MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 chromosome

Total Repeats: 37029

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_014220	GT	4	8	395637	395644	0 %	50 %	50 %	0 %	297616581
6003	NC_014220	CGA	2	6	395685	395690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616581
6004	NC_014220	ATG	2	6	395721	395726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616581
6005	NC_014220	AGG	2	6	395755	395760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616581
6006	NC_014220	GTG	2	6	395787	395792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616581
6007	NC_014220	CGCC	2	8	395819	395826	0 %	0 %	25 %	75 %	297616581
6008	NC_014220	GGC	2	6	395906	395911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616581
6009	NC_014220	TGG	2	6	395956	395961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616581
6010	NC_014220	T	6	6	395980	395985	0 %	100 %	0 %	0 %	297616581
6011	NC_014220	CGA	2	6	395987	395992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616581
6012	NC_014220	GTC	2	6	396066	396071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616581
6013	NC_014220	GCT	2	6	396137	396142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616581
6014	NC_014220	GGC	2	6	396227	396232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616581
6015	NC_014220	GAA	2	6	396312	396317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616581
6016	NC_014220	GCGCA	2	10	396333	396342	20 %	0 %	40 %	40 %	297616581
6017	NC_014220	GTT	2	6	396434	396439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616581
6018	NC_014220	TAT	2	6	396510	396515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616581
6019	NC_014220	AAG	2	6	396972	396977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616582
6020	NC_014220	TAA	2	6	397069	397074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616582
6021	NC_014220	G	6	6	397091	397096	0 %	0 %	100 %	0 %	297616582
6022	NC_014220	TGCG	2	8	397142	397149	0 %	25 %	50 %	25 %	297616582
6023	NC_014220	GAA	2	6	397188	397193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616582
6024	NC_014220	GGA	2	6	397205	397210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616582
6025	NC_014220	GCT	2	6	397224	397229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616582
6026	NC_014220	GCT	2	6	397242	397247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616582
6027	NC_014220	AGT	2	6	397286	397291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616582
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6030	NC_014220	CCGG	2	8	397364	397371	0 %	0 %	50 %	50 %	297616582
6031	NC_014220	GCTC	2	8	397436	397443	0 %	25 %	25 %	50 %	297616582
6032	NC_014220	GCCA	2	8	397486	397493	25 %	0 %	25 %	50 %	297616582
6033	NC_014220	AGGTG	2	10	397534	397543	20 %	20 %	60 %	0 %	297616582
6034	NC_014220	CAG	2	6	397596	397601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616582
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6036	NC_014220	TGG	2	6	397720	397725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616582
6037	NC_014220	GAGGAA	2	12	398231	398242	50 %	0 %	50 %	0 %	297616583
6038	NC_014220	ATTT	2	8	398246	398253	25 %	75 %	0 %	0 %	297616583
6039	NC_014220	GAG	2	6	398276	398281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616583
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6041	NC_014220	GGA	2	6	398353	398358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616583
6042	NC_014220	AAGG	2	8	398546	398553	50 %	0 %	50 %	0 %	297616583
6043	NC_014220	TGT	2	6	398605	398610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616583
6044	NC_014220	GAA	2	6	398627	398632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616583
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6047	NC_014220	TG	3	6	398895	398900	0 %	50 %	50 %	0 %	297616584
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6049	NC_014220	TGCCG	2	10	399131	399140	0 %	20 %	40 %	40 %	297616584
6050	NC_014220	GCG	2	6	399151	399156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616584
6051	NC_014220	GAG	2	6	399197	399202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616584
6052	NC_014220	AGT	2	6	399208	399213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616584
6053	NC_014220	GGA	2	6	399242	399247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616584
6054	NC_014220	TTC	2	6	399299	399304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616584
6055	NC_014220	CT	3	6	399375	399380	0 %	50 %	0 %	50 %	297616584
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6057	NC_014220	AAG	2	6	399757	399762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616585
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6061	NC_014220	TGT	2	6	399821	399826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616585
6062	NC_014220	ACA	2	6	399856	399861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616585
6063	NC_014220	GTG	2	6	399924	399929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616585
6064	NC_014220	TTAC	2	8	399961	399968	25 %	50 %	0 %	25 %	297616585
6065	NC_014220	AGTCG	2	10	399986	399995	20 %	20 %	40 %	20 %	297616585
6066	NC_014220	GAG	2	6	400116	400121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616585
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6070	NC_014220	TGTT	2	8	400306	400313	0 %	75 %	25 %	0 %	297616585
6071	NC_014220	GCT	2	6	400337	400342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616585
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6073	NC_014220	TTTAC	2	10	400444	400453	20 %	60 %	0 %	20 %	297616586
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6087	NC_014220	GAAG	2	8	401364	401371	50 %	0 %	50 %	0 %	297616587
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6092	NC_014220	ATA	2	6	401587	401592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616588
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6095	NC_014220	TTCT	2	8	401711	401718	0 %	75 %	0 %	25 %	297616588
6096	NC_014220	T	7	7	401753	401759	0 %	100 %	0 %	0 %	297616588
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6117	NC_014220	AGG	2	6	403032	403037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616589
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6120	NC_014220	GAT	2	6	403103	403108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616589
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6122	NC_014220	GAA	2	6	403173	403178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616589
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6359	NC_014220	GAAGA	2	10	417906	417915	60 %	0 %	40 %	0 %	297616603
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6487	NC_014220	CTG	2	6	426207	426212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616612
6488	NC_014220	AG	3	6	426402	426407	50 %	0 %	50 %	0 %	297616612
6489	NC_014220	CTG	2	6	426420	426425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616612
6490	NC_014220	CAAC	2	8	426431	426438	50 %	0 %	0 %	50 %	297616612
6491	NC_014220	AG	3	6	426453	426458	50 %	0 %	50 %	0 %	297616612
6492	NC_014220	G	6	6	426469	426474	0 %	0 %	100 %	0 %	297616612
6493	NC_014220	CGA	2	6	426520	426525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616612
6494	NC_014220	AGTTGG	2	12	426540	426551	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	297616612
6495	NC_014220	GAG	2	6	426671	426676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616612
6496	NC_014220	AGT	2	6	426703	426708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616612
6497	NC_014220	CCG	2	6	426755	426760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616612
6498	NC_014220	TGA	2	6	426825	426830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616612
6499	NC_014220	AGT	2	6	426859	426864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616612
6500	NC_014220	TGG	2	6	426960	426965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616613

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