MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Sulfolobus islandicus L.D.8.5 plasmid pLD8501

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013770	GGTT	2	8	2761	2768	0 %	50 %	50 %	0 %	284807104
2	NC_013770	TTTC	2	8	2870	2877	0 %	75 %	0 %	25 %	284807104
3	NC_013770	AAGA	2	8	3049	3056	75 %	0 %	25 %	0 %	284807104
4	NC_013770	TTAG	2	8	4168	4175	25 %	50 %	25 %	0 %	284807106
5	NC_013770	TTCT	2	8	4201	4208	0 %	75 %	0 %	25 %	284807106
6	NC_013770	TTCA	2	8	4407	4414	25 %	50 %	0 %	25 %	284807106
7	NC_013770	ATTT	2	8	5776	5783	25 %	75 %	0 %	0 %	284807108
8	NC_013770	TCTG	2	8	6885	6892	0 %	50 %	25 %	25 %	284807109
9	NC_013770	AGGT	2	8	6907	6914	25 %	25 %	50 %	0 %	284807109
10	NC_013770	CTAA	2	8	9236	9243	50 %	25 %	0 %	25 %	284807110
11	NC_013770	TATC	2	8	9654	9661	25 %	50 %	0 %	25 %	284807110
12	NC_013770	TCCT	2	8	10699	10706	0 %	50 %	0 %	50 %	284807111
13	NC_013770	TCTT	2	8	10721	10728	0 %	75 %	0 %	25 %	284807111
14	NC_013770	GTAA	2	8	10735	10742	50 %	25 %	25 %	0 %	284807111
15	NC_013770	TTTC	2	8	10747	10754	0 %	75 %	0 %	25 %	284807111
16	NC_013770	TTAA	2	8	11260	11267	50 %	50 %	0 %	0 %	284807111
17	NC_013770	TTAC	2	8	11478	11485	25 %	50 %	0 %	25 %	284807112
18	NC_013770	AACA	2	8	12209	12216	75 %	0 %	0 %	25 %	284807114
19	NC_013770	GAAA	2	8	12415	12422	75 %	0 %	25 %	0 %	284807114
20	NC_013770	TGAG	2	8	12718	12725	25 %	25 %	50 %	0 %	284807115
21	NC_013770	TCTT	2	8	13352	13359	0 %	75 %	0 %	25 %	284807117
22	NC_013770	TTCC	2	8	13990	13997	0 %	50 %	0 %	50 %	284807118
23	NC_013770	TTAT	2	8	14776	14783	25 %	75 %	0 %	0 %	284807119
24	NC_013770	TGAG	2	8	15966	15973	25 %	25 %	50 %	0 %	284807123
25	NC_013770	AGAA	2	8	16488	16495	75 %	0 %	25 %	0 %	284807125
26	NC_013770	GTTA	2	8	16592	16599	25 %	50 %	25 %	0 %	284807125
27	NC_013770	AGTT	2	8	16674	16681	25 %	50 %	25 %	0 %	284807125
28	NC_013770	CTAG	2	8	17510	17517	25 %	25 %	25 %	25 %	284807125
29	NC_013770	TTGA	2	8	17750	17757	25 %	50 %	25 %	0 %	284807125
30	NC_013770	ATCA	2	8	17781	17788	50 %	25 %	0 %	25 %	284807125
31	NC_013770	AGAA	2	8	17940	17947	75 %	0 %	25 %	0 %	284807125
32	NC_013770	TAAT	2	8	17961	17968	50 %	50 %	0 %	0 %	284807125
33	NC_013770	TGAA	2	8	18103	18110	50 %	25 %	25 %	0 %	284807125
34	NC_013770	TTTC	2	8	18390	18397	0 %	75 %	0 %	25 %	284807127
35	NC_013770	TTTC	2	8	18420	18427	0 %	75 %	0 %	25 %	284807127
36	NC_013770	AGAT	2	8	18439	18446	50 %	25 %	25 %	0 %	284807127
37	NC_013770	CATA	2	8	18483	18490	50 %	25 %	0 %	25 %	284807127
38	NC_013770	TTTC	2	8	18840	18847	0 %	75 %	0 %	25 %	284807127
39	NC_013770	GTAT	2	8	18904	18911	25 %	50 %	25 %	0 %	284807127
40	NC_013770	ATGT	2	8	19213	19220	25 %	50 %	25 %	0 %	284807128
41	NC_013770	ATTC	2	8	19293	19300	25 %	50 %	0 %	25 %	284807128
42	NC_013770	ACTT	2	8	19470	19477	25 %	50 %	0 %	25 %	284807128
43	NC_013770	GCTA	2	8	19588	19595	25 %	25 %	25 %	25 %	284807128
44	NC_013770	TATT	2	8	19644	19651	25 %	75 %	0 %	0 %	284807128
45	NC_013770	AATA	2	8	20127	20134	75 %	25 %	0 %	0 %	284807128
46	NC_013770	GCTG	2	8	20245	20252	0 %	25 %	50 %	25 %	284807128
47	NC_013770	ATTA	2	8	20467	20474	50 %	50 %	0 %	0 %	284807128
48	NC_013770	CCAG	2	8	20524	20531	25 %	0 %	25 %	50 %	284807128
49	NC_013770	TTTA	2	8	20611	20618	25 %	75 %	0 %	0 %	284807128

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.