MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingobium japonicum UT26S chromosome 1

Total Repeats: 82243

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014006	TGGGCG	2	12	233883	233894	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	294010207
5502	NC_014006	GAT	2	6	233897	233902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294010207
5503	NC_014006	CCGCG	2	10	233949	233958	0 %	0 %	40 %	60 %	294010208
5504	NC_014006	GC	3	6	233980	233985	0 %	0 %	50 %	50 %	294010208
5505	NC_014006	CCAG	2	8	234015	234022	25 %	0 %	25 %	50 %	294010208
5506	NC_014006	CG	3	6	234041	234046	0 %	0 %	50 %	50 %	294010208
5507	NC_014006	CGT	2	6	234048	234053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010208
5508	NC_014006	CAC	2	6	234076	234081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294010208
5509	NC_014006	GGC	2	6	234139	234144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010208
5510	NC_014006	TCC	2	6	234158	234163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294010208
5511	NC_014006	CG	3	6	234171	234176	0 %	0 %	50 %	50 %	294010208
5512	NC_014006	ATG	2	6	234194	234199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294010208
5513	NC_014006	CCG	2	6	234200	234205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010208
5514	NC_014006	CGAT	2	8	234258	234265	25 %	25 %	25 %	25 %	294010208
5515	NC_014006	TGC	2	6	234276	234281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010208
5516	NC_014006	TCC	2	6	234296	234301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294010208
5517	NC_014006	GCCCGT	2	12	234328	234339	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	294010209
5518	NC_014006	GCCG	2	8	234403	234410	0 %	0 %	50 %	50 %	294010209
5519	NC_014006	GCG	2	6	234476	234481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010209
5520	NC_014006	TCG	2	6	234527	234532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010209
5521	NC_014006	GCC	2	6	234550	234555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010209
5522	NC_014006	TCC	2	6	234581	234586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294010209
5523	NC_014006	CGGCG	2	10	234635	234644	0 %	0 %	60 %	40 %	294010209
5524	NC_014006	ATA	2	6	234661	234666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294010209
5525	NC_014006	GCCCTC	2	12	234745	234756	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	294010209
5526	NC_014006	TCA	2	6	234794	234799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294010209
5527	NC_014006	GC	3	6	234823	234828	0 %	0 %	50 %	50 %	294010209
5528	NC_014006	ATA	2	6	234871	234876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294010209
5529	NC_014006	GCC	2	6	234877	234882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010209
5530	NC_014006	GC	3	6	234883	234888	0 %	0 %	50 %	50 %	294010209
5531	NC_014006	CCA	2	6	234895	234900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294010209
5532	NC_014006	GTT	2	6	234934	234939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294010209
5533	NC_014006	ATA	2	6	234955	234960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294010209
5534	NC_014006	GTC	2	6	235006	235011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010209
5535	NC_014006	CGA	2	6	235044	235049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010209
5536	NC_014006	CGC	2	6	235051	235056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010209
5537	NC_014006	C	6	6	235071	235076	0 %	0 %	0 %	100 %	294010209
5538	NC_014006	GGC	2	6	235081	235086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010209
5539	NC_014006	GC	3	6	235085	235090	0 %	0 %	50 %	50 %	294010209
5540	NC_014006	TCG	2	6	235097	235102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010209
5541	NC_014006	AGC	2	6	235103	235108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010209
5542	NC_014006	CG	3	6	235141	235146	0 %	0 %	50 %	50 %	294010209
5543	NC_014006	CAG	2	6	235150	235155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010209
5544	NC_014006	CCTT	2	8	235178	235185	0 %	50 %	0 %	50 %	294010209
5545	NC_014006	CTC	2	6	235213	235218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294010209
5546	NC_014006	GGC	3	9	235364	235372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010210
5547	NC_014006	CCG	2	6	235375	235380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010210
5548	NC_014006	ACC	2	6	235383	235388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294010210
5549	NC_014006	GCG	2	6	235395	235400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010210
5550	NC_014006	GCA	2	6	235408	235413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010210
5551	NC_014006	CGC	2	6	235417	235422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010210
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5553	NC_014006	GCCG	2	8	235499	235506	0 %	0 %	50 %	50 %	294010210
5554	NC_014006	CG	3	6	235505	235510	0 %	0 %	50 %	50 %	294010210
5555	NC_014006	TCG	2	6	235513	235518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010210
5556	NC_014006	ATA	2	6	235523	235528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294010210
