MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus mutans NN2025

Total Repeats: 724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013928	CTATTC	2	12	1787	1798	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	290579528
2	NC_013928	ATCAAA	2	12	3225	3236	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	290579529
3	NC_013928	CTTGAC	2	12	7530	7541	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	290579532
4	NC_013928	TGCTTA	2	12	8004	8015	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	290579532
5	NC_013928	AAATTG	2	12	8627	8638	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	290579532
6	NC_013928	GATTTT	2	12	9233	9244	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	290579534
7	NC_013928	TAATGT	2	12	9642	9653	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	290579536
8	NC_013928	CAGGAA	2	12	13376	13387	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	290579539
9	NC_013928	TTTTGG	2	12	15781	15792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	290579540
10	NC_013928	GCACAA	2	12	25124	25135	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	290579544
11	NC_013928	AGCTGT	2	12	26101	26112	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	290579544
12	NC_013928	TTCAAG	2	12	26172	26183	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	290579544
13	NC_013928	GTAGAT	2	12	33393	33404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290579552
14	NC_013928	CAGGTG	2	12	33559	33570	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	290579552
15	NC_013928	GCAATG	2	12	33955	33966	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	290579552
16	NC_013928	TTGATT	2	12	34975	34986	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	290579552
17	NC_013928	GCTGGT	2	12	38760	38771	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	290579555
18	NC_013928	ATGCGG	2	12	41145	41156	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	290579558
19	NC_013928	TTTATG	2	12	48614	48625	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	290579565
20	NC_013928	GGAATG	2	12	48856	48867	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	290579565
21	NC_013928	TAAAAT	2	12	48942	48953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	290579565
22	NC_013928	TAAAAA	2	12	49902	49913	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	290579567
23	NC_013928	ACAGTG	2	12	52778	52789	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	290579569
24	NC_013928	TGCAGG	2	12	53453	53464	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	290579570
25	NC_013928	CAAGCC	2	12	54682	54693	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	290579571
26	NC_013928	GTAATG	2	12	62657	62668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290579577
27	NC_013928	TTGATT	2	12	68087	68098	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	290579583
28	NC_013928	TTATGC	2	12	68694	68705	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	290579583
29	NC_013928	AGTCTG	2	12	70159	70170	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	290579584
30	NC_013928	AATGGA	2	12	77535	77546	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	290579590
31	NC_013928	CAAAAA	2	12	79279	79290	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	290579590
32	NC_013928	AAGCTC	2	12	85668	85679	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	290579594
33	NC_013928	TGATTC	2	12	85753	85764	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	290579594
34	NC_013928	GCTGAA	2	12	88932	88943	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	290579597
35	NC_013928	AAAAGC	2	12	92192	92203	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	290579601
36	NC_013928	TGAACG	2	12	93070	93081	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	290579602
37	NC_013928	AGTCAA	2	12	98726	98737	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	290579609
38	NC_013928	TGACCT	2	12	104411	104422	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	290579615
39	NC_013928	CCGTCA	2	12	105581	105592	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	290579615
40	NC_013928	GACTTG	2	12	119840	119851	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	290579629
41	NC_013928	GTTTGG	2	12	130258	130269	0 %	50 %	50 %	0 %	290579638
42	NC_013928	CTCAGG	2	12	137371	137382	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	290579642
43	NC_013928	TGACAT	2	12	138865	138876	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	290579643
44	NC_013928	AATTGG	2	12	142098	142109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290579645
45	NC_013928	GGCCTA	2	12	142379	142390	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	290579645
46	NC_013928	ATCACG	2	12	144462	144473	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	290579647
47	NC_013928	TTTGGG	2	12	148556	148567	0 %	50 %	50 %	0 %	290579651
48	NC_013928	TTGATT	2	12	148716	148727	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	290579651
49	NC_013928	AAGATA	2	12	149312	149323	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	290579652
50	NC_013928	TGAAAC	2	12	150540	150551	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	290579652
51	NC_013928	GTTGAT	2	12	154834	154845	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	290579654
52	NC_013928	ATTGAT	2	12	154915	154926	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	290579654
53	NC_013928	TTTTCT	2	12	161549	161560	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	290579662
54	NC_013928	TCTTGT	2	12	164340	164351	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	290579665
55	NC_013928	TGTTAT	2	12	165882	165893	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	290579668
