MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingobium japonicum UT26S chromosome 2

Total Repeats: 16478

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014013	CAG	2	6	242459	242464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146635
6002	NC_014013	GGC	2	6	242506	242511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146635
6003	NC_014013	GGC	2	6	242533	242538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146635
6004	NC_014013	CAGC	2	8	242539	242546	25 %	0 %	25 %	50 %	294146635
6005	NC_014013	CGC	2	6	242593	242598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146635
6006	NC_014013	ATC	2	6	242606	242611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294146635
6007	NC_014013	GCG	2	6	242681	242686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146635
6008	NC_014013	GCC	2	6	242707	242712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146635
6009	NC_014013	AGC	2	6	242762	242767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146635
6010	NC_014013	GC	3	6	242776	242781	0 %	0 %	50 %	50 %	294146635
6011	NC_014013	GCC	2	6	242818	242823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146635
6012	NC_014013	CCG	2	6	242886	242891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146635
6013	NC_014013	CAG	2	6	242908	242913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146635
6014	NC_014013	TCG	2	6	242924	242929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146635
6015	NC_014013	GGGCG	2	10	242934	242943	0 %	0 %	80 %	20 %	294146635
6016	NC_014013	CAGG	2	8	242968	242975	25 %	0 %	50 %	25 %	294146635
6017	NC_014013	CAGGG	2	10	242992	243001	20 %	0 %	60 %	20 %	294146635
6018	NC_014013	CG	3	6	243025	243030	0 %	0 %	50 %	50 %	294146635
6019	NC_014013	GAC	2	6	243052	243057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146635
6020	NC_014013	TGG	2	6	243081	243086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294146635
6021	NC_014013	GCA	2	6	243462	243467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146636
6022	NC_014013	CG	3	6	243485	243490	0 %	0 %	50 %	50 %	294146636
6023	NC_014013	CCG	2	6	243555	243560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146636
6024	NC_014013	GGC	2	6	243565	243570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146636
6025	NC_014013	CAT	2	6	243595	243600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294146636
6026	NC_014013	TCG	3	9	243681	243689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146636
6027	NC_014013	CAT	2	6	243751	243756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294146636
6028	NC_014013	GCA	2	6	243813	243818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146636
6029	NC_014013	TCA	2	6	243822	243827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294146636
6030	NC_014013	CAT	2	6	243917	243922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294146636
6031	NC_014013	CTG	2	6	244001	244006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146636
6032	NC_014013	GCG	2	6	244015	244020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146636
6033	NC_014013	CATGG	2	10	244024	244033	20 %	20 %	40 %	20 %	294146636
6034	NC_014013	TCG	2	6	244047	244052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146636
6035	NC_014013	CTG	2	6	244070	244075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146636
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6037	NC_014013	G	6	6	244100	244105	0 %	0 %	100 %	0 %	294146636
6038	NC_014013	CTG	2	6	244160	244165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146636
6039	NC_014013	CAAAT	2	10	244250	244259	60 %	20 %	0 %	20 %	294146636
6040	NC_014013	CGA	2	6	244348	244353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146637
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6042	NC_014013	CAT	2	6	244392	244397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294146637
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6045	NC_014013	GCCT	2	8	244529	244536	0 %	25 %	25 %	50 %	294146637
6046	NC_014013	CTG	2	6	244571	244576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146637
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6052	NC_014013	GGCG	2	8	244671	244678	0 %	0 %	75 %	25 %	294146637
6053	NC_014013	AGA	2	6	244716	244721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294146637
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6055	NC_014013	CGA	2	6	244792	244797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146637
6056	NC_014013	AGC	2	6	244818	244823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146637
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6058	NC_014013	GTC	2	6	244862	244867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146637
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6060	NC_014013	TGA	2	6	244938	244943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294146637
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6062	NC_014013	GCG	2	6	245015	245020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146637
6063	NC_014013	AGC	2	6	245030	245035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146637
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6065	NC_014013	CCGC	2	8	245095	245102	0 %	0 %	25 %	75 %	294146637
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6091	NC_014013	GCG	2	6	245937	245942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146638
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6100	NC_014013	CATC	2	8	246142	246149	25 %	25 %	0 %	50 %	294146638
6101	NC_014013	TGCC	2	8	246156	246163	0 %	25 %	25 %	50 %	294146638
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6242	NC_014013	CGA	2	6	251221	251226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146642
6243	NC_014013	GCC	2	6	251237	251242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146642
6244	NC_014013	GGC	2	6	251249	251254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146642
6245	NC_014013	AAT	2	6	251328	251333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294146642
6246	NC_014013	GAC	2	6	251347	251352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146643
6247	NC_014013	CTG	2	6	251353	251358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146643
6248	NC_014013	CAT	2	6	251373	251378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294146643
6249	NC_014013	ATC	2	6	251458	251463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294146643
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6251	NC_014013	GC	3	6	251641	251646	0 %	0 %	50 %	50 %	294146644
