MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 chromosome

Total Repeats: 37029

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014220	GTG	2	6	365952	365957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616549
5502	NC_014220	GGC	2	6	365966	365971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616549
5503	NC_014220	AACA	2	8	366017	366024	75 %	0 %	0 %	25 %	297616549
5504	NC_014220	AGA	2	6	366096	366101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616550
5505	NC_014220	GTT	2	6	366129	366134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616550
5506	NC_014220	GAA	2	6	366142	366147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616550
5507	NC_014220	GAA	2	6	366226	366231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616550
5508	NC_014220	GAA	2	6	366235	366240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616550
5509	NC_014220	GAA	3	9	366244	366252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616550
5510	NC_014220	GAG	2	6	366253	366258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616550
5511	NC_014220	GAG	2	6	366337	366342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616550
5512	NC_014220	TAG	2	6	366374	366379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616550
5513	NC_014220	GAA	2	6	366385	366390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616550
5514	NC_014220	GTT	2	6	366464	366469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616551
5515	NC_014220	GAA	2	6	366476	366481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616551
5516	NC_014220	CCCG	2	8	366572	366579	0 %	0 %	25 %	75 %	297616551
5517	NC_014220	G	7	7	366605	366611	0 %	0 %	100 %	0 %	297616551
5518	NC_014220	GCG	2	6	366627	366632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616551
5519	NC_014220	GAG	2	6	366653	366658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616551
5520	NC_014220	GGCG	2	8	366726	366733	0 %	0 %	75 %	25 %	297616551
5521	NC_014220	AGT	2	6	366749	366754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616551
5522	NC_014220	TGA	2	6	366755	366760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616551
5523	NC_014220	TGG	2	6	366792	366797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616551
5524	NC_014220	AAG	2	6	366984	366989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616551
5525	NC_014220	ACC	2	6	367173	367178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616551
5526	NC_014220	CGG	2	6	367210	367215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616551
5527	NC_014220	TTTC	2	8	367225	367232	0 %	75 %	0 %	25 %	297616551
5528	NC_014220	GA	3	6	367250	367255	50 %	0 %	50 %	0 %	297616551
5529	NC_014220	GGT	2	6	367334	367339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616551
5530	NC_014220	TA	3	6	367348	367353	50 %	50 %	0 %	0 %	297616551
5531	NC_014220	CAA	2	6	367475	367480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616551
5532	NC_014220	GGC	2	6	367502	367507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616551
5533	NC_014220	CCGGG	2	10	367508	367517	0 %	0 %	60 %	40 %	297616551
5534	NC_014220	GGC	2	6	367518	367523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616551
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5536	NC_014220	TGAT	2	8	367585	367592	25 %	50 %	25 %	0 %	297616551
5537	NC_014220	A	8	8	367648	367655	100 %	0 %	0 %	0 %	297616551
5538	NC_014220	AAGC	2	8	367659	367666	50 %	0 %	25 %	25 %	297616551
5539	NC_014220	CGTT	2	8	367689	367696	0 %	50 %	25 %	25 %	297616551
5540	NC_014220	T	6	6	367702	367707	0 %	100 %	0 %	0 %	297616551
5541	NC_014220	ACG	2	6	367708	367713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616551
5542	NC_014220	CGC	2	6	367731	367736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616551
5543	NC_014220	AGC	2	6	367919	367924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616551
5544	NC_014220	AAT	2	6	368001	368006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616552
5545	NC_014220	GTG	2	6	368011	368016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616552
5546	NC_014220	CTG	2	6	368126	368131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616552
5547	NC_014220	TGATT	2	10	368169	368178	20 %	60 %	20 %	0 %	297616552
5548	NC_014220	TA	3	6	368199	368204	50 %	50 %	0 %	0 %	297616552
5549	NC_014220	CTG	2	6	368365	368370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616552
5550	NC_014220	ATT	2	6	368429	368434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616552
5551	NC_014220	ATG	2	6	368539	368544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616552
5552	NC_014220	GCA	2	6	368595	368600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616552
5553	NC_014220	GACG	2	8	368603	368610	25 %	0 %	50 %	25 %	297616552
5554	NC_014220	GGT	2	6	368619	368624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616552
5555	NC_014220	TGG	2	6	368639	368644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616552
5556	NC_014220	CGA	2	6	368661	368666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616552
5557	NC_014220	TGT	2	6	368717	368722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616552
5558	NC_014220	AGC	2	6	368765	368770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616552
5559	NC_014220	ACA	2	6	368807	368812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616552
5560	NC_014220	ATT	2	6	368900	368905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616552
5561	NC_014220	ACT	2	6	368906	368911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616552
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5563	NC_014220	ACT	2	6	368936	368941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616552
5564	NC_014220	GAG	2	6	368956	368961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616552
5565	NC_014220	GAA	2	6	368973	368978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616552
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5567	NC_014220	TGG	2	6	369380	369385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616553
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5570	NC_014220	ATA	2	6	369640	369645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616553
5571	NC_014220	GCC	2	6	369739	369744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616553
5572	NC_014220	GAA	2	6	369802	369807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616553
5573	NC_014220	AGCTGG	2	12	369833	369844	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	297616553
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5580	NC_014220	TAC	2	6	370251	370256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616553
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5588	NC_014220	TTC	2	6	370758	370763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616554
5589	NC_014220	AAGTA	2	10	370790	370799	60 %	20 %	20 %	0 %	297616554
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5591	NC_014220	GTTG	2	8	371269	371276	0 %	50 %	50 %	0 %	297616555
5592	NC_014220	GAG	2	6	371354	371359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616555
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5597	NC_014220	AGG	2	6	371695	371700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616555
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5603	NC_014220	AC	3	6	372426	372431	50 %	0 %	0 %	50 %	297616556
5604	NC_014220	TTGGG	2	10	372454	372463	0 %	40 %	60 %	0 %	297616556
5605	NC_014220	GGC	2	6	372477	372482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616556
5606	NC_014220	CTG	2	6	372601	372606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616556
5607	NC_014220	GC	3	6	372686	372691	0 %	0 %	50 %	50 %	297616556
5608	NC_014220	ACG	2	6	372737	372742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616556
5609	NC_014220	TCC	2	6	372825	372830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616556
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5613	NC_014220	TGGCCA	2	12	372980	372991	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	297616556
5614	NC_014220	ACG	2	6	373010	373015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616556
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5617	NC_014220	ACC	2	6	373079	373084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616556
5618	NC_014220	TGG	2	6	373103	373108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616556
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5620	NC_014220	GCT	2	6	373202	373207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616556
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5622	NC_014220	CTG	2	6	373309	373314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616556
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5989	NC_014220	TGC	2	6	395033	395038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616579
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