MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 36584

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_014251	CTAT	2	8	249361	249368	25 %	50 %	0 %	25 %	298501760
4503	NC_014251	TTC	2	6	249369	249374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501760
4504	NC_014251	TC	3	6	249474	249479	0 %	50 %	0 %	50 %	298501760
4505	NC_014251	ATT	2	6	249540	249545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501760
4506	NC_014251	TTGT	2	8	249566	249573	0 %	75 %	25 %	0 %	298501760
4507	NC_014251	ATA	2	6	249604	249609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501760
4508	NC_014251	CCT	2	6	249715	249720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501761
4509	NC_014251	ATA	2	6	249728	249733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501761
4510	NC_014251	AG	3	6	249761	249766	50 %	0 %	50 %	0 %	298501761
4511	NC_014251	T	6	6	249776	249781	0 %	100 %	0 %	0 %	298501761
4512	NC_014251	A	6	6	249826	249831	100 %	0 %	0 %	0 %	298501761
4513	NC_014251	TCC	2	6	250333	250338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501762
4514	NC_014251	CTT	3	9	250409	250417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501762
4515	NC_014251	T	6	6	250450	250455	0 %	100 %	0 %	0 %	298501762
4516	NC_014251	CCTAT	2	10	250459	250468	20 %	40 %	0 %	40 %	298501762
4517	NC_014251	TCA	2	6	250522	250527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501762
4518	NC_014251	ACC	2	6	250528	250533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501762
4519	NC_014251	TGT	2	6	250670	250675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501763
4520	NC_014251	GTA	2	6	250757	250762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501763
4521	NC_014251	GTT	2	6	250773	250778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501763
4522	NC_014251	T	7	7	250870	250876	0 %	100 %	0 %	0 %	298501763
4523	NC_014251	T	7	7	251016	251022	0 %	100 %	0 %	0 %	298501764
4524	NC_014251	TAA	2	6	251066	251071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501764
4525	NC_014251	ATC	2	6	251073	251078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501764
4526	NC_014251	ATCT	2	8	251082	251089	25 %	50 %	0 %	25 %	298501764
4527	NC_014251	TCA	2	6	251146	251151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501764
4528	NC_014251	GTT	2	6	251152	251157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501764
4529	NC_014251	AAT	2	6	251296	251301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501765
4530	NC_014251	AAGC	2	8	251423	251430	50 %	0 %	25 %	25 %	298501765
4531	NC_014251	TTC	2	6	251537	251542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501765
4532	NC_014251	TCC	2	6	251625	251630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501765
4533	NC_014251	CTA	2	6	251641	251646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501765
4534	NC_014251	TAC	2	6	251684	251689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501765
4535	NC_014251	TGT	2	6	251809	251814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501765
4536	NC_014251	TCA	2	6	251930	251935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501766
4537	NC_014251	TCT	2	6	252059	252064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501766
4538	NC_014251	CCTAA	2	10	252418	252427	40 %	20 %	0 %	40 %	298501767
4539	NC_014251	ATCTTC	2	12	252428	252439	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	298501767
4540	NC_014251	CCGTT	2	10	252523	252532	0 %	40 %	20 %	40 %	298501767
4541	NC_014251	GTT	2	6	252555	252560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501767
4542	NC_014251	T	6	6	252559	252564	0 %	100 %	0 %	0 %	298501767
4543	NC_014251	ATTT	2	8	252643	252650	25 %	75 %	0 %	0 %	298501767
4544	NC_014251	ATCGTT	2	12	252731	252742	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	298501767
4545	NC_014251	T	6	6	252760	252765	0 %	100 %	0 %	0 %	298501767
4546	NC_014251	AGC	2	6	252834	252839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501767
4547	NC_014251	TTCT	2	8	252878	252885	0 %	75 %	0 %	25 %	298501767
4548	NC_014251	ACC	2	6	252931	252936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501767
4549	NC_014251	T	7	7	253021	253027	0 %	100 %	0 %	0 %	298501767
4550	NC_014251	ATC	2	6	253100	253105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501767
