MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 71419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014012	TTC	2	6	414327	414332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139119
6002	NC_014012	TAA	2	6	414393	414398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139119
6003	NC_014012	TCT	2	6	414679	414684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139119
6004	NC_014012	CCAT	2	8	414712	414719	25 %	25 %	0 %	50 %	294139119
6005	NC_014012	AAC	2	6	414744	414749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139119
6006	NC_014012	ATT	2	6	414792	414797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139119
6007	NC_014012	ATC	2	6	414867	414872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139119
6008	NC_014012	TTG	2	6	414986	414991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139120
6009	NC_014012	T	6	6	415078	415083	0 %	100 %	0 %	0 %	294139120
6010	NC_014012	TTAT	2	8	415099	415106	25 %	75 %	0 %	0 %	294139120
6011	NC_014012	AT	3	6	415105	415110	50 %	50 %	0 %	0 %	294139120
6012	NC_014012	GTTC	2	8	415197	415204	0 %	50 %	25 %	25 %	294139121
6013	NC_014012	TTCT	2	8	415343	415350	0 %	75 %	0 %	25 %	294139121
6014	NC_014012	TGT	2	6	415424	415429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139121
6015	NC_014012	AG	3	6	415463	415468	50 %	0 %	50 %	0 %	294139121
6016	NC_014012	TGGC	2	8	415476	415483	0 %	25 %	50 %	25 %	294139121
6017	NC_014012	GT	4	8	415520	415527	0 %	50 %	50 %	0 %	294139121
6018	NC_014012	TGG	2	6	415530	415535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139121
6019	NC_014012	CTG	2	6	415681	415686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139121
6020	NC_014012	GCTCT	2	10	416015	416024	0 %	40 %	20 %	40 %	294139122
6021	NC_014012	CTG	2	6	416109	416114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139122
6022	NC_014012	GCT	2	6	416234	416239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139122
6023	NC_014012	TAGC	2	8	416240	416247	25 %	25 %	25 %	25 %	294139122
6024	NC_014012	CTTCAT	2	12	416262	416273	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	294139122
6025	NC_014012	ATT	2	6	416284	416289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139122
6026	NC_014012	CAG	2	6	416310	416315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139122
6027	NC_014012	TTA	2	6	416317	416322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139122
6028	NC_014012	CTGA	2	8	416421	416428	25 %	25 %	25 %	25 %	294139122
6029	NC_014012	T	7	7	416453	416459	0 %	100 %	0 %	0 %	294139122
6030	NC_014012	CAT	2	6	416465	416470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139122
6031	NC_014012	GCTT	2	8	416506	416513	0 %	50 %	25 %	25 %	294139122
6032	NC_014012	GTC	2	6	416621	416626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139122
6033	NC_014012	T	6	6	416697	416702	0 %	100 %	0 %	0 %	294139122
6034	NC_014012	TCC	2	6	416767	416772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139122
6035	NC_014012	GCT	2	6	416878	416883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139122
6036	NC_014012	AAG	2	6	416892	416897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139122
6037	NC_014012	GAA	2	6	416898	416903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139122
6038	NC_014012	GA	4	8	416904	416911	50 %	0 %	50 %	0 %	294139122
6039	NC_014012	GCA	2	6	417125	417130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139123
6040	NC_014012	ATC	2	6	417135	417140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139123
6041	NC_014012	TTC	2	6	417169	417174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139123
6042	NC_014012	GTGA	2	8	417177	417184	25 %	25 %	50 %	0 %	294139123
6043	NC_014012	CAG	2	6	417285	417290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139123
6044	NC_014012	AAT	2	6	417328	417333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139123
6045	NC_014012	GAA	2	6	417338	417343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139123
6046	NC_014012	GTT	2	6	417438	417443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139123
6047	NC_014012	GGC	2	6	417478	417483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139123
6048	NC_014012	TA	3	6	417491	417496	50 %	50 %	0 %	0 %	294139123
6049	NC_014012	TTC	2	6	417574	417579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139123
6050	NC_014012	TGG	2	6	417593	417598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139123
6051	NC_014012	ATC	2	6	417672	417677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139123
6052	NC_014012	CAT	2	6	417750	417755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139123
6053	NC_014012	CAC	2	6	417788	417793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139123
6054	NC_014012	ATG	2	6	417814	417819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139123
