MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Segniliparus rotundus DSM 44985 chromosome

Total Repeats: 71525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014168	GCGG	2	8	150490	150497	0 %	0 %	75 %	25 %	296392603
3502	NC_014168	CGG	2	6	150524	150529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392603
3503	NC_014168	GAG	2	6	150542	150547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392603
3504	NC_014168	GCT	2	6	150642	150647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392603
3505	NC_014168	CCGG	2	8	150672	150679	0 %	0 %	50 %	50 %	296392603
3506	NC_014168	GGA	2	6	150687	150692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392603
3507	NC_014168	GC	3	6	150696	150701	0 %	0 %	50 %	50 %	296392603
3508	NC_014168	GC	4	8	150703	150710	0 %	0 %	50 %	50 %	296392603
3509	NC_014168	CG	3	6	150712	150717	0 %	0 %	50 %	50 %	296392603
3510	NC_014168	GCG	2	6	150771	150776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392603
3511	NC_014168	CGT	2	6	150779	150784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392603
3512	NC_014168	CG	3	6	150789	150794	0 %	0 %	50 %	50 %	296392603
3513	NC_014168	CGG	2	6	150878	150883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392603
3514	NC_014168	TGT	2	6	150891	150896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296392603
3515	NC_014168	CGA	2	6	150903	150908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392603
3516	NC_014168	CGC	2	6	150927	150932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392603
3517	NC_014168	CCG	2	6	150995	151000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392603
3518	NC_014168	CCG	2	6	151036	151041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392603
3519	NC_014168	GGCGT	2	10	151054	151063	0 %	20 %	60 %	20 %	296392603
3520	NC_014168	GC	4	8	151070	151077	0 %	0 %	50 %	50 %	296392603
3521	NC_014168	GTACGG	2	12	151125	151136	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	296392603
3522	NC_014168	TCG	2	6	151196	151201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392603
3523	NC_014168	GC	3	6	151235	151240	0 %	0 %	50 %	50 %	296392603
3524	NC_014168	GCGA	2	8	151255	151262	25 %	0 %	50 %	25 %	296392603
3525	NC_014168	G	6	6	151320	151325	0 %	0 %	100 %	0 %	296392603
3526	NC_014168	GCG	2	6	151333	151338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392603
3527	NC_014168	GTC	2	6	151368	151373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392603
3528	NC_014168	GCG	2	6	151378	151383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392603
3529	NC_014168	TGT	2	6	151433	151438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296392603
3530	NC_014168	GCT	2	6	151461	151466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392603
3531	NC_014168	ACA	2	6	151472	151477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296392603
3532	NC_014168	GGA	2	6	151521	151526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392603
3533	NC_014168	CG	3	6	151619	151624	0 %	0 %	50 %	50 %	296392603
3534	NC_014168	CG	3	6	151635	151640	0 %	0 %	50 %	50 %	296392603
3535	NC_014168	GAA	2	6	151656	151661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392603
3536	NC_014168	TGC	2	6	151664	151669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392603
3537	NC_014168	CGGC	2	8	151688	151695	0 %	0 %	50 %	50 %	296392603
3538	NC_014168	TGC	2	6	151805	151810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392603
3539	NC_014168	GGA	2	6	151902	151907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392603
3540	NC_014168	CGC	2	6	151908	151913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392603
3541	NC_014168	AGGA	2	8	151928	151935	50 %	0 %	50 %	0 %	296392603
3542	NC_014168	CGA	2	6	151945	151950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392604
3543	NC_014168	CG	4	8	151969	151976	0 %	0 %	50 %	50 %	296392604
3544	NC_014168	CCG	2	6	151985	151990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392604
3545	NC_014168	GC	3	6	152018	152023	0 %	0 %	50 %	50 %	296392604
3546	NC_014168	GAG	2	6	152079	152084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392604
3547	NC_014168	GGA	3	9	152147	152155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392604
3548	NC_014168	GTC	2	6	152181	152186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392604
3549	NC_014168	ACT	2	6	152209	152214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392604
3550	NC_014168	GCT	2	6	152297	152302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392604
3551	NC_014168	GCC	2	6	152304	152309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392604
3552	NC_014168	CG	3	6	152457	152462	0 %	0 %	50 %	50 %	296392604
3553	NC_014168	CGA	2	6	152550	152555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392605
3554	NC_014168	GCT	2	6	152569	152574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392605
3555	NC_014168	CGG	2	6	152610	152615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392605
3556	NC_014168	GTCC	2	8	152623	152630	0 %	25 %	25 %	50 %	296392605
