MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 71419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_014012	AGC	2	6	178200	178205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138921
2503	NC_014012	CTT	2	6	178269	178274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138921
2504	NC_014012	ATTC	2	8	178304	178311	25 %	50 %	0 %	25 %	294138921
2505	NC_014012	AAT	2	6	178339	178344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138921
2506	NC_014012	GCA	2	6	178400	178405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138921
2507	NC_014012	GAG	2	6	178537	178542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294138921
2508	NC_014012	GAA	2	6	178675	178680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138921
2509	NC_014012	AGT	2	6	178689	178694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138921
2510	NC_014012	GAT	2	6	178722	178727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138921
2511	NC_014012	AGTT	2	8	178736	178743	25 %	50 %	25 %	0 %	294138921
2512	NC_014012	TA	3	6	178838	178843	50 %	50 %	0 %	0 %	294138921
2513	NC_014012	CCAG	2	8	178850	178857	25 %	0 %	25 %	50 %	294138921
2514	NC_014012	AG	3	6	178873	178878	50 %	0 %	50 %	0 %	294138921
2515	NC_014012	A	6	6	178951	178956	100 %	0 %	0 %	0 %	294138921
2516	NC_014012	TGC	2	6	179015	179020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138921
2517	NC_014012	TAGC	2	8	179027	179034	25 %	25 %	25 %	25 %	294138921
2518	NC_014012	GGC	2	6	179070	179075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138921
2519	NC_014012	GAA	2	6	179103	179108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138921
2520	NC_014012	GT	3	6	179150	179155	0 %	50 %	50 %	0 %	294138921
2521	NC_014012	CGG	2	6	179169	179174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138921
2522	NC_014012	CCG	2	6	179246	179251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294138921
2523	NC_014012	GTTT	2	8	179330	179337	0 %	75 %	25 %	0 %	294138921
2524	NC_014012	ACT	2	6	179668	179673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138922
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2526	NC_014012	TCT	2	6	179696	179701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138922
2527	NC_014012	A	6	6	180315	180320	100 %	0 %	0 %	0 %	294138923
2528	NC_014012	TAA	2	6	180365	180370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138923
2529	NC_014012	AT	3	6	180391	180396	50 %	50 %	0 %	0 %	294138923
2530	NC_014012	TTG	2	6	180435	180440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138923
2531	NC_014012	ATG	2	6	180481	180486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138923
2532	NC_014012	TTGCCG	2	12	180517	180528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138923
2533	NC_014012	AGC	2	6	180529	180534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138923
2534	NC_014012	TAA	2	6	180536	180541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138923
2535	NC_014012	TC	3	6	180644	180649	0 %	50 %	0 %	50 %	294138923
2536	NC_014012	CGT	2	6	180657	180662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138923
2537	NC_014012	GAT	2	6	180768	180773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138923
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2539	NC_014012	GATAA	2	10	181118	181127	60 %	20 %	20 %	0 %	294138924
2540	NC_014012	AG	3	6	181162	181167	50 %	0 %	50 %	0 %	294138924
2541	NC_014012	GCTA	2	8	181184	181191	25 %	25 %	25 %	25 %	294138924
2542	NC_014012	TAA	3	9	181267	181275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138924
2543	NC_014012	CAG	2	6	181347	181352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138924
2544	NC_014012	AAC	2	6	181382	181387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294138924
2545	NC_014012	CCA	2	6	181473	181478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138924
2546	NC_014012	T	6	6	181533	181538	0 %	100 %	0 %	0 %	294138924
2547	NC_014012	ATG	2	6	181650	181655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138924
2548	NC_014012	G	7	7	181847	181853	0 %	0 %	100 %	0 %	294138924
2549	NC_014012	GCC	2	6	181910	181915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294138924
2550	NC_014012	AAATC	4	20	182031	182050	60 %	20 %	0 %	20 %	294138924
2551	NC_014012	AAG	2	6	182422	182427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138925
2552	NC_014012	GGAAG	2	10	182432	182441	40 %	0 %	60 %	0 %	294138925
2553	NC_014012	CTT	2	6	182478	182483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138925
2554	NC_014012	GAT	2	6	182616	182621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138925
2555	NC_014012	CTT	2	6	182700	182705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138925
2556	NC_014012	GAA	2	6	182730	182735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138925
