MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salinibacter ruber M8 plasmid pSR61

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014030	GCCA	2	8	97	104	25 %	0 %	25 %	50 %	294505654
2	NC_014030	ACTC	2	8	678	685	25 %	25 %	0 %	50 %	294505655
3	NC_014030	TGCT	2	8	705	712	0 %	50 %	25 %	25 %	294505655
4	NC_014030	GACA	2	8	898	905	50 %	0 %	25 %	25 %	294505655
5	NC_014030	AGAT	2	8	1029	1036	50 %	25 %	25 %	0 %	294505655
6	NC_014030	TCGG	2	8	1185	1192	0 %	25 %	50 %	25 %	294505655
7	NC_014030	GGGC	2	8	2116	2123	0 %	0 %	75 %	25 %	294505656
8	NC_014030	AAAT	2	8	2274	2281	75 %	25 %	0 %	0 %	294505656
9	NC_014030	CCAT	2	8	2651	2658	25 %	25 %	0 %	50 %	294505656
10	NC_014030	TCGG	2	8	3174	3181	0 %	25 %	50 %	25 %	294505657
11	NC_014030	ACCC	2	8	3518	3525	25 %	0 %	0 %	75 %	294505657
12	NC_014030	CGGG	2	8	3694	3701	0 %	0 %	75 %	25 %	294505657
13	NC_014030	GAAG	2	8	4369	4376	50 %	0 %	50 %	0 %	294505659
14	NC_014030	GTGA	2	8	4439	4446	25 %	25 %	50 %	0 %	294505659
15	NC_014030	CGGT	2	8	4473	4480	0 %	25 %	50 %	25 %	294505659
16	NC_014030	GGAT	2	8	5043	5050	25 %	25 %	50 %	0 %	294505661
17	NC_014030	GAAG	2	8	5087	5094	50 %	0 %	50 %	0 %	294505661
18	NC_014030	GAAA	2	8	5942	5949	75 %	0 %	25 %	0 %	294505662
19	NC_014030	GATG	2	8	6152	6159	25 %	25 %	50 %	0 %	294505662
20	NC_014030	CTAC	2	8	8340	8347	25 %	25 %	0 %	50 %	294505664
21	NC_014030	ATCG	2	8	8501	8508	25 %	25 %	25 %	25 %	294505664
22	NC_014030	GCCA	2	8	8690	8697	25 %	0 %	25 %	50 %	294505664
23	NC_014030	GCAG	2	8	12065	12072	25 %	0 %	50 %	25 %	294505666
24	NC_014030	TGCA	2	8	12426	12433	25 %	25 %	25 %	25 %	294505666
25	NC_014030	CCTC	2	8	12858	12865	0 %	25 %	0 %	75 %	294505667
26	NC_014030	CGGT	2	8	12933	12940	0 %	25 %	50 %	25 %	294505667
27	NC_014030	TCCC	2	8	13035	13042	0 %	25 %	0 %	75 %	294505668
28	NC_014030	CGCT	2	8	13369	13376	0 %	25 %	25 %	50 %	294505669
29	NC_014030	CTTT	2	8	13484	13491	0 %	75 %	0 %	25 %	294505669
30	NC_014030	GCGA	2	8	13639	13646	25 %	0 %	50 %	25 %	294505670
31	NC_014030	CTTT	2	8	13672	13679	0 %	75 %	0 %	25 %	294505670
32	NC_014030	GGCA	2	8	13804	13811	25 %	0 %	50 %	25 %	294505670
33	NC_014030	CCGG	2	8	14146	14153	0 %	0 %	50 %	50 %	294505670
34	NC_014030	TTCC	2	8	14978	14985	0 %	50 %	0 %	50 %	294505671
35	NC_014030	CCGA	2	8	15246	15253	25 %	0 %	25 %	50 %	294505671
36	NC_014030	CGAG	2	8	15290	15297	25 %	0 %	50 %	25 %	294505671
37	NC_014030	CCGG	2	8	15912	15919	0 %	0 %	50 %	50 %	294505672
38	NC_014030	CGGT	2	8	16330	16337	0 %	25 %	50 %	25 %	294505673
39	NC_014030	CGCC	2	8	16589	16596	0 %	0 %	25 %	75 %	294505673
40	NC_014030	GCCG	2	8	16617	16624	0 %	0 %	50 %	50 %	294505673
41	NC_014030	AGCC	2	8	17645	17652	25 %	0 %	25 %	50 %	294505674
42	NC_014030	TCCT	2	8	18227	18234	0 %	50 %	0 %	50 %	294505674
43	NC_014030	TCCA	2	8	19074	19081	25 %	25 %	0 %	50 %	294505675