3557	NC_014168	TCG	2	6	152708	152713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392605
3558	NC_014168	CCG	2	6	152726	152731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392605
3559	NC_014168	CCG	2	6	152742	152747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392605
3560	NC_014168	CCA	2	6	152793	152798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392605
3561	NC_014168	GTG	2	6	152807	152812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392605
3562	NC_014168	CGA	2	6	152838	152843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392605
3563	NC_014168	GCC	2	6	152872	152877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392605
3564	NC_014168	GCG	2	6	152888	152893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392605
3565	NC_014168	CGA	2	6	152898	152903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392605
3566	NC_014168	CGC	2	6	152925	152930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392605
3567	NC_014168	CCCGG	2	10	152947	152956	0 %	0 %	40 %	60 %	296392605
3568	NC_014168	GCC	2	6	152978	152983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392605
3569	NC_014168	GCG	2	6	152987	152992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392605
3570	NC_014168	GCA	2	6	153234	153239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392606
3571	NC_014168	GCT	2	6	153264	153269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392606
3572	NC_014168	TGC	2	6	153332	153337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392606
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3574	NC_014168	GC	3	6	153399	153404	0 %	0 %	50 %	50 %	296392606
3575	NC_014168	CGT	2	6	153512	153517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392606
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3577	NC_014168	CG	3	6	153580	153585	0 %	0 %	50 %	50 %	296392606
3578	NC_014168	CCGC	2	8	153605	153612	0 %	0 %	25 %	75 %	296392606
3579	NC_014168	ACG	2	6	153655	153660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392606
3580	NC_014168	CTC	2	6	153676	153681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296392606
3581	NC_014168	GCT	2	6	153738	153743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392606
3582	NC_014168	TGT	2	6	153761	153766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296392606
3583	NC_014168	TGC	2	6	153767	153772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392606
3584	NC_014168	GTCG	2	8	153789	153796	0 %	25 %	50 %	25 %	296392606
3585	NC_014168	CAT	2	6	153798	153803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392606
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3587	NC_014168	ACG	2	6	153841	153846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392606
3588	NC_014168	GGC	2	6	153861	153866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392606
3589	NC_014168	GGCGC	2	10	153994	154003	0 %	0 %	60 %	40 %	296392606
3590	NC_014168	TGT	2	6	154007	154012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296392606
3591	NC_014168	GCA	2	6	154062	154067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392606
3592	NC_014168	G	6	6	154099	154104	0 %	0 %	100 %	0 %	296392606
3593	NC_014168	GGT	2	6	154134	154139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392606
3594	NC_014168	CGC	2	6	154140	154145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392606
3595	NC_014168	CGA	2	6	154202	154207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392606
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3597	NC_014168	GCT	2	6	154257	154262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392606
3598	NC_014168	GC	3	6	154277	154282	0 %	0 %	50 %	50 %	296392606
3599	NC_014168	G	6	6	154322	154327	0 %	0 %	100 %	0 %	296392606
3600	NC_014168	CGC	3	9	154328	154336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392606
3601	NC_014168	CTTT	2	8	154384	154391	0 %	75 %	0 %	25 %	296392606
3602	NC_014168	ACG	2	6	154414	154419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392606
3603	NC_014168	GGC	2	6	154420	154425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392606
3604	NC_014168	GCG	2	6	154454	154459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392606
3605	NC_014168	CG	4	8	154458	154465	0 %	0 %	50 %	50 %	296392606
3606	NC_014168	GGT	2	6	154479	154484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392606
3607	NC_014168	CG	3	6	154551	154556	0 %	0 %	50 %	50 %	296392606
3608	NC_014168	GCA	2	6	154577	154582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392606
3609	NC_014168	GC	3	6	154701	154706	0 %	0 %	50 %	50 %	296392607
3610	NC_014168	CG	3	6	154712	154717	0 %	0 %	50 %	50 %	296392607
3611	NC_014168	GCT	2	6	154758	154763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392607
3612	NC_014168	CGG	2	6	154789	154794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392607
3613	NC_014168	CCG	2	6	154801	154806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392607