56	NC_013928	GCACAA	2	12	166192	166203	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	290579669
57	NC_013928	AATTAC	2	12	166970	166981	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	290579670
58	NC_013928	TGCTTT	2	12	169942	169953	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	290579675
59	NC_013928	ATTGAT	2	12	172615	172626	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	290579678
60	NC_013928	AGGTGG	2	12	172875	172886	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	290579678
61	NC_013928	ACAATT	2	12	174056	174067	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	290579678
62	NC_013928	TATCCA	2	12	181167	181178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290579685
63	NC_013928	CTGGTA	2	12	202977	202988	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	290579695
64	NC_013928	TATTGT	2	12	205561	205572	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	290579698
65	NC_013928	ATCATG	2	12	206560	206571	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	290579701
66	NC_013928	TAAAGT	2	12	209576	209587	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	290579705
67	NC_013928	ATTTTG	2	12	211057	211068	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	290579708
68	NC_013928	AGAAAG	2	12	211105	211116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290579708
69	NC_013928	ATGTTT	2	12	211300	211311	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	290579708
70	NC_013928	AGCAAC	2	12	212296	212307	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	290579709
71	NC_013928	ATAAAA	2	12	215579	215590	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	290579715
72	NC_013928	GACATG	2	12	218698	218709	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	290579718
73	NC_013928	GATGGT	2	12	220176	220187	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	290579720
74	NC_013928	CGATGA	2	12	223337	223348	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	290579723
75	NC_013928	ATGAAA	2	12	224257	224268	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	290579725
76	NC_013928	ACAGAA	2	12	226189	226200	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	290579727
77	NC_013928	CATGAT	2	12	229188	229199	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	290579729
78	NC_013928	CAATGC	2	12	231763	231774	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	290579730
79	NC_013928	CTAATT	2	12	232080	232091	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	290579730
80	NC_013928	TGAACT	2	12	233275	233286	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	290579732
81	NC_013928	GTCAAG	2	12	233838	233849	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	290579733
82	NC_013928	AACGAA	2	12	233950	233961	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	290579733
83	NC_013928	TGTCGG	2	12	245067	245078	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	290579742
84	NC_013928	TTTATT	2	12	251297	251308	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	290579749
85	NC_013928	GGTTTT	2	12	251323	251334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	290579749
86	NC_013928	GGAACA	2	12	255230	255241	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	290579752
87	NC_013928	AAATTA	2	12	258561	258572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	290579756
88	NC_013928	CTTTAT	2	12	258890	258901	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	290579756
89	NC_013928	GCTTCC	2	12	264778	264789	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	290579762
90	NC_013928	ATGGTT	2	12	267555	267566	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	290579766
91	NC_013928	TCAAAC	2	12	268063	268074	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	290579767
92	NC_013928	AGCAAT	2	12	271363	271374	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	290579773
93	NC_013928	TGATTT	2	12	272959	272970	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	290579775
94	NC_013928	CTTTTT	2	12	275211	275222	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	290579777
95	NC_013928	TGACAA	2	12	276998	277009	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	290579781
96	NC_013928	GCTGGT	2	12	277745	277756	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	290579782
97	NC_013928	AATGGC	2	12	281034	281045	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	290579785
98	NC_013928	CTGGTA	2	12	281082	281093	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	290579785
99	NC_013928	TATGGT	2	12	284880	284891	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	290579788
100	NC_013928	AATACC	2	12	289685	289696	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	290579792
101	NC_013928	AGATAA	2	12	294338	294349	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	290579796
102	NC_013928	CTTTGG	2	12	296679	296690	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	290579799
103	NC_013928	ACTTGT	2	12	298949	298960	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	290579800
104	NC_013928	AGATGA	2	12	299033	299044	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	290579800
105	NC_013928	TATCAT	2	12	299901	299912	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	290579801
106	NC_013928	CCTAAA	2	12	302772	302783	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	290579803
107	NC_013928	TAAGAA	2	12	306146	306157	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	290579809
108	NC_013928	CAACAT	2	12	306337	306348	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	290579809
109	NC_013928	ATCTTC	2	12	308070	308081	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	290579812
110	NC_013928	GATATT	2	12	310471	310482	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	290579813
