MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Segniliparus rotundus DSM 44985 chromosome

Total Repeats: 51983

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014168	ACA	2	6	240	245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296392441
2	NC_014168	CGG	2	6	323	328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392441
3	NC_014168	CGC	2	6	360	365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392441
4	NC_014168	CCG	2	6	452	457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392441
5	NC_014168	CGG	2	6	458	463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392441
6	NC_014168	GGA	2	6	483	488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392441
7	NC_014168	GAA	2	6	502	507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392441
8	NC_014168	CCG	2	6	508	513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392441
9	NC_014168	CAC	2	6	546	551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392441
10	NC_014168	ACG	2	6	559	564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392441
11	NC_014168	CGC	2	6	627	632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392441
12	NC_014168	CTG	2	6	715	720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392441
13	NC_014168	CGG	2	6	725	730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392441
14	NC_014168	TCA	2	6	803	808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392441
15	NC_014168	CCG	2	6	825	830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392441
16	NC_014168	AGC	2	6	842	847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392441
17	NC_014168	CTC	2	6	868	873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296392441
18	NC_014168	CGA	2	6	876	881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392441
19	NC_014168	AGG	2	6	902	907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392441
20	NC_014168	TTC	2	6	922	927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296392441
21	NC_014168	CAA	2	6	954	959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296392441
22	NC_014168	ATC	3	9	964	972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392441
23	NC_014168	GAA	2	6	990	995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392441
24	NC_014168	CGC	2	6	999	1004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392441
25	NC_014168	TCA	2	6	1043	1048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392441
26	NC_014168	CGA	2	6	1128	1133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392441
27	NC_014168	ACC	2	6	1223	1228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392441
28	NC_014168	CCT	2	6	1586	1591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296392441
29	NC_014168	GAA	2	6	2101	2106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392442
30	NC_014168	CGT	2	6	2164	2169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392442
31	NC_014168	TGT	2	6	2210	2215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296392442
32	NC_014168	CGA	2	6	2445	2450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392442
33	NC_014168	GTT	2	6	2505	2510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296392442
34	NC_014168	GCC	2	6	2536	2541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392442
35	NC_014168	GAC	2	6	2548	2553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392442
36	NC_014168	CAG	2	6	2699	2704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392442
37	NC_014168	CGA	2	6	2742	2747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392442
38	NC_014168	CAC	2	6	2826	2831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392442
39	NC_014168	GCT	2	6	3003	3008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392442
40	NC_014168	AGA	2	6	3027	3032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392442
41	NC_014168	AGA	3	9	3045	3053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392442
42	NC_014168	GCA	2	6	3063	3068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392442
43	NC_014168	AGA	2	6	3210	3215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392442
44	NC_014168	CGC	2	6	3339	3344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392443
45	NC_014168	CGA	2	6	3354	3359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392443
46	NC_014168	GTT	2	6	3369	3374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296392443
47	NC_014168	CGC	2	6	3462	3467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392443
48	NC_014168	GCG	2	6	3484	3489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392443
49	NC_014168	GCG	3	9	3681	3689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392443
50	NC_014168	GCG	2	6	3794	3799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392443
51	NC_014168	ACG	2	6	3818	3823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392443
52	NC_014168	GCT	2	6	3932	3937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392443
53	NC_014168	GAC	2	6	3961	3966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392443
54	NC_014168	CCG	2	6	3989	3994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392443
55	NC_014168	AAG	2	6	4007	4012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392443
56	NC_014168	GAA	2	6	4099	4104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392443
57	NC_014168	GCA	2	6	4171	4176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392443
58	NC_014168	GGA	2	6	4251	4256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392443
59	NC_014168	CGA	2	6	4281	4286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392443
60	NC_014168	TCA	2	6	4358	4363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392443
61	NC_014168	TGT	2	6	4407	4412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296392443
62	NC_014168	GAA	2	6	4520	4525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392444
63	NC_014168	AGA	2	6	4689	4694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392444
64	NC_014168	TCG	2	6	4752	4757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392444
65	NC_014168	CTG	2	6	4805	4810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392444
66	NC_014168	CAC	2	6	4886	4891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392444
67	NC_014168	GTC	2	6	4904	4909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392444
68	NC_014168	GAA	2	6	4948	4953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392444
69	NC_014168	GAG	2	6	5275	5280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392445
70	NC_014168	TCG	2	6	5282	5287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392445
71	NC_014168	GCG	2	6	5357	5362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392445
72	NC_014168	TCG	2	6	5366	5371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392445
73	NC_014168	TGA	2	6	5373	5378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296392445
