MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 60283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013959	CCA	2	6	224753	224758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612692
4502	NC_013959	GCT	2	6	224778	224783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612692
4503	NC_013959	GC	3	6	224812	224817	0 %	0 %	50 %	50 %	291612692
4504	NC_013959	GATG	2	8	224859	224866	25 %	25 %	50 %	0 %	291612692
4505	NC_013959	GAA	2	6	224884	224889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612692
4506	NC_013959	CTG	2	6	225079	225084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612692
4507	NC_013959	CGC	2	6	225119	225124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612693
4508	NC_013959	CGC	2	6	225129	225134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612693
4509	NC_013959	CTG	2	6	225144	225149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612693
4510	NC_013959	CTGG	2	8	225257	225264	0 %	25 %	50 %	25 %	291612693
4511	NC_013959	GCTGGA	2	12	225287	225298	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	291612693
4512	NC_013959	GCC	2	6	225364	225369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612693
4513	NC_013959	TGA	2	6	225399	225404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612693
4514	NC_013959	CGC	2	6	225409	225414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612694
4515	NC_013959	CG	3	6	225421	225426	0 %	0 %	50 %	50 %	291612694
4516	NC_013959	AAGG	2	8	225469	225476	50 %	0 %	50 %	0 %	291612694
4517	NC_013959	GC	3	6	225507	225512	0 %	0 %	50 %	50 %	291612694
4518	NC_013959	CGA	2	6	225528	225533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612694
4519	NC_013959	CGCGC	2	10	225547	225556	0 %	0 %	40 %	60 %	291612694
4520	NC_013959	GAT	2	6	225558	225563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612694
4521	NC_013959	GTG	2	6	225586	225591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612694
4522	NC_013959	GCA	2	6	225615	225620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612694
4523	NC_013959	CGCC	2	8	225665	225672	0 %	0 %	25 %	75 %	291612694
4524	NC_013959	ACA	2	6	225710	225715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612694
4525	NC_013959	GCC	2	6	225724	225729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612694
4526	NC_013959	GAT	2	6	225738	225743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612694
4527	NC_013959	CGATCC	2	12	225973	225984	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	291612695
4528	NC_013959	CTGA	2	8	225992	225999	25 %	25 %	25 %	25 %	291612695
4529	NC_013959	CTT	2	6	226030	226035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291612695
4530	NC_013959	CAG	2	6	226068	226073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612695
4531	NC_013959	ACCT	2	8	226088	226095	25 %	25 %	0 %	50 %	291612695
4532	NC_013959	CGCC	2	8	226099	226106	0 %	0 %	25 %	75 %	291612695
4533	NC_013959	CG	3	6	226158	226163	0 %	0 %	50 %	50 %	291612695
4534	NC_013959	CCA	2	6	226176	226181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612695
4535	NC_013959	GGC	2	6	226264	226269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612695
4536	NC_013959	GCG	3	9	226341	226349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612695
4537	NC_013959	GT	3	6	226353	226358	0 %	50 %	50 %	0 %	291612695
4538	NC_013959	CGA	2	6	226471	226476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612695
4539	NC_013959	GAA	2	6	226537	226542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612695
4540	NC_013959	GCT	2	6	226562	226567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612695
4541	NC_013959	GATG	2	8	226576	226583	25 %	25 %	50 %	0 %	291612695
4542	NC_013959	ATC	3	9	226586	226594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612695
4543	NC_013959	GAA	2	6	226657	226662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612695
4544	NC_013959	ACA	2	6	226689	226694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612695
4545	NC_013959	GATG	2	8	226780	226787	25 %	25 %	50 %	0 %	291612695
4546	NC_013959	GTG	2	6	226796	226801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612695
4547	NC_013959	GC	3	6	226843	226848	0 %	0 %	50 %	50 %	291612695
4548	NC_013959	CAG	2	6	226880	226885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612695
4549	NC_013959	TGA	2	6	226903	226908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612695
4550	NC_013959	CATCGG	2	12	227023	227034	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	291612695
4551	NC_013959	TCG	2	6	227067	227072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612695
4552	NC_013959	ATC	2	6	227105	227110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612695
4553	NC_013959	CAT	2	6	227116	227121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612695
4554	NC_013959	CGCAG	2	10	227207	227216	20 %	0 %	40 %	40 %	291612695
4555	NC_013959	CG	3	6	227217	227222	0 %	0 %	50 %	50 %	291612695
4556	NC_013959	GCT	2	6	227266	227271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612695
4557	NC_013959	GATC	2	8	227341	227348	25 %	25 %	25 %	25 %	291612695
4558	NC_013959	ACG	3	9	227376	227384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612695
4559	NC_013959	GGC	2	6	227413	227418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612695
4560	NC_013959	GCA	2	6	227427	227432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612695
4561	NC_013959	GCC	2	6	227463	227468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612695
4562	NC_013959	ACG	2	6	227475	227480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612695
4563	NC_013959	AGGA	2	8	227482	227489	50 %	0 %	50 %	0 %	291612695
4564	NC_013959	GCGG	2	8	227541	227548	0 %	0 %	75 %	25 %	291612696
4565	NC_013959	GCCA	2	8	227599	227606	25 %	0 %	25 %	50 %	291612696
4566	NC_013959	GC	3	6	227638	227643	0 %	0 %	50 %	50 %	291612696
4567	NC_013959	AC	3	6	227669	227674	50 %	0 %	0 %	50 %	291612696
4568	NC_013959	GCA	2	6	227679	227684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612696
4569	NC_013959	GCAAGC	2	12	227738	227749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612696
4570	NC_013959	GC	3	6	227748	227753	0 %	0 %	50 %	50 %	291612696
4571	NC_013959	GCC	2	6	227781	227786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612696
4572	NC_013959	GCT	2	6	227835	227840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612696
4573	NC_013959	GCT	2	6	227928	227933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612696
4574	NC_013959	GGC	2	6	228037	228042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612696
4575	NC_013959	ACT	2	6	228152	228157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612696
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4577	NC_013959	CGA	2	6	228234	228239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612696
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4579	NC_013959	TGA	2	6	228266	228271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612696
4580	NC_013959	CAT	2	6	228294	228299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612696
4581	NC_013959	GTG	2	6	228372	228377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612696
4582	NC_013959	GGC	2	6	228406	228411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612696
