MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 60283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013959	CAG	2	6	273198	273203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612740
5502	NC_013959	GGC	2	6	273300	273305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612740
5503	NC_013959	GGC	2	6	273320	273325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612740
5504	NC_013959	CAA	2	6	273335	273340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612740
5505	NC_013959	CGCC	2	8	273430	273437	0 %	0 %	25 %	75 %	291612741
5506	NC_013959	CG	4	8	273512	273519	0 %	0 %	50 %	50 %	291612741
5507	NC_013959	TGACAC	2	12	273520	273531	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	291612741
5508	NC_013959	TGCTGG	2	12	273541	273552	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	291612741
5509	NC_013959	GCA	2	6	273605	273610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612741
5510	NC_013959	GC	3	6	273618	273623	0 %	0 %	50 %	50 %	291612741
5511	NC_013959	GGC	2	6	273702	273707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612741
5512	NC_013959	CTG	2	6	273717	273722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612741
5513	NC_013959	GC	3	6	273752	273757	0 %	0 %	50 %	50 %	291612741
5514	NC_013959	AGC	2	6	273789	273794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612741
5515	NC_013959	A	6	6	273939	273944	100 %	0 %	0 %	0 %	291612741
5516	NC_013959	TGCG	2	8	273970	273977	0 %	25 %	50 %	25 %	291612741
5517	NC_013959	TGC	2	6	274159	274164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612741
5518	NC_013959	TTG	2	6	274197	274202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291612741
5519	NC_013959	TCTT	2	8	274215	274222	0 %	75 %	0 %	25 %	291612741
5520	NC_013959	CT	3	6	274251	274256	0 %	50 %	0 %	50 %	291612741
5521	NC_013959	CA	3	6	274258	274263	50 %	0 %	0 %	50 %	291612741
5522	NC_013959	CCG	2	6	274295	274300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612741
5523	NC_013959	GCA	2	6	274382	274387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612741
5524	NC_013959	TGC	2	6	274391	274396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612741
5525	NC_013959	GGC	2	6	274428	274433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612741
5526	NC_013959	CTG	2	6	274622	274627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612742
5527	NC_013959	AT	3	6	274645	274650	50 %	50 %	0 %	0 %	291612742
5528	NC_013959	CTGC	2	8	274682	274689	0 %	25 %	25 %	50 %	291612742
5529	NC_013959	CG	3	6	274706	274711	0 %	0 %	50 %	50 %	291612742
5530	NC_013959	GCC	2	6	274718	274723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612742
5531	NC_013959	GAT	2	6	274741	274746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612742
5532	NC_013959	GCA	2	6	274781	274786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612742
5533	NC_013959	CG	3	6	274805	274810	0 %	0 %	50 %	50 %	291612742
5534	NC_013959	GGC	2	6	274858	274863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612742
5535	NC_013959	GGTG	2	8	274924	274931	0 %	25 %	75 %	0 %	291612742
5536	NC_013959	GCAT	2	8	275028	275035	25 %	25 %	25 %	25 %	291612742
5537	NC_013959	GCA	3	9	275071	275079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612742
5538	NC_013959	CAG	2	6	275168	275173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612742
5539	NC_013959	CTGG	2	8	275176	275183	0 %	25 %	50 %	25 %	291612742
5540	NC_013959	CGAC	2	8	275202	275209	25 %	0 %	25 %	50 %	291612742
5541	NC_013959	ATCC	2	8	275236	275243	25 %	25 %	0 %	50 %	291612742
5542	NC_013959	GCA	2	6	275323	275328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612742
5543	NC_013959	AAC	2	6	275402	275407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612742
5544	NC_013959	GCTG	2	8	275433	275440	0 %	25 %	50 %	25 %	291612742
5545	NC_013959	CGA	2	6	275452	275457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612742
5546	NC_013959	TTGC	2	8	275468	275475	0 %	50 %	25 %	25 %	291612742
5547	NC_013959	AGCC	2	8	275551	275558	25 %	0 %	25 %	50 %	291612742
5548	NC_013959	GAG	2	6	275609	275614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291612742
5549	NC_013959	GCC	2	6	275877	275882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612743
5550	NC_013959	GGC	2	6	275915	275920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612743
5551	NC_013959	AAC	2	6	275935	275940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612743
5552	NC_013959	AAC	2	6	275959	275964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612743
5553	NC_013959	CTG	2	6	276090	276095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612743
5554	NC_013959	GCG	2	6	276310	276315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612744
5555	NC_013959	GT	3	6	276319	276324	0 %	50 %	50 %	0 %	291612744
5556	NC_013959	GCG	2	6	276325	276330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612744
5557	NC_013959	GA	3	6	276365	276370	50 %	0 %	50 %	0 %	291612744
5558	NC_013959	AGG	2	6	276398	276403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291612744
5559	NC_013959	GCAG	2	8	276405	276412	25 %	0 %	50 %	25 %	291612744
5560	NC_013959	TCC	2	6	276415	276420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291612744
5561	NC_013959	CGG	3	9	276464	276472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612744