111	NC_013928	TAAAAA	2	12	311118	311129	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	290579813
112	NC_013928	CTTATT	2	12	312483	312494	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	290579814
113	NC_013928	GAAGAG	2	12	315872	315883	50 %	0 %	50 %	0 %	290579819
114	NC_013928	GAATTA	2	12	316771	316782	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	290579820
115	NC_013928	CGTCTT	2	12	319049	319060	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	290579822
116	NC_013928	CTTTAC	2	12	319771	319782	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	290579822
117	NC_013928	TATTGA	2	12	321356	321367	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	290579823
118	NC_013928	TTCCAG	2	12	321937	321948	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	290579823
119	NC_013928	ATGCTT	2	12	322510	322521	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	290579824
120	NC_013928	GATTAT	2	12	331481	331492	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	290579830
121	NC_013928	TGATGT	2	12	336435	336446	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	290579835
122	NC_013928	TGCAAC	2	12	340137	340148	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	290579838
123	NC_013928	ATTGAA	2	12	343041	343052	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	290579841
124	NC_013928	GCTTAT	2	12	343221	343232	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	290579841
125	NC_013928	TCAATA	2	12	346743	346754	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	290579846
126	NC_013928	TCAAGA	2	12	352485	352496	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	290579852
127	NC_013928	CTAAAG	2	12	354143	354154	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	290579853
128	NC_013928	TCATTG	2	12	354855	354866	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	290579853
129	NC_013928	AAAATA	2	12	366723	366734	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	290579868
130	NC_013928	ATTTCT	2	12	366827	366838	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	290579868
131	NC_013928	GACGAT	2	12	371562	371573	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	290579874
132	NC_013928	TTGACG	2	12	372517	372528	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	290579876
133	NC_013928	CCATCG	2	12	373538	373549	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	290579877
134	NC_013928	TTTTTG	2	12	374943	374954	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	290579879
135	NC_013928	TTTGTA	2	12	383959	383970	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	290579881
136	NC_013928	TTAATT	2	12	386191	386202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	290579884
137	NC_013928	TGTCAA	2	12	386966	386977	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	290579885
138	NC_013928	AAGGAA	2	12	392082	392093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290579890
139	NC_013928	GCTGTC	2	12	398735	398746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290579895
140	NC_013928	CCAATT	2	12	398813	398824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290579895
141	NC_013928	AAGATG	2	12	399366	399377	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	290579895
142	NC_013928	CGCCAA	2	12	400588	400599	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	290579895
143	NC_013928	TTTAGT	2	12	404512	404523	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	290579900
144	NC_013928	TAGAAT	2	12	414804	414815	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	290579903
145	NC_013928	TGCTTT	2	12	415973	415984	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	290579905
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147	NC_013928	ATTGGT	2	12	420310	420321	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	290579910
148	NC_013928	GGTCAA	2	12	420853	420864	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	290579910
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150	NC_013928	GGTTTT	2	12	422269	422280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	290579913
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153	NC_013928	TAATCC	2	12	428478	428489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290579917
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202	NC_013928	ATGGCA	2	12	592386	592397	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	290580091
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227	NC_013928	TGATAA	2	12	665392	665403	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	290580151
228	NC_013928	AAAGGA	2	12	677667	677678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290580165
229	NC_013928	TTGCTG	2	12	681282	681293	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	290580170
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231	NC_013928	AATTGG	2	12	681732	681743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290580170
232	NC_013928	ATATTG	2	12	682123	682134	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	290580171
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347	NC_013928	TGGTTG	2	12	995569	995580	0 %	50 %	50 %	0 %	290580478
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443	NC_013928	ATGAAA	2	12	1249023	1249034	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	290580709
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446	NC_013928	TAAAAG	2	12	1253870	1253881	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	290580713
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452	NC_013928	TTTAAC	2	12	1267869	1267880	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	290580727
453	NC_013928	ATTTGG	2	12	1269425	1269436	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	290580728
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