MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 chromosome

Total Repeats: 37029

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_014220	GCC	2	6	141377	141382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616338
2003	NC_014220	AGA	3	9	141403	141411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616338
2004	NC_014220	GAA	3	9	141476	141484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616338
2005	NC_014220	CTGG	2	8	141515	141522	0 %	25 %	50 %	25 %	297616338
2006	NC_014220	TGCC	2	8	141574	141581	0 %	25 %	25 %	50 %	297616338
2007	NC_014220	CAT	2	6	141598	141603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616338
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2009	NC_014220	GGT	2	6	141646	141651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616338
2010	NC_014220	GGT	3	9	141670	141678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616338
2011	NC_014220	GAT	2	6	141736	141741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616338
2012	NC_014220	AGA	2	6	141742	141747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616338
2013	NC_014220	CAT	3	9	141799	141807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616338
2014	NC_014220	GAA	2	6	141839	141844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616338
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2017	NC_014220	TGG	2	6	142177	142182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616339
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2053	NC_014220	GAAA	2	8	144169	144176	75 %	0 %	25 %	0 %	297616342
2054	NC_014220	A	6	6	144174	144179	100 %	0 %	0 %	0 %	297616342
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2105	NC_014220	CGGT	2	8	146892	146899	0 %	25 %	50 %	25 %	297616345
2106	NC_014220	ATC	2	6	146921	146926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616345
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2114	NC_014220	GGA	2	6	147413	147418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616346
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2122	NC_014220	GTTC	2	8	147890	147897	0 %	50 %	25 %	25 %	297616346
2123	NC_014220	CCG	2	6	147932	147937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616346
2124	NC_014220	ACC	2	6	148015	148020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616346
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2131	NC_014220	GCA	2	6	148573	148578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616346
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2143	NC_014220	GA	3	6	149300	149305	50 %	0 %	50 %	0 %	297616347
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2154	NC_014220	TGC	2	6	150005	150010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616348
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2227	NC_014220	AGTG	2	8	154531	154538	25 %	25 %	50 %	0 %	297616353
2228	NC_014220	TCA	2	6	154650	154655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616353
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2232	NC_014220	GC	3	6	154766	154771	0 %	0 %	50 %	50 %	297616353
2233	NC_014220	CAG	2	6	154829	154834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616353
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2236	NC_014220	ATACCT	2	12	154973	154984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616353
2237	NC_014220	GCTC	2	8	154989	154996	0 %	25 %	25 %	50 %	297616353
2238	NC_014220	ATC	2	6	155033	155038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616353
2239	NC_014220	ATT	2	6	155112	155117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616353
2240	NC_014220	GCT	2	6	155374	155379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616353
2241	NC_014220	TTG	2	6	155520	155525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616354
2242	NC_014220	GCTC	2	8	155549	155556	0 %	25 %	25 %	50 %	297616354
2243	NC_014220	ACT	2	6	155624	155629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616354
2244	NC_014220	G	7	7	155721	155727	0 %	0 %	100 %	0 %	297616354
2245	NC_014220	AGGA	2	8	155845	155852	50 %	0 %	50 %	0 %	297616354
2246	NC_014220	CGGTA	2	10	155859	155868	20 %	20 %	40 %	20 %	297616354
2247	NC_014220	TGGT	2	8	155880	155887	0 %	50 %	50 %	0 %	297616354
2248	NC_014220	GAA	2	6	155929	155934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616354
2249	NC_014220	GCA	2	6	156102	156107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616354
2250	NC_014220	GGCAA	2	10	156114	156123	40 %	0 %	40 %	20 %	297616354
2251	NC_014220	ATA	2	6	156135	156140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616354
2252	NC_014220	CTC	2	6	156169	156174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616354
2253	NC_014220	GTT	2	6	156233	156238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616354
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2256	NC_014220	TTC	2	6	156444	156449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616354
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2264	NC_014220	CGGC	2	8	157040	157047	0 %	0 %	50 %	50 %	297616355
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2270	NC_014220	ATC	2	6	157622	157627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616356
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2276	NC_014220	CACC	2	8	157726	157733	25 %	0 %	0 %	75 %	297616356
2277	NC_014220	CGG	2	6	157801	157806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616356
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2350	NC_014220	CAG	2	6	162815	162820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616360
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2353	NC_014220	GAA	2	6	162993	162998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616360
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2365	NC_014220	GCTC	2	8	163423	163430	0 %	25 %	25 %	50 %	297616360
2366	NC_014220	CTT	2	6	163489	163494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616360
2367	NC_014220	TA	3	6	163598	163603	50 %	50 %	0 %	0 %	297616360
2368	NC_014220	GAA	2	6	163606	163611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616360
2369	NC_014220	GGCTCT	2	12	163678	163689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616360
2370	NC_014220	ATA	2	6	163691	163696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616360
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2463	NC_014220	CCCA	2	8	170273	170280	25 %	0 %	0 %	75 %	297616366
2464	NC_014220	TCA	2	6	170283	170288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616366
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2471	NC_014220	TGA	2	6	170673	170678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616366
2472	NC_014220	CAT	2	6	170752	170757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616366
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2483	NC_014220	GGC	2	6	171420	171425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616366
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2485	NC_014220	GAG	2	6	171447	171452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616366
2486	NC_014220	TCGC	2	8	171527	171534	0 %	25 %	25 %	50 %	297616366
2487	NC_014220	GCCATG	2	12	171536	171547	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	297616366
2488	NC_014220	TGG	2	6	171570	171575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616366
2489	NC_014220	TGTCC	2	10	171591	171600	0 %	40 %	20 %	40 %	297616366
2490	NC_014220	TGGCAG	2	12	171639	171650	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	297616366
2491	NC_014220	CCT	2	6	171684	171689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616366
2492	NC_014220	GCG	2	6	171728	171733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616366
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2496	NC_014220	CCG	2	6	172113	172118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616366
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