MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Spirosoma linguale DSM 74 plasmid pSLIN05

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013735	TTC	2	6	1143	1148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005955
2	NC_013735	ACT	2	6	1155	1160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005955
3	NC_013735	TTG	2	6	1360	1365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284005955
4	NC_013735	TCA	2	6	1588	1593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005956
5	NC_013735	TGT	2	6	1623	1628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284005956
6	NC_013735	TAT	2	6	1642	1647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284005956
7	NC_013735	CTG	2	6	1662	1667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005956
8	NC_013735	AGG	2	6	1674	1679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284005956
9	NC_013735	TAG	2	6	1781	1786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005957
10	NC_013735	CTG	3	9	1797	1805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005957
11	NC_013735	CAG	2	6	2018	2023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005958
12	NC_013735	CAG	2	6	2060	2065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005958
13	NC_013735	GAT	2	6	2342	2347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005958
14	NC_013735	TTC	2	6	2405	2410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005958
15	NC_013735	GTA	2	6	2536	2541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005959
16	NC_013735	ATC	2	6	2542	2547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005959
17	NC_013735	CTT	2	6	2581	2586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005959
18	NC_013735	CTC	2	6	2605	2610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284005959
19	NC_013735	CTT	2	6	2960	2965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005961
20	NC_013735	TAG	2	6	3116	3121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005961
21	NC_013735	GAC	2	6	3167	3172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005961
22	NC_013735	CTT	2	6	3206	3211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005961
23	NC_013735	TCC	2	6	3263	3268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284005961
24	NC_013735	TCA	2	6	3322	3327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005961
25	NC_013735	CAA	2	6	3346	3351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005961
26	NC_013735	CAC	2	6	3450	3455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005961
27	NC_013735	GAC	2	6	3494	3499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005961
28	NC_013735	TTC	2	6	3585	3590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005961
29	NC_013735	AAC	2	6	3674	3679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005961
30	NC_013735	CTT	2	6	3722	3727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005961
31	NC_013735	GAA	2	6	3767	3772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005961
32	NC_013735	TGT	2	6	3842	3847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284005961
33	NC_013735	TTC	2	6	4420	4425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005962
34	NC_013735	AAG	2	6	4842	4847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005963
35	NC_013735	GCA	2	6	4861	4866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005963
36	NC_013735	CCG	2	6	4990	4995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284005963
37	NC_013735	AGG	2	6	4999	5004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284005963
38	NC_013735	CTG	2	6	5007	5012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005963
39	NC_013735	CAA	2	6	5033	5038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005963
40	NC_013735	TGG	2	6	5095	5100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284005963
41	NC_013735	CGG	2	6	5103	5108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005963
42	NC_013735	GCT	2	6	5311	5316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005964
43	NC_013735	CGA	2	6	5368	5373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005964
44	NC_013735	TCA	2	6	5457	5462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005964
45	NC_013735	CCA	2	6	5467	5472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005964
46	NC_013735	AGC	2	6	5631	5636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005964
47	NC_013735	CCA	2	6	5671	5676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005964
48	NC_013735	ACC	2	6	5705	5710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005964
49	NC_013735	AGC	2	6	5877	5882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005964
50	NC_013735	ACC	2	6	5892	5897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005964
51	NC_013735	GCT	2	6	5930	5935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005964
52	NC_013735	CGT	2	6	5985	5990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005964
53	NC_013735	GAG	2	6	5993	5998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284005964
54	NC_013735	CAG	2	6	6056	6061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005964
55	NC_013735	AAC	2	6	6267	6272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005964
56	NC_013735	GGC	2	6	6292	6297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005964
57	NC_013735	GGT	2	6	6300	6305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284005964
58	NC_013735	AAG	2	6	6327	6332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005964
59	NC_013735	GAT	2	6	6356	6361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005964
60	NC_013735	CAG	2	6	6539	6544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005964
61	NC_013735	CAG	3	9	6554	6562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005964
62	NC_013735	TGA	2	6	6779	6784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005965
63	NC_013735	ACA	2	6	7346	7351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005966
64	NC_013735	CAA	2	6	7383	7388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005966
65	NC_013735	CAA	2	6	7493	7498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005966

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.