MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 60283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013959	GCC	2	6	247226	247231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612722
5002	NC_013959	CTT	2	6	247296	247301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291612722
5003	NC_013959	AGC	2	6	247315	247320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612722
5004	NC_013959	CGG	2	6	247323	247328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612722
5005	NC_013959	CCA	3	9	247358	247366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612722
5006	NC_013959	CTG	2	6	247384	247389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612722
5007	NC_013959	AAGCC	2	10	247407	247416	40 %	0 %	20 %	40 %	291612722
5008	NC_013959	GATC	2	8	247586	247593	25 %	25 %	25 %	25 %	291612722
5009	NC_013959	GAT	2	6	247602	247607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612722
5010	NC_013959	GGTG	2	8	247686	247693	0 %	25 %	75 %	0 %	291612722
5011	NC_013959	GCG	2	6	247711	247716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612722
5012	NC_013959	GCA	2	6	247891	247896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612723
5013	NC_013959	TTG	2	6	247921	247926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291612723
5014	NC_013959	GAA	2	6	247996	248001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612723
5015	NC_013959	ACG	2	6	248126	248131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612723
5016	NC_013959	A	6	6	248456	248461	100 %	0 %	0 %	0 %	291612724
5017	NC_013959	CTG	2	6	248462	248467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612724
5018	NC_013959	TTTC	2	8	248490	248497	0 %	75 %	0 %	25 %	291612724
5019	NC_013959	CGT	2	6	248521	248526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612724
5020	NC_013959	CTA	2	6	248536	248541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612724
5021	NC_013959	TCCT	2	8	248552	248559	0 %	50 %	0 %	50 %	291612724
5022	NC_013959	CAT	2	6	248638	248643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612724
5023	NC_013959	CGA	2	6	248650	248655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612724
5024	NC_013959	GC	3	6	248705	248710	0 %	0 %	50 %	50 %	291612724
5025	NC_013959	GCA	2	6	248729	248734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612724
5026	NC_013959	GCGG	2	8	248818	248825	0 %	0 %	75 %	25 %	291612724
5027	NC_013959	TTTCGA	2	12	248848	248859	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	291612724
5028	NC_013959	GCGCG	2	10	248908	248917	0 %	0 %	60 %	40 %	291612724
5029	NC_013959	GTCGGG	2	12	248918	248929	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	291612724
5030	NC_013959	GGC	2	6	249025	249030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612724
5031	NC_013959	CGC	2	6	249058	249063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612724
5032	NC_013959	GGA	2	6	249064	249069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291612724
5033	NC_013959	TTCG	2	8	249166	249173	0 %	50 %	25 %	25 %	291612724
5034	NC_013959	CGA	2	6	249319	249324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612724
5035	NC_013959	CAT	2	6	249325	249330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612724
5036	NC_013959	GGC	2	6	249353	249358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612724
5037	NC_013959	TCA	2	6	249384	249389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612724
5038	NC_013959	GAC	2	6	249418	249423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612724
5039	NC_013959	CAT	2	6	249523	249528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612724
5040	NC_013959	GCT	2	6	249556	249561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612724
5041	NC_013959	CGG	2	6	249565	249570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612724
5042	NC_013959	GC	3	6	249602	249607	0 %	0 %	50 %	50 %	291612724
5043	NC_013959	TGG	2	6	249648	249653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612724
5044	NC_013959	GGC	2	6	249676	249681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612724
5045	NC_013959	ACG	2	6	249740	249745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612724
5046	NC_013959	AGG	2	6	249768	249773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291612724
5047	NC_013959	CAT	2	6	249862	249867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612724
5048	NC_013959	GGCT	2	8	249909	249916	0 %	25 %	50 %	25 %	291612724
5049	NC_013959	ATGA	2	8	249947	249954	50 %	25 %	25 %	0 %	291612724
5050	NC_013959	GC	3	6	249958	249963	0 %	0 %	50 %	50 %	291612724
5051	NC_013959	TGGC	2	8	249968	249975	0 %	25 %	50 %	25 %	291612724
5052	NC_013959	CGG	2	6	250003	250008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612724
5053	NC_013959	GGT	2	6	250024	250029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612724
