MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingobium japonicum UT26S plasmid pUT1

Total Repeats: 626

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014005	ATCCCG	2	12	110	121	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	293980645
2	NC_014005	TCGC	2	8	193	200	0 %	25 %	25 %	50 %	293980645
3	NC_014005	CAA	2	6	243	248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	293980645
4	NC_014005	CGA	2	6	281	286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980645
5	NC_014005	GC	3	6	379	384	0 %	0 %	50 %	50 %	293980645
6	NC_014005	CAC	2	6	474	479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	293980645
7	NC_014005	TCA	2	6	524	529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293980645
8	NC_014005	GC	3	6	694	699	0 %	0 %	50 %	50 %	293980645
9	NC_014005	GCG	2	6	707	712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980645
10	NC_014005	TGC	2	6	794	799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980645
11	NC_014005	TCG	2	6	806	811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980645
12	NC_014005	ATC	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293980645
13	NC_014005	ACG	2	6	947	952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980645
14	NC_014005	TGG	2	6	1009	1014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	293980645
15	NC_014005	CGC	2	6	1050	1055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980645
16	NC_014005	CAA	2	6	1074	1079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	293980645
17	NC_014005	CTT	2	6	1157	1162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293980646
18	NC_014005	GTC	2	6	1172	1177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980646
19	NC_014005	GTC	2	6	1206	1211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980646
20	NC_014005	ATA	2	6	1227	1232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	293980646
21	NC_014005	TG	3	6	1239	1244	0 %	50 %	50 %	0 %	293980646
22	NC_014005	G	6	6	1254	1259	0 %	0 %	100 %	0 %	293980646
23	NC_014005	CGG	2	6	1298	1303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980646
24	NC_014005	TCCG	2	8	1361	1368	0 %	25 %	25 %	50 %	293980646
25	NC_014005	CGC	2	6	1420	1425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980647
26	NC_014005	TCG	2	6	1478	1483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980647
27	NC_014005	GGCCT	2	10	1516	1525	0 %	20 %	40 %	40 %	293980647
28	NC_014005	ATCGC	2	10	1607	1616	20 %	20 %	20 %	40 %	293980647
29	NC_014005	GC	3	6	1759	1764	0 %	0 %	50 %	50 %	293980647
30	NC_014005	CG	4	8	1782	1789	0 %	0 %	50 %	50 %	293980647
31	NC_014005	CCG	2	6	1791	1796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980647
32	NC_014005	CGG	2	6	1881	1886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980647
33	NC_014005	GAT	2	6	1945	1950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293980647
34	NC_014005	CGT	2	6	2002	2007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980647
35	NC_014005	GA	3	6	2030	2035	50 %	0 %	50 %	0 %	293980647
36	NC_014005	CAT	2	6	2172	2177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293980648
37	NC_014005	TCC	2	6	2178	2183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	293980648
38	NC_014005	TGC	2	6	2214	2219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980648
39	NC_014005	GCG	2	6	2248	2253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980648
40	NC_014005	GC	3	6	2276	2281	0 %	0 %	50 %	50 %	293980648
41	NC_014005	CTT	2	6	2339	2344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293980648
42	NC_014005	GTG	2	6	2445	2450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	293980648
43	NC_014005	GC	3	6	2451	2456	0 %	0 %	50 %	50 %	293980648
44	NC_014005	GCCCA	2	10	2471	2480	20 %	0 %	20 %	60 %	293980648
45	NC_014005	GGC	2	6	2483	2488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980648
46	NC_014005	CTG	2	6	2685	2690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980648
47	NC_014005	CACGCG	2	12	2705	2716	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	293980648
48	NC_014005	G	6	6	2725	2730	0 %	0 %	100 %	0 %	293980648
49	NC_014005	TGG	2	6	2796	2801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	293980648
50	NC_014005	GCCAT	2	10	2843	2852	20 %	20 %	20 %	40 %	293980649
51	NC_014005	CGG	2	6	2881	2886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980649
52	NC_014005	G	6	6	2891	2896	0 %	0 %	100 %	0 %	293980649
53	NC_014005	CGCAG	2	10	2925	2934	20 %	0 %	40 %	40 %	293980649
54	NC_014005	GA	3	6	2968	2973	50 %	0 %	50 %	0 %	293980649
55	NC_014005	GAC	2	6	3004	3009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980649
