GT	3	6	28054	28059	0 %	50 %	50 %	0 %	298501532
504	NC_014251	GCT	2	6	28142	28147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501533
505	NC_014251	CTG	2	6	28149	28154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501533
506	NC_014251	ACC	2	6	28240	28245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501533
507	NC_014251	T	6	6	28279	28284	0 %	100 %	0 %	0 %	298501533
508	NC_014251	TTA	2	6	28289	28294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501533
509	NC_014251	AAG	2	6	28324	28329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501533
510	NC_014251	GCT	2	6	28469	28474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501533
511	NC_014251	TAG	2	6	28479	28484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501533
512	NC_014251	ATT	2	6	28534	28539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501533
513	NC_014251	CCA	2	6	28553	28558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501533
514	NC_014251	AAT	2	6	28585	28590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501533
515	NC_014251	AAGC	2	8	28642	28649	50 %	0 %	25 %	25 %	298501533
516	NC_014251	ATA	2	6	28667	28672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501533
517	NC_014251	GCT	2	6	28697	28702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501533
518	NC_014251	AATCC	2	10	28795	28804	40 %	20 %	0 %	40 %	298501534
519	NC_014251	TTC	2	6	28829	28834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501534
520	NC_014251	TCT	2	6	28851	28856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501534
521	NC_014251	TCT	2	6	28890	28895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501534
522	NC_014251	AAT	2	6	28910	28915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501534
523	NC_014251	TG	3	6	28934	28939	0 %	50 %	50 %	0 %	298501534
524	NC_014251	TTG	2	6	28951	28956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501534
525	NC_014251	CAA	2	6	28967	28972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501534
526	NC_014251	ACA	2	6	29001	29006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501534
527	NC_014251	CTT	2	6	29197	29202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501534
528	NC_014251	ATC	2	6	29384	29389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501535
529	NC_014251	TGA	2	6	29582	29587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501535
530	NC_014251	CCATT	2	10	29590	29599	20 %	40 %	0 %	40 %	298501535
531	NC_014251	GCT	2	6	29607	29612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501535
532	NC_014251	CTT	3	9	29654	29662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501536
533	NC_014251	CAAG	2	8	29726	29733	50 %	0 %	25 %	25 %	298501536
534	NC_014251	AC	3	6	29739	29744	50 %	0 %	0 %	50 %	298501536
535	NC_014251	CAA	2	6	29756	29761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501536
536	NC_014251	AT	3	6	29779	29784	50 %	50 %	0 %	0 %	298501536
537	NC_014251	CCA	2	6	29830	29835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501536
538	NC_014251	CA	3	6	29859	29864	50 %	0 %	0 %	50 %	298501536
539	NC_014251	AAAGG	2	10	29901	29910	60 %	0 %	40 %	0 %	298501536
540	NC_014251	CCG	2	6	29929	29934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298501536
541	NC_014251	TAA	3	9	29993	30001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501536
542	NC_014251	AAG	2	6	30104	30109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501536
543	NC_014251	CAA	2	6	30141	30146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501536
544	NC_014251	TTTG	2	8	30147	30154	0 %	75 %	25 %	0 %	298501536
545	NC_014251	TGA	2	6	30302	30307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501536
546	NC_014251	CTT	2	6	30308	30313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501536
547	NC_014251	GAA	2	6	30357	30362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501536
548	NC_014251	CAA	2	6	30386	30391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501536
549	NC_014251	TCT	2	6	30445	30450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501536
550	NC_014251	CCA	3	9	30526	30534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501536
551	NC_014251	AACT	2	8	30569	30576	50 %	25 %	0 %	25 %	298501536
552	NC_014251	GAT	2	6	30594	30599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501536
553	NC_014251	GCT	2	6	30607	30612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501536
554	NC_014251	TTG	2	6	30675	30680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501536
555	NC_014251	ATG	2	6	30685	30690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501536
556	NC_014251	TAA	2	6	30698	30703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501536
557	NC_014251	CAAT	2	8	30764	30771	50 %	25 %	0 %	25 %	298501536
558	NC_014251	CAA	2	6	30791	30796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501536
559	NC_014251	CTG	2	6	30809	30814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501536
560	NC_014251	TGT	2	6	30821	30826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501536
561	NC_014251	TGC	2	6	30828	30833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501536
562	NC_014251	GCT	2	6	30892	30897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501536
563	NC_014251	AACCA	2	10	30918	30927	60 %	0 %	0 %	40 %	298501536
564	NC_014251	A	6	6	30980	30985	100 %	0 %	0 %	0 %	298501536
565	NC_014251	T	6	6	30999	31004	0 %	100 %	0 %	0 %	298501536
566	NC_014251	ATA	2	6	31253	31258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501537
567	NC_014251	GAA	2	6	31261	31266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501537
