MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 60283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013959	GGTG	2	8	50076	50083	0 %	25 %	75 %	0 %	291612516
1002	NC_013959	TCG	2	6	50090	50095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612516
1003	NC_013959	CTG	2	6	50145	50150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612516
1004	NC_013959	CGG	2	6	50260	50265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612517
1005	NC_013959	GGT	2	6	50393	50398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612517
1006	NC_013959	CG	3	6	50468	50473	0 %	0 %	50 %	50 %	291612517
1007	NC_013959	GAG	2	6	50538	50543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291612517
1008	NC_013959	GT	4	8	50643	50650	0 %	50 %	50 %	0 %	291612517
1009	NC_013959	GCCCAG	2	12	50708	50719	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	291612517
1010	NC_013959	G	6	6	50770	50775	0 %	0 %	100 %	0 %	291612517
1011	NC_013959	GCC	2	6	50822	50827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612517
1012	NC_013959	AAG	2	6	50898	50903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612517
1013	NC_013959	GCA	2	6	50962	50967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612517
1014	NC_013959	GTA	2	6	50996	51001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612517
1015	NC_013959	CGC	2	6	51031	51036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612517
1016	NC_013959	GTT	2	6	51128	51133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291612517
1017	NC_013959	ATGC	2	8	51158	51165	25 %	25 %	25 %	25 %	291612517
1018	NC_013959	CAG	2	6	51200	51205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612517
1019	NC_013959	CTG	2	6	51314	51319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612517
1020	NC_013959	AGA	2	6	51327	51332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612517
1021	NC_013959	ACC	2	6	51357	51362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612517
1022	NC_013959	AG	3	6	51437	51442	50 %	0 %	50 %	0 %	291612517
1023	NC_013959	CAT	2	6	51511	51516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612517
1024	NC_013959	GC	3	6	51635	51640	0 %	0 %	50 %	50 %	291612517
1025	NC_013959	GTT	2	6	51677	51682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291612517
1026	NC_013959	TCG	2	6	51721	51726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612517
1027	NC_013959	GA	3	6	51739	51744	50 %	0 %	50 %	0 %	291612517
1028	NC_013959	AGT	2	6	51751	51756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612517
1029	NC_013959	TGC	2	6	51790	51795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612517
1030	NC_013959	TCCA	2	8	51846	51853	25 %	25 %	0 %	50 %	291612517
1031	NC_013959	GGC	2	6	51937	51942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612517
1032	NC_013959	GGT	2	6	51980	51985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612517
1033	NC_013959	TCG	2	6	51996	52001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612517
1034	NC_013959	TTC	2	6	52011	52016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291612517
1035	NC_013959	GCCGC	2	10	52041	52050	0 %	0 %	40 %	60 %	291612517
1036	NC_013959	GCG	2	6	52215	52220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612517
1037	NC_013959	GCTT	2	8	52259	52266	0 %	50 %	25 %	25 %	291612517
1038	NC_013959	GCT	2	6	52270	52275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612517
1039	NC_013959	CTT	2	6	52280	52285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291612517
1040	NC_013959	GGC	2	6	52313	52318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612517
1041	NC_013959	CGAA	2	8	52561	52568	50 %	0 %	25 %	25 %	291612518
1042	NC_013959	CCG	2	6	52607	52612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612518
1043	NC_013959	TCA	2	6	52651	52656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612518
1044	NC_013959	GCA	2	6	52670	52675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612518
1045	NC_013959	ACC	2	6	52797	52802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612518
1046	NC_013959	GGC	2	6	52817	52822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612518
1047	NC_013959	TCA	2	6	52864	52869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612518
1048	NC_013959	GAAAGA	2	12	52886	52897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612518
1049	NC_013959	GCT	2	6	52919	52924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612518
1050	NC_013959	GAA	2	6	53010	53015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612518
1051	NC_013959	CAA	2	6	53036	53041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612518
1052	NC_013959	ATG	2	6	53367	53372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612518
1053	NC_013959	ACC	2	6	53419	53424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612518
1054	NC_013959	CTG	2	6	53523	53528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612518
1055	NC_013959	GCA	2	6	53549	53554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612518
1056	NC_013959	GCG	2	6	53735	53740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612519
1057	NC_013959	ACCG	2	8	53758	53765	25 %	0 %	25 %	50 %	291612519
1058	NC_013959	CTG	2	6	53779	53784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612519
1059	NC_013959	CAGG	2	8	53785	53792	25 %	0 %	50 %	25 %	291612519
1060	NC_013959	GC	3	6	53832	53837	0 %	0 %	50 %	50 %	291612519
1061	NC_013959	TCA	2	6	53855	53860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612519
