MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 36584

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014251	TGC	2	6	312821	312826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501837
5502	NC_014251	AGG	2	6	312871	312876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298501837
5503	NC_014251	CTG	2	6	313015	313020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501837
5504	NC_014251	TGGCT	2	10	313079	313088	0 %	40 %	40 %	20 %	298501837
5505	NC_014251	CT	3	6	313115	313120	0 %	50 %	0 %	50 %	298501837
5506	NC_014251	AAGA	2	8	313122	313129	75 %	0 %	25 %	0 %	298501837
5507	NC_014251	TCG	2	6	313193	313198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501837
5508	NC_014251	GGT	2	6	313254	313259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501837
5509	NC_014251	GGT	2	6	313355	313360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501837
5510	NC_014251	TGA	2	6	313442	313447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501837
5511	NC_014251	GAT	2	6	313476	313481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501837
5512	NC_014251	TTC	2	6	313637	313642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501837
5513	NC_014251	GAA	2	6	313668	313673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501837
5514	NC_014251	AAATG	2	10	313685	313694	60 %	20 %	20 %	0 %	298501837
5515	NC_014251	CTG	2	6	313780	313785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501837
5516	NC_014251	TGG	2	6	313819	313824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501837
5517	NC_014251	AAC	2	6	313844	313849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501837
5518	NC_014251	TCG	2	6	313853	313858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501837
5519	NC_014251	AAG	2	6	313876	313881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501837
5520	NC_014251	GAA	2	6	313995	314000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501837
5521	NC_014251	TTGA	2	8	314052	314059	25 %	50 %	25 %	0 %	298501837
5522	NC_014251	GGT	2	6	314091	314096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501837
5523	NC_014251	CT	3	6	314134	314139	0 %	50 %	0 %	50 %	298501837
5524	NC_014251	GAA	2	6	314148	314153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501837
5525	NC_014251	GAA	2	6	314172	314177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501837
5526	NC_014251	GTT	2	6	314292	314297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501838
5527	NC_014251	TGG	2	6	314354	314359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501838
5528	NC_014251	TGG	2	6	314363	314368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501838
5529	NC_014251	TG	3	6	314490	314495	0 %	50 %	50 %	0 %	298501838
5530	NC_014251	TG	3	6	314500	314505	0 %	50 %	50 %	0 %	298501838
5531	NC_014251	CAT	2	6	314513	314518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501838
5532	NC_014251	TGC	2	6	314519	314524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501838
5533	NC_014251	GAA	2	6	314567	314572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501838
5534	NC_014251	AGCTA	2	10	314579	314588	40 %	20 %	20 %	20 %	298501838
5535	NC_014251	TG	3	6	314619	314624	0 %	50 %	50 %	0 %	298501838
5536	NC_014251	TGC	2	6	314633	314638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501838
5537	NC_014251	GAC	2	6	314685	314690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501838
5538	NC_014251	CGGT	2	8	314710	314717	0 %	25 %	50 %	25 %	298501838
5539	NC_014251	GGT	2	6	314753	314758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501838
5540	NC_014251	TTC	2	6	314770	314775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501838
5541	NC_014251	TCG	2	6	314822	314827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501838
5542	NC_014251	TCA	2	6	314938	314943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501838
5543	NC_014251	AAG	2	6	314944	314949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501838
5544	NC_014251	GGT	2	6	314979	314984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501838
5545	NC_014251	GCT	2	6	315027	315032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501838
5546	NC_014251	TGA	2	6	315038	315043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501838
5547	NC_014251	GAA	2	6	315105	315110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501838
5548	NC_014251	TTG	2	6	315186	315191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501838
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5550	NC_014251	A	7	7	315257	315263	100 %	0 %	0 %	0 %	298501838
5551	NC_014251	GAA	2	6	315311	315316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501839
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5553	NC_014251	AGC	2	6	315439	315444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501839
5554	NC_014251	GAA	2	6	315461	315466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501839
5555	NC_014251	TCA	2	6	315678	315683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501839
5556	NC_014251	TGA	2	6	315709	315714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501839
5557	NC_014251	AGT	2	6	315772	315777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501839
5558	NC_014251	A	7	7	315895	315901	100 %	0 %	0 %	0 %	298501840
