MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 71419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014012	TTC	2	6	347799	347804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139059
5002	NC_014012	CTG	2	6	347915	347920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139059
5003	NC_014012	TTG	2	6	347936	347941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139059
5004	NC_014012	CTA	2	6	348090	348095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139059
5005	NC_014012	CGA	2	6	348136	348141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139059
5006	NC_014012	GGC	2	6	348147	348152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139059
5007	NC_014012	TTA	2	6	348156	348161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139059
5008	NC_014012	GAA	2	6	348223	348228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139059
5009	NC_014012	CTT	2	6	348240	348245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139059
5010	NC_014012	AGCT	2	8	348281	348288	25 %	25 %	25 %	25 %	294139059
5011	NC_014012	GAA	2	6	348391	348396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139059
5012	NC_014012	ATT	2	6	348408	348413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139059
5013	NC_014012	GGT	2	6	348437	348442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139059
5014	NC_014012	CAAG	2	8	348492	348499	50 %	0 %	25 %	25 %	294139059
5015	NC_014012	CAG	2	6	348518	348523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139059
5016	NC_014012	CAG	2	6	348535	348540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139059
5017	NC_014012	GA	3	6	348543	348548	50 %	0 %	50 %	0 %	294139059
5018	NC_014012	AT	3	6	348549	348554	50 %	50 %	0 %	0 %	294139059
5019	NC_014012	GA	3	6	348578	348583	50 %	0 %	50 %	0 %	294139059
5020	NC_014012	CTG	2	6	348657	348662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139060
5021	NC_014012	AGCAG	2	10	348671	348680	40 %	0 %	40 %	20 %	294139060
5022	NC_014012	AGT	2	6	348684	348689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139060
5023	NC_014012	A	6	6	348693	348698	100 %	0 %	0 %	0 %	294139060
5024	NC_014012	GATC	2	8	348713	348720	25 %	25 %	25 %	25 %	294139060
5025	NC_014012	ACT	2	6	348743	348748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139060
5026	NC_014012	CT	3	6	348756	348761	0 %	50 %	0 %	50 %	294139060
5027	NC_014012	CAG	2	6	348762	348767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139060
5028	NC_014012	TTG	2	6	348825	348830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139060
5029	NC_014012	GCT	2	6	348992	348997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139060
5030	NC_014012	GCC	2	6	349071	349076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139060
5031	NC_014012	GAT	2	6	349077	349082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139060
5032	NC_014012	GCC	2	6	349281	349286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139060
5033	NC_014012	TGGC	2	8	349312	349319	0 %	25 %	50 %	25 %	294139060
5034	NC_014012	CTG	2	6	349443	349448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139060
5035	NC_014012	TCAG	2	8	349451	349458	25 %	25 %	25 %	25 %	294139060
5036	NC_014012	TGAA	2	8	349474	349481	50 %	25 %	25 %	0 %	294139060
5037	NC_014012	GCC	2	6	349490	349495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139060
5038	NC_014012	ACTAC	2	10	349728	349737	40 %	20 %	0 %	40 %	294139060
5039	NC_014012	ATC	2	6	349752	349757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139060
5040	NC_014012	TGG	2	6	349759	349764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139060
5041	NC_014012	GA	3	6	349780	349785	50 %	0 %	50 %	0 %	294139060
5042	NC_014012	AC	3	6	349841	349846	50 %	0 %	0 %	50 %	294139060
5043	NC_014012	ATG	2	6	349849	349854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139060
5044	NC_014012	TAG	2	6	349903	349908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139060
5045	NC_014012	ATT	2	6	349926	349931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139060
5046	NC_014012	GT	3	6	350104	350109	0 %	50 %	50 %	0 %	294139060
5047	NC_014012	GCA	2	6	350181	350186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139060
5048	NC_014012	A	6	6	350186	350191	100 %	0 %	0 %	0 %	294139060
5049	NC_014012	GAC	2	6	350249	350254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139060
5050	NC_014012	GCA	2	6	350463	350468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139061
5051	NC_014012	GGT	2	6	350478	350483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139061
5052	NC_014012	TC	3	6	350576	350581	0 %	50 %	0 %	50 %	294139061
5053	NC_014012	GCA	2	6	350584	350589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139061
5054	NC_014012	GC	3	6	350676	350681	0 %	0 %	50 %	50 %	294139061
5055	NC_014012	CCG	2	6	350756	350761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139061
5056	NC_014012	GTC	2	6	350762	350767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139061
5057	NC_014012	ATC	2	6	350786	350791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139061
5058	NC_014012	GA	3	6	350837	350842	50 %	0 %	50 %	0 %	294139061
5059	NC_014012	CAT	2	6	350985	350990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139061
5060	NC_014012	GCCA	2	8	351093	351100	25 %	0 %	25 %	50 %	294139061
