MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Segniliparus rotundus DSM 44985 chromosome

Total Repeats: 71525

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014168	CGC	2	6	22621	22626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392459
502	NC_014168	CAA	2	6	22715	22720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296392459
503	NC_014168	CGC	2	6	22770	22775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392460
504	NC_014168	CGC	2	6	22779	22784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392460
505	NC_014168	CGC	2	6	22803	22808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392460
506	NC_014168	AGC	3	9	22815	22823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392460
507	NC_014168	CGT	2	6	22857	22862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392460
508	NC_014168	GGC	2	6	22893	22898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392460
509	NC_014168	CGG	2	6	22907	22912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392460
510	NC_014168	CGC	2	6	22950	22955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392460
511	NC_014168	CCG	2	6	23006	23011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392460
512	NC_014168	CGAGG	2	10	23014	23023	20 %	0 %	60 %	20 %	296392460
513	NC_014168	CAT	2	6	23076	23081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392460
514	NC_014168	TTC	2	6	23173	23178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296392460
515	NC_014168	TGG	2	6	23350	23355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392460
516	NC_014168	GC	3	6	23447	23452	0 %	0 %	50 %	50 %	296392460
517	NC_014168	CAA	2	6	23500	23505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296392460
518	NC_014168	TTC	2	6	23515	23520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296392460
519	NC_014168	GCC	2	6	23529	23534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392460
520	NC_014168	ACG	2	6	23550	23555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392461
521	NC_014168	GCG	2	6	23556	23561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392461
522	NC_014168	GAT	2	6	23586	23591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296392461
523	NC_014168	ACCAA	2	10	23677	23686	60 %	0 %	0 %	40 %	296392461
524	NC_014168	TGC	2	6	23716	23721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392461
525	NC_014168	GAG	2	6	23739	23744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392461
526	NC_014168	CGG	2	6	23841	23846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392461
527	NC_014168	CG	3	6	23879	23884	0 %	0 %	50 %	50 %	296392461
528	NC_014168	GTC	2	6	23912	23917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392461
529	NC_014168	CGA	2	6	23927	23932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392461
530	NC_014168	CGA	2	6	23957	23962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392461
531	NC_014168	ACG	2	6	24034	24039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392461
532	NC_014168	CAA	2	6	24051	24056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296392461
533	NC_014168	GTT	2	6	24130	24135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296392461
534	NC_014168	GC	3	6	24137	24142	0 %	0 %	50 %	50 %	296392461
535	NC_014168	C	6	6	24188	24193	0 %	0 %	0 %	100 %	296392462
536	NC_014168	CGC	2	6	24211	24216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392462
537	NC_014168	CGC	2	6	24253	24258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392462
538	NC_014168	CGC	2	6	24349	24354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392462
539	NC_014168	CCG	2	6	24371	24376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392462
540	NC_014168	GC	3	6	24389	24394	0 %	0 %	50 %	50 %	296392462
541	NC_014168	TCG	2	6	24396	24401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392462
542	NC_014168	CCT	2	6	24441	24446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296392462
543	NC_014168	GGC	2	6	24454	24459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392462
544	NC_014168	CGC	2	6	24463	24468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392462
545	NC_014168	CTC	2	6	24473	24478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296392462
546	NC_014168	GCTG	2	8	24484	24491	0 %	25 %	50 %	25 %	296392462
547	NC_014168	GATG	2	8	24501	24508	25 %	25 %	50 %	0 %	296392462
548	NC_014168	CTG	2	6	24537	24542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392462
549	NC_014168	CCGC	2	8	24543	24550	0 %	0 %	25 %	75 %	296392462
550	NC_014168	GCG	2	6	24582	24587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392462
551	NC_014168	CGG	3	9	24595	24603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392462
552	NC_014168	GTG	2	6	24614	24619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392462
553	NC_014168	TGA	2	6	24651	24656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296392462
554	NC_014168	ACG	2	6	24657	24662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392462
555	NC_014168	TCG	2	6	24702	24707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392462
556	NC_014168	CCA	2	6	24762	24767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392462
557	NC_014168	CCG	2	6	24768	24773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392462
558	NC_014168	CGG	2	6	24826	24831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392462
559	NC_014168	CGTC	2	8	24913	24920	0 %	25 %	25 %	50 %	296392463
560	NC_014168	GCG	2	6	24927	24932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392463
561	NC_014168	C	6	6	24945	24950	0 %	0 %	0 %	100 %	296392463
562	NC_014168	CGC	2	6	24994	24999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392463
563	NC_014168	GAA	2	6	25025	25030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296392463
564	NC_014168	CAC	2	6	25124	25129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392463
565	NC_014168	GCC	2	6	25185	25190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392463
566	NC_014168	TGA	2	6	25230	25235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296392463
567	NC_014168	GCA	2	6	25249	25254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392463
568	NC_014168	GC	3	6	25261	25266	0 %	0 %	50 %	50 %	296392463