5054	NC_013959	GGCA	2	8	250030	250037	25 %	0 %	50 %	25 %	291612724
5055	NC_013959	GCT	2	6	250097	250102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612724
5056	NC_013959	TGG	2	6	250143	250148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612724
5057	NC_013959	GAG	2	6	250151	250156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291612724
5058	NC_013959	A	7	7	250163	250169	100 %	0 %	0 %	0 %	291612724
5059	NC_013959	GTG	2	6	250211	250216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612724
5060	NC_013959	CAAA	2	8	250219	250226	75 %	0 %	0 %	25 %	291612724
5061	NC_013959	CTG	3	9	250304	250312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612724
5062	NC_013959	CG	3	6	250316	250321	0 %	0 %	50 %	50 %	291612724
5063	NC_013959	GC	3	6	250337	250342	0 %	0 %	50 %	50 %	291612724
5064	NC_013959	GAC	2	6	250376	250381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612724
5065	NC_013959	GAA	2	6	250423	250428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612724
5066	NC_013959	GAA	2	6	250436	250441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612724
5067	NC_013959	TGC	2	6	250580	250585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612725
5068	NC_013959	GCC	2	6	250606	250611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612725
5069	NC_013959	GCAGGC	2	12	250615	250626	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	291612725
5070	NC_013959	GAAC	2	8	250659	250666	50 %	0 %	25 %	25 %	291612725
5071	NC_013959	GCT	2	6	250689	250694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612725
5072	NC_013959	TGA	2	6	250772	250777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612725
5073	NC_013959	TGG	2	6	250856	250861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612725
5074	NC_013959	GGT	2	6	250878	250883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612725
5075	NC_013959	GCA	2	6	250925	250930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612725
5076	NC_013959	CGG	2	6	250935	250940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612725
5077	NC_013959	GCG	2	6	251098	251103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612725
5078	NC_013959	GAAA	2	8	251106	251113	75 %	0 %	25 %	0 %	291612725
5079	NC_013959	GAC	2	6	251185	251190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612725
5080	NC_013959	AAGGC	2	10	251369	251378	40 %	0 %	40 %	20 %	291612725
5081	NC_013959	GCA	2	6	251418	251423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612725
5082	NC_013959	TGG	2	6	251453	251458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612725
5083	NC_013959	GTC	2	6	251467	251472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612725
5084	NC_013959	CTT	2	6	251494	251499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291612725
5085	NC_013959	GGC	2	6	251505	251510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612725
5086	NC_013959	CGG	2	6	251546	251551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612725
5087	NC_013959	CTG	2	6	251617	251622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612725
5088	NC_013959	GCGA	2	8	251644	251651	25 %	0 %	50 %	25 %	291612725
5089	NC_013959	CT	3	6	251674	251679	0 %	50 %	0 %	50 %	291612725
5090	NC_013959	GCG	2	6	251699	251704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612725
5091	NC_013959	A	7	7	251934	251940	100 %	0 %	0 %	0 %	291612725
5092	NC_013959	GC	3	6	251945	251950	0 %	0 %	50 %	50 %	291612725
5093	NC_013959	CAG	2	6	251971	251976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612725
5094	NC_013959	CG	3	6	252002	252007	0 %	0 %	50 %	50 %	291612725
5095	NC_013959	GGC	2	6	252055	252060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612725
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5097	NC_013959	GAC	2	6	252220	252225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612725
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5100	NC_013959	A	6	6	252423	252428	100 %	0 %	0 %	0 %	291612725
5101	NC_013959	GCG	2	6	252434	252439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612725
5102	NC_013959	AAC	2	6	252466	252471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612725
5103	NC_013959	ATT	2	6	252506	252511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291612725
5104	NC_013959	GA	3	6	252527	252532	50 %	0 %	50 %	0 %	291612725
5105	NC_013959	GTTC	2	8	252588	252595	0 %	50 %	25 %	25 %	291612725
5106	NC_013959	GGC	2	6	252654	252659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612725
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5108	NC_013959	AGG	2	6	252701	252706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291612725
5109	NC_013959	TCA	2	6	252749	252754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612725
5110	NC_013959	CTA	2	6	252786	252791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612725