568	NC_014251	TCT	2	6	31302	31307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501537
569	NC_014251	CTT	2	6	31360	31365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501537
570	NC_014251	ACG	2	6	31391	31396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501537
571	NC_014251	TTC	2	6	31400	31405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501537
572	NC_014251	ATA	2	6	31448	31453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501537
573	NC_014251	CTT	2	6	31514	31519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501537
574	NC_014251	TC	3	6	31611	31616	0 %	50 %	0 %	50 %	298501537
575	NC_014251	GCTT	2	8	31700	31707	0 %	50 %	25 %	25 %	298501537
576	NC_014251	TCT	2	6	31774	31779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501537
577	NC_014251	TCTTA	2	10	31841	31850	20 %	60 %	0 %	20 %	298501537
578	NC_014251	ACA	3	9	31922	31930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501538
579	NC_014251	TCA	2	6	31943	31948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501538
580	NC_014251	CCAT	2	8	31970	31977	25 %	25 %	0 %	50 %	298501538
581	NC_014251	ATA	2	6	31985	31990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501538
582	NC_014251	CTT	2	6	32046	32051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501538
583	NC_014251	CATTGA	2	12	32118	32129	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298501538
584	NC_014251	ATA	2	6	32219	32224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501538
585	NC_014251	ACG	2	6	32263	32268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501538
586	NC_014251	TCA	2	6	32306	32311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501538
587	NC_014251	TCT	2	6	32390	32395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501538
588	NC_014251	TCA	2	6	32435	32440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501538
589	NC_014251	CTT	2	6	32448	32453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501538
590	NC_014251	TCT	2	6	32507	32512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501538
591	NC_014251	TCA	2	6	32561	32566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501538
592	NC_014251	CTT	2	6	32580	32585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501538
593	NC_014251	T	7	7	32592	32598	0 %	100 %	0 %	0 %	298501538
594	NC_014251	TTC	2	6	32632	32637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501538
595	NC_014251	T	7	7	32673	32679	0 %	100 %	0 %	0 %	298501538
596	NC_014251	TAC	2	6	32692	32697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501538
597	NC_014251	ACA	2	6	32714	32719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501538
598	NC_014251	T	6	6	32758	32763	0 %	100 %	0 %	0 %	298501538
599	NC_014251	T	6	6	32785	32790	0 %	100 %	0 %	0 %	298501538
600	NC_014251	CTT	2	6	32862	32867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501538
601	NC_014251	TAC	2	6	32887	32892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501538
602	NC_014251	TTAT	2	8	32910	32917	25 %	75 %	0 %	0 %	298501539
603	NC_014251	CTTTT	2	10	32943	32952	0 %	80 %	0 %	20 %	298501539
604	NC_014251	TAC	2	6	32980	32985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501539
605	NC_014251	ATT	2	6	33016	33021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501539
606	NC_014251	CAT	2	6	33130	33135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501539
607	NC_014251	TTG	2	6	33170	33175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501539
608	NC_014251	CTG	2	6	33204	33209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501539
609	NC_014251	GAA	2	6	33219	33224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501539
610	NC_014251	AG	3	6	33347	33352	50 %	0 %	50 %	0 %	298501539
611	NC_014251	CCA	2	6	33492	33497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501539
612	NC_014251	AAT	2	6	33550	33555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501539
613	NC_014251	AAG	2	6	33605	33610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501539
614	NC_014251	TTCC	2	8	33745	33752	0 %	50 %	0 %	50 %	298501540
615	NC_014251	ACA	2	6	33840	33845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501540
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617	NC_014251	ATA	2	6	33885	33890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501540
618	NC_014251	T	6	6	33938	33943	0 %	100 %	0 %	0 %	298501540
619	NC_014251	CCT	2	6	34027	34032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501540
620	NC_014251	TC	3	6	34054	34059	0 %	50 %	0 %	50 %	298501540
621	NC_014251	TTC	2	6	34077	34082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501540
622	NC_014251	TAC	2	6	34107	34112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501541
623	NC_014251	TAT	2	6	34113	34118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501541
624	NC_014251	A	6	6	34131	34136	100 %	0 %	0 %	0 %	298501541
625	NC_014251	TCA	2	6	34165	34170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501541
626	NC_014251	AAG	2	6	34175	34180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501541
627	NC_014251	T	7	7	34218	34224	0 %	100 %	0 %	0 %	298501541
628	NC_014251	T	6	6	34236	34241	0 %	100 %	0 %	0 %	298501542
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752	NC_014251	TTCCT	2	10	41026	41035	0 %	60 %	0 %	40 %	298501552
753	NC_014251	GTTT	2	8	41041	41048	0 %	75 %	25 %	0 %	298501552
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758	NC_014251	TCA	2	6	41180	41185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501552
759	NC_014251	GTA	2	6	41244	41249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501552
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