6055	NC_014012	AGC	2	6	417891	417896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139123
6056	NC_014012	CCA	2	6	417904	417909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139123
6057	NC_014012	AGC	2	6	417925	417930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139123
6058	NC_014012	CTC	2	6	417996	418001	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139123
6059	NC_014012	TGCC	2	8	418142	418149	0 %	25 %	25 %	50 %	294139123
6060	NC_014012	TGGC	2	8	418258	418265	0 %	25 %	50 %	25 %	294139123
6061	NC_014012	CAC	2	6	418319	418324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139123
6062	NC_014012	CTT	2	6	418424	418429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139123
6063	NC_014012	CTGG	2	8	418452	418459	0 %	25 %	50 %	25 %	294139123
6064	NC_014012	AAT	2	6	418461	418466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139123
6065	NC_014012	CTT	2	6	418473	418478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139123
6066	NC_014012	GGTT	2	8	418484	418491	0 %	50 %	50 %	0 %	294139123
6067	NC_014012	CCA	2	6	418533	418538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139123
6068	NC_014012	CTG	2	6	418546	418551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139123
6069	NC_014012	TCT	2	6	418571	418576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139123
6070	NC_014012	GCTT	2	8	418588	418595	0 %	50 %	25 %	25 %	294139123
6071	NC_014012	TCA	2	6	418625	418630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139123
6072	NC_014012	CGC	2	6	418644	418649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139123
6073	NC_014012	CTG	2	6	418723	418728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139123
6074	NC_014012	TTG	2	6	418797	418802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139123
6075	NC_014012	GTCG	2	8	418893	418900	0 %	25 %	50 %	25 %	294139123
6076	NC_014012	CCG	2	6	418912	418917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139123
6077	NC_014012	CGG	2	6	418928	418933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139123
6078	NC_014012	T	6	6	418955	418960	0 %	100 %	0 %	0 %	294139123
6079	NC_014012	TGA	2	6	419032	419037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139123
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6081	NC_014012	TCT	2	6	419207	419212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139123
6082	NC_014012	AG	3	6	419227	419232	50 %	0 %	50 %	0 %	294139123
6083	NC_014012	GCG	2	6	419328	419333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139123
6084	NC_014012	TGA	2	6	419416	419421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139123
6085	NC_014012	CTG	2	6	419517	419522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139123
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6087	NC_014012	AAT	2	6	419590	419595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139123
6088	NC_014012	CGAT	2	8	419629	419636	25 %	25 %	25 %	25 %	294139123
6089	NC_014012	TTG	2	6	419665	419670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139123
6090	NC_014012	TC	3	6	419696	419701	0 %	50 %	0 %	50 %	294139123
6091	NC_014012	AG	3	6	419704	419709	50 %	0 %	50 %	0 %	294139123
6092	NC_014012	TTC	2	6	419758	419763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139123
6093	NC_014012	GAC	2	6	420394	420399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139124
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6095	NC_014012	TAC	2	6	420431	420436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139124
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6097	NC_014012	CG	3	6	420546	420551	0 %	0 %	50 %	50 %	294139124
6098	NC_014012	CGG	2	6	420582	420587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139124
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6100	NC_014012	CGG	2	6	420631	420636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139124
6101	NC_014012	CTAT	2	8	420664	420671	25 %	50 %	0 %	25 %	294139124
6102	NC_014012	ATC	2	6	420680	420685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139124
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6105	NC_014012	ACTGC	2	10	420745	420754	20 %	20 %	20 %	40 %	294139124
6106	NC_014012	A	6	6	420761	420766	100 %	0 %	0 %	0 %	294139124
6107	NC_014012	CGT	2	6	420783	420788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139124
6108	NC_014012	TGG	2	6	420845	420850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139124
6109	NC_014012	GAT	2	6	420877	420882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139124
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6112	NC_014012	GAC	2	6	421084	421089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139124
6113	NC_014012	GAA	2	6	421152	421157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139124
6114	NC_014012	CTG	2	6	421186	421191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139124