5559	NC_014251	TTA	2	6	315934	315939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501840
5560	NC_014251	ATT	2	6	316071	316076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501840
5561	NC_014251	GTTT	2	8	316105	316112	0 %	75 %	25 %	0 %	298501840
5562	NC_014251	TTACTG	2	12	316363	316374	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	298501840
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5564	NC_014251	A	6	6	316483	316488	100 %	0 %	0 %	0 %	298501841
5565	NC_014251	TTGG	2	8	316490	316497	0 %	50 %	50 %	0 %	298501841
5566	NC_014251	GAT	2	6	316564	316569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501841
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5568	NC_014251	TCG	2	6	316644	316649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501841
5569	NC_014251	ACA	2	6	316682	316687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501841
5570	NC_014251	TGG	2	6	316709	316714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501841
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5572	NC_014251	CAG	2	6	316814	316819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501841
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5577	NC_014251	AAGC	2	8	317004	317011	50 %	0 %	25 %	25 %	298501841
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5588	NC_014251	CCTTG	2	10	317469	317478	0 %	40 %	20 %	40 %	298501841
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5591	NC_014251	TAT	2	6	317676	317681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501841
5592	NC_014251	AACC	2	8	317724	317731	50 %	0 %	0 %	50 %	298501841
5593	NC_014251	CTT	2	6	317805	317810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501841
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5601	NC_014251	ATTG	2	8	318247	318254	25 %	50 %	25 %	0 %	298501842
5602	NC_014251	ATG	2	6	318270	318275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501842
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5605	NC_014251	GAT	2	6	318326	318331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501842
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5608	NC_014251	GC	3	6	318626	318631	0 %	0 %	50 %	50 %	298501842
5609	NC_014251	CAT	2	6	318703	318708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501842
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5612	NC_014251	GTC	2	6	318870	318875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501842
5613	NC_014251	GGAC	2	8	319050	319057	25 %	0 %	50 %	25 %	298501842
5614	NC_014251	GCCA	2	8	319129	319136	25 %	0 %	25 %	50 %	298501842
5615	NC_014251	TCA	2	6	319152	319157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501842
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5621	NC_014251	AAAAAT	2	12	319523	319534	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	298501843
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5742	NC_014251	GAT	2	6	325604	325609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501848
5743	NC_014251	GTA	2	6	325646	325651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501848
5744	NC_014251	CGT	2	6	325657	325662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501848
5745	NC_014251	CGAG	2	8	325701	325708	25 %	0 %	50 %	25 %	298501848
5746	NC_014251	CAT	2	6	325813	325818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501848
5747	NC_014251	TCA	2	6	325827	325832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501848
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5751	NC_014251	CAT	2	6	326230	326235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501848
5752	NC_014251	GAT	2	6	326285	326290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501848
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5762	NC_014251	TCT	2	6	326622	326627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501848
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5766	NC_014251	GGTT	2	8	326772	326779	0 %	50 %	50 %	0 %	298501848
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5773	NC_014251	TCT	2	6	327218	327223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501849
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5986	NC_014251	TTGT	2	8	340377	340384	0 %	75 %	25 %	0 %	298501864
5987	NC_014251	AGAAA	2	10	340406	340415	80 %	0 %	20 %	0 %	298501864
5988	NC_014251	GAAAG	2	10	340458	340467	60 %	0 %	40 %	0 %	298501865
5989	NC_014251	TGA	2	6	340566	340571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501865
5990	NC_014251	ATCA	2	8	340585	340592	50 %	25 %	0 %	25 %	298501865
5991	NC_014251	GAA	2	6	340639	340644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501865
5992	NC_014251	CAG	2	6	340655	340660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501865
5993	NC_014251	ATA	2	6	340877	340882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501865
5994	NC_014251	TCA	2	6	341090	341095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501865
5995	NC_014251	TAG	2	6	341117	341122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501865
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5998	NC_014251	AGAA	2	8	341240	341247	75 %	0 %	25 %	0 %	298501866
5999	NC_014251	AG	4	8	341254	341261	50 %	0 %	50 %	0 %	298501866
6000	NC_014251	GCT	2	6	341308	341313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501867

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