MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 60283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013959	ATC	2	6	176775	176780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612632
3502	NC_013959	CTG	2	6	176826	176831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612632
3503	NC_013959	ATT	2	6	176839	176844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291612632
3504	NC_013959	CAA	2	6	176852	176857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612632
3505	NC_013959	TGA	2	6	176860	176865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612632
3506	NC_013959	GTC	2	6	176915	176920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612632
3507	NC_013959	TG	3	6	176966	176971	0 %	50 %	50 %	0 %	291612632
3508	NC_013959	GTG	2	6	177000	177005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612632
3509	NC_013959	CGG	2	6	177058	177063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612632
3510	NC_013959	GAA	2	6	177065	177070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612632
3511	NC_013959	GTG	2	6	177093	177098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612632
3512	NC_013959	GCT	2	6	177185	177190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612632
3513	NC_013959	CGAT	2	8	177214	177221	25 %	25 %	25 %	25 %	291612632
3514	NC_013959	GGC	2	6	177269	177274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612632
3515	NC_013959	GGCT	2	8	177281	177288	0 %	25 %	50 %	25 %	291612632
3516	NC_013959	TTC	2	6	177342	177347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291612632
3517	NC_013959	ATC	2	6	177435	177440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612632
3518	NC_013959	CGGGT	2	10	177457	177466	0 %	20 %	60 %	20 %	291612632
3519	NC_013959	GGC	2	6	177554	177559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612632
3520	NC_013959	TTGG	2	8	177594	177601	0 %	50 %	50 %	0 %	291612632
3521	NC_013959	AGC	2	6	177614	177619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612632
3522	NC_013959	CG	3	6	177626	177631	0 %	0 %	50 %	50 %	291612632
3523	NC_013959	GGT	2	6	177716	177721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612632
3524	NC_013959	GTGC	2	8	177744	177751	0 %	25 %	50 %	25 %	291612632
3525	NC_013959	GTT	2	6	177774	177779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291612632
3526	NC_013959	AC	3	6	177797	177802	50 %	0 %	0 %	50 %	291612632
3527	NC_013959	ACG	2	6	177807	177812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612632
3528	NC_013959	GCG	2	6	177881	177886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612632
3529	NC_013959	GC	3	6	177899	177904	0 %	0 %	50 %	50 %	291612632
3530	NC_013959	TGG	2	6	177939	177944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612632
3531	NC_013959	ATC	2	6	177945	177950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612632
3532	NC_013959	GCGCA	2	10	177960	177969	20 %	0 %	40 %	40 %	291612632
3533	NC_013959	TGGA	2	8	178174	178181	25 %	25 %	50 %	0 %	291612632
3534	NC_013959	GAT	2	6	178251	178256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612632
3535	NC_013959	CCGG	2	8	178279	178286	0 %	0 %	50 %	50 %	291612632
3536	NC_013959	GC	3	6	178416	178421	0 %	0 %	50 %	50 %	291612632
3537	NC_013959	CGA	2	6	178466	178471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612632
3538	NC_013959	ATG	2	6	178510	178515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612632
3539	NC_013959	GCCT	2	8	178622	178629	0 %	25 %	25 %	50 %	291612632
3540	NC_013959	ACT	2	6	178767	178772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612632
3541	NC_013959	CTGC	2	8	178831	178838	0 %	25 %	25 %	50 %	291612632
3542	NC_013959	ACC	2	6	178882	178887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612632
3543	NC_013959	GCTG	2	8	178961	178968	0 %	25 %	50 %	25 %	291612632
3544	NC_013959	CGCC	2	8	178971	178978	0 %	0 %	25 %	75 %	291612632
3545	NC_013959	CGAC	2	8	178990	178997	25 %	0 %	25 %	50 %	291612632
3546	NC_013959	TG	3	6	179009	179014	0 %	50 %	50 %	0 %	291612632
3547	NC_013959	A	6	6	179035	179040	100 %	0 %	0 %	0 %	291612632
3548	NC_013959	GGCA	2	8	179105	179112	25 %	0 %	50 %	25 %	291612632
3549	NC_013959	GGC	2	6	179383	179388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612633
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3551	NC_013959	CGA	2	6	179418	179423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612633
3552	NC_013959	AGG	2	6	179439	179444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291612633
3553	NC_013959	CAG	3	9	179446	179454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612633
3554	NC_013959	A	6	6	179523	179528	100 %	0 %	0 %	0 %	291612633
3555	NC_013959	A	6	6	179593	179598	100 %	0 %	0 %	0 %	291612633
3556	NC_013959	CAGCAC	2	12	179617	179628	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	291612633
3557	NC_013959	GC	4	8	179681	179688	0 %	0 %	50 %	50 %	291612633
3558	NC_013959	CAG	3	9	179740	179748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612633
3559	NC_013959	TGA	2	6	179829	179834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612633
3560	NC_013959	CTG	2	6	179876	179881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612633
3561	NC_013959	CTG	2	6	179889	179894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612633
