MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Salinibacter ruber M8 plasmid pSR56

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014028	GC	3	6	192	197	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
2	NC_014028	GC	4	8	310	317	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
3	NC_014028	GC	4	8	430	437	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
4	NC_014028	GC	3	6	552	557	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
5	NC_014028	GC	3	6	672	677	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
6	NC_014028	CT	3	6	736	741	0 %	50 %	0 %	50 %	294502070
7	NC_014028	GC	3	6	792	797	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
8	NC_014028	GC	3	6	912	917	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
9	NC_014028	CG	3	6	1031	1036	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
10	NC_014028	GC	3	6	1152	1157	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
11	NC_014028	GC	4	8	1270	1277	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
12	NC_014028	CG	3	6	1391	1396	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
13	NC_014028	CG	3	6	1511	1516	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
14	NC_014028	GC	4	8	1630	1637	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
15	NC_014028	CG	3	6	1751	1756	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
16	NC_014028	GC	3	6	1872	1877	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
17	NC_014028	GC	4	8	1990	1997	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
18	NC_014028	CG	3	6	2111	2116	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
19	NC_014028	CG	3	6	2231	2236	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
20	NC_014028	CG	3	6	2351	2356	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
21	NC_014028	GC	3	6	2443	2448	0 %	0 %	50 %	50 %	294502070
22	NC_014028	GA	4	8	2478	2485	50 %	0 %	50 %	0 %	294502070
23	NC_014028	GA	3	6	3432	3437	50 %	0 %	50 %	0 %	294502071
24	NC_014028	GC	3	6	5608	5613	0 %	0 %	50 %	50 %	294502074
25	NC_014028	TC	3	6	6008	6013	0 %	50 %	0 %	50 %	294502075
26	NC_014028	GT	3	6	6260	6265	0 %	50 %	50 %	0 %	294502075
27	NC_014028	GA	3	6	7051	7056	50 %	0 %	50 %	0 %	294502075
28	NC_014028	TC	3	6	9822	9827	0 %	50 %	0 %	50 %	294502079
29	NC_014028	GA	3	6	10527	10532	50 %	0 %	50 %	0 %	294502080
30	NC_014028	CG	3	6	11615	11620	0 %	0 %	50 %	50 %	294502080
31	NC_014028	GC	3	6	12139	12144	0 %	0 %	50 %	50 %	294502080
32	NC_014028	TC	3	6	13873	13878	0 %	50 %	0 %	50 %	294502081
33	NC_014028	TC	3	6	14587	14592	0 %	50 %	0 %	50 %	294502082
34	NC_014028	CG	3	6	15234	15239	0 %	0 %	50 %	50 %	294502082
35	NC_014028	GC	3	6	15320	15325	0 %	0 %	50 %	50 %	294502082
36	NC_014028	AG	3	6	15416	15421	50 %	0 %	50 %	0 %	294502082
37	NC_014028	CG	3	6	15646	15651	0 %	0 %	50 %	50 %	294502083
38	NC_014028	GC	4	8	16457	16464	0 %	0 %	50 %	50 %	294502083
39	NC_014028	TC	3	6	16948	16953	0 %	50 %	0 %	50 %	294502083
40	NC_014028	CT	3	6	17540	17545	0 %	50 %	0 %	50 %	294502083
