MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 71419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014012	AGCT	2	8	113566	113573	25 %	25 %	25 %	25 %	294138868
1502	NC_014012	TTTA	2	8	113689	113696	25 %	75 %	0 %	0 %	294138868
1503	NC_014012	GTA	2	6	113717	113722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138868
1504	NC_014012	GCG	2	6	113804	113809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138868
1505	NC_014012	ATT	2	6	114030	114035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138869
1506	NC_014012	GGC	2	6	114080	114085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138869
1507	NC_014012	TGA	2	6	114101	114106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138869
1508	NC_014012	GATA	2	8	114214	114221	50 %	25 %	25 %	0 %	294138869
1509	NC_014012	TCT	2	6	114234	114239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138869
1510	NC_014012	TAA	2	6	114304	114309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138869
1511	NC_014012	CTGTT	2	10	114323	114332	0 %	60 %	20 %	20 %	294138869
1512	NC_014012	TCA	2	6	114483	114488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138869
1513	NC_014012	GCC	2	6	114570	114575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294138869
1514	NC_014012	GGC	2	6	114656	114661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138869
1515	NC_014012	CAT	2	6	114733	114738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138869
1516	NC_014012	TA	3	6	114761	114766	50 %	50 %	0 %	0 %	294138869
1517	NC_014012	GC	3	6	114827	114832	0 %	0 %	50 %	50 %	294138869
1518	NC_014012	ATA	2	6	115261	115266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138870
1519	NC_014012	ATA	2	6	115346	115351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138870
1520	NC_014012	CTG	2	6	115414	115419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138870
1521	NC_014012	CTG	2	6	115430	115435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138870
1522	NC_014012	T	6	6	115440	115445	0 %	100 %	0 %	0 %	294138870
1523	NC_014012	GATA	2	8	115449	115456	50 %	25 %	25 %	0 %	294138870
1524	NC_014012	GTG	2	6	115558	115563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138870
1525	NC_014012	AGC	2	6	115585	115590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138870
1526	NC_014012	CTG	2	6	115640	115645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138870
1527	NC_014012	GAG	2	6	115705	115710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294138870
1528	NC_014012	AGT	2	6	115713	115718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138870
1529	NC_014012	T	6	6	115953	115958	0 %	100 %	0 %	0 %	294138871
1530	NC_014012	ATT	2	6	115970	115975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138871
1531	NC_014012	CAAC	2	8	116013	116020	50 %	0 %	0 %	50 %	294138871
1532	NC_014012	GGGA	2	8	116202	116209	25 %	0 %	75 %	0 %	294138871
1533	NC_014012	A	6	6	116261	116266	100 %	0 %	0 %	0 %	294138871
1534	NC_014012	AAT	2	6	116336	116341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138871
1535	NC_014012	TCT	2	6	116403	116408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138871
1536	NC_014012	ATG	2	6	116496	116501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138871
1537	NC_014012	ATTG	2	8	116517	116524	25 %	50 %	25 %	0 %	294138871
1538	NC_014012	TAA	2	6	116578	116583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138871
1539	NC_014012	TGTT	2	8	116895	116902	0 %	75 %	25 %	0 %	294138872
1540	NC_014012	TG	3	6	116924	116929	0 %	50 %	50 %	0 %	294138872
1541	NC_014012	A	6	6	117108	117113	100 %	0 %	0 %	0 %	294138872
1542	NC_014012	TGC	3	9	117121	117129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138872
1543	NC_014012	AAG	2	6	117369	117374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138872
1544	NC_014012	GCC	3	9	117411	117419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294138872
1545	NC_014012	CGC	2	6	117455	117460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294138872
1546	NC_014012	TG	3	6	117502	117507	0 %	50 %	50 %	0 %	294138872
1547	NC_014012	ATT	2	6	117605	117610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138872
