MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella violacea DSS12 chromosome

Total Repeats: 71419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014012	TGG	2	6	313755	313760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139036
4502	NC_014012	AGA	2	6	313844	313849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139036
4503	NC_014012	CGG	2	6	313955	313960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139036
4504	NC_014012	AAGA	2	8	313966	313973	75 %	0 %	25 %	0 %	294139036
4505	NC_014012	TTC	2	6	314052	314057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139036
4506	NC_014012	TCTG	2	8	314058	314065	0 %	50 %	25 %	25 %	294139036
4507	NC_014012	GAA	2	6	314088	314093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139036
4508	NC_014012	AAG	2	6	314209	314214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139036
4509	NC_014012	GGT	2	6	314251	314256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139036
4510	NC_014012	GCT	2	6	314477	314482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139036
4511	NC_014012	A	8	8	314510	314517	100 %	0 %	0 %	0 %	294139036
4512	NC_014012	CGG	2	6	314730	314735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139037
4513	NC_014012	ATC	2	6	314771	314776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139037
4514	NC_014012	GGC	2	6	314975	314980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139037
4515	NC_014012	TAT	2	6	315094	315099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139037
4516	NC_014012	AAG	2	6	315186	315191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139037
4517	NC_014012	GCG	2	6	315216	315221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139037
4518	NC_014012	CAT	2	6	315223	315228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139037
4519	NC_014012	CAG	2	6	315306	315311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139037
4520	NC_014012	CGTG	2	8	315325	315332	0 %	25 %	50 %	25 %	294139037
4521	NC_014012	AAG	2	6	315341	315346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139037
4522	NC_014012	ATG	2	6	315368	315373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139037
4523	NC_014012	GAT	2	6	315404	315409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139037
4524	NC_014012	AAG	2	6	315434	315439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139037
4525	NC_014012	CTG	2	6	315444	315449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139037
4526	NC_014012	TCA	2	6	315552	315557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139037
4527	NC_014012	TCG	2	6	315612	315617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139037
4528	NC_014012	TGCT	2	8	315627	315634	0 %	50 %	25 %	25 %	294139037
4529	NC_014012	CTT	2	6	315691	315696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139037
4530	NC_014012	GAAG	2	8	315763	315770	50 %	0 %	50 %	0 %	294139037
4531	NC_014012	GCC	2	6	315815	315820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139037
4532	NC_014012	TCG	2	6	315909	315914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139037
4533	NC_014012	CGG	2	6	315922	315927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139037
4534	NC_014012	AGA	2	6	315976	315981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139037
4535	NC_014012	A	6	6	316084	316089	100 %	0 %	0 %	0 %	294139037
4536	NC_014012	GAA	2	6	316090	316095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139037
4537	NC_014012	A	6	6	316312	316317	100 %	0 %	0 %	0 %	294139038
4538	NC_014012	TG	3	6	316318	316323	0 %	50 %	50 %	0 %	294139038
4539	NC_014012	TGAG	2	8	316572	316579	25 %	25 %	50 %	0 %	294139038
4540	NC_014012	ATT	2	6	316599	316604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139038
4541	NC_014012	ATC	2	6	316691	316696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139038
4542	NC_014012	TTCC	2	8	316793	316800	0 %	50 %	0 %	50 %	294139038
4543	NC_014012	GAT	2	6	316841	316846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139038
4544	NC_014012	TCG	2	6	316857	316862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139038
4545	NC_014012	TGAGTT	2	12	316867	316878	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	294139038
4546	NC_014012	TGC	2	6	316909	316914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139038
4547	NC_014012	GAA	2	6	316928	316933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139038
4548	NC_014012	TGA	2	6	316941	316946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139038
4549	NC_014012	GTT	2	6	316951	316956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139038
4550	NC_014012	CCA	2	6	317061	317066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139038
4551	NC_014012	AGG	2	6	317236	317241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139038
4552	NC_014012	T	6	6	317281	317286	0 %	100 %	0 %	0 %	294139038
4553	NC_014012	TGA	2	6	317326	317331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139038
4554	NC_014012	ATT	2	6	317333	317338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139038
4555	NC_014012	TTGG	2	8	317368	317375	0 %	50 %	50 %	0 %	294139038
4556	NC_014012	ATAA	2	8	317399	317406	75 %	25 %	0 %	0 %	294139038
4557	NC_014012	TAT	2	6	317499	317504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139038
4558	NC_014012	ACC	2	6	317507	317512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139038
4559	NC_014012	GTG	2	6	317525	317530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139038
4560	NC_014012	TGG	2	6	317642	317647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139038
4561	NC_014012	GAT	2	6	317720	317725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139038
4562	NC_014012	AAT	2	6	317737	317742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139038
4563	NC_014012	GGT	2	6	317789	317794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139038
4564	NC_014012	GCA	2	6	317862	317867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139038
4565	NC_014012	TTGG	2	8	317914	317921	0 %	50 %	50 %	0 %	294139038
4566	NC_014012	AC	3	6	317949	317954	50 %	0 %	0 %	50 %	294139038
