MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salinibacter ruber M8 plasmid pSR56

Total Repeats: 953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014028	AAG	2	6	27581	27586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502088
502	NC_014028	GC	3	6	27613	27618	0 %	0 %	50 %	50 %	294502088
503	NC_014028	ATA	2	6	27644	27649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294502088
504	NC_014028	TCT	2	6	27663	27668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502088
505	NC_014028	CCTC	2	8	27739	27746	0 %	25 %	0 %	75 %	294502088
506	NC_014028	TCGC	2	8	27789	27796	0 %	25 %	25 %	50 %	294502088
507	NC_014028	CGT	2	6	27841	27846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502088
508	NC_014028	GAAA	2	8	27856	27863	75 %	0 %	25 %	0 %	294502088
509	NC_014028	CGG	2	6	27882	27887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502088
510	NC_014028	CTC	2	6	27893	27898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502088
511	NC_014028	TGC	2	6	28065	28070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502088
512	NC_014028	CAG	3	9	28109	28117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502088
513	NC_014028	ACCG	2	8	28301	28308	25 %	0 %	25 %	50 %	294502088
514	NC_014028	TTC	2	6	28322	28327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502088
515	NC_014028	CTC	2	6	28328	28333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502088
516	NC_014028	CAG	2	6	28364	28369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502088
517	NC_014028	TC	3	6	28420	28425	0 %	50 %	0 %	50 %	294502088
518	NC_014028	CTC	2	6	28440	28445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502088
519	NC_014028	GAT	2	6	28571	28576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502088
520	NC_014028	T	6	6	28590	28595	0 %	100 %	0 %	0 %	294502088
521	NC_014028	CGCGG	2	10	28658	28667	0 %	0 %	60 %	40 %	294502088
522	NC_014028	TAG	2	6	28690	28695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502088
523	NC_014028	TAC	2	6	28715	28720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502088
524	NC_014028	CAC	2	6	28727	28732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502088
525	NC_014028	CT	3	6	28734	28739	0 %	50 %	0 %	50 %	294502088
526	NC_014028	GCT	2	6	28764	28769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502088
527	NC_014028	GCCA	2	8	29022	29029	25 %	0 %	25 %	50 %	294502089
528	NC_014028	ACACC	2	10	29046	29055	40 %	0 %	0 %	60 %	294502089
529	NC_014028	CCGCT	2	10	29058	29067	0 %	20 %	20 %	60 %	294502089
530	NC_014028	GC	3	6	29103	29108	0 %	0 %	50 %	50 %	294502089
531	NC_014028	CTC	2	6	29131	29136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502089
532	NC_014028	GGA	2	6	29157	29162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294502089
533	NC_014028	CCG	2	6	29181	29186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502089
534	NC_014028	CGGT	2	8	29300	29307	0 %	25 %	50 %	25 %	294502089
535	NC_014028	GTT	2	6	29425	29430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502089
536	NC_014028	CCG	2	6	29535	29540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502089
537	NC_014028	GCT	2	6	29559	29564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502089
538	NC_014028	GGCG	2	8	29611	29618	0 %	0 %	75 %	25 %	294502089
539	NC_014028	TCC	2	6	29696	29701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502089
540	NC_014028	CTT	2	6	29704	29709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502089
541	NC_014028	TCGG	2	8	29805	29812	0 %	25 %	50 %	25 %	294502089
542	NC_014028	TCG	2	6	30029	30034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502090
543	NC_014028	GAC	2	6	30040	30045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502090
544	NC_014028	CAG	2	6	30099	30104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502090
545	NC_014028	CCA	2	6	30182	30187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502090
546	NC_014028	TCC	2	6	30203	30208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502090
547	NC_014028	GCA	2	6	30279	30284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502090
548	NC_014028	CCT	2	6	30324	30329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502090
549	NC_014028	TCCT	2	8	30364	30371	0 %	50 %	0 %	50 %	294502090
550	NC_014028	ATC	2	6	30433	30438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502090
551	NC_014028	CGG	3	9	30496	30504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502090
552	NC_014028	CA	3	6	30517	30522	50 %	0 %	0 %	50 %	294502090
553	NC_014028	CCT	2	6	30651	30656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502090
554	NC_014028	GCCA	2	8	30658	30665	25 %	0 %	25 %	50 %	294502090
555	NC_014028	TGC	2	6	30689	30694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502090