4551	NC_014251	TTCC	2	8	253123	253130	0 %	50 %	0 %	50 %	298501767
4552	NC_014251	ATT	2	6	253235	253240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501767
4553	NC_014251	CTT	2	6	253327	253332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501767
4554	NC_014251	ATCAAA	2	12	253364	253375	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	298501767
4555	NC_014251	AT	3	6	253506	253511	50 %	50 %	0 %	0 %	298501767
4556	NC_014251	GGT	2	6	253527	253532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501767
4557	NC_014251	TTTC	2	8	253790	253797	0 %	75 %	0 %	25 %	298501767
4558	NC_014251	CTA	2	6	253854	253859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501767
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4560	NC_014251	CT	3	6	253895	253900	0 %	50 %	0 %	50 %	298501767
4561	NC_014251	TTC	2	6	253934	253939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501767
4562	NC_014251	CT	3	6	253958	253963	0 %	50 %	0 %	50 %	298501767
4563	NC_014251	CTC	2	6	254007	254012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501768
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4566	NC_014251	AAT	2	6	254172	254177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501768
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4568	NC_014251	TGT	2	6	254316	254321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501768
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4570	NC_014251	TCA	2	6	254426	254431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501768
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4573	NC_014251	CTATG	2	10	254471	254480	20 %	40 %	20 %	20 %	298501768
4574	NC_014251	CAAA	2	8	254513	254520	75 %	0 %	0 %	25 %	298501768
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4579	NC_014251	TCAT	2	8	254810	254817	25 %	50 %	0 %	25 %	298501768
4580	NC_014251	CGG	2	6	254879	254884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298501769
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4590	NC_014251	CGCT	2	8	255462	255469	0 %	25 %	25 %	50 %	298501771
4591	NC_014251	CAA	2	6	255562	255567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501771
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4594	NC_014251	TCCC	2	8	255695	255702	0 %	25 %	0 %	75 %	298501772
4595	NC_014251	AT	3	6	255727	255732	50 %	50 %	0 %	0 %	298501772
4596	NC_014251	T	7	7	255806	255812	0 %	100 %	0 %	0 %	298501772
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4598	NC_014251	TAAA	2	8	255828	255835	75 %	25 %	0 %	0 %	298501772
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4601	NC_014251	TTCA	2	8	255894	255901	25 %	50 %	0 %	25 %	298501772
4602	NC_014251	TCC	2	6	255908	255913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501773
4603	NC_014251	TG	3	6	256001	256006	0 %	50 %	50 %	0 %	298501773
4604	NC_014251	TCTTT	2	10	256032	256041	0 %	80 %	0 %	20 %	298501773
4605	NC_014251	ATC	2	6	256117	256122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501773
4606	NC_014251	TCT	2	6	256148	256153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501773
4607	NC_014251	GTC	2	6	256182	256187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501774
4608	NC_014251	TCTA	2	8	256209	256216	25 %	50 %	0 %	25 %	298501774
4609	NC_014251	A	6	6	256216	256221	100 %	0 %	0 %	0 %	298501774
4610	NC_014251	TGA	2	6	256226	256231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501774
4611	NC_014251	TCA	2	6	256276	256281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501774
4612	NC_014251	CATTG	2	10	256317	256326	20 %	40 %	20 %	20 %	298501774
4613	NC_014251	CCT	2	6	256327	256332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501775
4614	NC_014251	AATC	2	8	256333	256340	50 %	25 %	0 %	25 %	298501775
4615	NC_014251	TA	3	6	256354	256359	50 %	50 %	0 %	0 %	298501775
4616	NC_014251	T	6	6	256392	256397	0 %	100 %	0 %	0 %	298501775
4617	NC_014251	T	6	6	256403	256408	0 %	100 %	0 %	0 %	298501775
4618	NC_014251	CATA	2	8	256437	256444	50 %	25 %	0 %	25 %	298501775
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4621	NC_014251	AAGAA	2	10	256512	256521	80 %	0 %	20 %	0 %	298501775
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4991	NC_014251	TCG	2	6	277890	277895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501803
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