56	NC_014005	GTC	2	6	3074	3079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980649
57	NC_014005	AGCTTG	2	12	3307	3318	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	293980650
58	NC_014005	CGA	2	6	3329	3334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980650
59	NC_014005	CGA	2	6	3338	3343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980650
60	NC_014005	ATCT	2	8	3420	3427	25 %	50 %	0 %	25 %	293980650
61	NC_014005	AAAG	2	8	3491	3498	75 %	0 %	25 %	0 %	293980650
62	NC_014005	CGCT	2	8	3579	3586	0 %	25 %	25 %	50 %	293980651
63	NC_014005	AGG	2	6	3597	3602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	293980651
64	NC_014005	GGT	2	6	3649	3654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	293980651
65	NC_014005	CTG	2	6	3725	3730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980651
66	NC_014005	AAG	2	6	3813	3818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	293980651
67	NC_014005	GCGCC	2	10	3901	3910	0 %	0 %	40 %	60 %	293980652
68	NC_014005	GC	3	6	3920	3925	0 %	0 %	50 %	50 %	293980652
69	NC_014005	GGC	2	6	3949	3954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980652
70	NC_014005	CG	4	8	3984	3991	0 %	0 %	50 %	50 %	293980652
71	NC_014005	ATG	2	6	4062	4067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293980652
72	NC_014005	GGC	2	6	4114	4119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980653
73	NC_014005	CGA	2	6	4193	4198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980653
74	NC_014005	GAT	2	6	4301	4306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293980654
75	NC_014005	GC	3	6	4346	4351	0 %	0 %	50 %	50 %	293980654
76	NC_014005	CGA	2	6	4431	4436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980654
77	NC_014005	CG	3	6	4438	4443	0 %	0 %	50 %	50 %	293980654
78	NC_014005	GC	3	6	4502	4507	0 %	0 %	50 %	50 %	293980654
79	NC_014005	GCGGA	2	10	4526	4535	20 %	0 %	60 %	20 %	293980654
80	NC_014005	ATT	2	6	4575	4580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	293980654
81	NC_014005	CGC	2	6	4648	4653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980654
82	NC_014005	CG	5	10	4708	4717	0 %	0 %	50 %	50 %	293980654
83	NC_014005	TCG	2	6	4719	4724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980654
84	NC_014005	GCC	2	6	4780	4785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980654
85	NC_014005	GCC	2	6	4988	4993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980655
86	NC_014005	TCG	2	6	5100	5105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980655
87	NC_014005	TTG	2	6	5144	5149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	293980655
88	NC_014005	GCC	2	6	5161	5166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980655
89	NC_014005	GCC	2	6	5212	5217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980655
90	NC_014005	GCG	2	6	5235	5240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980655
91	NC_014005	C	6	6	5254	5259	0 %	0 %	0 %	100 %	293980655
92	NC_014005	CG	3	6	5263	5268	0 %	0 %	50 %	50 %	293980655
93	NC_014005	CGC	2	6	5306	5311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980655
94	NC_014005	CCG	2	6	5325	5330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980655
95	NC_014005	TGA	2	6	5382	5387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293980656
96	NC_014005	CCCAA	2	10	5463	5472	40 %	0 %	0 %	60 %	293980656
97	NC_014005	CGA	2	6	5516	5521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980656
98	NC_014005	TCG	2	6	5528	5533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980656
99	NC_014005	GC	3	6	5537	5542	0 %	0 %	50 %	50 %	293980656
100	NC_014005	CTG	2	6	5608	5613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980656
101	NC_014005	GCCGA	2	10	5641	5650	20 %	0 %	40 %	40 %	293980656
102	NC_014005	CTG	2	6	5806	5811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980656
103	NC_014005	CTT	2	6	5827	5832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293980656
104	NC_014005	CGGTG	2	10	5853	5862	0 %	20 %	60 %	20 %	293980656
105	NC_014005	GAG	2	6	6031	6036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	293980656
106	NC_014005	TCG	2	6	6042	6047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980656
107	NC_014005	CGC	2	6	6066	6071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980656
108	NC_014005	GAG	2	6	6118	6123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	293980656
109	NC_014005	ATGG	2	8	6136	6143	25 %	25 %	50 %	0 %	293980656
110	NC_014005	TGCCG	2	10	6151	6160	0 %	20 %	40 %	40 %	293980656
111	NC_014005	GCG	2	6	6180	6185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980656
