MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 chromosome

Total Repeats: 37029

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014220	ACA	2	6	32400	32405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616239
502	NC_014220	TTTA	2	8	32445	32452	25 %	75 %	0 %	0 %	297616239
503	NC_014220	TCT	2	6	32458	32463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616239
504	NC_014220	CTT	2	6	32474	32479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616239
505	NC_014220	GAAC	2	8	32641	32648	50 %	0 %	25 %	25 %	297616240
506	NC_014220	GGC	2	6	32654	32659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616240
507	NC_014220	TAT	2	6	32752	32757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616240
508	NC_014220	CGA	2	6	32822	32827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616240
509	NC_014220	GTA	2	6	33033	33038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616240
510	NC_014220	GTT	2	6	33269	33274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616240
511	NC_014220	CCG	2	6	33528	33533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616241
512	NC_014220	GCC	2	6	33551	33556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616241
513	NC_014220	GGA	2	6	33573	33578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616241
514	NC_014220	CTT	2	6	33589	33594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616241
515	NC_014220	GGA	2	6	33595	33600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616241
516	NC_014220	GCG	2	6	33670	33675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616241
517	NC_014220	TCC	2	6	33686	33691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616241
518	NC_014220	TGG	2	6	33805	33810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616241
519	NC_014220	CCT	2	6	33876	33881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616241
520	NC_014220	TTG	2	6	33897	33902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616241
521	NC_014220	AGAC	2	8	33964	33971	50 %	0 %	25 %	25 %	297616241
522	NC_014220	CGG	2	6	34019	34024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616241
523	NC_014220	TGT	2	6	34061	34066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616241
524	NC_014220	G	6	6	34131	34136	0 %	0 %	100 %	0 %	297616241
525	NC_014220	A	7	7	34139	34145	100 %	0 %	0 %	0 %	297616241
526	NC_014220	GTT	2	6	34347	34352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616241
527	NC_014220	GTGAA	2	10	34396	34405	40 %	20 %	40 %	0 %	297616241
528	NC_014220	GCT	2	6	34407	34412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616241
529	NC_014220	TAG	2	6	34572	34577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616242
530	NC_014220	AT	3	6	34725	34730	50 %	50 %	0 %	0 %	297616242
531	NC_014220	TGG	2	6	34827	34832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616242
532	NC_014220	CAA	2	6	34846	34851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616242
533	NC_014220	GAA	2	6	34856	34861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616242
534	NC_014220	CGC	2	6	34882	34887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616242
535	NC_014220	TGC	2	6	34923	34928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616242
536	NC_014220	AAG	2	6	34943	34948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616242
537	NC_014220	GTG	2	6	34961	34966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616242
538	NC_014220	GAAC	2	8	35003	35010	50 %	0 %	25 %	25 %	297616242
539	NC_014220	GGT	2	6	35020	35025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616242
540	NC_014220	AGA	2	6	35029	35034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616242
541	NC_014220	AT	3	6	35040	35045	50 %	50 %	0 %	0 %	297616242
542	NC_014220	GAT	2	6	35048	35053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616242
543	NC_014220	ATG	2	6	35165	35170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616242
544	NC_014220	TGT	2	6	35172	35177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616242
545	NC_014220	GT	3	6	35239	35244	0 %	50 %	50 %	0 %	297616242
546	NC_014220	A	7	7	35258	35264	100 %	0 %	0 %	0 %	297616242
547	NC_014220	TTA	2	6	35356	35361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616242
548	NC_014220	ATA	2	6	35375	35380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616242
549	NC_014220	TTG	2	6	35388	35393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616242
550	NC_014220	ATG	2	6	35559	35564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616242
551	NC_014220	GT	3	6	35597	35602	0 %	50 %	50 %	0 %	297616242
552	NC_014220	AGG	2	6	35613	35618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616242
553	NC_014220	ATT	2	6	35674	35679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616243
554	NC_014220	GAA	3	9	35704	35712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616243
555	NC_014220	A	6	6	35711	35716	100 %	0 %	0 %	0 %	297616243
556	NC_014220	TCG	2	6	35827	35832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616243
557	NC_014220	GA	3	6	35998	36003	50 %	0 %	50 %	0 %	297616243
558	NC_014220	A	6	6	36104	36109	100 %	0 %	0 %	0 %	297616243
559	NC_014220	TAC	2	6	36225	36230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616243
560	NC_014220	AGG	2	6	36237	36242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616243
561	NC_014220	CGA	2	6	36255	36260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616243
562	NC_014220	AG	3	6	36307	36312	50 %	0 %	50 %	0 %	297616243
563	NC_014220	TGC	2	6	36363	36368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616243