5562	NC_013959	GCG	2	6	276503	276508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612744
5563	NC_013959	ATT	2	6	276512	276517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291612744
5564	NC_013959	TGA	2	6	276638	276643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612744
5565	NC_013959	ACG	2	6	276673	276678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612744
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5567	NC_013959	GCT	2	6	276756	276761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612744
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5569	NC_013959	CAT	2	6	276885	276890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612745
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5572	NC_013959	ACG	2	6	277046	277051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612745
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5574	NC_013959	C	6	6	277125	277130	0 %	0 %	0 %	100 %	291612745
5575	NC_013959	GAT	2	6	277177	277182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612745
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5589	NC_013959	TGG	2	6	277827	277832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612745
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5593	NC_013959	GCT	2	6	277948	277953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612746
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5603	NC_013959	ACCA	2	8	278435	278442	50 %	0 %	0 %	50 %	291612746
5604	NC_013959	CGA	2	6	278452	278457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612746
5605	NC_013959	CG	3	6	278461	278466	0 %	0 %	50 %	50 %	291612746
5606	NC_013959	CAT	2	6	278467	278472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612746
5607	NC_013959	AACCG	2	10	278496	278505	40 %	0 %	20 %	40 %	291612746
5608	NC_013959	CGA	2	6	278521	278526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612746
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5612	NC_013959	GAAT	2	8	278650	278657	50 %	25 %	25 %	0 %	291612746
5613	NC_013959	GGA	2	6	278676	278681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291612746
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5622	NC_013959	GAC	2	6	279100	279105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612747
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5742	NC_013959	CAC	2	6	284421	284426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612751
5743	NC_013959	GCA	3	9	284447	284455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612751
5744	NC_013959	GCAT	2	8	284518	284525	25 %	25 %	25 %	25 %	291612751
5745	NC_013959	GC	3	6	284537	284542	0 %	0 %	50 %	50 %	291612751
5746	NC_013959	TCA	2	6	284579	284584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612751
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5751	NC_013959	GAT	2	6	284768	284773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612752
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5755	NC_013959	GCC	2	6	284981	284986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612752
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5763	NC_013959	CGA	2	6	286225	286230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612753
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5981	NC_013959	GCA	2	6	298100	298105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612765
5982	NC_013959	TCAACT	2	12	298127	298138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612765
5983	NC_013959	CAG	2	6	298180	298185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612765
5984	NC_013959	GCG	2	6	298186	298191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612765
5985	NC_013959	TGG	2	6	298214	298219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612765
5986	NC_013959	ACA	3	9	298265	298273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612765
5987	NC_013959	CGATGC	2	12	298278	298289	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	291612765
5988	NC_013959	GCG	2	6	298355	298360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612765
5989	NC_013959	CGG	2	6	298428	298433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612765
5990	NC_013959	CAT	2	6	298434	298439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612765
5991	NC_013959	TCG	2	6	298496	298501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612765
5992	NC_013959	TCA	2	6	298505	298510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612765
5993	NC_013959	CTG	2	6	298547	298552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612765
5994	NC_013959	GTGG	2	8	298621	298628	0 %	25 %	75 %	0 %	291612765
5995	NC_013959	CTG	2	6	298633	298638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612765
5996	NC_013959	AAC	2	6	298712	298717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612765
5997	NC_013959	GACC	2	8	298719	298726	25 %	0 %	25 %	50 %	291612765
5998	NC_013959	GCCTGA	2	12	298871	298882	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	291612765
5999	NC_013959	CGT	2	6	298890	298895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612765
6000	NC_013959	TTC	2	6	298909	298914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291612765

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