44	NC_014030	ACTC	2	8	19610	19617	25 %	25 %	0 %	50 %	294505675
45	NC_014030	AAGG	2	8	19644	19651	50 %	0 %	50 %	0 %	294505676
46	NC_014030	TACC	2	8	19845	19852	25 %	25 %	0 %	50 %	294505676
47	NC_014030	GGGA	2	8	20984	20991	25 %	0 %	75 %	0 %	294505678
48	NC_014030	TCGG	2	8	21036	21043	0 %	25 %	50 %	25 %	294505678
49	NC_014030	TGCA	2	8	21137	21144	25 %	25 %	25 %	25 %	294505678
50	NC_014030	AGAA	2	8	21622	21629	75 %	0 %	25 %	0 %	294505679
51	NC_014030	TCCC	2	8	23069	23076	0 %	25 %	0 %	75 %	294505680
52	NC_014030	AAGA	2	8	23227	23234	75 %	0 %	25 %	0 %	294505680
53	NC_014030	TCGG	2	8	23918	23925	0 %	25 %	50 %	25 %	294505681
54	NC_014030	CGGC	2	8	24273	24280	0 %	0 %	50 %	50 %	294505681
55	NC_014030	GGGA	2	8	24326	24333	25 %	0 %	75 %	0 %	294505681
56	NC_014030	CTGC	2	8	24393	24400	0 %	25 %	25 %	50 %	294505681
57	NC_014030	CGGA	2	8	24716	24723	25 %	0 %	50 %	25 %	294505681
58	NC_014030	CCCG	2	8	24724	24731	0 %	0 %	25 %	75 %	294505681
59	NC_014030	AGCC	2	8	25134	25141	25 %	0 %	25 %	50 %	294505681
60	NC_014030	CTTG	2	8	27534	27541	0 %	50 %	25 %	25 %	294505682
61	NC_014030	GGCA	2	8	27809	27816	25 %	0 %	50 %	25 %	294505682
62	NC_014030	TGGC	2	8	27897	27904	0 %	25 %	50 %	25 %	294505682
63	NC_014030	GCAC	2	8	29572	29579	25 %	0 %	25 %	50 %	294505683
64	NC_014030	ATTT	2	8	29625	29632	25 %	75 %	0 %	0 %	294505683
65	NC_014030	TCGA	2	8	29679	29686	25 %	25 %	25 %	25 %	294505683
66	NC_014030	TCAA	2	8	30370	30377	50 %	25 %	0 %	25 %	294505683
67	NC_014030	TCAA	2	8	30445	30452	50 %	25 %	0 %	25 %	294505683
68	NC_014030	TCAA	2	8	30895	30902	50 %	25 %	0 %	25 %	294505683
69	NC_014030	GAAG	2	8	31271	31278	50 %	0 %	50 %	0 %	294505683
70	NC_014030	GACC	2	8	31307	31314	25 %	0 %	25 %	50 %	294505683
71	NC_014030	CGCA	2	8	32460	32467	25 %	0 %	25 %	50 %	294505683
72	NC_014030	CCAG	2	8	32789	32796	25 %	0 %	25 %	50 %	294505683
73	NC_014030	GTTC	2	8	32951	32958	0 %	50 %	25 %	25 %	294505683
74	NC_014030	CCGG	2	8	33157	33164	0 %	0 %	50 %	50 %	294505683
75	NC_014030	CCTC	2	8	33382	33389	0 %	25 %	0 %	75 %	294505683
76	NC_014030	TCAA	2	8	33643	33650	50 %	25 %	0 %	25 %	294505683
77	NC_014030	CCGA	2	8	34068	34075	25 %	0 %	25 %	50 %	294505683
78	NC_014030	CGGT	2	8	34710	34717	0 %	25 %	50 %	25 %	294505683
79	NC_014030	GGCG	2	8	34997	35004	0 %	0 %	75 %	25 %	294505683
80	NC_014030	CGGG	2	8	35881	35888	0 %	0 %	75 %	25 %	294505683
81	NC_014030	CTCC	2	8	36071	36078	0 %	25 %	0 %	75 %	294505683
82	NC_014030	CAGT	2	8	41619	41626	25 %	25 %	25 %	25 %	294505688
83	NC_014030	CAGG	2	8	42287	42294	25 %	0 %	50 %	25 %	294505688
84	NC_014030	CGAC	2	8	43101	43108	25 %	0 %	25 %	50 %	294505688
85	NC_014030	CGAG	2	8	43641	43648	25 %	0 %	50 %	25 %	294505688
86	NC_014030	CCGG	2	8	43911	43918	0 %	0 %	50 %	50 %	294505688
87	NC_014030	CCGC	2	8	44177	44184	0 %	0 %	25 %	75 %	294505688
88	NC_014030	GCCG	2	8	44628	44635	0 %	0 %	50 %	50 %	294505688