112	NC_014005	CGGT	2	8	6191	6198	0 %	25 %	50 %	25 %	293980656
113	NC_014005	TGG	2	6	6201	6206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	293980656
114	NC_014005	CCG	2	6	6254	6259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980656
115	NC_014005	GCCCG	2	10	6265	6274	0 %	0 %	40 %	60 %	293980656
116	NC_014005	GGC	2	6	6328	6333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980656
117	NC_014005	TCGGC	2	10	6336	6345	0 %	20 %	40 %	40 %	293980656
118	NC_014005	GCC	2	6	6374	6379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980656
119	NC_014005	GCA	2	6	6417	6422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980656
120	NC_014005	GC	3	6	6423	6428	0 %	0 %	50 %	50 %	293980656
121	NC_014005	GGC	2	6	6524	6529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980656
122	NC_014005	ACA	2	6	6588	6593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	293980656
123	NC_014005	GGCA	2	8	6610	6617	25 %	0 %	50 %	25 %	293980656
124	NC_014005	TCG	2	6	6653	6658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980656
125	NC_014005	CAT	2	6	6666	6671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293980656
126	NC_014005	TCGC	2	8	6700	6707	0 %	25 %	25 %	50 %	293980656
127	NC_014005	GCA	2	6	6719	6724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980656
128	NC_014005	GCGCG	2	10	6774	6783	0 %	0 %	60 %	40 %	293980656
129	NC_014005	CGAG	2	8	6810	6817	25 %	0 %	50 %	25 %	293980656
130	NC_014005	CGG	2	6	6820	6825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980656
131	NC_014005	AGC	2	6	6854	6859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980656
132	NC_014005	GC	3	6	6927	6932	0 %	0 %	50 %	50 %	293980656
133	NC_014005	AGGG	2	8	7030	7037	25 %	0 %	75 %	0 %	293980656
134	NC_014005	TCGCG	2	10	7077	7086	0 %	20 %	40 %	40 %	293980656
135	NC_014005	ACG	2	6	7213	7218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980656
136	NC_014005	GAT	2	6	7219	7224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	293980656
137	NC_014005	CCG	2	6	7286	7291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980656
138	NC_014005	TGC	2	6	7297	7302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980656
139	NC_014005	CGC	2	6	7441	7446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980656
140	NC_014005	GACGC	2	10	7661	7670	20 %	0 %	40 %	40 %	293980656
141	NC_014005	GGAC	2	8	7785	7792	25 %	0 %	50 %	25 %	293980657
142	NC_014005	GTGAT	2	10	7830	7839	20 %	40 %	40 %	0 %	293980657
143	NC_014005	ACG	2	6	7931	7936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980657
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146	NC_014005	CGAT	2	8	8097	8104	25 %	25 %	25 %	25 %	293980657
147	NC_014005	GA	3	6	8483	8488	50 %	0 %	50 %	0 %	293980657
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149	NC_014005	GCA	2	6	8549	8554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980657
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151	NC_014005	GAATG	2	10	8650	8659	40 %	20 %	40 %	0 %	293980658
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153	NC_014005	GAG	2	6	8699	8704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	293980658
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159	NC_014005	CG	3	6	8872	8877	0 %	0 %	50 %	50 %	293980658
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162	NC_014005	GC	3	6	9213	9218	0 %	0 %	50 %	50 %	293980658
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251	NC_014005	CTGG	2	8	13132	13139	0 %	25 %	50 %	25 %	293980664
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254	NC_014005	CGA	2	6	13231	13236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980664
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258	NC_014005	CGG	2	6	13275	13280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980664
259	NC_014005	CG	3	6	13292	13297	0 %	0 %	50 %	50 %	293980664
260	NC_014005	TTCG	2	8	13318	13325	0 %	50 %	25 %	25 %	293980664
261	NC_014005	CG	3	6	13324	13329	0 %	0 %	50 %	50 %	293980664
262	NC_014005	CGGCG	2	10	13333	13342	0 %	0 %	60 %	40 %	293980664
263	NC_014005	CCG	2	6	13378	13383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980664
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265	NC_014005	CCA	2	6	13435	13440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	293980664
266	NC_014005	GC	4	8	13486	13493	0 %	0 %	50 %	50 %	293980664
267	NC_014005	GTT	2	6	13507	13512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	293980664
268	NC_014005	CG	4	8	13522	13529	0 %	0 %	50 %	50 %	293980664
269	NC_014005	CG	3	6	13592	13597	0 %	0 %	50 %	50 %	293980664
270	NC_014005	GGC	2	6	13600	13605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980664