5061	NC_014012	GCA	2	6	351206	351211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139061
5062	NC_014012	ATG	2	6	351256	351261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139061
5063	NC_014012	CATG	2	8	351327	351334	25 %	25 %	25 %	25 %	294139061
5064	NC_014012	TCG	2	6	351341	351346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139061
5065	NC_014012	CTC	2	6	351413	351418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139061
5066	NC_014012	GCT	2	6	351468	351473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139061
5067	NC_014012	TGC	2	6	351480	351485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139061
5068	NC_014012	TGT	2	6	351624	351629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139061
5069	NC_014012	GGA	2	6	351634	351639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139061
5070	NC_014012	TAGGGC	2	12	351643	351654	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294139061
5071	NC_014012	AGGG	2	8	352179	352186	25 %	0 %	75 %	0 %	294139062
5072	NC_014012	CAG	2	6	352400	352405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139063
5073	NC_014012	GAT	2	6	352441	352446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139063
5074	NC_014012	GCTA	2	8	352471	352478	25 %	25 %	25 %	25 %	294139063
5075	NC_014012	GCT	2	6	352517	352522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139063
5076	NC_014012	GAT	2	6	352609	352614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139063
5077	NC_014012	AGTCA	2	10	352656	352665	40 %	20 %	20 %	20 %	294139063
5078	NC_014012	AGG	2	6	352702	352707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139063
5079	NC_014012	TAA	2	6	352720	352725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139063
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5084	NC_014012	TAA	2	6	352904	352909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139063
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5086	NC_014012	GTGATT	2	12	353094	353105	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	294139064
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5088	NC_014012	TGG	2	6	353189	353194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139064
5089	NC_014012	GTA	2	6	353245	353250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139064
5090	NC_014012	TC	3	6	353283	353288	0 %	50 %	0 %	50 %	294139064
5091	NC_014012	AT	3	6	353399	353404	50 %	50 %	0 %	0 %	294139064
5092	NC_014012	CAG	2	6	353437	353442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139064
5093	NC_014012	GTAG	2	8	353484	353491	25 %	25 %	50 %	0 %	294139064
5094	NC_014012	ATC	2	6	353545	353550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139064
5095	NC_014012	ACTA	2	8	353664	353671	50 %	25 %	0 %	25 %	294139064
5096	NC_014012	AT	3	6	353765	353770	50 %	50 %	0 %	0 %	294139065
5097	NC_014012	CAA	2	6	353775	353780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139065
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5101	NC_014012	AGA	2	6	354050	354055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139065
5102	NC_014012	TTG	2	6	354088	354093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139065
5103	NC_014012	CTC	2	6	354106	354111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139065
5104	NC_014012	TTG	2	6	354133	354138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139065
5105	NC_014012	TA	3	6	354176	354181	50 %	50 %	0 %	0 %	294139065
5106	NC_014012	GC	3	6	354190	354195	0 %	0 %	50 %	50 %	294139065
5107	NC_014012	AAG	2	6	354229	354234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139065
5108	NC_014012	TTG	2	6	354265	354270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139065
5109	NC_014012	GTT	2	6	354277	354282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139065
5110	NC_014012	TTG	2	6	354333	354338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139066
5111	NC_014012	TTA	2	6	354387	354392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139066
5112	NC_014012	GCT	2	6	354476	354481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139066
5113	NC_014012	GAA	2	6	354491	354496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139066
5114	NC_014012	CTG	2	6	354540	354545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139066
5115	NC_014012	ACT	2	6	354731	354736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139066
5116	NC_014012	TA	3	6	354759	354764	50 %	50 %	0 %	0 %	294139066
5117	NC_014012	AAT	2	6	355032	355037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139067
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5119	NC_014012	GTG	2	6	355074	355079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139067
5120	NC_014012	TTA	2	6	355123	355128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139067
5121	NC_014012	GC	3	6	355174	355179	0 %	0 %	50 %	50 %	294139067
5122	NC_014012	TAA	2	6	355256	355261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139067
5123	NC_014012	GGTACC	2	12	355278	355289	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	294139067
5124	NC_014012	CAATG	2	10	355340	355349	40 %	20 %	20 %	20 %	294139067
5125	NC_014012	TGA	2	6	355361	355366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139067
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5130	NC_014012	TGA	2	6	355816	355821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139068