4567	NC_014012	TAAA	2	8	317979	317986	75 %	25 %	0 %	0 %	294139038
4568	NC_014012	ATTG	2	8	317996	318003	25 %	50 %	25 %	0 %	294139038
4569	NC_014012	GGA	2	6	318130	318135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294139038
4570	NC_014012	ATG	2	6	318141	318146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139038
4571	NC_014012	ATG	2	6	318279	318284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139038
4572	NC_014012	A	6	6	318318	318323	100 %	0 %	0 %	0 %	294139038
4573	NC_014012	GAT	2	6	318343	318348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139038
4574	NC_014012	GAT	2	6	318380	318385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139038
4575	NC_014012	TAC	2	6	318447	318452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139038
4576	NC_014012	TGG	2	6	318581	318586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139038
4577	NC_014012	CTG	2	6	318608	318613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139038
4578	NC_014012	TTA	2	6	318614	318619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139038
4579	NC_014012	TAT	2	6	318624	318629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139038
4580	NC_014012	AG	3	6	318712	318717	50 %	0 %	50 %	0 %	294139038
4581	NC_014012	GGT	2	6	318880	318885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139038
4582	NC_014012	GCA	2	6	318904	318909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139038
4583	NC_014012	TATCGC	2	12	318938	318949	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294139038
4584	NC_014012	GGTGGA	2	12	318994	319005	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	294139038
4585	NC_014012	GTA	2	6	319017	319022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139038
4586	NC_014012	AGA	2	6	319072	319077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139038
4587	NC_014012	TAA	2	6	319162	319167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139038
4588	NC_014012	GCC	2	6	319169	319174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139038
4589	NC_014012	CGG	2	6	319194	319199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139038
4590	NC_014012	AATT	2	8	319227	319234	50 %	50 %	0 %	0 %	294139038
4591	NC_014012	GA	3	6	319418	319423	50 %	0 %	50 %	0 %	294139038
4592	NC_014012	ATG	2	6	319461	319466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139038
4593	NC_014012	TTTG	2	8	319492	319499	0 %	75 %	25 %	0 %	294139038
4594	NC_014012	GTG	2	6	319539	319544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139038
4595	NC_014012	TCTCGA	2	12	319564	319575	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294139038
4596	NC_014012	TTG	2	6	319625	319630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139038
4597	NC_014012	CGG	2	6	319690	319695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139038
4598	NC_014012	TTA	2	6	319712	319717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139038
4599	NC_014012	TGC	2	6	319723	319728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139038
4600	NC_014012	T	6	6	319808	319813	0 %	100 %	0 %	0 %	294139038
4601	NC_014012	GAT	2	6	319847	319852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139038
4602	NC_014012	AAT	2	6	319877	319882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139038
4603	NC_014012	AGA	2	6	319909	319914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139038
4604	NC_014012	ACC	2	6	319968	319973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139038
4605	NC_014012	AG	4	8	320005	320012	50 %	0 %	50 %	0 %	294139038
4606	NC_014012	AT	3	6	320127	320132	50 %	50 %	0 %	0 %	294139038
4607	NC_014012	CGG	2	6	320262	320267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139038
4608	NC_014012	TGA	2	6	320370	320375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139038
4609	NC_014012	GAT	2	6	320441	320446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139038
4610	NC_014012	CTC	2	6	320461	320466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294139038
4611	NC_014012	CCA	2	6	320535	320540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139038
4612	NC_014012	AGT	2	6	320564	320569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139038
4613	NC_014012	ATT	2	6	320570	320575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139038
4614	NC_014012	TAAAC	2	10	320593	320602	60 %	20 %	0 %	20 %	294139038
4615	NC_014012	AGC	2	6	320631	320636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139038
4616	NC_014012	ATT	2	6	320679	320684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139038
4617	NC_014012	AT	3	6	320719	320724	50 %	50 %	0 %	0 %	294139038
4618	NC_014012	GTG	3	9	320964	320972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139039
4619	NC_014012	AG	3	6	321195	321200	50 %	0 %	50 %	0 %	294139039
4620	NC_014012	CGA	2	6	321235	321240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139039
4621	NC_014012	GACA	2	8	321273	321280	50 %	0 %	25 %	25 %	294139039
4622	NC_014012	TGC	2	6	321291	321296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139039
4623	NC_014012	GCA	2	6	321408	321413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139039
4624	NC_014012	CAT	3	9	321547	321555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139039
4625	NC_014012	GAA	2	6	321583	321588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139039
4626	NC_014012	CT	3	6	321626	321631	0 %	50 %	0 %	50 %	294139039
4627	NC_014012	ACGA	2	8	321677	321684	50 %	0 %	25 %	25 %	294139039
4628	NC_014012	GA	3	6	321711	321716	50 %	0 %	50 %	0 %	294139039
4629	NC_014012	TAC	2	6	321721	321726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139039
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4632	NC_014012	ATC	2	6	321882	321887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139039
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4634	NC_014012	GAT	2	6	322142	322147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139039
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4642	NC_014012	CGA	2	6	322630	322635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139039
