MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 71419

< Previous12...949596979899100101102103104...142143Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
49001	NC_014012	CGC	2	6	3384063	3384068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294141758
49002	NC_014012	T	7	7	3384080	3384086	0 %	100 %	0 %	0 %	294141758
49003	NC_014012	AC	3	6	3384138	3384143	50 %	0 %	0 %	50 %	294141758
49004	NC_014012	T	6	6	3384182	3384187	0 %	100 %	0 %	0 %	294141758
49005	NC_014012	ATC	2	6	3384361	3384366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294141758
49006	NC_014012	AAG	2	6	3384411	3384416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294141758
49007	NC_014012	CAT	2	6	3384438	3384443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294141758
49008	NC_014012	GAA	2	6	3384540	3384545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294141758
49009	NC_014012	GCTA	2	8	3384571	3384578	25 %	25 %	25 %	25 %	294141758
49010	NC_014012	TGG	2	6	3384584	3384589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294141758
49011	NC_014012	TCT	2	6	3384599	3384604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294141758
49012	NC_014012	ATC	2	6	3384694	3384699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294141758
49013	NC_014012	CAAT	2	8	3384737	3384744	50 %	25 %	0 %	25 %	294141758
49014	NC_014012	GTT	2	6	3384872	3384877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294141759
49015	NC_014012	TTA	2	6	3384884	3384889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294141759
49016	NC_014012	AGC	2	6	3384930	3384935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294141759
49017	NC_014012	CAT	2	6	3384963	3384968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294141759
49018	NC_014012	CGA	2	6	3385006	3385011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294141759
49019	NC_014012	AT	3	6	3385023	3385028	50 %	50 %	0 %	0 %	294141759
49020	NC_014012	ATG	2	6	3385130	3385135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294141759
49021	NC_014012	TCT	2	6	3385165	3385170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294141759
49022	NC_014012	CT	3	6	3385192	3385197	0 %	50 %	0 %	50 %	294141759
49023	NC_014012	TAG	2	6	3385212	3385217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294141759
49024	NC_014012	T	6	6	3385248	3385253	0 %	100 %	0 %	0 %	294141759
49025	NC_014012	CG	3	6	3385289	3385294	0 %	0 %	50 %	50 %	294141759
49026	NC_014012	AGAA	2	8	3385323	3385330	75 %	0 %	25 %	0 %	294141759
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49030	NC_014012	CGG	2	6	3385440	3385445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294141759
49031	NC_014012	CGC	2	6	3385459	3385464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294141759
49032	NC_014012	CTT	2	6	3385471	3385476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294141759
49033	NC_014012	AAT	2	6	3385649	3385654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294141759
49034	NC_014012	CTC	2	6	3385716	3385721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294141760
49035	NC_014012	TAGA	2	8	3385740	3385747	50 %	25 %	25 %	0 %	294141760
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49041	NC_014012	AAG	3	9	3386063	3386071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294141760
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49043	NC_014012	CCAA	2	8	3386190	3386197	50 %	0 %	0 %	50 %	294141760
49044	NC_014012	TTA	2	6	3386204	3386209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294141760
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49046	NC_014012	CTG	2	6	3386306	3386311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294141760
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49050	NC_014012	GCA	2	6	3386524	3386529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294141760
49051	NC_014012	TG	3	6	3386582	3386587	0 %	50 %	50 %	0 %	294141760
49052	NC_014012	GTC	2	6	3386589	3386594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294141760
49053	NC_014012	GAA	2	6	3386648	3386653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294141760
49054	NC_014012	TAAG	2	8	3386692	3386699	50 %	25 %	25 %	0 %	294141761
49055	NC_014012	AGT	2	6	3386859	3386864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294141761
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49071	NC_014012	A	6	6	3387786	3387791	100 %	0 %	0 %	0 %	294141762
49072	NC_014012	GTTA	2	8	3387794	3387801	25 %	50 %	25 %	0 %	294141762
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49078	NC_014012	TGGT	2	8	3387920	3387927	0 %	50 %	50 %	0 %	294141762
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49085	NC_014012	CTAT	2	8	3388360	3388367	25 %	50 %	0 %	25 %	294141762
49086	NC_014012	CG	3	6	3388407	3388412	0 %	0 %	50 %	50 %	294141762