1548	NC_014012	AAGC	2	8	117621	117628	50 %	0 %	25 %	25 %	294138872
1549	NC_014012	AGTG	2	8	117755	117762	25 %	25 %	50 %	0 %	294138872
1550	NC_014012	ATG	2	6	117769	117774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138872
1551	NC_014012	GCTG	2	8	117893	117900	0 %	25 %	50 %	25 %	294138872
1552	NC_014012	TGT	2	6	118017	118022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138873
1553	NC_014012	TTTG	2	8	118036	118043	0 %	75 %	25 %	0 %	294138873
1554	NC_014012	ACC	2	6	118055	118060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138873
1555	NC_014012	ATC	2	6	118091	118096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138873
1556	NC_014012	TGA	2	6	118107	118112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138873
1557	NC_014012	GAT	2	6	118199	118204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138873
1558	NC_014012	A	7	7	118214	118220	100 %	0 %	0 %	0 %	294138873
1559	NC_014012	TAA	2	6	118239	118244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138873
1560	NC_014012	TGC	2	6	118276	118281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138873
1561	NC_014012	TTA	2	6	118335	118340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138873
1562	NC_014012	GACA	2	8	118393	118400	50 %	0 %	25 %	25 %	294138873
1563	NC_014012	TCGAT	2	10	118444	118453	20 %	40 %	20 %	20 %	294138873
1564	NC_014012	AT	3	6	118490	118495	50 %	50 %	0 %	0 %	294138873
1565	NC_014012	AGC	2	6	118527	118532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138873
1566	NC_014012	CT	3	6	118539	118544	0 %	50 %	0 %	50 %	294138873
1567	NC_014012	TA	3	6	118581	118586	50 %	50 %	0 %	0 %	294138873
1568	NC_014012	A	6	6	118612	118617	100 %	0 %	0 %	0 %	294138873
1569	NC_014012	TTA	2	6	118770	118775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138873
1570	NC_014012	CTGG	2	8	118781	118788	0 %	25 %	50 %	25 %	294138873
1571	NC_014012	GCT	2	6	118796	118801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138873
1572	NC_014012	GTG	2	6	118809	118814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138873
1573	NC_014012	A	6	6	119004	119009	100 %	0 %	0 %	0 %	294138873
1574	NC_014012	T	6	6	119205	119210	0 %	100 %	0 %	0 %	294138874
1575	NC_014012	AAC	2	6	119226	119231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294138874
1576	NC_014012	GTTTT	2	10	119255	119264	0 %	80 %	20 %	0 %	294138874
1577	NC_014012	T	6	6	119301	119306	0 %	100 %	0 %	0 %	294138874
1578	NC_014012	AAT	2	6	119354	119359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138874
1579	NC_014012	AT	3	6	119365	119370	50 %	50 %	0 %	0 %	294138874
1580	NC_014012	TAGT	3	12	119521	119532	25 %	50 %	25 %	0 %	294138874
1581	NC_014012	TTA	2	6	119554	119559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138874
1582	NC_014012	AAC	2	6	119620	119625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294138874
1583	NC_014012	CTT	2	6	119699	119704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138874
1584	NC_014012	TTA	2	6	119705	119710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138874
1585	NC_014012	TA	3	6	119749	119754	50 %	50 %	0 %	0 %	294138874
1586	NC_014012	ATA	2	6	119803	119808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138874
1587	NC_014012	TAGA	2	8	119820	119827	50 %	25 %	25 %	0 %	294138874
1588	NC_014012	CTT	2	6	119841	119846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138874
1589	NC_014012	TAG	2	6	119847	119852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138874
1590	NC_014012	T	6	6	119905	119910	0 %	100 %	0 %	0 %	294138874
1591	NC_014012	CTC	2	6	119931	119936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294138874
1592	NC_014012	TGC	2	6	119991	119996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138874
1593	NC_014012	T	6	6	120039	120044	0 %	100 %	0 %	0 %	294138874
1594	NC_014012	TTGA	2	8	120132	120139	25 %	50 %	25 %	0 %	294138875
1595	NC_014012	CTTG	2	8	120168	120175	0 %	50 %	25 %	25 %	294138875
1596	NC_014012	GCT	2	6	120198	120203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138875
1597	NC_014012	TGG	2	6	120204	120209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138875
