MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 71419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014012	GAT	2	6	33303	33308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138804
502	NC_014012	AG	3	6	33347	33352	50 %	0 %	50 %	0 %	294138804
503	NC_014012	GCG	2	6	33379	33384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138804
504	NC_014012	TCTA	2	8	33422	33429	25 %	50 %	0 %	25 %	294138804
505	NC_014012	GGCT	2	8	33614	33621	0 %	25 %	50 %	25 %	294138804
506	NC_014012	AGC	2	6	33979	33984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138804
507	NC_014012	TGG	2	6	34009	34014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138804
508	NC_014012	TTG	2	6	34053	34058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138804
509	NC_014012	GCA	2	6	34061	34066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138804
510	NC_014012	AAC	2	6	34189	34194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294138804
511	NC_014012	CGA	2	6	34195	34200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138804
512	NC_014012	GA	3	6	34199	34204	50 %	0 %	50 %	0 %	294138804
513	NC_014012	ATA	2	6	34205	34210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138804
514	NC_014012	TTC	2	6	34230	34235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138805
515	NC_014012	CGA	2	6	34302	34307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138805
516	NC_014012	ATC	2	6	34390	34395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138805
517	NC_014012	GAT	2	6	34429	34434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138805
518	NC_014012	GCGG	2	8	34510	34517	0 %	0 %	75 %	25 %	294138805
519	NC_014012	GAT	2	6	34525	34530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138805
520	NC_014012	TGG	2	6	34548	34553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138805
521	NC_014012	GGGT	2	8	34562	34569	0 %	25 %	75 %	0 %	294138805
522	NC_014012	ACT	2	6	34741	34746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138805
523	NC_014012	ATTTC	2	10	34755	34764	20 %	60 %	0 %	20 %	294138805
524	NC_014012	TGA	2	6	34848	34853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138805
525	NC_014012	GGC	2	6	34870	34875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138805
526	NC_014012	CAA	2	6	34905	34910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294138805
527	NC_014012	TTCA	2	8	34939	34946	25 %	50 %	0 %	25 %	294138805
528	NC_014012	TCT	2	6	35012	35017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138805
529	NC_014012	CAA	2	6	35025	35030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294138805
530	NC_014012	TGG	2	6	35046	35051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138805
531	NC_014012	GTG	2	6	35072	35077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138805
532	NC_014012	AAG	2	6	35125	35130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138805
533	NC_014012	GAT	2	6	35152	35157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138805
534	NC_014012	AGTTC	2	10	35207	35216	20 %	40 %	20 %	20 %	294138805
535	NC_014012	TCG	2	6	35327	35332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138805
536	NC_014012	GCG	2	6	35365	35370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138805
537	NC_014012	CGT	2	6	35392	35397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138805
538	NC_014012	GGT	2	6	35416	35421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138805
539	NC_014012	CTG	2	6	35495	35500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138805
540	NC_014012	TCT	2	6	35602	35607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138805
541	NC_014012	TGA	2	6	35655	35660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138805
542	NC_014012	TCA	2	6	35696	35701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138805
543	NC_014012	CTT	3	9	35751	35759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138805
544	NC_014012	CT	3	6	35813	35818	0 %	50 %	0 %	50 %	294138805
545	NC_014012	GAA	2	6	35826	35831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138805
546	NC_014012	GGT	2	6	35902	35907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138805
547	NC_014012	TTC	2	6	35916	35921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138805
548	NC_014012	ATC	2	6	36047	36052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138805
549	NC_014012	GTG	2	6	36099	36104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138805
550	NC_014012	TGA	2	6	36105	36110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138805
551	NC_014012	GCT	2	6	36298	36303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138805
552	NC_014012	GGC	2	6	36325	36330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138805
553	NC_014012	TCG	2	6	36371	36376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138805
554	NC_014012	TGA	2	6	36392	36397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138805
555	NC_014012	AGC	2	6	36458	36463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138805
556	NC_014012	ACC	2	6	36472	36477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138805
557	NC_014012	GTT	2	6	36540	36545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138805
558	NC_014012	CGT	2	6	36577	36582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138805
559	NC_014012	TAA	2	6	37131	37136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138806
560	NC_014012	AGTC	2	8	37141	37148	25 %	25 %	25 %	25 %	294138806
561	NC_014012	GCT	2	6	37528	37533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138807
562	NC_014012	TAA	2	6	37665	37670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138808
563	NC_014012	TGT	2	6	37795	37800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138808
