MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 chromosome

Total Repeats: 37029

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014220	GAA	2	6	107478	107483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616306
1502	NC_014220	T	9	9	107808	107816	0 %	100 %	0 %	0 %	297616307
1503	NC_014220	GAA	2	6	107856	107861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616307
1504	NC_014220	GCG	2	6	107933	107938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616307
1505	NC_014220	TGG	2	6	107986	107991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616307
1506	NC_014220	T	6	6	108096	108101	0 %	100 %	0 %	0 %	297616307
1507	NC_014220	CGG	2	6	108119	108124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616307
1508	NC_014220	GCA	2	6	108178	108183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616307
1509	NC_014220	GCT	2	6	108192	108197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616307
1510	NC_014220	G	6	6	108299	108304	0 %	0 %	100 %	0 %	297616307
1511	NC_014220	GA	3	6	108328	108333	50 %	0 %	50 %	0 %	297616307
1512	NC_014220	AAG	3	9	108646	108654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616307
1513	NC_014220	TAT	2	6	108825	108830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616308
1514	NC_014220	ATG	2	6	108859	108864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616308
1515	NC_014220	AAC	2	6	108881	108886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616308
1516	NC_014220	GA	3	6	108909	108914	50 %	0 %	50 %	0 %	297616308
1517	NC_014220	GCC	2	6	109042	109047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616308
1518	NC_014220	GGC	2	6	109053	109058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616308
1519	NC_014220	GAA	2	6	109075	109080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616308
1520	NC_014220	GGA	2	6	109083	109088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616308
1521	NC_014220	GTT	2	6	109098	109103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616308
1522	NC_014220	GAA	2	6	109141	109146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616308
1523	NC_014220	GTG	2	6	109147	109152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616308
1524	NC_014220	CTT	2	6	109259	109264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616308
1525	NC_014220	AAG	2	6	109286	109291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616308
1526	NC_014220	GAA	2	6	109297	109302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616308
1527	NC_014220	AAG	2	6	109306	109311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616308
1528	NC_014220	TGCA	2	8	109448	109455	25 %	25 %	25 %	25 %	297616309
1529	NC_014220	G	7	7	109481	109487	0 %	0 %	100 %	0 %	297616309
1530	NC_014220	TAC	2	6	109565	109570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616309
1531	NC_014220	AAG	2	6	109652	109657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616309
1532	NC_014220	AAC	2	6	109661	109666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616309
1533	NC_014220	GTACTG	2	12	109754	109765	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	297616309
1534	NC_014220	GAT	2	6	109802	109807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616309
1535	NC_014220	GAA	2	6	109829	109834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616309
1536	NC_014220	T	8	8	109840	109847	0 %	100 %	0 %	0 %	297616309
1537	NC_014220	AAG	2	6	109917	109922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616309
1538	NC_014220	TG	3	6	109976	109981	0 %	50 %	50 %	0 %	297616309
1539	NC_014220	CGC	2	6	110006	110011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616309
1540	NC_014220	GGGC	2	8	110129	110136	0 %	0 %	75 %	25 %	297616309
1541	NC_014220	CTGG	2	8	110191	110198	0 %	25 %	50 %	25 %	297616309
1542	NC_014220	GTG	2	6	110401	110406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616310
1543	NC_014220	AAC	2	6	110420	110425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616310
1544	NC_014220	AGC	2	6	110474	110479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616310
1545	NC_014220	CTC	2	6	110558	110563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616310
1546	NC_014220	TTC	2	6	110564	110569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616310
1547	NC_014220	GGA	2	6	110666	110671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616310
1548	NC_014220	GAG	2	6	110710	110715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616310
1549	NC_014220	TGA	2	6	110745	110750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616310
1550	NC_014220	TAC	2	6	110836	110841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616310
1551	NC_014220	TGA	2	6	110861	110866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616310
1552	NC_014220	AGA	2	6	110910	110915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616310
1553	NC_014220	A	6	6	110976	110981	100 %	0 %	0 %	0 %	297616310
1554	NC_014220	TGA	2	6	110990	110995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616310
1555	NC_014220	ATG	2	6	111010	111015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616310
1556	NC_014220	GCA	2	6	111110	111115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616310
1557	NC_014220	AG	3	6	111177	111182	50 %	0 %	50 %	0 %	297616310
