MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Segniliparus rotundus DSM 44985 chromosome

Total Repeats: 71525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014168	AGC	2	6	172646	172651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392627
4002	NC_014168	GAT	2	6	172660	172665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296392627
4003	NC_014168	TCG	2	6	172673	172678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392627
4004	NC_014168	TCG	2	6	172706	172711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392627
4005	NC_014168	TTTC	2	8	172761	172768	0 %	75 %	0 %	25 %	296392627
4006	NC_014168	GCG	2	6	172781	172786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392627
4007	NC_014168	GTG	2	6	172852	172857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392627
4008	NC_014168	CGA	2	6	172962	172967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392627
4009	NC_014168	A	6	6	172967	172972	100 %	0 %	0 %	0 %	296392627
4010	NC_014168	TTG	2	6	172985	172990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296392627
4011	NC_014168	GC	4	8	173035	173042	0 %	0 %	50 %	50 %	296392627
4012	NC_014168	CCG	2	6	173087	173092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392627
4013	NC_014168	GCA	2	6	173132	173137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392628
4014	NC_014168	CGG	2	6	173150	173155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392628
4015	NC_014168	GCG	2	6	173171	173176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392628
4016	NC_014168	GTC	2	6	173179	173184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392628
4017	NC_014168	GGT	2	6	173361	173366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392628
4018	NC_014168	CCG	2	6	173410	173415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392628
4019	NC_014168	CGA	2	6	173435	173440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392628
4020	NC_014168	GAC	2	6	173526	173531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392628
4021	NC_014168	GAG	2	6	173607	173612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392628
4022	NC_014168	CGC	3	9	173755	173763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392629
4023	NC_014168	GC	4	8	173770	173777	0 %	0 %	50 %	50 %	296392629
4024	NC_014168	CCG	2	6	173783	173788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392629
4025	NC_014168	TGC	2	6	173792	173797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392629
4026	NC_014168	GTT	2	6	173803	173808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296392629
4027	NC_014168	GTGC	2	8	173822	173829	0 %	25 %	50 %	25 %	296392629
4028	NC_014168	CGG	2	6	173840	173845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392629
4029	NC_014168	TG	3	6	173862	173867	0 %	50 %	50 %	0 %	296392629
4030	NC_014168	CGA	2	6	173868	173873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392629
4031	NC_014168	GCG	2	6	173882	173887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392629
4032	NC_014168	TCGT	2	8	173914	173921	0 %	50 %	25 %	25 %	296392629
4033	NC_014168	ACGCCA	2	12	173939	173950	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	296392629
4034	NC_014168	GCG	2	6	173974	173979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392629
4035	NC_014168	TGGC	2	8	173995	174002	0 %	25 %	50 %	25 %	296392629
4036	NC_014168	GCC	2	6	174029	174034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392629
4037	NC_014168	AGC	2	6	174046	174051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392629
4038	NC_014168	CAGC	2	8	174054	174061	25 %	0 %	25 %	50 %	296392629
4039	NC_014168	GAG	2	6	174085	174090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392629
4040	NC_014168	CCA	2	6	174096	174101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392629
4041	NC_014168	TGT	2	6	174110	174115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296392629
4042	NC_014168	ACGA	2	8	174130	174137	50 %	0 %	25 %	25 %	296392629
4043	NC_014168	ACG	2	6	174173	174178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392629
4044	NC_014168	CGG	2	6	174179	174184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392629
4045	NC_014168	GGC	2	6	174195	174200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392629
4046	NC_014168	CGG	2	6	174219	174224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392629
4047	NC_014168	CGA	2	6	174225	174230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392629
4048	NC_014168	GCC	2	6	174245	174250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392630
4049	NC_014168	GCG	2	6	174309	174314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392630
4050	NC_014168	TGGG	2	8	174320	174327	0 %	25 %	75 %	0 %	296392630
4051	NC_014168	TCTGGT	2	12	174381	174392	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	296392630
4052	NC_014168	G	6	6	174422	174427	0 %	0 %	100 %	0 %	296392630
4053	NC_014168	CGA	2	6	174446	174451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392630
4054	NC_014168	AGA	2	6	174469	174474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392630
4055	NC_014168	CGGG	2	8	174502	174509	0 %	0 %	75 %	25 %	296392630
4056	NC_014168	GC	3	6	174531	174536	0 %	0 %	50 %	50 %	296392630
