MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 chromosome

Total Repeats: 37029

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014220	GGC	2	6	298063	298068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616485
4502	NC_014220	G	6	6	298368	298373	0 %	0 %	100 %	0 %	297616486
4503	NC_014220	GAT	2	6	298385	298390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616486
4504	NC_014220	CAG	2	6	298400	298405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616486
4505	NC_014220	AAG	2	6	298600	298605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616487
4506	NC_014220	TTC	2	6	298672	298677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616487
4507	NC_014220	CAGC	2	8	298715	298722	25 %	0 %	25 %	50 %	297616487
4508	NC_014220	GCC	2	6	298768	298773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616487
4509	NC_014220	CGT	2	6	298874	298879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616487
4510	NC_014220	CAA	2	6	298956	298961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616487
4511	NC_014220	CTC	2	6	299003	299008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	297616487
4512	NC_014220	CAGC	2	8	299025	299032	25 %	0 %	25 %	50 %	297616487
4513	NC_014220	AGA	2	6	299271	299276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616487
4514	NC_014220	CAA	2	6	299417	299422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616487
4515	NC_014220	GGC	2	6	299427	299432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616487
4516	NC_014220	ACG	2	6	299518	299523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616487
4517	NC_014220	CTG	2	6	299536	299541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616487
4518	NC_014220	AT	3	6	299576	299581	50 %	50 %	0 %	0 %	297616487
4519	NC_014220	CAG	2	6	299650	299655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616487
4520	NC_014220	CGC	2	6	299704	299709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616487
4521	NC_014220	GTG	2	6	299916	299921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616488
4522	NC_014220	CG	3	6	300089	300094	0 %	0 %	50 %	50 %	297616488
4523	NC_014220	TTA	2	6	300106	300111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	297616488
4524	NC_014220	TGC	2	6	300123	300128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616488
4525	NC_014220	CTT	2	6	300193	300198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616488
4526	NC_014220	TTC	2	6	300223	300228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616488
4527	NC_014220	CCAG	2	8	300324	300331	25 %	0 %	25 %	50 %	297616488
4528	NC_014220	G	6	6	300331	300336	0 %	0 %	100 %	0 %	297616488
4529	NC_014220	CGGA	2	8	300338	300345	25 %	0 %	50 %	25 %	297616488
4530	NC_014220	TTC	3	9	300365	300373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616488
4531	NC_014220	GGC	2	6	300391	300396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616488
4532	NC_014220	CTT	2	6	300397	300402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616488
4533	NC_014220	AG	3	6	300419	300424	50 %	0 %	50 %	0 %	297616488
4534	NC_014220	CTT	2	6	300434	300439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616488
4535	NC_014220	CAG	2	6	300472	300477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616488
4536	NC_014220	TA	3	6	300534	300539	50 %	50 %	0 %	0 %	297616488
4537	NC_014220	GAA	2	6	300616	300621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616488
4538	NC_014220	GCG	2	6	300627	300632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616488
4539	NC_014220	AGT	2	6	300691	300696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616488
4540	NC_014220	GGC	2	6	300718	300723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616488
4541	NC_014220	AGTA	2	8	300738	300745	50 %	25 %	25 %	0 %	297616488
4542	NC_014220	TGC	2	6	300756	300761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616488
4543	NC_014220	GGC	2	6	300894	300899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616488
4544	NC_014220	ACT	2	6	301032	301037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616488
4545	NC_014220	CATT	2	8	301066	301073	25 %	50 %	0 %	25 %	297616488
4546	NC_014220	CCA	2	6	301080	301085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616489
4547	NC_014220	TAA	2	6	301095	301100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616489
4548	NC_014220	TTCAA	2	10	301165	301174	40 %	40 %	0 %	20 %	297616489
4549	NC_014220	TAC	2	6	301386	301391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616489
4550	NC_014220	AATA	2	8	301394	301401	75 %	25 %	0 %	0 %	297616489
4551	NC_014220	AAGA	2	8	301406	301413	75 %	0 %	25 %	0 %	297616489
4552	NC_014220	A	8	8	301543	301550	100 %	0 %	0 %	0 %	297616489
4553	NC_014220	GTA	2	6	301607	301612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616489
4554	NC_014220	AAG	2	6	301633	301638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616489
4555	NC_014220	AAGA	2	8	301661	301668	75 %	0 %	25 %	0 %	297616489
4556	NC_014220	GCT	2	6	301669	301674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616489
4557	NC_014220	A	7	7	301703	301709	100 %	0 %	0 %	0 %	297616489
4558	NC_014220	CGG	2	6	301744	301749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616489