1558	NC_014220	AT	3	6	111237	111242	50 %	50 %	0 %	0 %	297616310
1559	NC_014220	AG	3	6	111263	111268	50 %	0 %	50 %	0 %	297616310
1560	NC_014220	AAG	2	6	111298	111303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616310
1561	NC_014220	CGA	2	6	111312	111317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616310
1562	NC_014220	GCA	2	6	111320	111325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616310
1563	NC_014220	A	6	6	111414	111419	100 %	0 %	0 %	0 %	297616310
1564	NC_014220	CGGG	2	8	111492	111499	0 %	0 %	75 %	25 %	297616310
1565	NC_014220	CGA	2	6	111521	111526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616310
1566	NC_014220	CCT	2	6	111541	111546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616310
1567	NC_014220	A	7	7	111575	111581	100 %	0 %	0 %	0 %	297616310
1568	NC_014220	ACG	2	6	111617	111622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616310
1569	NC_014220	GGA	2	6	111666	111671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616311
1570	NC_014220	CG	3	6	111907	111912	0 %	0 %	50 %	50 %	297616311
1571	NC_014220	GTA	2	6	112031	112036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616311
1572	NC_014220	T	6	6	112070	112075	0 %	100 %	0 %	0 %	297616311
1573	NC_014220	CTG	2	6	112094	112099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616311
1574	NC_014220	CCA	2	6	112107	112112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616311
1575	NC_014220	GGT	2	6	112153	112158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616311
1576	NC_014220	G	7	7	112175	112181	0 %	0 %	100 %	0 %	297616311
1577	NC_014220	TAT	2	6	112228	112233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616311
1578	NC_014220	ATC	2	6	112307	112312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616311
1579	NC_014220	GGA	2	6	112334	112339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616311
1580	NC_014220	TGAC	2	8	112365	112372	25 %	25 %	25 %	25 %	297616311
1581	NC_014220	GTA	2	6	112377	112382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616311
1582	NC_014220	TGC	2	6	112397	112402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616311
1583	NC_014220	GCCA	2	8	112423	112430	25 %	0 %	25 %	50 %	297616311
1584	NC_014220	GAGG	2	8	112441	112448	25 %	0 %	75 %	0 %	297616311
1585	NC_014220	TCC	2	6	112489	112494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616311
1586	NC_014220	GAA	2	6	112498	112503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616311
1587	NC_014220	ATA	2	6	112553	112558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616311
1588	NC_014220	TTGA	2	8	112593	112600	25 %	50 %	25 %	0 %	297616311
1589	NC_014220	TGG	3	9	112740	112748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616312
1590	NC_014220	CCG	2	6	112759	112764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616312
1591	NC_014220	TGGCT	2	10	112806	112815	0 %	40 %	40 %	20 %	297616312
1592	NC_014220	GGT	3	9	112834	112842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616312
1593	NC_014220	AT	3	6	112858	112863	50 %	50 %	0 %	0 %	297616312
1594	NC_014220	AGC	2	6	113024	113029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616312
1595	NC_014220	C	6	6	113075	113080	0 %	0 %	0 %	100 %	297616312
1596	NC_014220	GCGA	2	8	113123	113130	25 %	0 %	50 %	25 %	297616312
1597	NC_014220	AGGGC	2	10	113188	113197	20 %	0 %	60 %	20 %	297616312
1598	NC_014220	TGT	2	6	113325	113330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616313
1599	NC_014220	GAAGGT	2	12	113358	113369	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	297616313
1600	NC_014220	GAG	2	6	113406	113411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616313
1601	NC_014220	GGC	2	6	113415	113420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616313
1602	NC_014220	ATTT	2	8	113428	113435	25 %	75 %	0 %	0 %	297616313
1603	NC_014220	AGT	2	6	113442	113447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616313
1604	NC_014220	CTGAGC	2	12	113462	113473	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	297616313
1605	NC_014220	T	8	8	114022	114029	0 %	100 %	0 %	0 %	297616314
1606	NC_014220	GAG	2	6	114082	114087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616314
1607	NC_014220	TCCC	2	8	114150	114157	0 %	25 %	0 %	75 %	297616314
1608	NC_014220	AGGG	2	8	114180	114187	25 %	0 %	75 %	0 %	297616314
1609	NC_014220	TC	3	6	114280	114285	0 %	50 %	0 %	50 %	297616314
1610	NC_014220	A	6	6	114362	114367	100 %	0 %	0 %	0 %	297616314
1611	NC_014220	TGG	2	6	114380	114385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616314
1612	NC_014220	GGT	2	6	114408	114413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616314
1613	NC_014220	GACC	2	8	114414	114421	25 %	0 %	25 %	50 %	297616314
1614	NC_014220	G	7	7	114442	114448	0 %	0 %	100 %	0 %	297616314
1615	NC_014220	G	6	6	114588	114593	0 %	0 %	100 %	0 %	297616314
1616	NC_014220	GCT	2	6	114610	114615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616314
1617	NC_014220	T	7	7	114650	114656	0 %	100 %	0 %	0 %	297616314
1618	NC_014220	AGG	2	6	114707	114712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616314
1619	NC_014220	T	6	6	114825	114830	0 %	100 %	0 %	0 %	297616314
1620	NC_014220	AT	3	6	114872	114877	50 %	50 %	0 %	0 %	297616314
1621	NC_014220	T	6	6	114898	114903	0 %	100 %	0 %	0 %	297616314