4057	NC_014168	CGT	2	6	174589	174594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392630
4058	NC_014168	GC	3	6	174658	174663	0 %	0 %	50 %	50 %	296392630
4059	NC_014168	GAG	2	6	174668	174673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392630
4060	NC_014168	GC	3	6	174697	174702	0 %	0 %	50 %	50 %	296392630
4061	NC_014168	TTCG	2	8	174722	174729	0 %	50 %	25 %	25 %	296392630
4062	NC_014168	GAT	2	6	174755	174760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296392630
4063	NC_014168	AGC	2	6	174765	174770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392630
4064	NC_014168	CGG	2	6	174802	174807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392630
4065	NC_014168	AGCGCG	2	12	174864	174875	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296392630
4066	NC_014168	GAG	2	6	174878	174883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392630
4067	NC_014168	GGC	2	6	174886	174891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392630
4068	NC_014168	GC	4	8	174905	174912	0 %	0 %	50 %	50 %	296392630
4069	NC_014168	CGG	2	6	174925	174930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392630
4070	NC_014168	GGC	2	6	174951	174956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392630
4071	NC_014168	GCC	2	6	175052	175057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392630
4072	NC_014168	CGC	2	6	175066	175071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392630
4073	NC_014168	GGC	2	6	175118	175123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392630
4074	NC_014168	GAA	2	6	175145	175150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392630
4075	NC_014168	GCG	2	6	175248	175253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392630
4076	NC_014168	CG	3	6	175256	175261	0 %	0 %	50 %	50 %	296392630
4077	NC_014168	CGA	2	6	175288	175293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392630
4078	NC_014168	CAGG	2	8	175294	175301	25 %	0 %	50 %	25 %	296392630
4079	NC_014168	GAG	2	6	175485	175490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392631
4080	NC_014168	GCG	2	6	175501	175506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392631
4081	NC_014168	TCGACG	2	12	175519	175530	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296392631
4082	NC_014168	TGGG	2	8	175590	175597	0 %	25 %	75 %	0 %	296392631
4083	NC_014168	CCG	2	6	175611	175616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392631
4084	NC_014168	CG	3	6	175665	175670	0 %	0 %	50 %	50 %	296392631
4085	NC_014168	TCA	2	6	175678	175683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392631
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4087	NC_014168	CG	3	6	175743	175748	0 %	0 %	50 %	50 %	296392631
4088	NC_014168	TGT	2	6	175771	175776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296392631
4089	NC_014168	G	6	6	175777	175782	0 %	0 %	100 %	0 %	296392631
4090	NC_014168	CGC	3	9	175787	175795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392631
4091	NC_014168	GTG	2	6	175865	175870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392631
4092	NC_014168	CGA	2	6	175900	175905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392631
4093	NC_014168	AGC	2	6	175966	175971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392631
4094	NC_014168	TCA	2	6	176008	176013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392631
4095	NC_014168	GCG	2	6	176014	176019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392631
4096	NC_014168	ACA	2	6	176041	176046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296392631
4097	NC_014168	CG	3	6	176063	176068	0 %	0 %	50 %	50 %	296392631
4098	NC_014168	GGGC	2	8	176083	176090	0 %	0 %	75 %	25 %	296392631
4099	NC_014168	CTT	2	6	176108	176113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296392631
4100	NC_014168	AGCGCG	2	12	176143	176154	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	296392631
4101	NC_014168	CCA	2	6	176212	176217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392631
4102	NC_014168	GCTG	2	8	176260	176267	0 %	25 %	50 %	25 %	296392631
4103	NC_014168	CGG	2	6	176270	176275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392631
4104	NC_014168	ACG	2	6	176281	176286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392631
4105	NC_014168	CAA	2	6	176429	176434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296392631
4106	NC_014168	CAT	2	6	176453	176458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392631
4107	NC_014168	CTG	2	6	176484	176489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392631
4108	NC_014168	GC	3	6	176516	176521	0 %	0 %	50 %	50 %	296392631
4109	NC_014168	GCC	2	6	176538	176543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392631
4110	NC_014168	CGG	2	6	176687	176692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392631
4111	NC_014168	CTT	2	6	176699	176704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296392631
4112	NC_014168	CGCGA	2	10	176733	176742	20 %	0 %	40 %	40 %	296392631
4113	NC_014168	CAC	2	6	176765	176770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392631
4114	NC_014168	CTT	3	9	176789	176797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296392631
4115	NC_014168	GC	3	6	176898	176903	0 %	0 %	50 %	50 %	296392631