89	NC_014030	GCGA	2	8	44969	44976	25 %	0 %	50 %	25 %	294505688
90	NC_014030	CCGG	2	8	45136	45143	0 %	0 %	50 %	50 %	294505688
91	NC_014030	CGGT	2	8	45299	45306	0 %	25 %	50 %	25 %	294505688
92	NC_014030	CGGC	2	8	45711	45718	0 %	0 %	50 %	50 %	294505688
93	NC_014030	AGCC	2	8	45755	45762	25 %	0 %	25 %	50 %	294505688
94	NC_014030	CGGC	2	8	46066	46073	0 %	0 %	50 %	50 %	294505688
95	NC_014030	CTTT	2	8	46386	46393	0 %	75 %	0 %	25 %	294505689
96	NC_014030	TCCT	2	8	46425	46432	0 %	50 %	0 %	50 %	294505689
97	NC_014030	GCCG	2	8	46637	46644	0 %	0 %	50 %	50 %	294505689
98	NC_014030	CTCC	2	8	47538	47545	0 %	25 %	0 %	75 %	294505690
99	NC_014030	ACCG	2	8	47729	47736	25 %	0 %	25 %	50 %	294505690
100	NC_014030	GTAG	2	8	47781	47788	25 %	25 %	50 %	0 %	294505690
101	NC_014030	TCCA	2	8	47819	47826	25 %	25 %	0 %	50 %	294505690
102	NC_014030	CGAG	2	8	49151	49158	25 %	0 %	50 %	25 %	294505691
103	NC_014030	CAGC	2	8	49516	49523	25 %	0 %	25 %	50 %	294505691
104	NC_014030	CGGA	2	8	49649	49656	25 %	0 %	50 %	25 %	294505691
105	NC_014030	GCGG	2	8	49885	49892	0 %	0 %	75 %	25 %	294505691
106	NC_014030	CGAG	2	8	50072	50079	25 %	0 %	50 %	25 %	294505691
107	NC_014030	CAGA	2	8	50386	50393	50 %	0 %	25 %	25 %	294505691
108	NC_014030	TTAG	2	8	50578	50585	25 %	50 %	25 %	0 %	294505691
109	NC_014030	GAAC	2	8	50777	50784	50 %	0 %	25 %	25 %	294505691
110	NC_014030	GGGA	2	8	50928	50935	25 %	0 %	75 %	0 %	294505691
111	NC_014030	GTCG	2	8	51289	51296	0 %	25 %	50 %	25 %	294505691
112	NC_014030	ACTG	2	8	51674	51681	25 %	25 %	25 %	25 %	294505692
113	NC_014030	CCAT	2	8	52031	52038	25 %	25 %	0 %	50 %	294505692
114	NC_014030	GGCA	2	8	54310	54317	25 %	0 %	50 %	25 %	294505694
115	NC_014030	CGGC	2	8	54403	54410	0 %	0 %	50 %	50 %	294505694
116	NC_014030	CGGC	2	8	55067	55074	0 %	0 %	50 %	50 %	294505695
117	NC_014030	GGCG	2	8	55095	55102	0 %	0 %	75 %	25 %	294505695
118	NC_014030	ACCG	2	8	55354	55361	25 %	0 %	25 %	50 %	294505695
119	NC_014030	AGAC	2	8	56716	56723	50 %	0 %	25 %	25 %	294505696
120	NC_014030	TTGG	2	8	57241	57248	0 %	50 %	50 %	0 %	294505697
121	NC_014030	GACA	2	8	57932	57939	50 %	0 %	25 %	25 %	294505699
122	NC_014030	ATTG	2	8	58279	58286	25 %	50 %	25 %	0 %	294505699
123	NC_014030	GATC	2	8	58883	58890	25 %	25 %	25 %	25 %	294505700
124	NC_014030	ACCG	2	8	58908	58915	25 %	0 %	25 %	50 %	294505700
125	NC_014030	GATC	2	8	58943	58950	25 %	25 %	25 %	25 %	294505700
126	NC_014030	CCAC	2	8	59913	59920	25 %	0 %	0 %	75 %	294505701
127	NC_014030	CTTT	2	8	60343	60350	0 %	75 %	0 %	25 %	294505702
128	NC_014030	AAAG	2	8	60666	60673	75 %	0 %	25 %	0 %	294505702
129	NC_014030	TGCC	2	8	60686	60693	0 %	25 %	25 %	50 %	294505702
130	NC_014030	GAGG	2	8	60747	60754	25 %	0 %	75 %	0 %	294505702
131	NC_014030	CCGT	2	8	61023	61030	0 %	25 %	25 %	50 %	294505703

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.