MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salinibacter ruber M8 plasmid pSR61

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014030	ATCAC	2	10	1155	1164	40 %	20 %	0 %	40 %	294505655
2	NC_014030	AAAAG	2	10	1246	1255	80 %	0 %	20 %	0 %	294505655
3	NC_014030	GATTG	2	10	1802	1811	20 %	40 %	40 %	0 %	294505655
4	NC_014030	AGATG	2	10	4767	4776	40 %	20 %	40 %	0 %	294505660
5	NC_014030	TGAGC	2	10	6858	6867	20 %	20 %	40 %	20 %	294505663
6	NC_014030	CTTTG	2	10	12004	12013	0 %	60 %	20 %	20 %	294505666
7	NC_014030	CACGC	2	10	13430	13439	20 %	0 %	20 %	60 %	294505669
8	NC_014030	TCGAG	2	10	21207	21216	20 %	20 %	40 %	20 %	294505678
9	NC_014030	GGCAC	2	10	24435	24444	20 %	0 %	40 %	40 %	294505681
10	NC_014030	CTTCC	2	10	25398	25407	0 %	40 %	0 %	60 %	294505681
11	NC_014030	CGCAC	2	10	27905	27914	20 %	0 %	20 %	60 %	294505682
12	NC_014030	CGGGG	2	10	27945	27954	0 %	0 %	80 %	20 %	294505682
13	NC_014030	GAGAA	2	10	29260	29269	60 %	0 %	40 %	0 %	294505683
14	NC_014030	CCAGC	2	10	29374	29383	20 %	0 %	20 %	60 %	294505683
15	NC_014030	GCGAC	2	10	31084	31093	20 %	0 %	40 %	40 %	294505683
16	NC_014030	GCCGG	2	10	34188	34197	0 %	0 %	60 %	40 %	294505683
17	NC_014030	CGGCG	2	10	34256	34265	0 %	0 %	60 %	40 %	294505683
18	NC_014030	GATCG	2	10	34512	34521	20 %	20 %	40 %	20 %	294505683
19	NC_014030	TGGCC	2	10	34748	34757	0 %	20 %	40 %	40 %	294505683
20	NC_014030	CTGGC	2	10	34855	34864	0 %	20 %	40 %	40 %	294505683
21	NC_014030	CGGCC	2	10	36217	36226	0 %	0 %	40 %	60 %	294505683
22	NC_014030	CGGAC	2	10	42102	42111	20 %	0 %	40 %	40 %	294505688
23	NC_014030	GTCCA	2	10	42313	42322	20 %	20 %	20 %	40 %	294505688
24	NC_014030	GGGCT	2	10	45423	45432	0 %	20 %	60 %	20 %	294505688
25	NC_014030	AGCGC	2	10	45530	45539	20 %	0 %	40 %	40 %	294505688
26	NC_014030	TCTCT	2	10	46497	46506	0 %	60 %	0 %	40 %	294505689
27	NC_014030	CCGTT	2	10	47179	47188	0 %	40 %	20 %	40 %	294505689
28	NC_014030	TCCAA	2	10	47854	47863	40 %	20 %	0 %	40 %	294505690
29	NC_014030	GTTTG	2	10	48622	48631	0 %	60 %	40 %	0 %	294505691
30	NC_014030	CCAGA	2	10	48880	48889	40 %	0 %	20 %	40 %	294505691
31	NC_014030	GGACG	2	10	49110	49119	20 %	0 %	60 %	20 %	294505691
32	NC_014030	CGATC	2	10	49848	49857	20 %	20 %	20 %	40 %	294505691
33	NC_014030	CTGGG	2	10	52781	52790	0 %	20 %	60 %	20 %	294505693
34	NC_014030	CTGGG	2	10	53078	53087	0 %	20 %	60 %	20 %	294505693
35	NC_014030	GCATT	2	10	53634	53643	20 %	40 %	20 %	20 %	294505693
36	NC_014030	CGACA	2	10	53671	53680	40 %	0 %	20 %	40 %	294505693
37	NC_014030	CCGAA	2	10	54321	54330	40 %	0 %	20 %	40 %	294505694
38	NC_014030	GGGCA	2	10	54332	54341	20 %	0 %	60 %	20 %	294505694
39	NC_014030	GCACA	2	10	56327	56336	40 %	0 %	20 %	40 %	294505696
40	NC_014030	CTGTC	2	10	57321	57330	0 %	40 %	20 %	40 %	294505697
41	NC_014030	TTCCA	2	10	59303	59312	20 %	40 %	0 %	40 %	294505700
42	NC_014030	CAACG	2	10	60579	60588	40 %	0 %	20 %	40 %	294505702

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.