556	NC_014028	TCT	2	6	30695	30700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502090
557	NC_014028	GGT	2	6	30702	30707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502090
558	NC_014028	AGG	2	6	30826	30831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294502090
559	NC_014028	CGA	2	6	30873	30878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502090
560	NC_014028	AGC	2	6	30956	30961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502090
561	NC_014028	CTT	2	6	30975	30980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502090
562	NC_014028	GC	3	6	31085	31090	0 %	0 %	50 %	50 %	294502090
563	NC_014028	TTC	2	6	31093	31098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502090
564	NC_014028	CCAT	2	8	31099	31106	25 %	25 %	0 %	50 %	294502090
565	NC_014028	CG	4	8	31143	31150	0 %	0 %	50 %	50 %	294502090
566	NC_014028	CTC	2	6	31168	31173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502090
567	NC_014028	AGA	2	6	31221	31226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502090
568	NC_014028	AG	4	8	31229	31236	50 %	0 %	50 %	0 %	294502090
569	NC_014028	A	6	6	31302	31307	100 %	0 %	0 %	0 %	294502090
570	NC_014028	TTC	2	6	31318	31323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502090
571	NC_014028	TCG	2	6	31337	31342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502090
572	NC_014028	CCAG	2	8	31490	31497	25 %	0 %	25 %	50 %	294502091
573	NC_014028	TCG	2	6	31498	31503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502091
574	NC_014028	GCC	2	6	31538	31543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502091
575	NC_014028	ACC	2	6	31606	31611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502091
576	NC_014028	CGG	2	6	31614	31619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502091
577	NC_014028	GAG	2	6	31626	31631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294502091
578	NC_014028	GGATCT	2	12	31697	31708	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294502091
579	NC_014028	CG	3	6	31746	31751	0 %	0 %	50 %	50 %	294502091
580	NC_014028	CCT	2	6	31787	31792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502091
581	NC_014028	CTC	2	6	31917	31922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502091
582	NC_014028	CTC	2	6	31926	31931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502091
583	NC_014028	CT	3	6	31948	31953	0 %	50 %	0 %	50 %	294502091
584	NC_014028	GCGT	2	8	31962	31969	0 %	25 %	50 %	25 %	294502091
585	NC_014028	GCCT	2	8	31995	32002	0 %	25 %	25 %	50 %	294502091
586	NC_014028	CGG	2	6	32027	32032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502091
587	NC_014028	CGT	2	6	32154	32159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502091
588	NC_014028	GC	3	6	32233	32238	0 %	0 %	50 %	50 %	294502092
589	NC_014028	AGCG	2	8	32270	32277	25 %	0 %	50 %	25 %	294502092
590	NC_014028	CCA	2	6	32324	32329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502092
591	NC_014028	CTC	2	6	32363	32368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502092
592	NC_014028	GCT	2	6	32374	32379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502092
593	NC_014028	GTC	2	6	32417	32422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502092
594	NC_014028	CCT	2	6	32476	32481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502092
595	NC_014028	CGATGG	2	12	32485	32496	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294502092
596	NC_014028	TCTT	2	8	32538	32545	0 %	75 %	0 %	25 %	294502092
597	NC_014028	GCG	2	6	32670	32675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502092
598	NC_014028	CTT	2	6	32735	32740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502092
599	NC_014028	CTC	2	6	32762	32767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502092
600	NC_014028	TCT	2	6	32782	32787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502092
601	NC_014028	TCC	3	9	32808	32816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502092
602	NC_014028	GGC	2	6	32956	32961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502092
603	NC_014028	CCT	2	6	32992	32997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502092
604	NC_014028	CCT	2	6	33004	33009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502092
605	NC_014028	GGC	2	6	33098	33103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502092
606	NC_014028	CGA	2	6	33109	33114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502092
607	NC_014028	CCT	2	6	33115	33120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502092
608	NC_014028	CGT	2	6	33136	33141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502092
609	NC_014028	CGA	2	6	33169	33174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502092