3562	NC_013959	TC	3	6	179903	179908	0 %	50 %	0 %	50 %	291612633
3563	NC_013959	GGC	2	6	179935	179940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612633
3564	NC_013959	CGC	2	6	180021	180026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612633
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3570	NC_013959	CG	3	6	180193	180198	0 %	0 %	50 %	50 %	291612633
3571	NC_013959	ATC	2	6	180277	180282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612633
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3573	NC_013959	CGT	2	6	180327	180332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612633
3574	NC_013959	CGG	2	6	180342	180347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612633
3575	NC_013959	GCCC	2	8	180408	180415	0 %	0 %	25 %	75 %	291612633
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3578	NC_013959	GCC	2	6	180466	180471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612633
3579	NC_013959	CG	3	6	180558	180563	0 %	0 %	50 %	50 %	291612633
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3583	NC_013959	GCT	2	6	180743	180748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612633
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3588	NC_013959	CCA	2	6	180957	180962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612633
3589	NC_013959	C	7	7	181054	181060	0 %	0 %	0 %	100 %	291612633
3590	NC_013959	AGGG	2	8	181141	181148	25 %	0 %	75 %	0 %	291612633
3591	NC_013959	CAG	3	9	181174	181182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612633
3592	NC_013959	CAC	2	6	181237	181242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612633
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3594	NC_013959	AAT	2	6	181402	181407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291612633
3595	NC_013959	GGC	2	6	181408	181413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612633
3596	NC_013959	TCA	2	6	181415	181420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612633
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3602	NC_013959	CAG	2	6	181914	181919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612634
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3604	NC_013959	T	6	6	181968	181973	0 %	100 %	0 %	0 %	291612634
3605	NC_013959	TGA	2	6	181994	181999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612634
3606	NC_013959	CCA	2	6	182033	182038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612634
3607	NC_013959	TGAA	2	8	182044	182051	50 %	25 %	25 %	0 %	291612634
3608	NC_013959	GAC	2	6	182160	182165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612634
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3610	NC_013959	GAT	2	6	182208	182213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612634
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3613	NC_013959	TGA	2	6	182489	182494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612635
3614	NC_013959	ATCG	2	8	182586	182593	25 %	25 %	25 %	25 %	291612635
3615	NC_013959	GGA	2	6	182609	182614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291612635
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3617	NC_013959	GC	3	6	182974	182979	0 %	0 %	50 %	50 %	291612636
3618	NC_013959	GCA	2	6	183089	183094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612636
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3622	NC_013959	GAC	2	6	183241	183246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612636
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3624	NC_013959	GC	3	6	183310	183315	0 %	0 %	50 %	50 %	291612636
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3745	NC_013959	AGC	2	6	188730	188735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612641
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3985	NC_013959	CGGTG	2	10	200253	200262	0 %	20 %	60 %	20 %	291612653
3986	NC_013959	TTG	2	6	200305	200310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291612653
3987	NC_013959	GCA	2	6	200315	200320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612653
3988	NC_013959	CCG	2	6	200369	200374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612653
3989	NC_013959	ATCC	2	8	200395	200402	25 %	25 %	0 %	50 %	291612653
3990	NC_013959	TAC	2	6	200446	200451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612653
3991	NC_013959	GCC	2	6	200538	200543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612653
3992	NC_013959	CGA	2	6	200544	200549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612653
3993	NC_013959	GCT	2	6	200592	200597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612653
3994	NC_013959	GCC	2	6	200634	200639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612653
3995	NC_013959	GGT	2	6	200664	200669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612653
3996	NC_013959	GTG	3	9	200761	200769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612653
3997	NC_013959	GAC	2	6	200773	200778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612653
3998	NC_013959	GGAA	2	8	200795	200802	50 %	0 %	50 %	0 %	291612653
3999	NC_013959	CAC	2	6	200817	200822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612653
4000	NC_013959	GCT	2	6	200847	200852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612653

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