2557	NC_014012	GGT	2	6	182746	182751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138925
2558	NC_014012	CAA	2	6	182777	182782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294138925
2559	NC_014012	TCTG	2	8	182930	182937	0 %	50 %	25 %	25 %	294138925
2560	NC_014012	GAT	2	6	183007	183012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138925
2561	NC_014012	TGC	2	6	183069	183074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138925
2562	NC_014012	TTG	2	6	183252	183257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138925
2563	NC_014012	ACA	2	6	183320	183325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294138925
2564	NC_014012	ATG	2	6	183352	183357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138925
2565	NC_014012	CTG	2	6	183362	183367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138925
2566	NC_014012	CTC	2	6	183411	183416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294138925
2567	NC_014012	GCTG	2	8	183429	183436	0 %	25 %	50 %	25 %	294138925
2568	NC_014012	TTGA	2	8	183457	183464	25 %	50 %	25 %	0 %	294138925
2569	NC_014012	TAA	2	6	183465	183470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138925
2570	NC_014012	ATC	2	6	183490	183495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138925
2571	NC_014012	GAT	2	6	183519	183524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138925
2572	NC_014012	GGCCA	2	10	183526	183535	20 %	0 %	40 %	40 %	294138925
2573	NC_014012	GCT	2	6	183622	183627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138925
2574	NC_014012	ATTG	2	8	183688	183695	25 %	50 %	25 %	0 %	294138925
2575	NC_014012	GTTC	2	8	183913	183920	0 %	50 %	25 %	25 %	294138926
2576	NC_014012	CGG	2	6	183922	183927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138926
2577	NC_014012	GAT	2	6	184254	184259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138926
2578	NC_014012	AAGGC	2	10	184279	184288	40 %	0 %	40 %	20 %	294138926
2579	NC_014012	TCAA	2	8	184426	184433	50 %	25 %	0 %	25 %	294138926
2580	NC_014012	TAT	2	6	184518	184523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138926
2581	NC_014012	GTG	2	6	184543	184548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138926
2582	NC_014012	TGT	2	6	184604	184609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138926
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2584	NC_014012	TTA	2	6	184641	184646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138926
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2587	NC_014012	TGA	2	6	184937	184942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138927
2588	NC_014012	TCA	2	6	184972	184977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138927
2589	NC_014012	TAC	2	6	185070	185075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138927
2590	NC_014012	TGA	2	6	185246	185251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138927
2591	NC_014012	GCT	2	6	185276	185281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138927
2592	NC_014012	CGA	2	6	185354	185359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138927
2593	NC_014012	TTGA	2	8	185400	185407	25 %	50 %	25 %	0 %	294138927
2594	NC_014012	AT	3	6	185425	185430	50 %	50 %	0 %	0 %	294138927
2595	NC_014012	TGT	2	6	185431	185436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138927
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2601	NC_014012	TGA	2	6	186013	186018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138928
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2603	NC_014012	GTC	2	6	186146	186151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138928
2604	NC_014012	CTG	2	6	186159	186164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138928
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2606	NC_014012	TGG	2	6	186450	186455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138928
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2608	NC_014012	GTG	2	6	187034	187039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138929
2609	NC_014012	TGA	2	6	187212	187217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138929
2610	NC_014012	TGG	2	6	187282	187287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138929
2611	NC_014012	GGC	2	6	187393	187398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138929
2612	NC_014012	AATC	2	8	187492	187499	50 %	25 %	0 %	25 %	294138930
2613	NC_014012	T	6	6	187526	187531	0 %	100 %	0 %	0 %	294138930
2614	NC_014012	TTG	2	6	187567	187572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138930
2615	NC_014012	TCACT	2	10	187587	187596	20 %	40 %	0 %	40 %	294138930
2616	NC_014012	CTG	3	9	187669	187677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138930
2617	NC_014012	GCTC	2	8	187763	187770	0 %	25 %	25 %	50 %	294138930