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4585	NC_013959	GCT	2	6	228546	228551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612696
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4587	NC_013959	GAC	2	6	228574	228579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612696
4588	NC_013959	CGC	3	9	228580	228588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612696
4589	NC_013959	CGA	2	6	228612	228617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612696
4590	NC_013959	CGATG	2	10	228840	228849	20 %	20 %	40 %	20 %	291612696
4591	NC_013959	CTG	2	6	228871	228876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612696
4592	NC_013959	AGC	2	6	228885	228890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612696
4593	NC_013959	CGC	2	6	228891	228896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612696
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4598	NC_013959	GCCT	2	8	229089	229096	0 %	25 %	25 %	50 %	291612697
4599	NC_013959	AGG	2	6	229167	229172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291612697
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4602	NC_013959	TGG	2	6	229319	229324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612697
4603	NC_013959	CGC	2	6	229388	229393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612697
4604	NC_013959	GAT	2	6	229453	229458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612697
4605	NC_013959	ACG	3	9	229557	229565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612697
4606	NC_013959	TTGCCG	2	12	229603	229614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612697
4607	NC_013959	GCT	2	6	229631	229636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612697
4608	NC_013959	AAGGCC	2	12	229644	229655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612697
4609	NC_013959	CCG	2	6	229671	229676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612697
4610	NC_013959	GATC	2	8	229684	229691	25 %	25 %	25 %	25 %	291612697
4611	NC_013959	CAC	2	6	229714	229719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612697
4612	NC_013959	GCA	2	6	229804	229809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612697
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4616	NC_013959	AAG	2	6	229847	229852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291612697
4617	NC_013959	GTGA	2	8	229857	229864	25 %	25 %	50 %	0 %	291612697
4618	NC_013959	TGG	2	6	229928	229933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612698
4619	NC_013959	GGC	2	6	230006	230011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612698
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4621	NC_013959	TGC	2	6	230081	230086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612698
4622	NC_013959	AGC	2	6	230125	230130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612698
4623	NC_013959	CCA	2	6	230135	230140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612698
4624	NC_013959	GCA	2	6	230153	230158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612698
4625	NC_013959	GCA	2	6	230178	230183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612698
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4652	NC_013959	GCT	2	6	231486	231491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612699
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4662	NC_013959	ACGCC	2	10	231867	231876	20 %	0 %	20 %	60 %	291612700
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4733	NC_013959	CGAC	2	8	234901	234908	25 %	0 %	25 %	50 %	291612705
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4741	NC_013959	GCC	2	6	235378	235383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612707
4742	NC_013959	ATG	2	6	235414	235419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291612707
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4744	NC_013959	GCGGGC	2	12	235480	235491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612707
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4746	NC_013959	GGCA	2	8	235560	235567	25 %	0 %	50 %	25 %	291612707
4747	NC_013959	TCGCCG	2	12	235580	235591	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	291612707
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4771	NC_013959	TCG	2	6	236495	236500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612707
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4850	NC_013959	CGC	2	6	240189	240194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612712
4851	NC_013959	CGA	2	6	240355	240360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612712
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4854	NC_013959	GCGG	2	8	240499	240506	0 %	0 %	75 %	25 %	291612712
4855	NC_013959	CCG	2	6	240521	240526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612712
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4858	NC_013959	ACA	2	6	240591	240596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291612712
4859	NC_013959	CG	3	6	240599	240604	0 %	0 %	50 %	50 %	291612712
4860	NC_013959	GCT	2	6	240692	240697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612713
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4862	NC_013959	GATG	2	8	240765	240772	25 %	25 %	50 %	0 %	291612713
4863	NC_013959	GTCT	2	8	240773	240780	0 %	50 %	25 %	25 %	291612713
4864	NC_013959	GGC	2	6	240818	240823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612713
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4982	NC_013959	CTG	2	6	246330	246335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612720
4983	NC_013959	CGC	4	12	246336	246347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291612720
4984	NC_013959	TTA	2	6	246356	246361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	291612720
4985	NC_013959	TCG	2	6	246457	246462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612720
4986	NC_013959	CTG	2	6	246468	246473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291612720
4987	NC_013959	TGG	2	6	246499	246504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612720
4988	NC_013959	ACG	2	6	246553	246558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612720
4989	NC_013959	AT	3	6	246559	246564	50 %	50 %	0 %	0 %	291612720
4990	NC_013959	GCG	3	9	246571	246579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612720
4991	NC_013959	GGT	2	6	246631	246636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612720
4992	NC_013959	AGCA	2	8	246955	246962	50 %	0 %	25 %	25 %	291612721
4993	NC_013959	CAT	2	6	246993	246998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612722
4994	NC_013959	GGC	2	6	247009	247014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612722
4995	NC_013959	CAT	2	6	247035	247040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291612722
4996	NC_013959	GCG	2	6	247082	247087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612722
4997	NC_013959	CGG	2	6	247088	247093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291612722
4998	NC_013959	ACG	2	6	247136	247141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291612722
4999	NC_013959	GTG	2	6	247171	247176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291612722
5000	NC_013959	CAC	2	6	247180	247185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291612722

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