MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 36584

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014251	AACA	2	8	278372	278379	75 %	0 %	0 %	25 %	298501803
5002	NC_014251	TGA	2	6	278391	278396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501803
5003	NC_014251	GTTC	2	8	278401	278408	0 %	50 %	25 %	25 %	298501803
5004	NC_014251	ATT	2	6	278409	278414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501803
5005	NC_014251	GCT	2	6	278434	278439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501803
5006	NC_014251	ATT	2	6	278443	278448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501803
5007	NC_014251	ATT	2	6	278487	278492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501803
5008	NC_014251	AGA	2	6	278562	278567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501803
5009	NC_014251	ATG	2	6	278588	278593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501803
5010	NC_014251	ATGA	2	8	278608	278615	50 %	25 %	25 %	0 %	298501803
5011	NC_014251	GAA	2	6	278765	278770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501804
5012	NC_014251	AAG	2	6	278841	278846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501804
5013	NC_014251	TAG	2	6	278872	278877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501804
5014	NC_014251	AGA	2	6	278878	278883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501804
5015	NC_014251	GAA	2	6	279005	279010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501804
5016	NC_014251	GA	3	6	279015	279020	50 %	0 %	50 %	0 %	298501804
5017	NC_014251	G	6	6	279040	279045	0 %	0 %	100 %	0 %	298501804
5018	NC_014251	GAT	2	6	279056	279061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501804
5019	NC_014251	TAT	2	6	279062	279067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501804
5020	NC_014251	AAAC	2	8	279097	279104	75 %	0 %	0 %	25 %	298501804
5021	NC_014251	AAG	2	6	279120	279125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501804
5022	NC_014251	A	6	6	279451	279456	100 %	0 %	0 %	0 %	298501805
5023	NC_014251	GA	3	6	279505	279510	50 %	0 %	50 %	0 %	298501805
5024	NC_014251	ACA	2	6	279567	279572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501805
5025	NC_014251	GTA	2	6	279579	279584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501805
5026	NC_014251	TCTTGT	2	12	284964	284975	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	298501806
5027	NC_014251	TTG	2	6	285384	285389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501807
5028	NC_014251	GAT	2	6	285437	285442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501807
5029	NC_014251	AGTTGA	2	12	285628	285639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501808
5030	NC_014251	TGA	2	6	285650	285655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501808
5031	NC_014251	TGA	2	6	285708	285713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501808
5032	NC_014251	TGA	2	6	285725	285730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501808
5033	NC_014251	TTC	2	6	285731	285736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501808
5034	NC_014251	A	6	6	286089	286094	100 %	0 %	0 %	0 %	298501809
5035	NC_014251	GAA	2	6	286130	286135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501809
5036	NC_014251	TAT	2	6	286199	286204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501809
5037	NC_014251	TTG	2	6	286312	286317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501809
5038	NC_014251	ATGT	2	8	286507	286514	25 %	50 %	25 %	0 %	298501810
5039	NC_014251	GTT	3	9	286558	286566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501810
5040	NC_014251	TGA	2	6	286584	286589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501810
5041	NC_014251	GGT	2	6	286651	286656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501810
5042	NC_014251	TTC	2	6	286726	286731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501810
5043	NC_014251	A	6	6	286736	286741	100 %	0 %	0 %	0 %	298501810
5044	NC_014251	ATGGT	2	10	286757	286766	20 %	40 %	40 %	0 %	298501810
5045	NC_014251	AAC	2	6	286821	286826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501810
5046	NC_014251	AAG	3	9	286895	286903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501810
5047	NC_014251	GCT	2	6	286966	286971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501810
5048	NC_014251	GAT	2	6	287095	287100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501810
5049	NC_014251	GAA	2	6	287107	287112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501810
5050	NC_014251	CAA	2	6	287128	287133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501810
5051	NC_014251	GATA	2	8	287148	287155	50 %	25 %	25 %	0 %	298501810
5052	NC_014251	ATG	2	6	287171	287176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501810
5053	NC_014251	TCA	2	6	287263	287268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501810
5054	NC_014251	TGG	2	6	287280	287285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501810
5055	NC_014251	CAAG	2	8	287312	287319	50 %	0 %	25 %	25 %	298501810
5056	NC_014251	GTT	2	6	287388	287393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501810
5057	NC_014251	TGA	2	6	287394	287399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501810
5058	NC_014251	ACA	2	6	287440	287445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501810
5059	NC_014251	GTC	2	6	287450	287455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501810
5060	NC_014251	CGT	2	6	287458	287463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501810
5061	NC_014251	GGTT	2	8	287467	287474	0 %	50 %	50 %	0 %	298501810
5062	NC_014251	CGT	2	6	287500	287505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501810
5063	NC_014251	CTTT	2	8	287524	287531	0 %	75 %	0 %	25 %	298501810
5064	NC_014251	TG	3	6	287575	287580	0 %	50 %	50 %	0 %	298501810
5065	NC_014251	ACT	2	6	287609	287614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501810
5066	NC_014251	CTAT	2	8	287651	287658	25 %	50 %	0 %	25 %	298501810
5067	NC_014251	AGA	2	6	287679	287684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501810
5068	NC_014251	TCG	2	6	287739	287744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501810
5069	NC_014251	TTGG	2	8	287755	287762	0 %	50 %	50 %	0 %	298501810
5070	NC_014251	AACA	2	8	287801	287808	75 %	0 %	0 %	25 %	298501810