2618	NC_014012	TC	3	6	187769	187774	0 %	50 %	0 %	50 %	294138930
2619	NC_014012	GGC	2	6	187960	187965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138930
2620	NC_014012	AGTT	2	8	187980	187987	25 %	50 %	25 %	0 %	294138930
2621	NC_014012	GAT	2	6	188014	188019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138930
2622	NC_014012	TCT	2	6	188030	188035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138930
2623	NC_014012	TCG	2	6	188219	188224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138930
2624	NC_014012	GA	3	6	188283	188288	50 %	0 %	50 %	0 %	294138930
2625	NC_014012	TTGA	2	8	188377	188384	25 %	50 %	25 %	0 %	294138930
2626	NC_014012	G	6	6	188487	188492	0 %	0 %	100 %	0 %	294138930
2627	NC_014012	TAC	2	6	188494	188499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138930
2628	NC_014012	TTG	2	6	188506	188511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138930
2629	NC_014012	CGA	2	6	188646	188651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138930
2630	NC_014012	TC	3	6	188665	188670	0 %	50 %	0 %	50 %	294138930
2631	NC_014012	GCA	2	6	188691	188696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138930
2632	NC_014012	CT	3	6	188716	188721	0 %	50 %	0 %	50 %	294138930
2633	NC_014012	C	7	7	188790	188796	0 %	0 %	0 %	100 %	294138930
2634	NC_014012	TCT	2	6	188906	188911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138930
2635	NC_014012	GA	4	8	189008	189015	50 %	0 %	50 %	0 %	294138930
2636	NC_014012	GAGG	2	8	189025	189032	25 %	0 %	75 %	0 %	294138930
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2640	NC_014012	A	6	6	189188	189193	100 %	0 %	0 %	0 %	294138930
2641	NC_014012	ATT	2	6	189217	189222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138930
2642	NC_014012	TCG	2	6	189313	189318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138930
2643	NC_014012	ATT	2	6	189596	189601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138931
2644	NC_014012	GCCA	2	8	189633	189640	25 %	0 %	25 %	50 %	294138931
2645	NC_014012	TGA	2	6	189667	189672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138931
2646	NC_014012	TGA	2	6	189689	189694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138931
2647	NC_014012	CGT	2	6	189820	189825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138931
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2650	NC_014012	GAC	2	6	189987	189992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138931
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2652	NC_014012	CTGCTC	2	12	190014	190025	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	294138931
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2655	NC_014012	CAT	2	6	190137	190142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138931
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2657	NC_014012	CAGAGG	2	12	190293	190304	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	294138931
2658	NC_014012	CTG	2	6	190368	190373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138931
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2663	NC_014012	CAGA	2	8	190483	190490	50 %	0 %	25 %	25 %	294138931
2664	NC_014012	GGCG	2	8	190501	190508	0 %	0 %	75 %	25 %	294138931
2665	NC_014012	A	6	6	190521	190526	100 %	0 %	0 %	0 %	294138931
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2670	NC_014012	CTG	2	6	190770	190775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138931
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2679	NC_014012	CTT	2	6	191285	191290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138932
2680	NC_014012	CTG	2	6	191292	191297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138932
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2727	NC_014012	GAAG	2	8	195906	195913	50 %	0 %	50 %	0 %	294138936
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2730	NC_014012	GTAC	2	8	196414	196421	25 %	25 %	25 %	25 %	294138936
2731	NC_014012	GA	4	8	196485	196492	50 %	0 %	50 %	0 %	294138936
2732	NC_014012	GCTG	2	8	196500	196507	0 %	25 %	50 %	25 %	294138936
2733	NC_014012	ATTG	2	8	196512	196519	25 %	50 %	25 %	0 %	294138936
2734	NC_014012	AGCTG	2	10	196530	196539	20 %	20 %	40 %	20 %	294138936
2735	NC_014012	GACT	2	8	196544	196551	25 %	25 %	25 %	25 %	294138936
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2739	NC_014012	GTG	2	6	196774	196779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138936
2740	NC_014012	TG	3	6	196786	196791	0 %	50 %	50 %	0 %	294138936
2741	NC_014012	TGGC	2	8	196844	196851	0 %	25 %	50 %	25 %	294138936
2742	NC_014012	TTA	2	6	196924	196929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138936
2743	NC_014012	TGG	2	6	197042	197047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138936
2744	NC_014012	CGG	2	6	197120	197125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138936
