MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salinibacter ruber M8 chromosome

Total Repeats: 58989

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014032	CGT	2	6	30	35	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505816
2	NC_014032	GGA	2	6	84	89	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505816
3	NC_014032	CCG	2	6	235	240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505817
4	NC_014032	CAT	2	6	266	271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294505817
5	NC_014032	GCC	2	6	286	291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505817
6	NC_014032	GGA	2	6	335	340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505817
7	NC_014032	GAC	2	6	345	350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505817
8	NC_014032	TAC	2	6	387	392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294505817
9	NC_014032	GAG	2	6	402	407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505817
10	NC_014032	ACG	2	6	472	477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505817
11	NC_014032	GAC	2	6	492	497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505817
12	NC_014032	GGA	2	6	500	505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505817
13	NC_014032	GCC	2	6	596	601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505817
14	NC_014032	TCG	2	6	606	611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505817
15	NC_014032	GAC	2	6	675	680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505817
16	NC_014032	CGA	2	6	701	706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505817
17	NC_014032	GAA	2	6	752	757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294505817
18	NC_014032	GCC	2	6	840	845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505817
19	NC_014032	CGG	2	6	899	904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505817
20	NC_014032	TCT	2	6	979	984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294505817
21	NC_014032	CAC	2	6	1004	1009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294505817
22	NC_014032	GAC	2	6	1089	1094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505817
23	NC_014032	CGG	2	6	1106	1111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505817
24	NC_014032	AGG	2	6	1126	1131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505817
25	NC_014032	TTC	2	6	1134	1139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294505817
26	NC_014032	CGG	2	6	1186	1191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505817
27	NC_014032	CCG	2	6	1197	1202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505817
28	NC_014032	CCG	2	6	1258	1263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505817
29	NC_014032	CCG	2	6	1304	1309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505817
30	NC_014032	GAC	2	6	1320	1325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505817
31	NC_014032	CGA	2	6	1337	1342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505817
32	NC_014032	CGT	2	6	1346	1351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505817
33	NC_014032	CCA	2	6	1433	1438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294505817
34	NC_014032	GCC	2	6	1497	1502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505817
35	NC_014032	CGA	2	6	1514	1519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505817
36	NC_014032	AAG	2	6	1629	1634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294505817
37	NC_014032	CGG	2	6	1673	1678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505817
38	NC_014032	CAA	2	6	1706	1711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294505817
39	NC_014032	GGA	2	6	1718	1723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505817
40	NC_014032	GAC	2	6	1734	1739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505817
41	NC_014032	GGC	2	6	1802	1807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505818
42	NC_014032	TCG	2	6	1832	1837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505818
43	NC_014032	CCT	2	6	1957	1962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505818
44	NC_014032	ATC	2	6	2087	2092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294505818
45	NC_014032	CGG	2	6	2211	2216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505818
46	NC_014032	TGG	2	6	2265	2270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294505818
47	NC_014032	ACG	2	6	2274	2279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505818
48	NC_014032	GGA	2	6	2308	2313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505818
49	NC_014032	GCA	2	6	2314	2319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505818
50	NC_014032	CCT	2	6	2341	2346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505818
51	NC_014032	ATG	2	6	2405	2410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294505818
52	NC_014032	GAG	2	6	2432	2437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505818
53	NC_014032	GTG	2	6	2447	2452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294505818
54	NC_014032	CCA	2	6	2538	2543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294505818
55	NC_014032	GGA	2	6	2563	2568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505818
56	NC_014032	CGA	2	6	2569	2574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505818
57	NC_014032	GAC	2	6	2594	2599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505818
58	NC_014032	CGA	2	6	2650	2655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505818
59	NC_014032	GTC	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505818
60	NC_014032	CTC	2	6	2758	2763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505818
61	NC_014032	GAG	2	6	2849	2854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505818
62	NC_014032	CGA	2	6	2941	2946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505818
63	NC_014032	GGT	2	6	2947	2952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294505818
64	NC_014032	CGA	3	9	3007	3015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505818
65	NC_014032	TCA	2	6	3030	3035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294505818
66	NC_014032	AAC	2	6	3411	3416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294505819
67	NC_014032	TCG	2	6	3471	3476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505819
68	NC_014032	GCC	2	6	3477	3482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505819