569	NC_014168	GCC	2	6	25275	25280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392463
570	NC_014168	GAT	2	6	25318	25323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296392463
571	NC_014168	CAT	2	6	25325	25330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296392463
572	NC_014168	CAGCCG	2	12	25346	25357	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	296392463
573	NC_014168	CGC	2	6	25376	25381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392463
574	NC_014168	CCG	2	6	25394	25399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392463
575	NC_014168	TCG	2	6	25402	25407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392463
576	NC_014168	CCG	2	6	25471	25476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392463
577	NC_014168	CCA	2	6	25522	25527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392463
578	NC_014168	CGT	2	6	25589	25594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392463
579	NC_014168	TGC	2	6	26000	26005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392464
580	NC_014168	TCCAG	2	10	26084	26093	20 %	20 %	20 %	40 %	296392464
581	NC_014168	TGCG	2	8	26100	26107	0 %	25 %	50 %	25 %	296392464
582	NC_014168	CCT	2	6	26310	26315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296392465
583	NC_014168	GCG	2	6	26352	26357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392465
584	NC_014168	TGG	2	6	26412	26417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392465
585	NC_014168	CAC	2	6	26438	26443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392465
586	NC_014168	ACG	2	6	26610	26615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392466
587	NC_014168	CTT	2	6	26642	26647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296392466
588	NC_014168	TCC	2	6	26652	26657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296392466
589	NC_014168	CAG	2	6	26717	26722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392466
590	NC_014168	TCGA	2	8	26802	26809	25 %	25 %	25 %	25 %	296392466
591	NC_014168	GAG	2	6	27007	27012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392467
592	NC_014168	CAC	2	6	27064	27069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392467
593	NC_014168	GGT	2	6	27072	27077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392467
594	NC_014168	GGA	2	6	27111	27116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392467
595	NC_014168	GAG	2	6	27142	27147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392467
596	NC_014168	CGTT	2	8	27152	27159	0 %	50 %	25 %	25 %	296392467
597	NC_014168	GCCGC	2	10	27221	27230	0 %	0 %	40 %	60 %	296392468
598	NC_014168	GAG	2	6	27249	27254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296392468
599	NC_014168	GAC	2	6	27303	27308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392468
600	NC_014168	CGA	2	6	27329	27334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392468
601	NC_014168	CGC	2	6	27360	27365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392468
602	NC_014168	GAC	2	6	27372	27377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296392468
603	NC_014168	TGA	2	6	27477	27482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296392468
604	NC_014168	CG	4	8	27483	27490	0 %	0 %	50 %	50 %	296392469
605	NC_014168	GGCA	2	8	27518	27525	25 %	0 %	50 %	25 %	296392469
606	NC_014168	ATCC	2	8	27584	27591	25 %	25 %	0 %	50 %	296392469
607	NC_014168	CGG	2	6	27603	27608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392469
608	NC_014168	TGG	2	6	27618	27623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392469
609	NC_014168	GCG	2	6	27631	27636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392469
610	NC_014168	GGT	2	6	27682	27687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392469
611	NC_014168	TGG	2	6	27696	27701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392469
612	NC_014168	TTG	2	6	27713	27718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296392469
613	NC_014168	CG	3	6	27719	27724	0 %	0 %	50 %	50 %	296392469
614	NC_014168	CCGA	2	8	27761	27768	25 %	0 %	25 %	50 %	296392469
615	NC_014168	GGC	2	6	27796	27801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392469
616	NC_014168	GCG	2	6	27818	27823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392469
617	NC_014168	TGC	3	9	27829	27837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392469
618	NC_014168	CGAGA	2	10	27848	27857	40 %	0 %	40 %	20 %	296392469
619	NC_014168	AGGGC	2	10	27858	27867	20 %	0 %	60 %	20 %	296392469
620	NC_014168	CCG	2	6	27879	27884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392469
621	NC_014168	CGG	2	6	27888	27893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392469
622	NC_014168	GGC	2	6	28024	28029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392469
623	NC_014168	GC	3	6	28028	28033	0 %	0 %	50 %	50 %	296392469
624	NC_014168	CAC	2	6	28079	28084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296392469
625	NC_014168	GGC	2	6	28111	28116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296392469
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627	NC_014168	GGT	2	6	28279	28284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392469
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756	NC_014168	GCT	2	6	34210	34215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392482
757	NC_014168	CGC	2	6	34254	34259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296392483
758	NC_014168	CGCGG	2	10	34266	34275	0 %	0 %	60 %	40 %	296392483
759	NC_014168	TGG	2	6	34364	34369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296392483
760	NC_014168	GGCG	2	8	34410	34417	0 %	0 %	75 %	25 %	296392483
761	NC_014168	G	6	6	34431	34436	0 %	0 %	100 %	0 %	296392483
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763	NC_014168	CGT	3	9	34574	34582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296392484
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865	NC_014168	CTC	2	6	39223	39228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296392493
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873	NC_014168	CGGA	2	8	39531	39538	25 %	0 %	50 %	25 %	296392493
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