1622	NC_014220	GAA	2	6	114990	114995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616314
1623	NC_014220	GGA	2	6	115005	115010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616314
1624	NC_014220	GGA	2	6	115133	115138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616314
1625	NC_014220	GCAG	2	8	115300	115307	25 %	0 %	50 %	25 %	297616314
1626	NC_014220	CCTG	2	8	115320	115327	0 %	25 %	25 %	50 %	297616314
1627	NC_014220	TGA	2	6	115365	115370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616314
1628	NC_014220	G	6	6	115396	115401	0 %	0 %	100 %	0 %	297616314
1629	NC_014220	CGG	2	6	115565	115570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616314
1630	NC_014220	A	7	7	115596	115602	100 %	0 %	0 %	0 %	297616314
1631	NC_014220	CGC	2	6	115613	115618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616314
1632	NC_014220	CCTG	2	8	115763	115770	0 %	25 %	25 %	50 %	297616314
1633	NC_014220	CAG	2	6	115831	115836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616314
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1640	NC_014220	ACC	2	6	116240	116245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616314
1641	NC_014220	CGGG	2	8	116286	116293	0 %	0 %	75 %	25 %	297616314
1642	NC_014220	CAC	2	6	116361	116366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616314
1643	NC_014220	GGCT	2	8	116435	116442	0 %	25 %	50 %	25 %	297616314
1644	NC_014220	AG	3	6	116560	116565	50 %	0 %	50 %	0 %	297616314
1645	NC_014220	AGC	2	6	116645	116650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616314
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1647	NC_014220	GAA	2	6	116698	116703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616314
1648	NC_014220	CTG	2	6	116752	116757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616314
1649	NC_014220	CGA	2	6	116784	116789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616314
1650	NC_014220	CGA	2	6	116862	116867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616314
1651	NC_014220	CTG	2	6	116923	116928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616314
1652	NC_014220	GT	3	6	116947	116952	0 %	50 %	50 %	0 %	297616314
1653	NC_014220	CAAC	2	8	116981	116988	50 %	0 %	0 %	50 %	297616314
1654	NC_014220	GCC	2	6	117034	117039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616314
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1662	NC_014220	A	7	7	118146	118152	100 %	0 %	0 %	0 %	297616316
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1664	NC_014220	CAGT	2	8	118196	118203	25 %	25 %	25 %	25 %	297616316
1665	NC_014220	AGG	2	6	118248	118253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616316
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1682	NC_014220	CTG	2	6	119338	119343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616316
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1729	NC_014220	ATG	2	6	122724	122729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616323
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1735	NC_014220	GTCAAG	2	12	122979	122990	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	297616324
1736	NC_014220	TGTC	2	8	123025	123032	0 %	50 %	25 %	25 %	297616324
1737	NC_014220	GGA	2	6	123086	123091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616324
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1742	NC_014220	CCT	2	6	123422	123427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616325
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1744	NC_014220	GAA	2	6	123573	123578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616325
1745	NC_014220	GA	3	6	123746	123751	50 %	0 %	50 %	0 %	297616325
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1865	NC_014220	CT	3	6	132796	132801	0 %	50 %	0 %	50 %	297616332
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1985	NC_014220	GCC	2	6	140503	140508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616337
1986	NC_014220	CGGAG	2	10	140592	140601	20 %	0 %	60 %	20 %	297616337
1987	NC_014220	CAACGA	2	12	140634	140645	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	297616337
1988	NC_014220	CAG	2	6	140688	140693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616337
1989	NC_014220	T	6	6	140703	140708	0 %	100 %	0 %	0 %	297616337
1990	NC_014220	GCT	2	6	140774	140779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616337
1991	NC_014220	GA	3	6	140947	140952	50 %	0 %	50 %	0 %	297616338
1992	NC_014220	CGA	2	6	140962	140967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616338
1993	NC_014220	GATG	2	8	140979	140986	25 %	25 %	50 %	0 %	297616338
1994	NC_014220	GCG	2	6	141075	141080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616338
1995	NC_014220	AGC	2	6	141082	141087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616338
1996	NC_014220	TCA	2	6	141165	141170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616338
1997	NC_014220	AGA	2	6	141201	141206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616338
1998	NC_014220	CGA	2	6	141211	141216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616338
1999	NC_014220	TTCT	2	8	141340	141347	0 %	75 %	0 %	25 %	297616338
2000	NC_014220	CGGA	2	8	141348	141355	25 %	0 %	50 %	25 %	297616338

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