74	NC_014168	CGG	2	6	5385	5390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392445
75	NC_014168	GCA	2	6	5427	5432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392445
76	NC_014168	TTG	2	6	5452	5457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296392445
77	NC_014168	GCA	2	6	5556	5561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392445
78	NC_014168	GGC	2	6	6221	6226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392446
79	NC_014168	CGA	2	6	6260	6265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392446
80	NC_014168	GAG	2	6	6379	6384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392446
81	NC_014168	GCC	2	6	6534	6539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392446
82	NC_014168	CGG	2	6	6560	6565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392446
83	NC_014168	CAC	2	6	6621	6626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392446
84	NC_014168	GAC	2	6	6666	6671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392446
85	NC_014168	AGC	2	6	6712	6717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392446
86	NC_014168	CCA	2	6	6861	6866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392447
87	NC_014168	CCT	2	6	6887	6892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296392447
88	NC_014168	TCC	2	6	7027	7032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296392447
89	NC_014168	GGC	3	9	7074	7082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392447
90	NC_014168	GCG	2	6	7095	7100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392447
91	NC_014168	CAG	2	6	7131	7136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392447
92	NC_014168	GCA	2	6	7148	7153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392447
93	NC_014168	ACG	2	6	7168	7173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392447
94	NC_014168	CGG	2	6	7184	7189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392447
95	NC_014168	CCA	2	6	7259	7264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392447
96	NC_014168	CAC	2	6	7317	7322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392447
97	NC_014168	TGG	2	6	7330	7335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392447
98	NC_014168	CGC	2	6	7346	7351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392447
99	NC_014168	CCG	2	6	7362	7367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392447
100	NC_014168	GCA	2	6	7391	7396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392447
101	NC_014168	GCC	2	6	7399	7404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392447
102	NC_014168	GCA	2	6	7409	7414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392447
103	NC_014168	TGG	2	6	7489	7494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392447
104	NC_014168	GCG	2	6	7498	7503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392447
105	NC_014168	CCA	2	6	7562	7567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392447
106	NC_014168	CGA	2	6	7598	7603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392447
107	NC_014168	CGG	2	6	7634	7639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392447
108	NC_014168	CGC	2	6	7725	7730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392447
109	NC_014168	GTC	2	6	7749	7754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392447
110	NC_014168	CGA	2	6	7829	7834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392447
111	NC_014168	CGC	2	6	7838	7843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392447
112	NC_014168	CGG	2	6	7891	7896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392447
113	NC_014168	GTC	2	6	7959	7964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392447
114	NC_014168	GGT	2	6	7974	7979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392447
115	NC_014168	TTG	2	6	7990	7995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296392447
116	NC_014168	GGT	2	6	8097	8102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392447
117	NC_014168	GTC	2	6	8112	8117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392447
118	NC_014168	AGG	2	6	8131	8136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392447
119	NC_014168	GCC	2	6	8151	8156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392447
120	NC_014168	TCT	2	6	8287	8292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296392447
121	NC_014168	TCG	2	6	8312	8317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392447
122	NC_014168	CCA	2	6	8330	8335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392447
123	NC_014168	ACA	2	6	8412	8417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296392448
124	NC_014168	GCC	2	6	8469	8474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392448
125	NC_014168	TCG	3	9	8538	8546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392448
126	NC_014168	GCC	2	6	8560	8565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392448
127	NC_014168	GGA	2	6	8566	8571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392448
128	NC_014168	GCA	2	6	8730	8735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392448
129	NC_014168	CGA	2	6	8821	8826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392448
130	NC_014168	CGA	2	6	8893	8898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392448
131	NC_014168	AAC	2	6	8921	8926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296392448
132	NC_014168	GCG	3	9	8970	8978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392448
133	NC_014168	CGA	2	6	8995	9000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392448
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246	NC_014168	GCA	2	6	15024	15029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392452
247	NC_014168	GCC	2	6	15031	15036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392452
248	NC_014168	GGA	3	9	15052	15060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392452
249	NC_014168	CGT	2	6	15160	15165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392452
250	NC_014168	TTC	2	6	15291	15296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296392452
251	NC_014168	AAG	2	6	15300	15305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392452
252	NC_014168	CGA	2	6	15541	15546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392453
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254	NC_014168	GCC	2	6	15699	15704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392453
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498	NC_014168	CGG	2	6	30020	30025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392473
499	NC_014168	TCG	2	6	30080	30085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392473
500	NC_014168	CTG	2	6	30110	30115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392473

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