6252	NC_014013	CG	4	8	251658	251665	0 %	0 %	50 %	50 %	294146644
6253	NC_014013	GCT	2	6	251683	251688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146644
6254	NC_014013	GCGA	2	8	251735	251742	25 %	0 %	50 %	25 %	294146644
6255	NC_014013	GCG	2	6	251781	251786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146644
6256	NC_014013	CGA	2	6	251824	251829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146644
6257	NC_014013	CAT	2	6	251854	251859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294146644
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6261	NC_014013	ACA	2	6	251979	251984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294146644
6262	NC_014013	ATC	2	6	252005	252010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294146644
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6264	NC_014013	CGA	2	6	252120	252125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146645
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6266	NC_014013	GGC	2	6	252166	252171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146645
6267	NC_014013	CGGGC	2	10	252176	252185	0 %	0 %	60 %	40 %	294146645
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6271	NC_014013	GCC	2	6	252352	252357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146645
6272	NC_014013	GCC	2	6	252442	252447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146645
6273	NC_014013	CGC	2	6	252540	252545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146645
6274	NC_014013	GTG	2	6	252553	252558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294146645
6275	NC_014013	TCCC	2	8	252570	252577	0 %	25 %	0 %	75 %	294146645
6276	NC_014013	CG	3	6	252622	252627	0 %	0 %	50 %	50 %	294146645
6277	NC_014013	CGA	2	6	252630	252635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146645
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6281	NC_014013	CGC	2	6	252787	252792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146646
6282	NC_014013	GGT	2	6	252802	252807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294146646
6283	NC_014013	GCT	2	6	252817	252822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146646
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6325	NC_014013	AT	3	6	254528	254533	50 %	50 %	0 %	0 %	294146647
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6334	NC_014013	CTG	2	6	254760	254765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146647
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6337	NC_014013	GCT	2	6	254867	254872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146647
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6339	NC_014013	GTC	2	6	254925	254930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146647
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6345	NC_014013	CCGC	2	8	255325	255332	0 %	0 %	25 %	75 %	294146647
6346	NC_014013	CTG	2	6	255384	255389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146647
6347	NC_014013	GCC	2	6	255401	255406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146647
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6350	NC_014013	CTATC	2	10	255453	255462	20 %	40 %	0 %	40 %	294146647
6351	NC_014013	GC	3	6	255535	255540	0 %	0 %	50 %	50 %	294146647
6352	NC_014013	CAGA	2	8	255615	255622	50 %	0 %	25 %	25 %	294146647
6353	NC_014013	TGC	2	6	255625	255630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146647
6354	NC_014013	CTG	2	6	255735	255740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146647
6355	NC_014013	AGG	2	6	255751	255756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294146647
6356	NC_014013	TCCGC	2	10	255784	255793	0 %	20 %	20 %	60 %	294146647
6357	NC_014013	AGG	2	6	255799	255804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294146647
6358	NC_014013	GC	3	6	255809	255814	0 %	0 %	50 %	50 %	294146647
6359	NC_014013	GCC	2	6	255829	255834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146647
6360	NC_014013	ACG	2	6	255877	255882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146647
6361	NC_014013	GCA	2	6	255898	255903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146647
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6363	NC_014013	GGC	2	6	255932	255937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146647
6364	NC_014013	GATC	2	8	255976	255983	25 %	25 %	25 %	25 %	294146647
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6372	NC_014013	CAG	2	6	256181	256186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146647
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6402	NC_014013	TTGCC	2	10	257960	257969	0 %	40 %	20 %	40 %	294146651
6403	NC_014013	TGG	2	6	257986	257991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294146651
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6483	NC_014013	TCG	2	6	261486	261491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146654
6484	NC_014013	GCC	2	6	261521	261526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146654
6485	NC_014013	GTA	2	6	261539	261544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294146654
6486	NC_014013	CAT	2	6	261584	261589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294146654
6487	NC_014013	CGC	2	6	261610	261615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146654
6488	NC_014013	CGG	2	6	261694	261699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146654
6489	NC_014013	GC	3	6	261708	261713	0 %	0 %	50 %	50 %	294146654
6490	NC_014013	GCC	2	6	261719	261724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146654
6491	NC_014013	TGCCGA	2	12	261742	261753	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	294146654
6492	NC_014013	GCT	2	6	261772	261777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294146654
6493	NC_014013	TTC	2	6	261786	261791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294146654
6494	NC_014013	GC	3	6	261792	261797	0 %	0 %	50 %	50 %	294146654
6495	NC_014013	CGG	2	6	261814	261819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146654
6496	NC_014013	AT	3	6	261828	261833	50 %	50 %	0 %	0 %	294146654
6497	NC_014013	GCG	2	6	261856	261861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294146654
6498	NC_014013	GCA	2	6	261910	261915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294146654
6499	NC_014013	CGC	2	6	261958	261963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294146654
6500	NC_014013	TTGACC	2	12	261975	261986	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294146654

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