5131	NC_014012	TGA	2	6	355931	355936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139068
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5135	NC_014012	TGG	2	6	356267	356272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139069
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5141	NC_014012	ATG	2	6	356543	356548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139069
5142	NC_014012	GAT	2	6	356551	356556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139069
5143	NC_014012	ATG	2	6	356558	356563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139069
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5150	NC_014012	TCA	2	6	356854	356859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139070
5151	NC_014012	TCG	2	6	356875	356880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139070
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5233	NC_014012	GTA	2	6	361545	361550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139072
5234	NC_014012	TGG	2	6	361664	361669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139072
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5239	NC_014012	CTG	3	9	361803	361811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139072
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5242	NC_014012	GCT	2	6	361898	361903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139072
5243	NC_014012	ATA	2	6	361920	361925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139072
5244	NC_014012	CTTTAC	2	12	361963	361974	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	294139072
5245	NC_014012	CAA	2	6	362000	362005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139072
5246	NC_014012	TTG	2	6	362022	362027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139072
5247	NC_014012	AG	3	6	362050	362055	50 %	0 %	50 %	0 %	294139072
5248	NC_014012	AGA	2	6	362128	362133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139072
5249	NC_014012	CGG	2	6	362163	362168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139072
5250	NC_014012	ACT	2	6	362186	362191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139072
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5253	NC_014012	TTAAGC	2	12	362334	362345	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294139072
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5257	NC_014012	GTA	2	6	362970	362975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139073
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5261	NC_014012	GTA	2	6	363175	363180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139073
5262	NC_014012	ATG	2	6	363205	363210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139073
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5264	NC_014012	CTTG	2	8	363356	363363	0 %	50 %	25 %	25 %	294139073
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5266	NC_014012	CTAG	2	8	363462	363469	25 %	25 %	25 %	25 %	294139073
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5299	NC_014012	CT	3	6	365127	365132	0 %	50 %	0 %	50 %	294139073
5300	NC_014012	GAC	2	6	365187	365192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139073
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5314	NC_014012	TCGA	2	8	366245	366252	25 %	25 %	25 %	25 %	294139074
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5318	NC_014012	TG	3	6	366545	366550	0 %	50 %	50 %	0 %	294139074
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5321	NC_014012	GCT	2	6	366644	366649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139074
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5350	NC_014012	GGT	2	6	368328	368333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139076
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5484	NC_014012	GTTT	2	8	376570	376577	0 %	75 %	25 %	0 %	294139081
5485	NC_014012	CTG	2	6	376637	376642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139081
5486	NC_014012	GT	3	6	376679	376684	0 %	50 %	50 %	0 %	294139081
5487	NC_014012	GCA	2	6	376736	376741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139081
5488	NC_014012	GAT	2	6	376840	376845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139081
5489	NC_014012	TAAAT	2	10	376911	376920	60 %	40 %	0 %	0 %	294139081
5490	NC_014012	GC	3	6	376921	376926	0 %	0 %	50 %	50 %	294139081
5491	NC_014012	TGCCTA	2	12	376979	376990	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294139081
5492	NC_014012	GAT	2	6	377037	377042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139081
5493	NC_014012	AAAG	2	8	377052	377059	75 %	0 %	25 %	0 %	294139081
5494	NC_014012	GGT	3	9	377080	377088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139081
5495	NC_014012	TTGA	2	8	377140	377147	25 %	50 %	25 %	0 %	294139081
5496	NC_014012	TGG	2	6	377225	377230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139081
5497	NC_014012	AGAT	2	8	377318	377325	50 %	25 %	25 %	0 %	294139081
5498	NC_014012	TGG	2	6	377337	377342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139081
5499	NC_014012	GCT	2	6	377579	377584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139082
5500	NC_014012	AAG	2	6	377617	377622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139082

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