3614	NC_014168	AGGGGC	2	12	154817	154828	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	296392607
3615	NC_014168	CGC	2	6	154886	154891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392607
3616	NC_014168	GAC	2	6	154899	154904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392607
3617	NC_014168	CGA	2	6	154931	154936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392607
3618	NC_014168	CGA	3	9	154940	154948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392607
3619	NC_014168	GGACGT	2	12	154961	154972	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	296392607
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3621	NC_014168	ACG	3	9	155164	155172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392607
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3745	NC_014168	CGG	2	6	160857	160862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392612
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3768	NC_014168	CGG	3	9	161664	161672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392614
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3852	NC_014168	GCTC	2	8	165604	165611	0 %	25 %	25 %	50 %	296392618
3853	NC_014168	TGATC	2	10	165621	165630	20 %	40 %	20 %	20 %	296392618
3854	NC_014168	CAGGT	2	10	165644	165653	20 %	20 %	40 %	20 %	296392618
3855	NC_014168	GCG	2	6	165716	165721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392618
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3859	NC_014168	ACG	2	6	165834	165839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392618
3860	NC_014168	GTG	3	9	165854	165862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392618
3861	NC_014168	GGT	2	6	165892	165897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392618
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3863	NC_014168	CGA	2	6	165954	165959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392618
3864	NC_014168	AG	3	6	165979	165984	50 %	0 %	50 %	0 %	296392618
3865	NC_014168	GCG	4	12	166001	166012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392618
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3953	NC_014168	GC	3	6	170188	170193	0 %	0 %	50 %	50 %	296392623
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3970	NC_014168	CG	3	6	170898	170903	0 %	0 %	50 %	50 %	296392623
3971	NC_014168	GCA	2	6	170945	170950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392623
3972	NC_014168	CGC	2	6	170972	170977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392623
3973	NC_014168	CCG	2	6	171013	171018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392623
3974	NC_014168	GCT	2	6	171088	171093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392623
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3976	NC_014168	ATG	2	6	171193	171198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296392623
3977	NC_014168	C	7	7	171295	171301	0 %	0 %	0 %	100 %	296392624
3978	NC_014168	CGT	2	6	171325	171330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392624
3979	NC_014168	CGG	2	6	171418	171423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392624
3980	NC_014168	TGG	2	6	171492	171497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392624
3981	NC_014168	GTC	2	6	171515	171520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392624
3982	NC_014168	ACT	2	6	171534	171539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392624
3983	NC_014168	GGGCTG	2	12	171571	171582	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	296392624
3984	NC_014168	TGG	2	6	171816	171821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392625
3985	NC_014168	TCGGC	2	10	171840	171849	0 %	20 %	40 %	40 %	296392625
3986	NC_014168	GCC	2	6	171857	171862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392625
3987	NC_014168	ACA	2	6	171960	171965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296392625
3988	NC_014168	CGC	2	6	172046	172051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392625
3989	NC_014168	AGG	2	6	172124	172129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392626
3990	NC_014168	ACCGCG	2	12	172147	172158	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	296392626
3991	NC_014168	CGG	2	6	172162	172167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392626
3992	NC_014168	TGACC	2	10	172228	172237	20 %	20 %	20 %	40 %	296392626
3993	NC_014168	TCC	2	6	172245	172250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296392626
3994	NC_014168	CG	3	6	172359	172364	0 %	0 %	50 %	50 %	296392626
3995	NC_014168	GC	3	6	172369	172374	0 %	0 %	50 %	50 %	296392626
3996	NC_014168	TTG	2	6	172449	172454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296392626
3997	NC_014168	TGGC	2	8	172521	172528	0 %	25 %	50 %	25 %	296392626
3998	NC_014168	CGGG	2	8	172543	172550	0 %	0 %	75 %	25 %	296392626
3999	NC_014168	GAT	2	6	172603	172608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296392627
4000	NC_014168	TGG	3	9	172614	172622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392627

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