2745	NC_014012	TTA	2	6	197132	197137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138936
2746	NC_014012	GTG	2	6	197207	197212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138936
2747	NC_014012	AAGG	2	8	197233	197240	50 %	0 %	50 %	0 %	294138936
2748	NC_014012	GTG	2	6	197287	197292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138936
2749	NC_014012	CCATA	2	10	197391	197400	40 %	20 %	0 %	40 %	294138936
2750	NC_014012	AGCGTA	2	12	197450	197461	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294138936
2751	NC_014012	CA	3	6	197567	197572	50 %	0 %	0 %	50 %	294138936
2752	NC_014012	AAGC	2	8	197587	197594	50 %	0 %	25 %	25 %	294138936
2753	NC_014012	A	6	6	197641	197646	100 %	0 %	0 %	0 %	294138936
2754	NC_014012	T	6	6	197987	197992	0 %	100 %	0 %	0 %	294138937
2755	NC_014012	GTTG	2	8	198154	198161	0 %	50 %	50 %	0 %	294138937
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2757	NC_014012	T	6	6	198190	198195	0 %	100 %	0 %	0 %	294138937
2758	NC_014012	TATC	2	8	198347	198354	25 %	50 %	0 %	25 %	294138937
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2761	NC_014012	GAT	2	6	198398	198403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138937
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2764	NC_014012	CTG	2	6	198462	198467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138937
2765	NC_014012	GAT	2	6	198597	198602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138937
2766	NC_014012	CTT	2	6	198644	198649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138937
2767	NC_014012	ATCA	2	8	198654	198661	50 %	25 %	0 %	25 %	294138937
2768	NC_014012	ATC	2	6	198834	198839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138937
2769	NC_014012	AG	3	6	198845	198850	50 %	0 %	50 %	0 %	294138937
2770	NC_014012	GGT	2	6	198879	198884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138937
2771	NC_014012	AAGG	2	8	198918	198925	50 %	0 %	50 %	0 %	294138937
2772	NC_014012	ACT	2	6	198987	198992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138937
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2847	NC_014012	TGGCT	2	10	203939	203948	0 %	40 %	40 %	20 %	294138941
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2852	NC_014012	GAATA	2	10	204584	204593	60 %	20 %	20 %	0 %	294138941
2853	NC_014012	GCCA	2	8	204595	204602	25 %	0 %	25 %	50 %	294138941
2854	NC_014012	AT	3	6	204659	204664	50 %	50 %	0 %	0 %	294138941
2855	NC_014012	TGT	2	6	204712	204717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138941
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2858	NC_014012	ATA	2	6	204786	204791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138941
2859	NC_014012	CTG	2	6	204908	204913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138941
2860	NC_014012	AG	3	6	204937	204942	50 %	0 %	50 %	0 %	294138941
2861	NC_014012	CAG	2	6	204954	204959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138941
2862	NC_014012	AT	3	6	204979	204984	50 %	50 %	0 %	0 %	294138941
2863	NC_014012	TACTGC	2	12	205330	205341	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294138942
2864	NC_014012	CCA	2	6	205364	205369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138942
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2866	NC_014012	CTCA	2	8	205546	205553	25 %	25 %	0 %	50 %	294138942
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2872	NC_014012	AGC	2	6	205997	206002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138943
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2987	NC_014012	GAT	2	6	212302	212307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138947
2988	NC_014012	CAT	2	6	212326	212331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138947
2989	NC_014012	AC	3	6	212344	212349	50 %	0 %	0 %	50 %	294138947
2990	NC_014012	CGG	2	6	212379	212384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138947
2991	NC_014012	TGC	2	6	212387	212392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138947
2992	NC_014012	TC	3	6	212403	212408	0 %	50 %	0 %	50 %	294138947
2993	NC_014012	TAT	2	6	212463	212468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138947
2994	NC_014012	TGC	2	6	212595	212600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138947
2995	NC_014012	TCT	2	6	212646	212651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138947
2996	NC_014012	GA	3	6	212674	212679	50 %	0 %	50 %	0 %	294138947
2997	NC_014012	GAT	2	6	212692	212697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138947
2998	NC_014012	CAT	2	6	212716	212721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138947
2999	NC_014012	TGCT	2	8	212746	212753	0 %	50 %	25 %	25 %	294138947
3000	NC_014012	CTC	2	6	212785	212790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294138947

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