MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 chromosome

Total Repeats: 37029

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014220	T	7	7	234293	234299	0 %	100 %	0 %	0 %	297616427
3502	NC_014220	GC	3	6	234312	234317	0 %	0 %	50 %	50 %	297616427
3503	NC_014220	CCA	2	6	234361	234366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616427
3504	NC_014220	GCT	2	6	234378	234383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616427
3505	NC_014220	TCC	2	6	234431	234436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616427
3506	NC_014220	T	6	6	234455	234460	0 %	100 %	0 %	0 %	297616427
3507	NC_014220	TCA	2	6	234544	234549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616427
3508	NC_014220	ATA	2	6	235620	235625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616428
3509	NC_014220	CTG	2	6	235650	235655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616428
3510	NC_014220	AGT	2	6	235706	235711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616428
3511	NC_014220	GAA	2	6	235716	235721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616428
3512	NC_014220	TGGACC	2	12	235729	235740	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	297616428
3513	NC_014220	TCT	2	6	235765	235770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616428
3514	NC_014220	TCG	2	6	235822	235827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616428
3515	NC_014220	TAA	2	6	235864	235869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616428
3516	NC_014220	TCG	2	6	235909	235914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616428
3517	NC_014220	T	6	6	235922	235927	0 %	100 %	0 %	0 %	297616428
3518	NC_014220	CTT	2	6	235971	235976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616428
3519	NC_014220	TTTC	2	8	235977	235984	0 %	75 %	0 %	25 %	297616428
3520	NC_014220	GGGC	2	8	235995	236002	0 %	0 %	75 %	25 %	297616428
3521	NC_014220	TCG	2	6	236055	236060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616429
3522	NC_014220	CTG	2	6	236063	236068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616429
3523	NC_014220	AG	3	6	236096	236101	50 %	0 %	50 %	0 %	297616429
3524	NC_014220	GCG	2	6	236199	236204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616429
3525	NC_014220	GGC	2	6	236252	236257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616429
3526	NC_014220	GTG	2	6	236325	236330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616429
3527	NC_014220	CTA	2	6	236377	236382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616429
3528	NC_014220	GGCCA	2	10	236384	236393	20 %	0 %	40 %	40 %	297616429
3529	NC_014220	GCCA	2	8	236406	236413	25 %	0 %	25 %	50 %	297616429
3530	NC_014220	AT	3	6	236422	236427	50 %	50 %	0 %	0 %	297616429
3531	NC_014220	AGGCC	2	10	236470	236479	20 %	0 %	40 %	40 %	297616429
3532	NC_014220	GTA	2	6	236501	236506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616429
3533	NC_014220	GAC	2	6	236639	236644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616429
3534	NC_014220	AGC	2	6	236646	236651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616429
3535	NC_014220	AGGAAA	2	12	236652	236663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616429
3536	NC_014220	GCC	2	6	236808	236813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616429
3537	NC_014220	A	6	6	236983	236988	100 %	0 %	0 %	0 %	297616429
3538	NC_014220	CCA	2	6	237058	237063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616429
3539	NC_014220	AGC	2	6	237134	237139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616429
3540	NC_014220	ATT	2	6	237150	237155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616429
3541	NC_014220	GCCA	2	8	237177	237184	25 %	0 %	25 %	50 %	297616429
3542	NC_014220	CCT	2	6	237235	237240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616429
3543	NC_014220	CGGT	2	8	237285	237292	0 %	25 %	50 %	25 %	297616429
3544	NC_014220	GCC	2	6	237309	237314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616429
3545	NC_014220	TGA	2	6	237334	237339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616429
3546	NC_014220	GAC	2	6	237350	237355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616429
3547	NC_014220	CCAG	2	8	237374	237381	25 %	0 %	25 %	50 %	297616429
3548	NC_014220	GGCA	2	8	237429	237436	25 %	0 %	50 %	25 %	297616429
3549	NC_014220	GGT	2	6	237605	237610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616429
3550	NC_014220	CAGG	2	8	237653	237660	25 %	0 %	50 %	25 %	297616429
3551	NC_014220	AGG	2	6	237669	237674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616429
3552	NC_014220	GCA	2	6	237712	237717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616429
3553	NC_014220	CCGTAG	2	12	237738	237749	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	297616429
3554	NC_014220	TTTCCC	2	12	237781	237792	0 %	50 %	0 %	50 %	297616429
3555	NC_014220	GTA	2	6	237801	237806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616429
3556	NC_014220	AGG	2	6	237816	237821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616429
3557	NC_014220	CTG	2	6	237827	237832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616429
3558	NC_014220	AGG	2	6	237858	237863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616429
3559	NC_014220	AAG	2	6	237864	237869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616429
3560	NC_014220	GCGG	2	8	237893	237900	0 %	0 %	75 %	25 %	297616429
3561	NC_014220	CTG	2	6	237972	237977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616429
3562	NC_014220	GGC	2	6	237986	237991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616429