1598	NC_014012	CTT	2	6	120222	120227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138875
1599	NC_014012	CAT	2	6	120234	120239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138875
1600	NC_014012	A	6	6	120336	120341	100 %	0 %	0 %	0 %	294138875
1601	NC_014012	ATT	2	6	120390	120395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138875
1602	NC_014012	T	6	6	120394	120399	0 %	100 %	0 %	0 %	294138875
1603	NC_014012	T	6	6	120414	120419	0 %	100 %	0 %	0 %	294138875
1604	NC_014012	TTTC	2	8	120425	120432	0 %	75 %	0 %	25 %	294138875
1605	NC_014012	AATT	2	8	120474	120481	50 %	50 %	0 %	0 %	294138875
1606	NC_014012	ATG	2	6	120711	120716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138875
1607	NC_014012	ATT	2	6	120729	120734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138875
1608	NC_014012	TTC	2	6	120735	120740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138875
1609	NC_014012	AAT	2	6	120748	120753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138875
1610	NC_014012	TC	3	6	120842	120847	0 %	50 %	0 %	50 %	294138875
1611	NC_014012	ATTG	2	8	120906	120913	25 %	50 %	25 %	0 %	294138875
1612	NC_014012	TGT	2	6	120940	120945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138875
1613	NC_014012	TGA	2	6	120951	120956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138875
1614	NC_014012	CTT	2	6	120970	120975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138875
1615	NC_014012	TGC	2	6	121003	121008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138875
1616	NC_014012	TGC	2	6	121016	121021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138875
1617	NC_014012	ATT	2	6	121044	121049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138875
1618	NC_014012	ATC	2	6	121056	121061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138875
1619	NC_014012	ATT	2	6	121198	121203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138875
1620	NC_014012	AG	3	6	121212	121217	50 %	0 %	50 %	0 %	294138875
1621	NC_014012	GTT	2	6	121250	121255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138875
1622	NC_014012	TGAT	2	8	121399	121406	25 %	50 %	25 %	0 %	294138876
1623	NC_014012	A	6	6	121415	121420	100 %	0 %	0 %	0 %	294138876
1624	NC_014012	ATA	2	6	121483	121488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138876
1625	NC_014012	A	6	6	121590	121595	100 %	0 %	0 %	0 %	294138876
1626	NC_014012	TTA	2	6	121609	121614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138876
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1629	NC_014012	ATG	2	6	121908	121913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138876
1630	NC_014012	ATC	2	6	121955	121960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138876
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1633	NC_014012	TCC	2	6	122072	122077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294138876
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1635	NC_014012	GA	3	6	122131	122136	50 %	0 %	50 %	0 %	294138876
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1988	NC_014012	GC	3	6	146121	146126	0 %	0 %	50 %	50 %	294138897
1989	NC_014012	ATA	2	6	146147	146152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138897
1990	NC_014012	CTGC	2	8	146230	146237	0 %	25 %	25 %	50 %	294138897
1991	NC_014012	ACG	2	6	146264	146269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138897
1992	NC_014012	GTT	2	6	146354	146359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138897
1993	NC_014012	AGT	2	6	146520	146525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138897
1994	NC_014012	T	7	7	146545	146551	0 %	100 %	0 %	0 %	294138897
1995	NC_014012	A	6	6	146566	146571	100 %	0 %	0 %	0 %	294138897
1996	NC_014012	T	6	6	146590	146595	0 %	100 %	0 %	0 %	294138897
1997	NC_014012	TGC	2	6	146613	146618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138897
1998	NC_014012	GCT	2	6	146650	146655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138897
1999	NC_014012	ATA	2	6	146681	146686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138897
2000	NC_014012	AAT	2	6	146718	146723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138897

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