271	NC_014005	CG	3	6	13640	13645	0 %	0 %	50 %	50 %	293980664
272	NC_014005	GAA	2	6	13666	13671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	293980664
273	NC_014005	CGG	2	6	13672	13677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980664
274	NC_014005	CGA	2	6	13695	13700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980664
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276	NC_014005	CCG	2	6	13924	13929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980665
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279	NC_014005	GACT	2	8	14082	14089	25 %	25 %	25 %	25 %	293980665
280	NC_014005	GCC	2	6	14207	14212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980665
281	NC_014005	CA	3	6	14226	14231	50 %	0 %	0 %	50 %	293980665
282	NC_014005	CCA	2	6	14232	14237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	293980665
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291	NC_014005	CCG	2	6	14877	14882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980665
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386	NC_014005	GC	4	8	20022	20029	0 %	0 %	50 %	50 %	293980672
387	NC_014005	ATC	2	6	20054	20059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293980672
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389	NC_014005	GAG	2	6	20075	20080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	293980672
390	NC_014005	CTT	2	6	20119	20124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	293980672
391	NC_014005	AGC	2	6	20140	20145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980672
392	NC_014005	GTC	2	6	20232	20237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980673
393	NC_014005	TCG	2	6	20248	20253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980673
394	NC_014005	CTA	2	6	20285	20290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293980673
395	NC_014005	GCC	2	6	20343	20348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980673
396	NC_014005	CTG	2	6	20378	20383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980673
397	NC_014005	CGC	2	6	20447	20452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980673
398	NC_014005	CAG	2	6	20533	20538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980673
399	NC_014005	TGG	2	6	20548	20553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	293980673
400	NC_014005	GCT	2	6	20785	20790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980674
401	NC_014005	GCG	2	6	20825	20830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	293980674
402	NC_014005	AAGC	2	8	20854	20861	50 %	0 %	25 %	25 %	293980674
403	NC_014005	CG	3	6	20934	20939	0 %	0 %	50 %	50 %	293980674
404	NC_014005	CGC	2	6	21062	21067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980675
405	NC_014005	GCA	2	6	21089	21094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	293980675
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409	NC_014005	CT	3	6	21555	21560	0 %	50 %	0 %	50 %	293980676
410	NC_014005	TGGT	2	8	21575	21582	0 %	50 %	50 %	0 %	293980676
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415	NC_014005	C	6	6	21762	21767	0 %	0 %	0 %	100 %	293980677
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423	NC_014005	GC	3	6	21988	21993	0 %	0 %	50 %	50 %	293980677
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427	NC_014005	CTG	2	6	22108	22113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	293980677
428	NC_014005	CG	4	8	22182	22189	0 %	0 %	50 %	50 %	293980677
429	NC_014005	GC	3	6	22211	22216	0 %	0 %	50 %	50 %	293980677
430	NC_014005	CG	3	6	22262	22267	0 %	0 %	50 %	50 %	293980677
431	NC_014005	ATC	2	6	22303	22308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	293980677
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433	NC_014005	CGCGCC	2	12	22540	22551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	293980678
434	NC_014005	GC	3	6	22743	22748	0 %	0 %	50 %	50 %	293980678
435	NC_014005	CCT	2	6	22774	22779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	293980678
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439	NC_014005	CG	3	6	22907	22912	0 %	0 %	50 %	50 %	293980678
440	NC_014005	GCCC	2	8	22945	22952	0 %	0 %	25 %	75 %	293980678
441	NC_014005	CG	3	6	23003	23008	0 %	0 %	50 %	50 %	293980678
442	NC_014005	CTTC	2	8	23050	23057	0 %	50 %	0 %	50 %	293980678
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446	NC_014005	GCCGC	2	10	23192	23201	0 %	0 %	40 %	60 %	293980678
447	NC_014005	GCGTGG	2	12	23258	23269	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	293980678
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