49087	NC_014012	GGC	2	6	3388446	3388451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294141762
49088	NC_014012	CAGCT	2	10	3388493	3388502	20 %	20 %	20 %	40 %	294141762
49089	NC_014012	AAG	2	6	3388552	3388557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294141762
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49098	NC_014012	GC	3	6	3389542	3389547	0 %	0 %	50 %	50 %	294141763
49099	NC_014012	GGT	2	6	3389555	3389560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294141763
49100	NC_014012	GCTCCA	2	12	3389592	3389603	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	294141763
49101	NC_014012	GCCACC	2	12	3389615	3389626	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	294141763
49102	NC_014012	ACC	2	6	3389630	3389635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294141763
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49104	NC_014012	CCG	2	6	3389646	3389651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294141763
49105	NC_014012	ATC	2	6	3389669	3389674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294141763
49106	NC_014012	GCC	2	6	3389681	3389686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294141763
49107	NC_014012	ACC	2	6	3389762	3389767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294141763
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49112	NC_014012	CCA	2	6	3389901	3389906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294141763
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49116	NC_014012	GAA	2	6	3390080	3390085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294141763
49117	NC_014012	ATG	2	6	3390091	3390096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294141763
49118	NC_014012	CCG	2	6	3390159	3390164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294141763
49119	NC_014012	CAC	2	6	3390166	3390171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294141763
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49121	NC_014012	C	7	7	3390213	3390219	0 %	0 %	0 %	100 %	294141763
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49130	NC_014012	CGT	2	6	3391007	3391012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294141763
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49144	NC_014012	CATGG	2	10	3393384	3393393	20 %	20 %	40 %	20 %	294141764
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49147	NC_014012	CGC	2	6	3393546	3393551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294141764
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49151	NC_014012	TGA	2	6	3393710	3393715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294141764
49152	NC_014012	ATC	2	6	3393885	3393890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294141764
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49212	NC_014012	CTG	2	6	3397466	3397471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294141766
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49230	NC_014012	CAGA	2	8	3398311	3398318	50 %	0 %	25 %	25 %	294141767
49231	NC_014012	GAC	2	6	3398371	3398376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294141767
49232	NC_014012	CCA	2	6	3398547	3398552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294141767
49233	NC_014012	TCC	2	6	3398612	3398617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294141767
49234	NC_014012	AGT	2	6	3398658	3398663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294141767
49235	NC_014012	CGT	2	6	3398776	3398781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294141767
49236	NC_014012	T	6	6	3398991	3398996	0 %	100 %	0 %	0 %	294141767
49237	NC_014012	TA	3	6	3399013	3399018	50 %	50 %	0 %	0 %	294141767
49238	NC_014012	AG	3	6	3399026	3399031	50 %	0 %	50 %	0 %	294141767
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49244	NC_014012	CAGTA	2	10	3399250	3399259	40 %	20 %	20 %	20 %	294141767
49245	NC_014012	TCA	2	6	3399392	3399397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294141768
49246	NC_014012	CGA	2	6	3399404	3399409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294141768
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49255	NC_014012	TGA	2	6	3399710	3399715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294141768
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49257	NC_014012	ACCA	2	8	3399861	3399868	50 %	0 %	0 %	50 %	294141768
49258	NC_014012	ATA	2	6	3399874	3399879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294141768
49259	NC_014012	AATA	2	8	3399899	3399906	75 %	25 %	0 %	0 %	294141768
49260	NC_014012	ACC	2	6	3399940	3399945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294141768
49261	NC_014012	ATT	2	6	3399988	3399993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294141768
49262	NC_014012	AAGCT	2	10	3400071	3400080	40 %	20 %	20 %	20 %	294141769