5071	NC_014251	TAT	2	6	288039	288044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501811
5072	NC_014251	GAA	2	6	288051	288056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501811
5073	NC_014251	AAG	2	6	288058	288063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501811
5074	NC_014251	GAGG	2	8	288071	288078	25 %	0 %	75 %	0 %	298501811
5075	NC_014251	GA	3	6	288083	288088	50 %	0 %	50 %	0 %	298501811
5076	NC_014251	TG	3	6	288129	288134	0 %	50 %	50 %	0 %	298501811
5077	NC_014251	AGCG	2	8	288190	288197	25 %	0 %	50 %	25 %	298501811
5078	NC_014251	ATGC	2	8	288201	288208	25 %	25 %	25 %	25 %	298501811
5079	NC_014251	GCT	2	6	288372	288377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501811
5080	NC_014251	ATC	2	6	288415	288420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501811
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5082	NC_014251	A	6	6	288495	288500	100 %	0 %	0 %	0 %	298501811
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5085	NC_014251	TTC	2	6	288887	288892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501812
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5088	NC_014251	ATT	2	6	288949	288954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501812
5089	NC_014251	GAA	2	6	288995	289000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501812
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5092	NC_014251	TA	3	6	289195	289200	50 %	50 %	0 %	0 %	298501813
5093	NC_014251	GCA	2	6	289242	289247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501813
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5099	NC_014251	GTT	2	6	289561	289566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501813
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5102	NC_014251	GT	3	6	289800	289805	0 %	50 %	50 %	0 %	298501814
5103	NC_014251	GGA	2	6	289885	289890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298501814
5104	NC_014251	GAG	2	6	290033	290038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298501814
5105	NC_014251	CAG	2	6	290045	290050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501814
5106	NC_014251	CCAG	2	8	290149	290156	25 %	0 %	25 %	50 %	298501814
5107	NC_014251	ATT	2	6	290165	290170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501814
5108	NC_014251	TCCA	2	8	290174	290181	25 %	25 %	0 %	50 %	298501814
5109	NC_014251	CAT	2	6	290185	290190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501814
5110	NC_014251	AAG	2	6	290310	290315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501814
5111	NC_014251	TGG	2	6	290349	290354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501814
5112	NC_014251	CAC	2	6	290384	290389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501814
5113	NC_014251	GGC	2	6	290465	290470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298501814
5114	NC_014251	AGA	2	6	290506	290511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501814
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5116	NC_014251	TAC	2	6	290626	290631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501814
5117	NC_014251	CTG	2	6	290727	290732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501814
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5119	NC_014251	GA	3	6	290853	290858	50 %	0 %	50 %	0 %	298501814
5120	NC_014251	AGG	2	6	291087	291092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298501815
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5122	NC_014251	TTCG	2	8	291303	291310	0 %	50 %	25 %	25 %	298501815
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5130	NC_014251	CTA	2	6	291688	291693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501816
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5369	NC_014251	ATT	2	6	305107	305112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501833
5370	NC_014251	TCC	2	6	305138	305143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501833
5371	NC_014251	CTTG	2	8	305175	305182	0 %	50 %	25 %	25 %	298501833
5372	NC_014251	CTT	2	6	305253	305258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501833
5373	NC_014251	ATC	2	6	305311	305316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501833
5374	NC_014251	ATT	2	6	305371	305376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501833
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5377	NC_014251	GAA	2	6	305622	305627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501833
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5380	NC_014251	TTTAC	2	10	305783	305792	20 %	60 %	0 %	20 %	298501833
5381	NC_014251	ATC	2	6	305809	305814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501833
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5383	NC_014251	GAG	2	6	305893	305898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298501833
5384	NC_014251	TGA	2	6	305924	305929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501833
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5405	NC_014251	A	7	7	306989	306995	100 %	0 %	0 %	0 %	298501834
5406	NC_014251	AAG	2	6	307025	307030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501834
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5481	NC_014251	GATT	2	8	311436	311443	25 %	50 %	25 %	0 %	298501836
5482	NC_014251	AAGC	2	8	311477	311484	50 %	0 %	25 %	25 %	298501836
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5489	NC_014251	AGA	2	6	311805	311810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501836
5490	NC_014251	TGT	2	6	311832	311837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501836
5491	NC_014251	AAG	2	6	311933	311938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501836
5492	NC_014251	TGAA	2	8	311972	311979	50 %	25 %	25 %	0 %	298501836
5493	NC_014251	TCT	2	6	312038	312043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501836
5494	NC_014251	GTG	2	6	312152	312157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501836
5495	NC_014251	ATG	2	6	312266	312271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501836
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5499	NC_014251	A	6	6	312751	312756	100 %	0 %	0 %	0 %	298501837
5500	NC_014251	GAA	2	6	312783	312788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501837

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