69	NC_014032	TCG	2	6	4479	4484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505820
70	NC_014032	CGG	2	6	4641	4646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505820
71	NC_014032	TCG	2	6	4814	4819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505820
72	NC_014032	TCT	2	6	4922	4927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294505820
73	NC_014032	CCG	2	6	4939	4944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505820
74	NC_014032	GGA	2	6	5014	5019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505820
75	NC_014032	CGA	2	6	5562	5567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505821
76	NC_014032	ACC	2	6	5664	5669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294505821
77	NC_014032	ATC	2	6	5972	5977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294505821
78	NC_014032	ACC	2	6	6014	6019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294505821
79	NC_014032	TCG	2	6	6054	6059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505821
80	NC_014032	GTC	2	6	6086	6091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505821
81	NC_014032	TCT	2	6	6216	6221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294505821
82	NC_014032	AGC	2	6	6237	6242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505821
83	NC_014032	ATG	2	6	6292	6297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294505821
84	NC_014032	TCG	2	6	6445	6450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505822
85	NC_014032	ACC	2	6	6472	6477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294505822
86	NC_014032	CGC	2	6	6525	6530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505822
87	NC_014032	GAC	2	6	6537	6542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505822
88	NC_014032	CCT	2	6	6554	6559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505822
89	NC_014032	CAC	2	6	6651	6656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294505822
90	NC_014032	GTC	2	6	6774	6779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505822
91	NC_014032	TCC	2	6	7036	7041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505822
92	NC_014032	CAC	2	6	7164	7169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294505822
93	NC_014032	CGG	2	6	7193	7198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505822
94	NC_014032	CAC	2	6	7233	7238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294505822
95	NC_014032	CCG	2	6	7467	7472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505823
96	NC_014032	GTT	2	6	7529	7534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294505823
97	NC_014032	CGA	2	6	7681	7686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505823
98	NC_014032	CTG	2	6	7853	7858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505823
99	NC_014032	CTC	2	6	7862	7867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505823
100	NC_014032	CGT	2	6	7894	7899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505823
101	NC_014032	TCG	2	6	7902	7907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505823
102	NC_014032	CAC	2	6	7928	7933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294505823
103	NC_014032	GGC	2	6	8027	8032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505823
104	NC_014032	GAC	2	6	8394	8399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505824
105	NC_014032	GAG	2	6	8457	8462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505824
106	NC_014032	GCG	2	6	8473	8478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505824
107	NC_014032	GCA	2	6	8504	8509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505824
108	NC_014032	CGA	2	6	8585	8590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505824
109	NC_014032	GCC	2	6	8595	8600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505824
110	NC_014032	ACG	2	6	8611	8616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505824
111	NC_014032	ATC	2	6	8619	8624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294505824
112	NC_014032	GGA	2	6	8704	8709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505825
113	NC_014032	CCT	2	6	8710	8715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505825
114	NC_014032	GAC	2	6	8735	8740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505825
115	NC_014032	GCC	2	6	8834	8839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505825
116	NC_014032	AGG	2	6	8859	8864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505825
117	NC_014032	GGC	2	6	8875	8880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505825
118	NC_014032	GAC	2	6	8974	8979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505825
119	NC_014032	CGT	2	6	8990	8995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505825
120	NC_014032	CAT	2	6	9085	9090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294505825
121	NC_014032	CCT	2	6	9151	9156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505825
122	NC_014032	GAA	2	6	9191	9196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294505825
123	NC_014032	CCG	2	6	9231	9236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505825
124	NC_014032	GGA	2	6	9262	9267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505825
125	NC_014032	TTC	2	6	9392	9397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294505826
126	NC_014032	GAG	2	6	9413	9418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505826
127	NC_014032	GAC	2	6	9437	9442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505826
128	NC_014032	CAA	2	6	9487	9492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294505826
129	NC_014032	AGA	2	6	9493	9498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294505826
130	NC_014032	CGC	2	6	9504	9509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505826
131	NC_014032	TCG	2	6	9560	9565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505826
132	NC_014032	TGG	2	6	9610	9615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294505826
133	NC_014032	GTG	2	6	9716	9721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294505826
134	NC_014032	ACG	3	9	9865	9873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505826
135	NC_014032	GTC	2	6	9989	9994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505826
