MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 60283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013959	CCA	2	6	25534	25539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612492
502	NC_013959	ACA	2	6	25555	25560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612492
503	NC_013959	GCC	2	6	25624	25629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612492
504	NC_013959	TGCT	2	8	25715	25722	0 %	50 %	25 %	25 %	291612492
505	NC_013959	CTA	2	6	25726	25731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612492
506	NC_013959	CAT	2	6	25979	25984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612493
507	NC_013959	TTC	2	6	25994	25999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291612493
508	NC_013959	CAG	2	6	26000	26005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612493
509	NC_013959	CAA	2	6	26104	26109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612493
510	NC_013959	TGCC	2	8	26167	26174	0 %	25 %	25 %	50 %	291612493
511	NC_013959	GCAG	2	8	26220	26227	25 %	0 %	50 %	25 %	291612493
512	NC_013959	A	6	6	26246	26251	100 %	0 %	0 %	0 %	291612493
513	NC_013959	CAA	2	6	26257	26262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612493
514	NC_013959	CG	3	6	26266	26271	0 %	0 %	50 %	50 %	291612493
515	NC_013959	TGT	2	6	26329	26334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291612493
516	NC_013959	GCA	2	6	26361	26366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612493
517	NC_013959	TGAA	2	8	26526	26533	50 %	25 %	25 %	0 %	291612493
518	NC_013959	CAG	2	6	26540	26545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612493
519	NC_013959	AAT	2	6	26557	26562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	291612493
520	NC_013959	TCATC	2	10	26611	26620	20 %	40 %	0 %	40 %	291612493
521	NC_013959	GCCT	2	8	26684	26691	0 %	25 %	25 %	50 %	291612493
522	NC_013959	T	6	6	26705	26710	0 %	100 %	0 %	0 %	291612493
523	NC_013959	GCA	2	6	26869	26874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612493
524	NC_013959	GCA	2	6	27127	27132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612494
525	NC_013959	CCA	2	6	27176	27181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612494
526	NC_013959	CGA	2	6	27183	27188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612494
527	NC_013959	TAC	2	6	27217	27222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612494
528	NC_013959	CGA	2	6	27225	27230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612494
529	NC_013959	TTTC	2	8	27308	27315	0 %	75 %	0 %	25 %	291612494
530	NC_013959	AAC	2	6	27334	27339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612494
531	NC_013959	GC	3	6	27393	27398	0 %	0 %	50 %	50 %	291612494
532	NC_013959	GTC	2	6	27455	27460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612494
533	NC_013959	CGG	2	6	27471	27476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612494
534	NC_013959	CAT	2	6	27492	27497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612494
535	NC_013959	CTGG	2	8	27552	27559	0 %	25 %	50 %	25 %	291612494
536	NC_013959	TCA	2	6	27569	27574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612494
537	NC_013959	AAG	2	6	27616	27621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612494
538	NC_013959	TGC	2	6	27623	27628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612494
539	NC_013959	ACG	2	6	27638	27643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612494
540	NC_013959	GC	3	6	27651	27656	0 %	0 %	50 %	50 %	291612494
541	NC_013959	GGCCA	2	10	27670	27679	20 %	0 %	40 %	40 %	291612494
542	NC_013959	GAC	2	6	27706	27711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612494
543	NC_013959	TG	3	6	27722	27727	0 %	50 %	50 %	0 %	291612494
544	NC_013959	CGG	2	6	27801	27806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612494
545	NC_013959	ACC	2	6	27820	27825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612494
546	NC_013959	CGC	2	6	27829	27834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612494
547	NC_013959	GAAGGC	2	12	27994	28005	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	291612494
548	NC_013959	GAC	2	6	28006	28011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612494
549	NC_013959	ACC	2	6	28090	28095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612494
550	NC_013959	CGG	2	6	28107	28112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612494
551	NC_013959	CTT	2	6	28137	28142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291612494
552	NC_013959	TGG	2	6	28179	28184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612494
553	NC_013959	GCA	2	6	28213	28218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612494
554	NC_013959	CCGAT	2	10	28265	28274	20 %	20 %	20 %	40 %	291612494
555	NC_013959	AGC	2	6	28286	28291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612494
556	NC_013959	ACA	2	6	28496	28501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612495
557	NC_013959	TGC	2	6	28578	28583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612495
558	NC_013959	GC	3	6	28582	28587	0 %	0 %	50 %	50 %	291612495
559	NC_013959	TGG	2	6	28712	28717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612495
560	NC_013959	CGG	2	6	28737	28742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612495
561	NC_013959	GCTG	2	8	28748	28755	0 %	25 %	50 %	25 %	291612495
562	NC_013959	ACC	2	6	28768	28773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612495
563	NC_013959	GC	3	6	28777	28782	0 %	0 %	50 %	50 %	291612495
564	NC_013959	GGT	2	6	28809	28814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612495
