MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Spirosoma linguale DSM 74 plasmid pSLIN08

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013738	CTG	2	6	224	229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006005
2	NC_013738	CCG	2	6	259	264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284006005
3	NC_013738	TTC	2	6	276	281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284006005
4	NC_013738	TAC	2	6	388	393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284006005
5	NC_013738	AAT	2	6	437	442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284006005
6	NC_013738	CCG	2	6	535	540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284006005
7	NC_013738	GCA	2	6	559	564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284006005
8	NC_013738	GCC	2	6	581	586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284006005
9	NC_013738	CAC	2	6	599	604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284006005
10	NC_013738	GGA	2	6	683	688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284006005
11	NC_013738	ATG	2	6	693	698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284006005
12	NC_013738	AGT	4	12	789	800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284006005
13	NC_013738	TCG	2	6	1099	1104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006006
14	NC_013738	GGT	2	6	1110	1115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284006006
15	NC_013738	AGT	2	6	1155	1160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284006006
16	NC_013738	ATC	2	6	1234	1239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284006006
17	NC_013738	GTT	2	6	1275	1280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284006006
18	NC_013738	GTA	2	6	1327	1332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284006006
19	NC_013738	GCA	2	6	1674	1679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284006007
20	NC_013738	GTT	2	6	1837	1842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284006007
21	NC_013738	GTT	2	6	1953	1958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284006007
22	NC_013738	AAG	2	6	2076	2081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284006008
23	NC_013738	TAC	2	6	2202	2207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284006008
24	NC_013738	GTA	2	6	2255	2260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284006008
25	NC_013738	ATG	2	6	2363	2368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284006008
26	NC_013738	GAA	2	6	2426	2431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284006008
27	NC_013738	TTG	2	6	2432	2437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284006008
28	NC_013738	TGA	2	6	2494	2499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284006008
29	NC_013738	GTT	2	6	2533	2538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284006008
30	NC_013738	TTC	2	6	2625	2630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284006009
31	NC_013738	GCT	2	6	2907	2912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006009
32	NC_013738	AAT	2	6	2978	2983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284006009
33	NC_013738	GTA	2	6	3229	3234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284006009
34	NC_013738	TGG	2	6	3371	3376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284006009
35	NC_013738	TTC	2	6	3417	3422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284006009
36	NC_013738	CGT	2	6	3449	3454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006009
37	NC_013738	GTA	2	6	4236	4241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284006010
38	NC_013738	CCG	2	6	4389	4394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284006010
39	NC_013738	TTG	2	6	4410	4415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284006010
40	NC_013738	CAA	2	6	4423	4428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284006010
41	NC_013738	CGA	2	6	4468	4473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284006010
42	NC_013738	TCA	2	6	4495	4500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284006010
43	NC_013738	GAT	2	6	4518	4523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284006010
44	NC_013738	GCT	2	6	4611	4616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006011
45	NC_013738	ATG	2	6	4666	4671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284006011
46	NC_013738	CAG	2	6	4683	4688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284006011
47	NC_013738	GAA	2	6	4738	4743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284006011
48	NC_013738	AAG	2	6	4747	4752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284006011
49	NC_013738	TAC	2	6	4760	4765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284006011
50	NC_013738	GCC	2	6	4784	4789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284006011
51	NC_013738	AAC	2	6	5058	5063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284006011
52	NC_013738	ACG	2	6	5083	5088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284006011
53	NC_013738	ACG	2	6	5183	5188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284006011
54	NC_013738	CAG	2	6	5257	5262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284006011
55	NC_013738	GAA	2	6	5374	5379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284006011
56	NC_013738	AGC	2	6	5384	5389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284006011
57	NC_013738	GAA	2	6	5422	5427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284006011
58	NC_013738	ACA	2	6	5430	5435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284006011
59	NC_013738	CGG	2	6	5545	5550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284006012
60	NC_013738	TGC	2	6	5614	5619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284006012
61	NC_013738	GGC	2	6	5675	5680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284006012
62	NC_013738	TAC	2	6	5783	5788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284006012
63	NC_013738	TGG	2	6	5827	5832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284006012
64	NC_013738	ACT	2	6	5857	5862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284006012
65	NC_013738	ACT	2	6	5926	5931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284006012
66	NC_013738	AAC	2	6	5961	5966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284006012
67	NC_013738	ACG	2	6	5995	6000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284006012

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.