564	NC_014012	GGC	2	6	37824	37829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138808
565	NC_014012	ATC	2	6	37834	37839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138808
566	NC_014012	TAG	3	9	37878	37886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138808
567	NC_014012	CGC	2	6	37905	37910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294138808
568	NC_014012	AG	3	6	37960	37965	50 %	0 %	50 %	0 %	294138808
569	NC_014012	GAC	2	6	38042	38047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138808
570	NC_014012	TG	3	6	38121	38126	0 %	50 %	50 %	0 %	294138808
571	NC_014012	CAC	2	6	38141	38146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138808
572	NC_014012	GCA	2	6	38186	38191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138808
573	NC_014012	CTC	2	6	38207	38212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294138808
574	NC_014012	TTG	2	6	38430	38435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138809
575	NC_014012	GCC	2	6	38559	38564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294138809
576	NC_014012	TAG	2	6	38583	38588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138809
577	NC_014012	GGC	2	6	38608	38613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138809
578	NC_014012	TGCTCT	2	12	38656	38667	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	294138809
579	NC_014012	CT	3	6	38816	38821	0 %	50 %	0 %	50 %	294138809
580	NC_014012	GCG	2	6	38914	38919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294138809
581	NC_014012	CGC	2	6	38963	38968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294138809
582	NC_014012	TTG	2	6	39040	39045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138809
583	NC_014012	GCCA	2	8	39047	39054	25 %	0 %	25 %	50 %	294138809
584	NC_014012	TC	3	6	39062	39067	0 %	50 %	0 %	50 %	294138809
585	NC_014012	CCG	2	6	39146	39151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294138809
586	NC_014012	GAGT	2	8	39299	39306	25 %	25 %	50 %	0 %	294138809
587	NC_014012	ATC	2	6	39313	39318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138809
588	NC_014012	CTT	2	6	39337	39342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138810
589	NC_014012	AG	3	6	39399	39404	50 %	0 %	50 %	0 %	294138810
590	NC_014012	GCC	2	6	39461	39466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294138810
591	NC_014012	CTG	2	6	39520	39525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138810
592	NC_014012	TCCA	2	8	39578	39585	25 %	25 %	0 %	50 %	294138810
593	NC_014012	GTAT	2	8	39639	39646	25 %	50 %	25 %	0 %	294138810
594	NC_014012	TTG	2	6	39672	39677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138810
595	NC_014012	CAA	2	6	39685	39690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294138810
596	NC_014012	CCA	2	6	39714	39719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138810
597	NC_014012	TTGA	2	8	39791	39798	25 %	50 %	25 %	0 %	294138810
598	NC_014012	A	7	7	39828	39834	100 %	0 %	0 %	0 %	294138810
599	NC_014012	ATT	3	9	39842	39850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294138810
600	NC_014012	CAC	2	6	39874	39879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138810
601	NC_014012	AT	3	6	39889	39894	50 %	50 %	0 %	0 %	294138810
602	NC_014012	TGC	2	6	39931	39936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138810
603	NC_014012	AAT	2	6	39990	39995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294138810
604	NC_014012	TGG	2	6	40543	40548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294138811
605	NC_014012	TGA	2	6	40585	40590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138811
606	NC_014012	GAG	2	6	40618	40623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294138811
607	NC_014012	AG	3	6	40626	40631	50 %	0 %	50 %	0 %	294138811
608	NC_014012	CAG	2	6	40644	40649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138811
609	NC_014012	ACC	2	6	40692	40697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294138811
610	NC_014012	GAT	2	6	40712	40717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138811
611	NC_014012	TATT	2	8	40730	40737	25 %	75 %	0 %	0 %	294138811
612	NC_014012	CGC	2	6	40740	40745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294138811
613	NC_014012	AGC	2	6	40924	40929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138811
614	NC_014012	TGA	2	6	40954	40959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294138811
615	NC_014012	ATC	2	6	41024	41029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138811
616	NC_014012	AGC	2	6	41075	41080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138811
617	NC_014012	AAG	2	6	41211	41216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138811
618	NC_014012	CTT	2	6	41326	41331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294138812
619	NC_014012	AT	3	6	41344	41349	50 %	50 %	0 %	0 %	294138812
620	NC_014012	CTG	2	6	41350	41355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294138812
621	NC_014012	GGA	2	6	41359	41364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294138812
622	NC_014012	GTT	2	6	41399	41404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294138812
623	NC_014012	TCA	2	6	41418	41423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294138812
624	NC_014012	GAA	2	6	41444	41449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294138812
625	NC_014012	GCA	2	6	41508	41513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138812
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627	NC_014012	GAC	2	6	41740	41745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294138812
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636	NC_014012	TGCT	2	8	42058	42065	0 %	50 %	25 %	25 %	294138812
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