MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus gallolyticus UCN34 chromosome

Total Repeats: 851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013798	ATTGAA	2	12	1490	1501	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	288904224
2	NC_013798	AATTGA	2	12	3759	3770	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	288904226
3	NC_013798	AAAGAT	2	12	4648	4659	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	288904228
4	NC_013798	ATATTG	2	12	5611	5622	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	288904229
5	NC_013798	AGTGAC	2	12	11463	11474	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	288904235
6	NC_013798	AGTGGT	2	12	11812	11823	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	288904235
7	NC_013798	GGAAAA	2	12	12874	12885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288904236
8	NC_013798	AAGCAC	2	12	27070	27081	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	288904242
9	NC_013798	AGCACA	2	12	27113	27124	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	288904242
10	NC_013798	GCCAGC	2	12	29416	29427	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	288904244
11	NC_013798	TAAAGG	2	12	32656	32667	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	288904248
12	NC_013798	GTAATG	2	12	34770	34781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288904249
13	NC_013798	TCAGCT	2	12	35858	35869	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	288904249
14	NC_013798	ATGAAA	2	12	40370	40381	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	288904253
15	NC_013798	ATTGAA	2	12	40925	40936	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	288904253
16	NC_013798	GACGCT	2	12	41939	41950	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	288904254
17	NC_013798	GCTGGT	2	12	45623	45634	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	288904257
18	NC_013798	AGTGAT	2	12	54450	54461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288904264
19	NC_013798	TTATGC	2	12	55645	55656	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	288904265
20	NC_013798	TGTTTT	2	12	56985	56996	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	288904266
21	NC_013798	TTGGCT	2	12	60429	60440	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	288904268
22	NC_013798	TAAAGG	2	12	64483	64494	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	288904273
23	NC_013798	TGCAAC	2	12	65322	65333	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	288904274
24	NC_013798	AGCTGA	2	12	65702	65713	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	288904275
25	NC_013798	CGCAAT	2	12	67064	67075	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	288904278
26	NC_013798	AAAGGT	2	12	71663	71674	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	288904288
27	NC_013798	ATAAAA	2	12	71848	71859	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	288904289
28	NC_013798	AAATTA	2	12	72723	72734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288904291
29	NC_013798	TGGTAA	2	12	73111	73122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288904292
30	NC_013798	ATTGAA	2	12	75672	75683	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	288904295
31	NC_013798	GTAAAG	2	12	76358	76369	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	288904297
32	NC_013798	GGACTC	2	12	77760	77771	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	288904299
33	NC_013798	TGTTGA	2	12	87953	87964	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	288904303
34	NC_013798	GATTGC	2	12	88509	88520	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	288904304
35	NC_013798	AAGAAA	2	12	90283	90294	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	288904306
36	NC_013798	CAACGA	2	12	91181	91192	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	288904306
37	NC_013798	GTGAAG	2	12	98213	98224	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	288904308
38	NC_013798	CTTTCT	2	12	100600	100611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288904309
39	NC_013798	GTTGCA	2	12	101460	101471	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	288904310
40	NC_013798	GCAAAA	2	12	102511	102522	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	288904311
41	NC_013798	TTGTTT	2	12	102753	102764	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	288904311
42	NC_013798	GTTGAG	2	12	103713	103724	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	288904314
43	NC_013798	TTTATC	2	12	104789	104800	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	288904317
44	NC_013798	ATTTTT	2	12	107120	107131	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	288904319
45	NC_013798	GCTTGC	2	12	109435	109446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288904324
46	NC_013798	GTCTTG	2	12	118400	118411	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	288904333
47	NC_013798	TTGTGG	2	12	120076	120087	0 %	50 %	50 %	0 %	288904334
48	NC_013798	TTGACC	2	12	121491	121502	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	288904335
49	NC_013798	ACAGAA	2	12	132232	132243	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	288904346
50	NC_013798	TGAACT	2	12	132360	132371	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	288904346
51	NC_013798	AGCAGT	2	12	140102	140113	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	288904351
52	NC_013798	ATTTTC	2	12	140638	140649	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	288904353
53	NC_013798	CCAATC	2	12	144607	144618	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	288904357
54	NC_013798	ACCATC	2	12	150182	150193	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	288904363
55	NC_013798	ACAAGC	2	12	152122	152133	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	288904366
56	NC_013798	GATATT	2	12	158793	158804	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	288904371
57	NC_013798	CTGTGA	2	12	160134	160145	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	288904372
58	NC_013798	TCAGAA	2	12	163077	163088	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	288904376
59	NC_013798	TACTGA	2	12	172795	172806	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	288904384
60	NC_013798	TAGTTT	2	12	175894	175905	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	288904388
61	NC_013798	AATTGG	2	12	179771	179782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288904391
62	NC_013798	TTTGAA	2	12	184762	184773	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	288904395
63	NC_013798	CAACGT	2	12	185340	185351	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	288904396