1062	NC_013959	TGA	2	6	53937	53942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612519
1063	NC_013959	GGC	2	6	53965	53970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612519
1064	NC_013959	GTT	2	6	53988	53993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291612519
1065	NC_013959	CGA	2	6	53997	54002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612519
1066	NC_013959	GCG	2	6	54086	54091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612519
1067	NC_013959	CTGGTG	2	12	54103	54114	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	291612519
1068	NC_013959	CTG	2	6	54148	54153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612519
1069	NC_013959	GCA	2	6	54189	54194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612519
1070	NC_013959	GC	3	6	54253	54258	0 %	0 %	50 %	50 %	291612519
1071	NC_013959	CGCT	2	8	54272	54279	0 %	25 %	25 %	50 %	291612519
1072	NC_013959	GCT	2	6	54282	54287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612519
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1074	NC_013959	GAA	2	6	54370	54375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612519
1075	NC_013959	GCT	2	6	54384	54389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612519
1076	NC_013959	GC	3	6	54506	54511	0 %	0 %	50 %	50 %	291612520
1077	NC_013959	CGAG	2	8	54693	54700	25 %	0 %	50 %	25 %	291612520
1078	NC_013959	CGC	2	6	54715	54720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612520
1079	NC_013959	GC	3	6	54815	54820	0 %	0 %	50 %	50 %	291612520
1080	NC_013959	ATC	2	6	54821	54826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612520
1081	NC_013959	GCGCC	2	10	54952	54961	0 %	0 %	40 %	60 %	291612520
1082	NC_013959	CCG	2	6	54985	54990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612520
1083	NC_013959	GCT	2	6	55042	55047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612520
1084	NC_013959	GCC	2	6	55059	55064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612520
1085	NC_013959	TCG	2	6	55095	55100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612520
1086	NC_013959	CAA	2	6	55138	55143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612520
1087	NC_013959	CTG	2	6	55166	55171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612520
1088	NC_013959	GCA	2	6	55205	55210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612520
1089	NC_013959	CGCAG	2	10	55282	55291	20 %	0 %	40 %	40 %	291612520
1090	NC_013959	GCC	2	6	55295	55300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612520
1091	NC_013959	CGC	2	6	55335	55340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612520
1092	NC_013959	GCTGC	2	10	55346	55355	0 %	20 %	40 %	40 %	291612520
1093	NC_013959	GCACC	2	10	55447	55456	20 %	0 %	20 %	60 %	291612520
1094	NC_013959	CTGG	2	8	55462	55469	0 %	25 %	50 %	25 %	291612520
1095	NC_013959	GCGA	2	8	55506	55513	25 %	0 %	50 %	25 %	291612520
1096	NC_013959	GCT	2	6	55557	55562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612520
1097	NC_013959	CG	3	6	55587	55592	0 %	0 %	50 %	50 %	291612520
1098	NC_013959	GAG	2	6	55694	55699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291612520
1099	NC_013959	CAT	2	6	55736	55741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612521
1100	NC_013959	CGG	3	9	55742	55750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612521
1101	NC_013959	GC	3	6	55815	55820	0 %	0 %	50 %	50 %	291612521
1102	NC_013959	ACC	2	6	55836	55841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612521
1103	NC_013959	CG	3	6	55846	55851	0 %	0 %	50 %	50 %	291612521
1104	NC_013959	CTG	2	6	55881	55886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612521
1105	NC_013959	AGA	2	6	55985	55990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612521
1106	NC_013959	TGC	2	6	56017	56022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612521
1107	NC_013959	ACC	2	6	56028	56033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612521
1108	NC_013959	GCA	2	6	56048	56053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612521
1109	NC_013959	CCTG	2	8	56077	56084	0 %	25 %	25 %	50 %	291612521
1110	NC_013959	GCG	2	6	56091	56096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612521
1111	NC_013959	TATC	2	8	56135	56142	25 %	50 %	0 %	25 %	291612521
1112	NC_013959	GC	3	6	56172	56177	0 %	0 %	50 %	50 %	291612521
1113	NC_013959	GTC	2	6	56184	56189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612521
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1115	NC_013959	CAT	2	6	56255	56260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612521
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1121	NC_013959	TG	3	6	56674	56679	0 %	50 %	50 %	0 %	291612521
1122	NC_013959	CGC	2	6	56697	56702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612521
1123	NC_013959	GAA	2	6	56825	56830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612521
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1125	NC_013959	TGA	2	6	56868	56873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612521
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1158	NC_013959	CCCAG	2	10	58516	58525	20 %	0 %	20 %	60 %	291612524
1159	NC_013959	GC	3	6	58637	58642	0 %	0 %	50 %	50 %	291612524
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1498	NC_013959	CCGCA	2	10	73293	73302	20 %	0 %	20 %	60 %	291612540
1499	NC_013959	GCA	2	6	73341	73346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612540
1500	NC_013959	CTC	2	6	73351	73356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291612540

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