5557	NC_014006	ATC	2	6	235542	235547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294010210
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5559	NC_014006	CAG	2	6	235634	235639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010210
5560	NC_014006	CGC	2	6	235649	235654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010210
5561	NC_014006	GCCGC	2	10	235678	235687	0 %	0 %	40 %	60 %	294010210
5562	NC_014006	CAG	2	6	235760	235765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010210
5563	NC_014006	CGT	2	6	235789	235794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010210
5564	NC_014006	GAT	2	6	235819	235824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294010210
5565	NC_014006	CGA	2	6	235831	235836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010210
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5571	NC_014006	CG	3	6	236008	236013	0 %	0 %	50 %	50 %	294010210
5572	NC_014006	GCG	2	6	236019	236024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010210
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5591	NC_014006	GGC	2	6	236831	236836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010211
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5594	NC_014006	CG	3	6	236950	236955	0 %	0 %	50 %	50 %	294010211
5595	NC_014006	CCG	2	6	236975	236980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010211
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5601	NC_014006	AAT	2	6	237218	237223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294010211
5602	NC_014006	CGACC	2	10	237243	237252	20 %	0 %	20 %	60 %	294010211
5603	NC_014006	CGATAT	2	12	237269	237280	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294010211
5604	NC_014006	CGG	2	6	237304	237309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010211
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5608	NC_014006	TCA	2	6	237425	237430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294010211
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5610	NC_014006	GGC	2	6	237462	237467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010211
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5612	NC_014006	GCC	2	6	237573	237578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010211
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5621	NC_014006	CGCCTC	2	12	238089	238100	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	294010212
5622	NC_014006	CTG	2	6	238158	238163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010212
5623	NC_014006	GCC	2	6	238187	238192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010212
5624	NC_014006	AGC	3	9	238195	238203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010212
5625	NC_014006	GCA	2	6	238238	238243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010212
5626	NC_014006	C	6	6	238260	238265	0 %	0 %	0 %	100 %	294010212
5627	NC_014006	CGG	2	6	238319	238324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010212
5628	NC_014006	TCC	2	6	238345	238350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294010212
5629	NC_014006	CGA	2	6	238418	238423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010212
5630	NC_014006	CGCGAT	2	12	238464	238475	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	294010212
5631	NC_014006	GCA	3	9	238514	238522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010212
5632	NC_014006	GC	5	10	238547	238556	0 %	0 %	50 %	50 %	294010212
5633	NC_014006	GCC	2	6	238858	238863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010213
5634	NC_014006	TGGCG	2	10	238869	238878	0 %	20 %	60 %	20 %	294010213
5635	NC_014006	CG	3	6	238877	238882	0 %	0 %	50 %	50 %	294010213
5636	NC_014006	GCT	2	6	239046	239051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010213
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5640	NC_014006	CAT	2	6	239082	239087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294010213
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5642	NC_014006	CGC	2	6	239119	239124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010213
5643	NC_014006	CCG	3	9	239127	239135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010213
5644	NC_014006	CTG	2	6	239161	239166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010213
5645	NC_014006	CGA	2	6	239181	239186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010213
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5647	NC_014006	GCCA	2	8	239278	239285	25 %	0 %	25 %	50 %	294010213
5648	NC_014006	CGGC	2	8	239388	239395	0 %	0 %	50 %	50 %	294010213
5649	NC_014006	GTC	2	6	239431	239436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010213
5650	NC_014006	AAAT	2	8	239455	239462	75 %	25 %	0 %	0 %	294010213
5651	NC_014006	GC	3	6	239670	239675	0 %	0 %	50 %	50 %	294010214
5652	NC_014006	CG	3	6	239702	239707	0 %	0 %	50 %	50 %	294010214
5653	NC_014006	TGC	2	6	239783	239788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010214
5654	NC_014006	GTTC	2	8	239858	239865	0 %	50 %	25 %	25 %	294010214
