MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 60283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013959	CGA	2	6	149477	149482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612608
3002	NC_013959	GTG	2	6	149496	149501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612608
3003	NC_013959	TTC	2	6	149604	149609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291612609
3004	NC_013959	GTC	2	6	149628	149633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612609
3005	NC_013959	TCT	2	6	149641	149646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291612609
3006	NC_013959	CTG	4	12	149661	149672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612609
3007	NC_013959	CG	3	6	149681	149686	0 %	0 %	50 %	50 %	291612609
3008	NC_013959	TGA	2	6	149725	149730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612609
3009	NC_013959	CAA	2	6	149802	149807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612609
3010	NC_013959	ATG	2	6	149845	149850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612609
3011	NC_013959	CG	3	6	149877	149882	0 %	0 %	50 %	50 %	291612609
3012	NC_013959	GGT	2	6	150041	150046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612609
3013	NC_013959	CGA	2	6	150050	150055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612609
3014	NC_013959	GTG	2	6	150063	150068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612609
3015	NC_013959	GC	3	6	150164	150169	0 %	0 %	50 %	50 %	291612609
3016	NC_013959	GTG	2	6	150171	150176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612609
3017	NC_013959	GCGCT	2	10	150204	150213	0 %	20 %	40 %	40 %	291612609
3018	NC_013959	CG	4	8	150341	150348	0 %	0 %	50 %	50 %	291612609
3019	NC_013959	AACG	2	8	150443	150450	50 %	0 %	25 %	25 %	291612609
3020	NC_013959	A	7	7	150468	150474	100 %	0 %	0 %	0 %	291612609
3021	NC_013959	GGA	2	6	150484	150489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291612609
3022	NC_013959	CTG	2	6	150527	150532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612610
3023	NC_013959	TCA	2	6	150549	150554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612610
3024	NC_013959	GCGCTG	2	12	150608	150619	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	291612610
3025	NC_013959	CTG	2	6	150644	150649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612610
3026	NC_013959	GCAC	2	8	150657	150664	25 %	0 %	25 %	50 %	291612610
3027	NC_013959	GGT	2	6	150697	150702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612610
3028	NC_013959	TCT	2	6	150708	150713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291612610
3029	NC_013959	CGG	2	6	150775	150780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612610
3030	NC_013959	TGC	2	6	150786	150791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612610
3031	NC_013959	CGC	2	6	150794	150799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612610
3032	NC_013959	CAG	2	6	150821	150826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612610
3033	NC_013959	TGC	3	9	150846	150854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612610
3034	NC_013959	TGC	2	6	150871	150876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612610
3035	NC_013959	GCG	2	6	150927	150932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612610
3036	NC_013959	GCT	2	6	150940	150945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612610
3037	NC_013959	TGT	2	6	150963	150968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291612610
3038	NC_013959	CCGCG	2	10	150986	150995	0 %	0 %	40 %	60 %	291612610
3039	NC_013959	CGAA	2	8	150999	151006	50 %	0 %	25 %	25 %	291612610
3040	NC_013959	GAA	2	6	151269	151274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612611
3041	NC_013959	TGC	2	6	151340	151345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612611
3042	NC_013959	CTG	2	6	151351	151356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612611
3043	NC_013959	TCT	2	6	151364	151369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291612611
3044	NC_013959	ACT	2	6	151391	151396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612611
3045	NC_013959	CGT	2	6	151428	151433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612611
3046	NC_013959	GTG	2	6	151477	151482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612611
3047	NC_013959	GAA	2	6	151488	151493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612611
3048	NC_013959	AC	3	6	151505	151510	50 %	0 %	0 %	50 %	291612611
3049	NC_013959	ATGG	2	8	151540	151547	25 %	25 %	50 %	0 %	291612611
3050	NC_013959	CTG	2	6	151612	151617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612611
3051	NC_013959	GCT	2	6	151647	151652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612611
3052	NC_013959	GAA	2	6	151669	151674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612611
3053	NC_013959	TGC	2	6	151830	151835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612611
3054	NC_013959	GC	3	6	151947	151952	0 %	0 %	50 %	50 %	291612611
3055	NC_013959	CGCAC	2	10	151969	151978	20 %	0 %	20 %	60 %	291612611
3056	NC_013959	CAA	2	6	151989	151994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612611
3057	NC_013959	TGG	2	6	152066	152071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612611
3058	NC_013959	CCA	2	6	152081	152086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612611
3059	NC_013959	CGATAC	2	12	152151	152162	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	291612611
3060	NC_013959	CAA	2	6	152199	152204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612611
3061	NC_013959	TTA	2	6	152316	152321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291612611
3062	NC_013959	TGC	2	6	152324	152329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612611
3063	NC_013959	GCA	2	6	152333	152338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612611
3064	NC_013959	GGTG	2	8	152361	152368	0 %	25 %	75 %	0 %	291612611
3065	NC_013959	TCG	2	6	152399	152404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612611
3066	NC_013959	TTA	2	6	152418	152423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291612611
3067	NC_013959	AGA	2	6	152492	152497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612611
3068	NC_013959	GCT	2	6	152529	152534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612611
3069	NC_013959	ACG	2	6	152669	152674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612611
3070	NC_013959	GCC	2	6	152712	152717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612611
3071	NC_013959	GGC	2	6	152722	152727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612611