3563	NC_014220	GAT	2	6	238058	238063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616429
3564	NC_014220	CCCCG	2	10	238086	238095	0 %	0 %	20 %	80 %	297616429
3565	NC_014220	CGG	2	6	238098	238103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616429
3566	NC_014220	TCT	2	6	238143	238148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616429
3567	NC_014220	CGG	2	6	238177	238182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616429
3568	NC_014220	ACC	2	6	238191	238196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616429
3569	NC_014220	ATT	2	6	238227	238232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616429
3570	NC_014220	GCA	2	6	238372	238377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616429
3571	NC_014220	CCTC	2	8	238436	238443	0 %	25 %	0 %	75 %	297616430
3572	NC_014220	GAA	2	6	238495	238500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616430
3573	NC_014220	TCT	2	6	238583	238588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616430
3574	NC_014220	CGGT	2	8	238592	238599	0 %	25 %	50 %	25 %	297616430
3575	NC_014220	GAT	2	6	238648	238653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616430
3576	NC_014220	GTC	2	6	238690	238695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616430
3577	NC_014220	AGG	3	9	238697	238705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616430
3578	NC_014220	CAGGC	2	10	238730	238739	20 %	0 %	40 %	40 %	297616430
3579	NC_014220	CGG	2	6	238778	238783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616430
3580	NC_014220	CTC	2	6	238807	238812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616430
3581	NC_014220	TCA	2	6	238860	238865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616430
3582	NC_014220	CCG	2	6	238942	238947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616430
3583	NC_014220	GAG	2	6	238981	238986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616430
3584	NC_014220	ACT	2	6	239143	239148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616430
3585	NC_014220	TACT	2	8	239212	239219	25 %	50 %	0 %	25 %	297616431
3586	NC_014220	CGC	2	6	239311	239316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616431
3587	NC_014220	CGA	2	6	239395	239400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616431
3588	NC_014220	GTT	2	6	239525	239530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616431
3589	NC_014220	TCG	2	6	239547	239552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616431
3590	NC_014220	GCG	2	6	239586	239591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616431
3591	NC_014220	CGT	2	6	239596	239601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616431
3592	NC_014220	GGC	2	6	239648	239653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616431
3593	NC_014220	CG	3	6	239670	239675	0 %	0 %	50 %	50 %	297616431
3594	NC_014220	TTCGGC	2	12	239690	239701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616431
3595	NC_014220	GGT	2	6	239762	239767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616431
3596	NC_014220	GCT	2	6	239805	239810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616431
3597	NC_014220	CTT	2	6	239815	239820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616431
3598	NC_014220	GCC	2	6	239889	239894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616431
3599	NC_014220	CTG	2	6	240081	240086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616431
3600	NC_014220	CAG	2	6	240089	240094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616431
3601	NC_014220	GTC	2	6	240126	240131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616431
3602	NC_014220	TGTA	2	8	240184	240191	25 %	50 %	25 %	0 %	297616431
3603	NC_014220	AAT	2	6	240379	240384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616432
3604	NC_014220	CGTG	2	8	240397	240404	0 %	25 %	50 %	25 %	297616432
3605	NC_014220	GCTG	2	8	240472	240479	0 %	25 %	50 %	25 %	297616432
3606	NC_014220	TGG	2	6	240552	240557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616432
3607	NC_014220	ACA	2	6	240582	240587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616432
3608	NC_014220	GCA	3	9	240759	240767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616432
3609	NC_014220	GAG	2	6	240791	240796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616432
3610	NC_014220	AGC	2	6	240884	240889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616433
3611	NC_014220	GAA	2	6	240923	240928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616433
3612	NC_014220	GAG	2	6	240937	240942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616433
3613	NC_014220	AGT	2	6	240978	240983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616433
3614	NC_014220	AAT	2	6	241041	241046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616433
3615	NC_014220	GA	3	6	241050	241055	50 %	0 %	50 %	0 %	297616433
3616	NC_014220	AAAC	2	8	241068	241075	75 %	0 %	0 %	25 %	297616433
3617	NC_014220	GAT	2	6	241147	241152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616433
3618	NC_014220	TTC	2	6	241203	241208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616433
3619	NC_014220	GAAA	2	8	241412	241419	75 %	0 %	25 %	0 %	297616434
3620	NC_014220	GC	3	6	241431	241436	0 %	0 %	50 %	50 %	297616434
3621	NC_014220	AAT	2	6	241446	241451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616434
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3731	NC_014220	CTG	2	6	248747	248752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616440
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3744	NC_014220	ACT	2	6	249653	249658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616443