5655	NC_014006	GGC	2	6	239895	239900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010214
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5658	NC_014006	CGA	2	6	239967	239972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010214
5659	NC_014006	ACCA	2	8	239989	239996	50 %	0 %	0 %	50 %	294010214
5660	NC_014006	TAT	2	6	240094	240099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294010214
5661	NC_014006	TGG	2	6	240104	240109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294010214
5662	NC_014006	CGC	3	9	240186	240194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010214
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5664	NC_014006	GAG	2	6	240245	240250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294010215
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5691	NC_014006	CCTATC	2	12	241416	241427	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	294010215
5692	NC_014006	CCGA	2	8	241439	241446	25 %	0 %	25 %	50 %	294010215
5693	NC_014006	GC	3	6	241465	241470	0 %	0 %	50 %	50 %	294010215
5694	NC_014006	GCCGA	2	10	241511	241520	20 %	0 %	40 %	40 %	294010215
5695	NC_014006	GC	3	6	241601	241606	0 %	0 %	50 %	50 %	294010216
5696	NC_014006	GC	3	6	241669	241674	0 %	0 %	50 %	50 %	294010216
5697	NC_014006	CGGCC	2	10	241683	241692	0 %	0 %	40 %	60 %	294010216
5698	NC_014006	CAA	2	6	241728	241733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294010216
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5700	NC_014006	GGCG	2	8	241809	241816	0 %	0 %	75 %	25 %	294010216
5701	NC_014006	GCG	3	9	241814	241822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010216
5702	NC_014006	GGCG	2	8	241853	241860	0 %	0 %	75 %	25 %	294010216
5703	NC_014006	TCGC	2	8	241941	241948	0 %	25 %	25 %	50 %	294010216
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5707	NC_014006	GGC	2	6	242127	242132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010216
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5721	NC_014006	CG	4	8	242868	242875	0 %	0 %	50 %	50 %	294010217
5722	NC_014006	ATG	2	6	242885	242890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294010217
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5728	NC_014006	GGC	2	6	243071	243076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010217
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5730	NC_014006	GGTG	2	8	243108	243115	0 %	25 %	75 %	0 %	294010217
5731	NC_014006	TCA	2	6	243117	243122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294010217
5732	NC_014006	CG	4	8	243264	243271	0 %	0 %	50 %	50 %	294010218
5733	NC_014006	TTG	2	6	243276	243281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294010218
5734	NC_014006	CCG	3	9	243403	243411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010218
5735	NC_014006	GC	3	6	243418	243423	0 %	0 %	50 %	50 %	294010218
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5738	NC_014006	GCG	2	6	243488	243493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010218
5739	NC_014006	GCT	2	6	243503	243508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010218
5740	NC_014006	GGC	2	6	243511	243516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010218
5741	NC_014006	CGT	2	6	243555	243560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010218
5742	NC_014006	CGA	2	6	243585	243590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010218
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5744	NC_014006	CAA	2	6	243621	243626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294010218
5745	NC_014006	CGT	2	6	243654	243659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010218
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5985	NC_014006	CG	5	10	254272	254281	0 %	0 %	50 %	50 %	294010226
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5987	NC_014006	TCGA	2	8	254325	254332	25 %	25 %	25 %	25 %	294010226
5988	NC_014006	GCG	4	12	254347	254358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010226
5989	NC_014006	GCC	2	6	254432	254437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010226
5990	NC_014006	CGG	2	6	254482	254487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010226
5991	NC_014006	CGC	2	6	254593	254598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010226
5992	NC_014006	GC	3	6	254671	254676	0 %	0 %	50 %	50 %	294010226
5993	NC_014006	CGG	2	6	254792	254797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294010226
5994	NC_014006	CGC	2	6	254809	254814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010226
5995	NC_014006	GTCG	2	8	254843	254850	0 %	25 %	50 %	25 %	294010226
5996	NC_014006	CGC	2	6	254902	254907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010226
5997	NC_014006	GCC	2	6	254927	254932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010226
5998	NC_014006	GCC	2	6	255092	255097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294010226
5999	NC_014006	GCT	2	6	255104	255109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294010226
6000	NC_014006	CAG	2	6	255143	255148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294010226

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