610	NC_014028	TGG	2	6	33306	33311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502092
611	NC_014028	ACC	2	6	33312	33317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502092
612	NC_014028	AGC	2	6	33318	33323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502092
613	NC_014028	TCC	2	6	33333	33338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502092
614	NC_014028	CGG	2	6	33348	33353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502092
615	NC_014028	CTC	2	6	33368	33373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502092
616	NC_014028	GTC	2	6	33449	33454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502092
617	NC_014028	CGG	2	6	33456	33461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502092
618	NC_014028	CGC	2	6	33485	33490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502092
619	NC_014028	GGC	2	6	33496	33501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502092
620	NC_014028	TCT	2	6	33544	33549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502092
621	NC_014028	TCGC	2	8	33567	33574	0 %	25 %	25 %	50 %	294502092
622	NC_014028	GAT	2	6	33632	33637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502092
623	NC_014028	CCT	2	6	33673	33678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502092
624	NC_014028	CCT	2	6	33697	33702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502092
625	NC_014028	TGG	2	6	33723	33728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502092
626	NC_014028	AGA	2	6	33739	33744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502092
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628	NC_014028	CCG	2	6	33807	33812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502092
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884	NC_014028	GCC	2	6	49760	49765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502105
885	NC_014028	CGG	2	6	49831	49836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502105
886	NC_014028	TCG	2	6	49855	49860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502105
887	NC_014028	CCGG	2	8	49907	49914	0 %	0 %	50 %	50 %	294502105
888	NC_014028	GAAGA	2	10	49980	49989	60 %	0 %	40 %	0 %	294502105
889	NC_014028	G	7	7	50068	50074	0 %	0 %	100 %	0 %	294502105
890	NC_014028	AAG	2	6	50082	50087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502105
891	NC_014028	GAC	2	6	50103	50108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502105
892	NC_014028	TCGG	2	8	50139	50146	0 %	25 %	50 %	25 %	294502105
893	NC_014028	GGC	2	6	50230	50235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502105
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895	NC_014028	ACC	2	6	50328	50333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502105
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897	NC_014028	GGA	2	6	50354	50359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294502105
898	NC_014028	CTC	2	6	50385	50390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502105
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901	NC_014028	CCT	2	6	50423	50428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502105
902	NC_014028	GAG	2	6	50460	50465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294502105
903	NC_014028	CT	3	6	50517	50522	0 %	50 %	0 %	50 %	294502106
904	NC_014028	CGG	2	6	50547	50552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502106
905	NC_014028	GGC	2	6	50563	50568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502106
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908	NC_014028	GC	3	6	50757	50762	0 %	0 %	50 %	50 %	294502106
909	NC_014028	TTCTA	2	10	50803	50812	20 %	60 %	0 %	20 %	294502106
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914	NC_014028	GCG	2	6	51188	51193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502106
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918	NC_014028	CGGG	2	8	51506	51513	0 %	0 %	75 %	25 %	294502106
919	NC_014028	CAAA	2	8	51756	51763	75 %	0 %	0 %	25 %	294502107
920	NC_014028	CGACA	2	10	51807	51816	40 %	0 %	20 %	40 %	294502107
921	NC_014028	CTG	2	6	51827	51832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502107
922	NC_014028	CTA	2	6	51850	51855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502107
923	NC_014028	GCA	2	6	51985	51990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502107
924	NC_014028	CTA	2	6	52006	52011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502107
925	NC_014028	TTCGG	2	10	52074	52083	0 %	40 %	40 %	20 %	294502107
926	NC_014028	CGA	2	6	52105	52110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502107
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952	NC_014028	GAG	2	6	53372	53377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294502107
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