41	NC_014028	CT	3	6	21828	21833	0 %	50 %	0 %	50 %	294502087
42	NC_014028	AG	3	6	23163	23168	50 %	0 %	50 %	0 %	294502087
43	NC_014028	CT	4	8	23677	23684	0 %	50 %	0 %	50 %	294502087
44	NC_014028	AG	3	6	24780	24785	50 %	0 %	50 %	0 %	294502087
45	NC_014028	TC	3	6	24829	24834	0 %	50 %	0 %	50 %	294502087
46	NC_014028	CG	3	6	25004	25009	0 %	0 %	50 %	50 %	294502087
47	NC_014028	CT	3	6	26578	26583	0 %	50 %	0 %	50 %	294502088
48	NC_014028	AG	4	8	27122	27129	50 %	0 %	50 %	0 %	294502088
49	NC_014028	TC	3	6	27256	27261	0 %	50 %	0 %	50 %	294502088
50	NC_014028	CG	3	6	27359	27364	0 %	0 %	50 %	50 %	294502088
51	NC_014028	CG	3	6	27484	27489	0 %	0 %	50 %	50 %	294502088
52	NC_014028	GC	3	6	27613	27618	0 %	0 %	50 %	50 %	294502088
53	NC_014028	TC	3	6	28420	28425	0 %	50 %	0 %	50 %	294502088
54	NC_014028	CT	3	6	28734	28739	0 %	50 %	0 %	50 %	294502088
55	NC_014028	GC	3	6	29103	29108	0 %	0 %	50 %	50 %	294502089
56	NC_014028	CA	3	6	30517	30522	50 %	0 %	0 %	50 %	294502090
57	NC_014028	GC	3	6	31085	31090	0 %	0 %	50 %	50 %	294502090
58	NC_014028	CG	4	8	31143	31150	0 %	0 %	50 %	50 %	294502090
59	NC_014028	AG	4	8	31229	31236	50 %	0 %	50 %	0 %	294502090
60	NC_014028	CG	3	6	31746	31751	0 %	0 %	50 %	50 %	294502091
61	NC_014028	CT	3	6	31948	31953	0 %	50 %	0 %	50 %	294502091
62	NC_014028	GC	3	6	32233	32238	0 %	0 %	50 %	50 %	294502092
63	NC_014028	AC	3	6	34085	34090	50 %	0 %	0 %	50 %	294502092
64	NC_014028	GC	3	6	34811	34816	0 %	0 %	50 %	50 %	294502092
65	NC_014028	TC	3	6	35077	35082	0 %	50 %	0 %	50 %	294502092
66	NC_014028	TC	3	6	35668	35673	0 %	50 %	0 %	50 %	294502093
67	NC_014028	CT	3	6	35856	35861	0 %	50 %	0 %	50 %	294502093
68	NC_014028	TC	3	6	36127	36132	0 %	50 %	0 %	50 %	294502093
69	NC_014028	TC	3	6	36860	36865	0 %	50 %	0 %	50 %	294502094
70	NC_014028	CT	3	6	36878	36883	0 %	50 %	0 %	50 %	294502094
71	NC_014028	CT	4	8	37200	37207	0 %	50 %	0 %	50 %	294502094
72	NC_014028	GA	3	6	37958	37963	50 %	0 %	50 %	0 %	294502094
73	NC_014028	GA	4	8	39718	39725	50 %	0 %	50 %	0 %	294502095
74	NC_014028	GA	3	6	40212	40217	50 %	0 %	50 %	0 %	294502097
75	NC_014028	GA	3	6	40765	40770	50 %	0 %	50 %	0 %	294502097
76	NC_014028	CG	3	6	41162	41167	0 %	0 %	50 %	50 %	294502098
77	NC_014028	AG	3	6	41312	41317	50 %	0 %	50 %	0 %	294502098
78	NC_014028	TC	3	6	42789	42794	0 %	50 %	0 %	50 %	294502099
79	NC_014028	TC	3	6	43182	43187	0 %	50 %	0 %	50 %	294502099
80	NC_014028	TC	3	6	43386	43391	0 %	50 %	0 %	50 %	294502099
81	NC_014028	CT	3	6	46211	46216	0 %	50 %	0 %	50 %	294502101
82	NC_014028	TC	4	8	48379	48386	0 %	50 %	0 %	50 %	294502104
83	NC_014028	CG	3	6	48792	48797	0 %	0 %	50 %	50 %	294502104
84	NC_014028	GA	3	6	49675	49680	50 %	0 %	50 %	0 %	294502105
85	NC_014028	CT	3	6	50517	50522	0 %	50 %	0 %	50 %	294502106
86	NC_014028	GC	3	6	50757	50762	0 %	0 %	50 %	50 %	294502106
87	NC_014028	CG	3	6	51096	51101	0 %	0 %	50 %	50 %	294502106
88	NC_014028	CG	3	6	51314	51319	0 %	0 %	50 %	50 %	294502106
89	NC_014028	GC	4	8	52594	52601	0 %	0 %	50 %	50 %	294502107

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.