6115	NC_014012	CAG	2	6	421226	421231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139124
6116	NC_014012	GGC	3	9	421257	421265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139124
6117	NC_014012	GA	3	6	421282	421287	50 %	0 %	50 %	0 %	294139124
6118	NC_014012	TCC	2	6	421349	421354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139124
6119	NC_014012	ATG	2	6	421427	421432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139124
6120	NC_014012	CAT	2	6	421458	421463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139124
6121	NC_014012	GTG	2	6	421528	421533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139124
6122	NC_014012	AGAT	2	8	421634	421641	50 %	25 %	25 %	0 %	294139124
6123	NC_014012	TCG	2	6	421682	421687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139124
6124	NC_014012	ATCT	2	8	421720	421727	25 %	50 %	0 %	25 %	294139124
6125	NC_014012	GAG	2	6	421765	421770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139124
6126	NC_014012	ATGA	2	8	422046	422053	50 %	25 %	25 %	0 %	294139125
6127	NC_014012	T	6	6	422114	422119	0 %	100 %	0 %	0 %	294139125
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6130	NC_014012	AGAT	2	8	422234	422241	50 %	25 %	25 %	0 %	294139125
6131	NC_014012	ATC	2	6	422297	422302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139125
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6135	NC_014012	ATCT	2	8	422547	422554	25 %	50 %	0 %	25 %	294139125
6136	NC_014012	TAA	2	6	422631	422636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139125
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6139	NC_014012	CAGCG	2	10	422674	422683	20 %	0 %	40 %	40 %	294139125
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6143	NC_014012	CTG	2	6	422854	422859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139125
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6147	NC_014012	TCAG	2	8	422927	422934	25 %	25 %	25 %	25 %	294139125
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6152	NC_014012	TGG	2	6	423362	423367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139125
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6240	NC_014012	CAGC	2	8	429251	429258	25 %	0 %	25 %	50 %	294139128
6241	NC_014012	GGCA	2	8	429316	429323	25 %	0 %	50 %	25 %	294139128
6242	NC_014012	AGA	2	6	429363	429368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139128
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6245	NC_014012	GTT	2	6	429718	429723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139129
6246	NC_014012	GATCT	2	10	429776	429785	20 %	40 %	20 %	20 %	294139129
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6249	NC_014012	TTC	2	6	429956	429961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139129
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6350	NC_014012	ACCA	2	8	439225	439232	50 %	0 %	0 %	50 %	294139135
6351	NC_014012	AGC	2	6	439235	439240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139135
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6355	NC_014012	ACTG	2	8	439551	439558	25 %	25 %	25 %	25 %	294139135
6356	NC_014012	A	6	6	439561	439566	100 %	0 %	0 %	0 %	294139135
6357	NC_014012	TCAT	2	8	439673	439680	25 %	50 %	0 %	25 %	294139135
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6359	NC_014012	ACTG	2	8	439984	439991	25 %	25 %	25 %	25 %	294139136
6360	NC_014012	TGC	2	6	439996	440001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139136
6361	NC_014012	AAGA	2	8	440126	440133	75 %	0 %	25 %	0 %	294139136
6362	NC_014012	GAA	2	6	440147	440152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139136
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6364	NC_014012	ACG	2	6	440290	440295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139137
6365	NC_014012	CGTAA	2	10	440367	440376	40 %	20 %	20 %	20 %	294139137
6366	NC_014012	CAC	2	6	440398	440403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139137
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6368	NC_014012	ACG	2	6	440506	440511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139137
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6480	NC_014012	ATTC	2	8	447160	447167	25 %	50 %	0 %	25 %	294139144
6481	NC_014012	TATTCA	2	12	447329	447340	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294139144
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6487	NC_014012	AG	3	6	447788	447793	50 %	0 %	50 %	0 %	294139144
6488	NC_014012	ATT	2	6	447802	447807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139144
6489	NC_014012	T	6	6	447806	447811	0 %	100 %	0 %	0 %	294139144
6490	NC_014012	GTG	2	6	447812	447817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139144
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6498	NC_014012	CGA	2	6	448111	448116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139144
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