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139	NC_014032	CGG	2	6	10114	10119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505826
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142	NC_014032	CGC	2	6	10192	10197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505826
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154	NC_014032	CGG	2	6	11050	11055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505827
155	NC_014032	TCT	2	6	11097	11102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294505827
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161	NC_014032	TTC	2	6	11380	11385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294505828
162	NC_014032	CAG	2	6	11389	11394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505828
163	NC_014032	TCC	2	6	11396	11401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505828
164	NC_014032	CGG	2	6	11458	11463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505828
165	NC_014032	GAC	2	6	11480	11485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505828
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169	NC_014032	CGG	3	9	11712	11720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505828
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242	NC_014032	CGG	2	6	17332	17337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505832
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248	NC_014032	ATT	2	6	17770	17775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294505833
249	NC_014032	CGT	2	6	17778	17783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505833
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251	NC_014032	TCA	2	6	17852	17857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294505833
252	NC_014032	CTG	2	6	17869	17874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505833
253	NC_014032	GAA	2	6	17925	17930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294505833
254	NC_014032	AGG	2	6	17939	17944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505833
255	NC_014032	CCG	2	6	17945	17950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505833
256	NC_014032	AGC	2	6	18032	18037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505833
257	NC_014032	CGT	3	9	18171	18179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505833
258	NC_014032	CGG	2	6	18185	18190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505833
259	NC_014032	GAG	2	6	18223	18228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505833
260	NC_014032	CGC	2	6	18288	18293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505833
261	NC_014032	TCA	2	6	18311	18316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294505833
262	NC_014032	CTT	2	6	18318	18323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294505833
263	NC_014032	CGA	2	6	18330	18335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505833
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265	NC_014032	GCC	2	6	18385	18390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505833
266	NC_014032	TCA	2	6	18422	18427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294505833
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270	NC_014032	CTG	2	6	18732	18737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505834
271	NC_014032	TCA	2	6	18810	18815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294505834
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274	NC_014032	TGG	2	6	19018	19023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294505834
275	NC_014032	CTC	2	6	19137	19142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505834
276	NC_014032	CGT	2	6	19168	19173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505834
277	NC_014032	TCC	2	6	19293	19298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505834
278	NC_014032	AGG	2	6	19330	19335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505834
279	NC_014032	GCC	2	6	19336	19341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505834
280	NC_014032	GCG	3	9	19383	19391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505834
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283	NC_014032	ACC	2	6	19618	19623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294505834
284	NC_014032	GGA	2	6	19637	19642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294505834
285	NC_014032	CGC	3	9	19645	19653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294505834
286	NC_014032	GCG	2	6	19822	19827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505834
287	NC_014032	AGT	2	6	19828	19833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294505834
288	NC_014032	ATC	2	6	19974	19979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294505835
289	NC_014032	GTG	2	6	20028	20033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294505835
290	NC_014032	TGA	2	6	20041	20046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294505835
291	NC_014032	ACG	2	6	20056	20061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505835
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373	NC_014032	CAC	2	6	25698	25703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294505840
374	NC_014032	GCG	2	6	25717	25722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505840
375	NC_014032	TCG	2	6	25771	25776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505840
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377	NC_014032	GCG	2	6	25845	25850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294505840
378	NC_014032	AGC	2	6	25852	25857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294505840
379	NC_014032	GAT	2	6	25869	25874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294505840
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381	NC_014032	GTG	2	6	25915	25920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294505840
382	NC_014032	GTA	2	6	25932	25937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294505840
383	NC_014032	TCC	2	6	25951	25956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294505840
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499	NC_014032	TCG	3	9	32353	32361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505847
500	NC_014032	CGT	2	6	32607	32612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294505848

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