565	NC_013959	GGT	2	6	28836	28841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612495
566	NC_013959	ATCC	2	8	28843	28850	25 %	25 %	0 %	50 %	291612495
567	NC_013959	CCG	2	6	28863	28868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612495
568	NC_013959	TGA	2	6	28958	28963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612495
569	NC_013959	CCA	2	6	28979	28984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612495
570	NC_013959	AGC	2	6	28985	28990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612495
571	NC_013959	GC	3	6	29107	29112	0 %	0 %	50 %	50 %	291612495
572	NC_013959	CTG	2	6	29155	29160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612495
573	NC_013959	GCG	2	6	29186	29191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612495
574	NC_013959	CGA	2	6	29238	29243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612495
575	NC_013959	ATG	2	6	29292	29297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612495
576	NC_013959	CGAC	2	8	29313	29320	25 %	0 %	25 %	50 %	291612496
577	NC_013959	GCAG	2	8	29401	29408	25 %	0 %	50 %	25 %	291612496
578	NC_013959	GGA	2	6	29509	29514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291612496
579	NC_013959	CGC	2	6	29527	29532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612496
580	NC_013959	GAA	2	6	29543	29548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612496
581	NC_013959	CAT	2	6	29560	29565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612496
582	NC_013959	ACGGC	2	10	29598	29607	20 %	0 %	40 %	40 %	291612496
583	NC_013959	CG	3	6	29641	29646	0 %	0 %	50 %	50 %	291612496
584	NC_013959	CG	3	6	29658	29663	0 %	0 %	50 %	50 %	291612496
585	NC_013959	CTG	2	6	29666	29671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612496
586	NC_013959	CAC	2	6	29710	29715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612496
587	NC_013959	CCA	2	6	29734	29739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612496
588	NC_013959	GGCC	2	8	29809	29816	0 %	0 %	50 %	50 %	291612496
589	NC_013959	ACG	2	6	29850	29855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612496
590	NC_013959	TGC	2	6	29913	29918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612496
591	NC_013959	CGGCA	2	10	29927	29936	20 %	0 %	40 %	40 %	291612496
592	NC_013959	GCT	2	6	29938	29943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612496
593	NC_013959	AACG	2	8	29951	29958	50 %	0 %	25 %	25 %	291612496
594	NC_013959	GAC	3	9	29993	30001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612496
595	NC_013959	ACG	2	6	30027	30032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612496
596	NC_013959	CTA	2	6	30052	30057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612496
597	NC_013959	ACG	2	6	30090	30095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612496
598	NC_013959	ACC	2	6	30167	30172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612496
599	NC_013959	CAT	2	6	30175	30180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612496
600	NC_013959	GGC	2	6	30211	30216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612496
601	NC_013959	GCC	2	6	30276	30281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612496
602	NC_013959	GCC	2	6	30407	30412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612496
603	NC_013959	TGC	2	6	30426	30431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612496
604	NC_013959	CGA	2	6	30571	30576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612496
605	NC_013959	CGA	2	6	30610	30615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612496
606	NC_013959	GCC	2	6	30673	30678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612496
607	NC_013959	ATCG	2	8	30776	30783	25 %	25 %	25 %	25 %	291612496
608	NC_013959	GAA	2	6	30820	30825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612496
609	NC_013959	CTG	2	6	30836	30841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612496
610	NC_013959	GAA	2	6	30875	30880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612496
611	NC_013959	CGCT	2	8	30911	30918	0 %	25 %	25 %	50 %	291612496
612	NC_013959	ACG	2	6	30975	30980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612496
613	NC_013959	CGGC	2	8	31038	31045	0 %	0 %	50 %	50 %	291612496
614	NC_013959	GCT	2	6	31087	31092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612496
615	NC_013959	TTCCA	2	10	31139	31148	20 %	40 %	0 %	40 %	291612496
616	NC_013959	GAC	2	6	31202	31207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612496
617	NC_013959	AGC	2	6	31296	31301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612496
618	NC_013959	AAG	2	6	31310	31315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612496
619	NC_013959	CAG	2	6	31415	31420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612496
620	NC_013959	AT	3	6	31476	31481	50 %	50 %	0 %	0 %	291612496
621	NC_013959	CAT	2	6	31498	31503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612496
622	NC_013959	TCA	2	6	31655	31660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612497
623	NC_013959	AGC	2	6	31667	31672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612497
624	NC_013959	GCG	2	6	31691	31696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612497
625	NC_013959	CTG	2	6	31708	31713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612497
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627	NC_013959	AGA	2	6	31820	31825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612497
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