4559	NC_014220	GAG	2	6	301770	301775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616489
4560	NC_014220	GA	3	6	301885	301890	50 %	0 %	50 %	0 %	297616489
4561	NC_014220	A	6	6	301930	301935	100 %	0 %	0 %	0 %	297616489
4562	NC_014220	TAAGG	2	10	301987	301996	40 %	20 %	40 %	0 %	297616489
4563	NC_014220	CCAGG	2	10	302013	302022	20 %	0 %	40 %	40 %	297616489
4564	NC_014220	GTT	2	6	302031	302036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616489
4565	NC_014220	GCC	2	6	302037	302042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616489
4566	NC_014220	TGA	2	6	302048	302053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297616489
4567	NC_014220	GAG	2	6	302057	302062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616489
4568	NC_014220	CAT	2	6	302139	302144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616489
4569	NC_014220	CCA	2	6	302201	302206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616490
4570	NC_014220	AAG	2	6	302310	302315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616490
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4572	NC_014220	CTA	2	6	302443	302448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616490
4573	NC_014220	CCA	3	9	302449	302457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616490
4574	NC_014220	CGG	2	6	302476	302481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616490
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4586	NC_014220	GGTT	2	8	303118	303125	0 %	50 %	50 %	0 %	297616490
4587	NC_014220	CGG	2	6	303135	303140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616490
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4589	NC_014220	CTT	2	6	303202	303207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	297616490
4590	NC_014220	GGT	2	6	303329	303334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297616490
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4592	NC_014220	CGG	2	6	303454	303459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616490
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4595	NC_014220	CAC	2	6	303545	303550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297616490
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4597	NC_014220	GCTT	2	8	303616	303623	0 %	50 %	25 %	25 %	297616490
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4602	NC_014220	TCG	2	6	304386	304391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616491
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4605	NC_014220	CGAA	2	8	304875	304882	50 %	0 %	25 %	25 %	297616492
4606	NC_014220	AAG	2	6	304930	304935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616492
4607	NC_014220	GAGCCA	2	12	305014	305025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616492
4608	NC_014220	CAA	2	6	305123	305128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297616492
4609	NC_014220	TAA	2	6	305178	305183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	297616492
4610	NC_014220	AT	3	6	305186	305191	50 %	50 %	0 %	0 %	297616492
4611	NC_014220	TGGC	2	8	305226	305233	0 %	25 %	50 %	25 %	297616492
4612	NC_014220	AGAA	2	8	305307	305314	75 %	0 %	25 %	0 %	297616492
4613	NC_014220	CGAG	2	8	305327	305334	25 %	0 %	50 %	25 %	297616492
4614	NC_014220	TGT	2	6	305424	305429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616492
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4617	NC_014220	GA	3	6	305602	305607	50 %	0 %	50 %	0 %	297616492
4618	NC_014220	CCG	2	6	305623	305628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297616492
4619	NC_014220	TTGC	2	8	305665	305672	0 %	50 %	25 %	25 %	297616492
4620	NC_014220	GGGA	2	8	305693	305700	25 %	0 %	75 %	0 %	297616492
4621	NC_014220	TCGC	2	8	305753	305760	0 %	25 %	25 %	50 %	297616492
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4623	NC_014220	GA	3	6	305831	305836	50 %	0 %	50 %	0 %	297616492
4624	NC_014220	AGACC	2	10	305856	305865	40 %	0 %	20 %	40 %	297616492
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4744	NC_014220	T	6	6	314427	314432	0 %	100 %	0 %	0 %	297616499
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4989	NC_014220	CGA	2	6	332587	332592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616514
4990	NC_014220	CCCTG	2	10	332614	332623	0 %	20 %	20 %	60 %	297616514
4991	NC_014220	GCG	2	6	332676	332681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297616514
4992	NC_014220	CTA	2	6	332688	332693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297616514
4993	NC_014220	GAA	2	6	332774	332779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297616514
4994	NC_014220	CAG	2	6	332796	332801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616514
4995	NC_014220	TGGCCA	2	12	332847	332858	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	297616514
4996	NC_014220	G	6	6	332872	332877	0 %	0 %	100 %	0 %	297616514
4997	NC_014220	CGA	2	6	332893	332898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297616514
4998	NC_014220	AGG	2	6	332951	332956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297616514
4999	NC_014220	GTT	2	6	333053	333058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297616514
5000	NC_014220	GCT	2	6	333238	333243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297616515

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