4116	NC_014168	GCT	2	6	176906	176911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392631
4117	NC_014168	GC	3	6	176912	176917	0 %	0 %	50 %	50 %	296392631
4118	NC_014168	CGC	2	6	176969	176974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392631
4119	NC_014168	AGC	2	6	176980	176985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392631
4120	NC_014168	CCT	2	6	177044	177049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296392631
4121	NC_014168	GGCT	2	8	177054	177061	0 %	25 %	50 %	25 %	296392631
4122	NC_014168	CGG	2	6	177101	177106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392631
4123	NC_014168	CGG	2	6	177151	177156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392631
4124	NC_014168	TCT	2	6	177157	177162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296392631
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4128	NC_014168	CAT	2	6	177323	177328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392632
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4131	NC_014168	TCGACG	2	12	177424	177435	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	296392632
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4230	NC_014168	CGC	2	6	181082	181087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392635
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4238	NC_014168	TGC	2	6	181342	181347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392635
4239	NC_014168	GGC	2	6	181367	181372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392635
4240	NC_014168	TCC	2	6	181383	181388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296392635
4241	NC_014168	CGG	2	6	181397	181402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392635
4242	NC_014168	ACG	2	6	181420	181425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392635
4243	NC_014168	CCG	2	6	181447	181452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392635
4244	NC_014168	GCCT	2	8	181458	181465	0 %	25 %	25 %	50 %	296392635
4245	NC_014168	GGT	2	6	181466	181471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392635
4246	NC_014168	TGC	2	6	181476	181481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392635
4247	NC_014168	GCC	2	6	181521	181526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392635
4248	NC_014168	CGGT	2	8	181555	181562	0 %	25 %	50 %	25 %	296392635
4249	NC_014168	TCG	2	6	181573	181578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392635
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4252	NC_014168	GTC	2	6	181605	181610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392635
4253	NC_014168	CTG	2	6	181645	181650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392635
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4344	NC_014168	CGC	3	9	185502	185510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392641
4345	NC_014168	GCT	2	6	185559	185564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392641
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4351	NC_014168	CGAG	2	8	185844	185851	25 %	0 %	50 %	25 %	296392641
4352	NC_014168	GACC	2	8	185862	185869	25 %	0 %	25 %	50 %	296392641
4353	NC_014168	TGT	2	6	185948	185953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296392641
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4355	NC_014168	CG	3	6	185980	185985	0 %	0 %	50 %	50 %	296392641
4356	NC_014168	GAG	2	6	185989	185994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392641
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4358	NC_014168	CGG	2	6	186065	186070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392641
4359	NC_014168	GCCC	2	8	186086	186093	0 %	0 %	25 %	75 %	296392641
4360	NC_014168	CGC	2	6	186126	186131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392641
4361	NC_014168	GGGC	2	8	186203	186210	0 %	0 %	75 %	25 %	296392641
4362	NC_014168	TGG	2	6	186313	186318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392641
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4364	NC_014168	CGGGCC	2	12	186575	186586	0 %	0 %	50 %	50 %	296392642
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4472	NC_014168	TGA	2	6	191108	191113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296392647
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4481	NC_014168	TGC	2	6	191395	191400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392647
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4483	NC_014168	CCGGG	2	10	191489	191498	0 %	0 %	60 %	40 %	296392647
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4485	NC_014168	GGAA	2	8	191566	191573	50 %	0 %	50 %	0 %	296392647
4486	NC_014168	TCG	2	6	191599	191604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392647
4487	NC_014168	AGC	2	6	191659	191664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392647
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4490	NC_014168	CG	3	6	191831	191836	0 %	0 %	50 %	50 %	296392647
4491	NC_014168	ACC	2	6	191845	191850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392647
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4497	NC_014168	C	7	7	192224	192230	0 %	0 %	0 %	100 %	296392648
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