64	NC_013798	TTCACT	2	12	186581	186592	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	288904397
65	NC_013798	ATGCGC	2	12	195220	195231	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	288904407
66	NC_013798	TATCTT	2	12	196734	196745	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	288904409
67	NC_013798	TGCTGG	2	12	198000	198011	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	288904409
68	NC_013798	CACCAA	2	12	200663	200674	50 %	0 %	0 %	50 %	288904411
69	NC_013798	ATTTTG	2	12	204563	204574	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	288904414
70	NC_013798	ATTTTG	2	12	205366	205377	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	288904415
71	NC_013798	GCATGG	2	12	214529	214540	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	288904421
72	NC_013798	AACAGA	2	12	217662	217673	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	288904423
73	NC_013798	GATTCC	2	12	220636	220647	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	288904426
74	NC_013798	CAGAAG	2	12	226116	226127	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	288904428
75	NC_013798	ATTAAT	2	12	231318	231329	50 %	50 %	0 %	0 %	288904434
76	NC_013798	TTTCAA	2	12	232287	232298	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	288904435
77	NC_013798	TTGCCA	2	12	233316	233327	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	288904437
78	NC_013798	TTTTGG	2	12	238156	238167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288904440
79	NC_013798	ACAAAT	2	12	240918	240929	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	288904443
80	NC_013798	GACGAA	2	12	241656	241667	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	288904443
81	NC_013798	TAAAGT	2	12	246502	246513	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	288904449
82	NC_013798	TCGTTA	2	12	248765	248776	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	288904452
83	NC_013798	GCACAA	2	12	249074	249085	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	288904453
84	NC_013798	TTTTTG	2	12	264230	264241	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	288904458
85	NC_013798	TTTTGA	2	12	265924	265935	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	288904460
86	NC_013798	AAGCTC	2	12	269035	269046	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	288904462
87	NC_013798	AGCTGC	2	12	269069	269080	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	288904462
88	NC_013798	CAAGGT	2	12	270726	270737	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	288904464
89	NC_013798	TAAAGG	2	12	270956	270967	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	288904464
90	NC_013798	TTATCC	2	12	271668	271679	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	288904465
91	NC_013798	ACCAGC	2	12	274413	274424	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	288904469
92	NC_013798	GAACGC	2	12	275395	275406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288904470
93	NC_013798	GCTGAC	2	12	276019	276030	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	288904470
94	NC_013798	TGACCT	2	12	277488	277499	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	288904472
95	NC_013798	CCGTCA	2	12	278658	278669	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	288904472
96	NC_013798	GTTAAC	2	12	280976	280987	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	288904474
97	NC_013798	AGTATT	2	12	283453	283464	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	288904478
98	NC_013798	TGTTGA	2	12	284919	284930	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	288904481
99	NC_013798	TGCGTT	2	12	287833	287844	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	288904488
100	NC_013798	AAAGAA	2	12	291051	291062	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	288904490
101	NC_013798	GCTGAT	2	12	292176	292187	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	288904491
102	NC_013798	TGCCGA	2	12	292511	292522	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	288904491
103	NC_013798	ACAGAA	2	12	292734	292745	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	288904491
104	NC_013798	TGCCGA	2	12	292847	292858	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	288904491
105	NC_013798	CGTAAA	2	12	294798	294809	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	288904491
106	NC_013798	TTTACT	2	12	296348	296359	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	288904494
107	NC_013798	CAATGA	2	12	299443	299454	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	288904498
108	NC_013798	AGCAAA	2	12	305372	305383	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	288904503
109	NC_013798	ACAAGA	2	12	305578	305589	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	288904504
110	NC_013798	GAACAA	2	12	306401	306412	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	288904505
111	NC_013798	GATGGA	2	12	307938	307949	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	288904506
112	NC_013798	ATTACC	2	12	309553	309564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288904507
113	NC_013798	CTGACC	2	12	311386	311397	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	288904510
114	NC_013798	CTGAAG	2	12	311773	311784	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	288904510
115	NC_013798	AATACG	2	12	313030	313041	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	288904511
116	NC_013798	TGATAG	2	12	314631	314642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288904511
117	NC_013798	AAAGCC	2	12	317122	317133	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	288904511
118	NC_013798	GTTGAA	2	12	325174	325185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288904520
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341	NC_013798	ATTGGC	2	12	926651	926662	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	288905076
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449	NC_013798	ATTGAA	2	12	1217757	1217768	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	288905348
450	NC_013798	AATACC	2	12	1217962	1217973	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	288905348
451	NC_013798	GCTACT	2	12	1219602	1219613	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	288905350
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453	NC_013798	CCATCA	2	12	1224991	1225002	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	288905356
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456	NC_013798	TCAAAA	2	12	1229424	1229435	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	288905362
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