564	NC_014220	TCA	2	6	36401	36406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616243
565	NC_014220	AG	3	6	36418	36423	50 %	0 %	50 %	0 %	297616243
566	NC_014220	CGC	2	6	36426	36431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616243
567	NC_014220	CTT	2	6	36466	36471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616243
568	NC_014220	ACC	2	6	36503	36508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616243
569	NC_014220	GCA	2	6	36549	36554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616243
570	NC_014220	TAA	2	6	36561	36566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616243
571	NC_014220	TAC	2	6	36586	36591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616243
572	NC_014220	AGC	2	6	36608	36613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616243
573	NC_014220	TA	3	6	36634	36639	50 %	50 %	0 %	0 %	297616243
574	NC_014220	CAGG	2	8	36660	36667	25 %	0 %	50 %	25 %	297616243
575	NC_014220	GGCAA	2	10	36669	36678	40 %	0 %	40 %	20 %	297616243
576	NC_014220	GTG	2	6	36679	36684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616243
577	NC_014220	GCTG	2	8	36735	36742	0 %	25 %	50 %	25 %	297616243
578	NC_014220	TAT	2	6	36888	36893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616244
579	NC_014220	TAA	2	6	37076	37081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616244
580	NC_014220	GCG	2	6	37121	37126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616244
581	NC_014220	GT	4	8	37229	37236	0 %	50 %	50 %	0 %	297616244
582	NC_014220	CCT	2	6	37618	37623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616246
583	NC_014220	GCTG	2	8	37706	37713	0 %	25 %	50 %	25 %	297616246
584	NC_014220	TGGT	2	8	37878	37885	0 %	50 %	50 %	0 %	297616246
585	NC_014220	GGTT	2	8	37896	37903	0 %	50 %	50 %	0 %	297616246
586	NC_014220	GCC	2	6	37964	37969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616246
587	NC_014220	TAA	2	6	37996	38001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616246
588	NC_014220	GAA	2	6	38003	38008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616246
589	NC_014220	TGC	2	6	38104	38109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616246
590	NC_014220	CTT	2	6	38116	38121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616246
591	NC_014220	TCC	2	6	38216	38221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616246
592	NC_014220	GGC	2	6	38246	38251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616246
593	NC_014220	GAA	2	6	38276	38281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616246
594	NC_014220	C	6	6	38284	38289	0 %	0 %	0 %	100 %	297616246
595	NC_014220	CGC	2	6	38341	38346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616246
596	NC_014220	ATC	2	6	38397	38402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616246
597	NC_014220	AACG	2	8	38480	38487	50 %	0 %	25 %	25 %	297616246
598	NC_014220	CAA	2	6	38624	38629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616246
599	NC_014220	ACA	2	6	38668	38673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616246
600	NC_014220	GTG	2	6	39509	39514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616247
601	NC_014220	CAA	2	6	39554	39559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616247
602	NC_014220	TGC	2	6	39739	39744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616247
603	NC_014220	GAT	2	6	39793	39798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616247
604	NC_014220	CGA	2	6	39832	39837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616247
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606	NC_014220	CTATC	2	10	39951	39960	20 %	40 %	0 %	40 %	297616247
607	NC_014220	CGC	2	6	39983	39988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616247
608	NC_014220	GA	3	6	40010	40015	50 %	0 %	50 %	0 %	297616247
609	NC_014220	AGA	2	6	40051	40056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616247
610	NC_014220	GCA	2	6	40092	40097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616247
611	NC_014220	TGG	2	6	40185	40190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616247
612	NC_014220	TTC	2	6	40211	40216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616247
613	NC_014220	TA	3	6	40256	40261	50 %	50 %	0 %	0 %	297616247
614	NC_014220	AAG	2	6	40284	40289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616247
615	NC_014220	GGCG	2	8	40471	40478	0 %	0 %	75 %	25 %	297616247
616	NC_014220	GCTTC	2	10	40480	40489	0 %	40 %	20 %	40 %	297616247
617	NC_014220	A	6	6	40597	40602	100 %	0 %	0 %	0 %	297616247
618	NC_014220	AAG	2	6	40772	40777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616247
619	NC_014220	GAA	2	6	40844	40849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616247
620	NC_014220	AGTTC	2	10	40870	40879	20 %	40 %	20 %	20 %	297616247
621	NC_014220	AGA	2	6	40900	40905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616247
622	NC_014220	AAGG	2	8	40918	40925	50 %	0 %	50 %	0 %	297616247
623	NC_014220	TGG	2	6	40950	40955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616247
624	NC_014220	GAT	2	6	41015	41020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616248
625	NC_014220	AAGC	2	8	41022	41029	50 %	0 %	25 %	25 %	297616248
626	NC_014220	A	6	6	41032	41037	100 %	0 %	0 %	0 %	297616248
627	NC_014220	GCA	2	6	41039	41044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616248
628	NC_014220	GAT	2	6	41048	41053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616248
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