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3749	NC_014220	GTA	2	6	249860	249865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616443
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3851	NC_014220	ATCT	2	8	255923	255930	25 %	50 %	0 %	25 %	297616450
3852	NC_014220	TGG	2	6	255948	255953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616450
3853	NC_014220	ACGGG	2	10	255954	255963	20 %	0 %	60 %	20 %	297616450
3854	NC_014220	AT	3	6	255984	255989	50 %	50 %	0 %	0 %	297616450
3855	NC_014220	GGC	2	6	256018	256023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616450
3856	NC_014220	GAC	2	6	256199	256204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616451
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3859	NC_014220	TGTGGG	2	12	256321	256332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616451
3860	NC_014220	ACCTG	2	10	256388	256397	20 %	20 %	20 %	40 %	297616451
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3862	NC_014220	CCT	2	6	256622	256627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616451
3863	NC_014220	CAT	3	9	256628	256636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616451
3864	NC_014220	GCA	3	9	256642	256650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616451
3865	NC_014220	GCT	2	6	256794	256799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616451
3866	NC_014220	GTTT	2	8	256826	256833	0 %	75 %	25 %	0 %	297616451
3867	NC_014220	CTG	2	6	256921	256926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616451
3868	NC_014220	A	7	7	256953	256959	100 %	0 %	0 %	0 %	297616451
3869	NC_014220	AGC	2	6	257009	257014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616451
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3873	NC_014220	TCGCT	2	10	257341	257350	0 %	40 %	20 %	40 %	297616451
3874	NC_014220	TCG	2	6	257395	257400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616451
3875	NC_014220	TGG	2	6	257560	257565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616451
3876	NC_014220	TCG	2	6	257584	257589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616451
3877	NC_014220	TGGGAG	2	12	257629	257640	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	297616451
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3888	NC_014220	CAGTA	2	10	258223	258232	40 %	20 %	20 %	20 %	297616452
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3892	NC_014220	T	6	6	258385	258390	0 %	100 %	0 %	0 %	297616452
3893	NC_014220	GGC	3	9	258406	258414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616452
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3896	NC_014220	TGG	2	6	258477	258482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616452
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3899	NC_014220	CTG	2	6	258693	258698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616452
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3902	NC_014220	TGA	2	6	258774	258779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616452
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3923	NC_014220	CG	3	6	260624	260629	0 %	0 %	50 %	50 %	297616453
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3971	NC_014220	G	6	6	263559	263564	0 %	0 %	100 %	0 %	297616456
3972	NC_014220	TGGTTT	2	12	263589	263600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616456
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3974	NC_014220	AGA	2	6	263640	263645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616456
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3978	NC_014220	TTTCT	2	10	263848	263857	0 %	80 %	0 %	20 %	297616456
3979	NC_014220	ATGA	2	8	263915	263922	50 %	25 %	25 %	0 %	297616456
3980	NC_014220	TTA	2	6	263967	263972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616456
3981	NC_014220	TTTG	2	8	264030	264037	0 %	75 %	25 %	0 %	297616456
3982	NC_014220	GTT	2	6	264088	264093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616456
3983	NC_014220	GTTTG	2	10	264148	264157	0 %	60 %	40 %	0 %	297616456
3984	NC_014220	CCG	2	6	264246	264251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616456
3985	NC_014220	CCA	2	6	264309	264314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616456
3986	NC_014220	GTT	2	6	264346	264351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616456
3987	NC_014220	CGA	2	6	264414	264419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616456
3988	NC_014220	GCAAA	2	10	264796	264805	60 %	0 %	20 %	20 %	297616457
3989	NC_014220	AG	3	6	264851	264856	50 %	0 %	50 %	0 %	297616457
3990	NC_014220	GGC	2	6	264921	264926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616457
3991	NC_014220	CCA	2	6	264981	264986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616457
3992	NC_014220	CAT	2	6	265075	265080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616457
3993	NC_014220	GCG	2	6	265090	265095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616457
3994	NC_014220	GGCT	2	8	265209	265216	0 %	25 %	50 %	25 %	297616457
3995	NC_014220	GGT	2	6	265303	265308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616457
3996	NC_014220	GTT	3	9	265390	265398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616457
3997	NC_014220	CGC	2	6	265438	265443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616457
3998	NC_014220	CGGTGG	2	12	265455	265466	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	297616457
3999	NC_014220	GCAG	2	8	265497	265504	25 %	0 %	50 %	25 %	297616457
4000	NC_014220	TTGC	2	8	265519	265526	0 %	50 %	25 %	25 %	297616457

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