5111	NC_013959	CCGC	2	8	252864	252871	0 %	0 %	25 %	75 %	291612725
5112	NC_013959	GGT	2	6	252885	252890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612725
5113	NC_013959	AT	3	6	252925	252930	50 %	50 %	0 %	0 %	291612725
5114	NC_013959	CGGG	2	8	252945	252952	0 %	0 %	75 %	25 %	291612725
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5118	NC_013959	GA	3	6	253064	253069	50 %	0 %	50 %	0 %	291612725
5119	NC_013959	GAA	2	6	253072	253077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612725
5120	NC_013959	CAA	2	6	253098	253103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612725
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5122	NC_013959	GGT	2	6	253305	253310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612725
5123	NC_013959	CGG	3	9	253349	253357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612725
5124	NC_013959	CG	3	6	253463	253468	0 %	0 %	50 %	50 %	291612725
5125	NC_013959	TGG	2	6	253505	253510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612725
5126	NC_013959	ATG	2	6	253582	253587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612725
5127	NC_013959	GCT	2	6	253683	253688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612725
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5132	NC_013959	GCCT	3	12	253805	253816	0 %	25 %	25 %	50 %	291612725
5133	NC_013959	CCG	2	6	253868	253873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612725
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5153	NC_013959	GGCT	3	12	255044	255055	0 %	25 %	50 %	25 %	291612727
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5243	NC_013959	TGA	2	6	259514	259519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612730
5244	NC_013959	TGC	2	6	259520	259525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612730
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5350	NC_013959	GGTG	2	8	264171	264178	0 %	25 %	75 %	0 %	291612735
5351	NC_013959	CGTTC	2	10	264195	264204	0 %	40 %	20 %	40 %	291612735
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5357	NC_013959	TGGC	2	8	264500	264507	0 %	25 %	50 %	25 %	291612735
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5364	NC_013959	TGG	2	6	264939	264944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612735
5365	NC_013959	AGC	2	6	264950	264955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612735
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5368	NC_013959	TTG	2	6	265721	265726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291612736
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5403	NC_013959	TCG	2	6	267945	267950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612737
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5463	NC_013959	CAT	2	6	270984	270989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612738
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5465	NC_013959	GTC	2	6	271047	271052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612738
5466	NC_013959	CGCGAT	2	12	271067	271078	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	291612738
5467	NC_013959	ATG	2	6	271096	271101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612738
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5469	NC_013959	GGGC	2	8	271257	271264	0 %	0 %	75 %	25 %	291612738
5470	NC_013959	GGC	2	6	271289	271294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612738
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5473	NC_013959	TCG	2	6	271540	271545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612738
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5475	NC_013959	GC	3	6	271796	271801	0 %	0 %	50 %	50 %	291612739
5476	NC_013959	ACC	2	6	271839	271844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612739
5477	NC_013959	CG	3	6	272026	272031	0 %	0 %	50 %	50 %	291612739
5478	NC_013959	GCAG	2	8	272076	272083	25 %	0 %	50 %	25 %	291612739
5479	NC_013959	GC	4	8	272123	272130	0 %	0 %	50 %	50 %	291612739
5480	NC_013959	CAT	2	6	272213	272218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612739
5481	NC_013959	GGC	3	9	272222	272230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612739
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5483	NC_013959	CG	3	6	272329	272334	0 %	0 %	50 %	50 %	291612739
5484	NC_013959	GCC	2	6	272388	272393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612739
5485	NC_013959	TG	3	6	272394	272399	0 %	50 %	50 %	0 %	291612739
5486	NC_013959	GCTG	2	8	272426	272433	0 %	25 %	50 %	25 %	291612739
5487	NC_013959	TCG	2	6	272500	272505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612739
5488	NC_013959	CAGG	2	8	272600	272607	25 %	0 %	50 %	25 %	291612739
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5491	NC_013959	CGA	2	6	272772	272777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612740
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