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49265	NC_014012	TGCT	2	8	3400167	3400174	0 %	50 %	25 %	25 %	294141769
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49328	NC_014012	TGT	2	6	3404700	3404705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294141771
49329	NC_014012	TGA	2	6	3404840	3404845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294141772
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49331	NC_014012	ATG	2	6	3405086	3405091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294141773
49332	NC_014012	GGC	2	6	3405136	3405141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294141773
49333	NC_014012	TTC	2	6	3405271	3405276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294141773
49334	NC_014012	ACA	2	6	3405290	3405295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294141773
49335	NC_014012	CAA	2	6	3405378	3405383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294141773
49336	NC_014012	GCAT	2	8	3405413	3405420	25 %	25 %	25 %	25 %	294141773
49337	NC_014012	TA	3	6	3405592	3405597	50 %	50 %	0 %	0 %	294141774
49338	NC_014012	GAT	2	6	3405628	3405633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294141774
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49340	NC_014012	GTT	2	6	3405886	3405891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294141774
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49342	NC_014012	GCG	2	6	3406037	3406042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294141774
49343	NC_014012	GAT	2	6	3406050	3406055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294141774
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49345	NC_014012	CTGG	2	8	3406102	3406109	0 %	25 %	50 %	25 %	294141774
49346	NC_014012	TGGT	2	8	3406130	3406137	0 %	50 %	50 %	0 %	294141774
49347	NC_014012	CTAA	2	8	3406211	3406218	50 %	25 %	0 %	25 %	294141774
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49349	NC_014012	CTCA	2	8	3406383	3406390	25 %	25 %	0 %	50 %	294141775
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49462	NC_014012	TC	3	6	3414748	3414753	0 %	50 %	0 %	50 %	294141781
49463	NC_014012	GTC	2	6	3414768	3414773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294141781
49464	NC_014012	ATG	2	6	3414789	3414794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294141781
49465	NC_014012	GAG	2	6	3414795	3414800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294141781
49466	NC_014012	TTGG	2	8	3414805	3414812	0 %	50 %	50 %	0 %	294141781
49467	NC_014012	AGA	2	6	3414857	3414862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294141781
49468	NC_014012	ACTC	2	8	3414914	3414921	25 %	25 %	0 %	50 %	294141781
49469	NC_014012	TGC	2	6	3414959	3414964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294141781
49470	NC_014012	ATC	2	6	3414990	3414995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294141781
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49473	NC_014012	CAC	2	6	3415249	3415254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294141781
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49475	NC_014012	AGA	2	6	3415310	3415315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294141781
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49481	NC_014012	A	6	6	3415620	3415625	100 %	0 %	0 %	0 %	294141781
49482	NC_014012	ATG	2	6	3415683	3415688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294141781
49483	NC_014012	CAT	2	6	3415692	3415697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294141781
49484	NC_014012	CGC	2	6	3415733	3415738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294141781
49485	NC_014012	AATA	2	8	3415756	3415763	75 %	25 %	0 %	0 %	294141781
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49488	NC_014012	TGA	2	6	3416076	3416081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294141782
49489	NC_014012	TGG	2	6	3416487	3416492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294141782
49490	NC_014012	GCT	2	6	3416495	3416500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294141782
49491	NC_014012	CA	4	8	3416514	3416521	50 %	0 %	0 %	50 %	294141782
49492	NC_014012	GATA	2	8	3416523	3416530	50 %	25 %	25 %	0 %	294141782
49493	NC_014012	CGT	2	6	3416647	3416652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294141782
49494	NC_014012	ACC	2	6	3416847	3416852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294141782
49495	NC_014012	CGA	2	6	3416887	3416892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294141782
49496	NC_014012	CAC	2	6	3416977	3416982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294141783
49497	NC_014012	CTT	2	6	3417065	3417070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294141783
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