3072	NC_013959	GATC	2	8	152766	152773	25 %	25 %	25 %	25 %	291612611
3073	NC_013959	AAG	2	6	152929	152934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612611
3074	NC_013959	CGG	2	6	153024	153029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612611
3075	NC_013959	CGG	2	6	153033	153038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612611
3076	NC_013959	CAC	2	6	153039	153044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612611
3077	NC_013959	GCA	2	6	153046	153051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612611
3078	NC_013959	CG	3	6	153057	153062	0 %	0 %	50 %	50 %	291612611
3079	NC_013959	ATT	2	6	153074	153079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291612611
3080	NC_013959	TGAC	2	8	153116	153123	25 %	25 %	25 %	25 %	291612611
3081	NC_013959	TGA	3	9	153145	153153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612611
3082	NC_013959	ACT	2	6	153161	153166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612612
3083	NC_013959	AAC	2	6	153169	153174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612612
3084	NC_013959	GCA	2	6	153182	153187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612612
3085	NC_013959	G	6	6	153216	153221	0 %	0 %	100 %	0 %	291612612
3086	NC_013959	TGC	2	6	153241	153246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612612
3087	NC_013959	GTG	2	6	153303	153308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612612
3088	NC_013959	TCG	2	6	153328	153333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612612
3089	NC_013959	ATGT	2	8	153375	153382	25 %	50 %	25 %	0 %	291612612
3090	NC_013959	CTG	4	12	153396	153407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612612
3091	NC_013959	TGA	2	6	153409	153414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612612
3092	NC_013959	CGC	2	6	153415	153420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612612
3093	NC_013959	CCA	2	6	153469	153474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612612
3094	NC_013959	TGA	2	6	153490	153495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612612
3095	NC_013959	TGA	2	6	153511	153516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612612
3096	NC_013959	ATT	2	6	153562	153567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291612612
3097	NC_013959	CCA	2	6	153574	153579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612612
3098	NC_013959	AGC	2	6	153613	153618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612612
3099	NC_013959	CAT	2	6	153692	153697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612612
3100	NC_013959	GCC	2	6	153714	153719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612612
3101	NC_013959	GC	3	6	153727	153732	0 %	0 %	50 %	50 %	291612612
3102	NC_013959	TGC	2	6	153748	153753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612612
3103	NC_013959	CAT	2	6	153773	153778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612612
3104	NC_013959	GAT	2	6	153836	153841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612612
3105	NC_013959	CGG	2	6	153854	153859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612612
3106	NC_013959	CAC	2	6	153920	153925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612612
3107	NC_013959	TGC	3	9	153976	153984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612612
3108	NC_013959	TCA	3	9	154018	154026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612612
3109	NC_013959	GCA	2	6	154066	154071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612612
3110	NC_013959	CTT	2	6	154082	154087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291612612
3111	NC_013959	GGT	2	6	154133	154138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612612
3112	NC_013959	TGCCGC	2	12	154144	154155	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	291612612
3113	NC_013959	CGG	2	6	154166	154171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612612
3114	NC_013959	TGA	2	6	154210	154215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612612
3115	NC_013959	CCA	2	6	154318	154323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612613
3116	NC_013959	CG	4	8	154394	154401	0 %	0 %	50 %	50 %	291612613
3117	NC_013959	CGG	2	6	154427	154432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612613
3118	NC_013959	AC	3	6	154564	154569	50 %	0 %	0 %	50 %	291612613
3119	NC_013959	AGC	2	6	154594	154599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612613
3120	NC_013959	CCT	2	6	154609	154614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291612613
3121	NC_013959	AAG	2	6	154623	154628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612613
3122	NC_013959	GC	3	6	154716	154721	0 %	0 %	50 %	50 %	291612613
3123	NC_013959	CGT	3	9	154748	154756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612613
3124	NC_013959	CAT	2	6	154793	154798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612613
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3126	NC_013959	TCA	2	6	154834	154839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612613
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3143	NC_013959	GCG	2	6	156405	156410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612615
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3231	NC_013959	CTC	2	6	160360	160365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291612620
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3237	NC_013959	CAC	2	6	160788	160793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612621
3238	NC_013959	GAT	2	6	160794	160799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612621
3239	NC_013959	GCCT	2	8	160800	160807	0 %	25 %	25 %	50 %	291612621
3240	NC_013959	CGCAG	2	10	160816	160825	20 %	0 %	40 %	40 %	291612621
3241	NC_013959	ATA	2	6	161014	161019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291612621
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3358	NC_013959	TGC	2	6	168555	168560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612626
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3362	NC_013959	TCGA	2	8	169500	169507	25 %	25 %	25 %	25 %	291612627
3363	NC_013959	GC	3	6	169530	169535	0 %	0 %	50 %	50 %	291612627
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3483	NC_013959	CGG	2	6	175541	175546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612630
3484	NC_013959	CA	3	6	175697	175702	50 %	0 %	0 %	50 %	291612630
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3487	NC_013959	CGG	2	6	175874	175879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612630
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