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4649	NC_014012	AGTA	2	8	323246	323253	50 %	25 %	25 %	0 %	294139040
4650	NC_014012	GCA	2	6	323289	323294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139040
4651	NC_014012	GTA	2	6	323296	323301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139040
4652	NC_014012	GTA	2	6	323319	323324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139040
4653	NC_014012	CAA	2	6	323325	323330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139040
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4660	NC_014012	GCG	2	6	323707	323712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139040
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4721	NC_014012	CAG	2	6	327479	327484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139042
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4725	NC_014012	TAC	2	6	327729	327734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139042
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4733	NC_014012	ATC	2	6	328330	328335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139042
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4738	NC_014012	GAT	2	6	328549	328554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139042
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4740	NC_014012	CAC	2	6	328697	328702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294139042
4741	NC_014012	GAA	2	6	328732	328737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139042
4742	NC_014012	CTA	2	6	328740	328745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139042
4743	NC_014012	GTT	2	6	328787	328792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139042
4744	NC_014012	TATG	2	8	328796	328803	25 %	50 %	25 %	0 %	294139042
4745	NC_014012	AGCT	2	8	328910	328917	25 %	25 %	25 %	25 %	294139042
4746	NC_014012	CTG	2	6	328930	328935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139042
4747	NC_014012	GTC	2	6	328937	328942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139042
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4749	NC_014012	TG	3	6	329285	329290	0 %	50 %	50 %	0 %	294139043
4750	NC_014012	TCG	2	6	329339	329344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139043
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4761	NC_014012	CTT	2	6	330558	330563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139044
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4828	NC_014012	TGG	2	6	334633	334638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139048
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4842	NC_014012	ATT	2	6	335576	335581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139048
4843	NC_014012	ATG	3	9	335627	335635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139048
4844	NC_014012	CTTGC	2	10	335791	335800	0 %	40 %	20 %	40 %	294139048
4845	NC_014012	CTGC	2	8	335913	335920	0 %	25 %	25 %	50 %	294139048
4846	NC_014012	TTC	2	6	335941	335946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139048
4847	NC_014012	ATCT	2	8	335977	335984	25 %	50 %	0 %	25 %	294139048
4848	NC_014012	CTT	2	6	336069	336074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139048
4849	NC_014012	ATG	2	6	336144	336149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139048
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4851	NC_014012	A	6	6	336177	336182	100 %	0 %	0 %	0 %	294139048
4852	NC_014012	GTG	2	6	336185	336190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139048
4853	NC_014012	ATA	2	6	336265	336270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294139048
4854	NC_014012	TA	3	6	336294	336299	50 %	50 %	0 %	0 %	294139048
4855	NC_014012	GTA	2	6	336309	336314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139048
4856	NC_014012	TGC	2	6	336407	336412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139048
4857	NC_014012	CAA	2	6	336519	336524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294139048
4858	NC_014012	CGC	2	6	336688	336693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139049
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4980	NC_014012	TGA	2	6	346224	346229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294139057
4981	NC_014012	GCT	2	6	346246	346251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294139057
4982	NC_014012	CT	3	6	346250	346255	0 %	50 %	0 %	50 %	294139057
4983	NC_014012	TTA	2	6	346265	346270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139057
4984	NC_014012	GAA	2	6	346321	346326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294139057
4985	NC_014012	TTC	2	6	346523	346528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294139058
4986	NC_014012	AATG	2	8	346651	346658	50 %	25 %	25 %	0 %	294139058
4987	NC_014012	CGG	2	6	346710	346715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294139058
4988	NC_014012	CCG	2	6	346758	346763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294139058
4989	NC_014012	CAACTG	2	12	346772	346783	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	294139058
4990	NC_014012	CAG	2	6	346796	346801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139058
4991	NC_014012	TG	3	6	346815	346820	0 %	50 %	50 %	0 %	294139058
4992	NC_014012	GGT	2	6	346936	346941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294139058
4993	NC_014012	CTGC	2	8	347023	347030	0 %	25 %	25 %	50 %	294139058
4994	NC_014012	TGGTTT	2	12	347291	347302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294139058
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4996	NC_014012	CAG	2	6	347410	347415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294139059
4997	NC_014012	TAT	2	6	347495	347500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294139059
4998	NC_014012	TCA	2	6	347575	347580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294139059
4999	NC_014012	CCTTG	2	10	347622	347631	0 %	40 %	20 %	40 %	294139059
5000	NC_014012	GCTG	2	8	347673	347680	0 %	25 %	50 %	25 %	294139059

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