MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Spirosoma linguale DSM 74 plasmid pSLIN02

Total Repeats: 387

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013732	GTAT	2	8	936	943	25 %	50 %	25 %	0 %	284005757
2	NC_013732	ATCT	2	8	993	1000	25 %	50 %	0 %	25 %	284005757
3	NC_013732	GTAC	2	8	1190	1197	25 %	25 %	25 %	25 %	284005758
4	NC_013732	CAAG	2	8	1413	1420	50 %	0 %	25 %	25 %	284005758
5	NC_013732	GGAA	2	8	1899	1906	50 %	0 %	50 %	0 %	284005759
6	NC_013732	CTTT	2	8	2184	2191	0 %	75 %	0 %	25 %	284005759
7	NC_013732	AGCA	2	8	2237	2244	50 %	0 %	25 %	25 %	284005759
8	NC_013732	TTAA	2	8	2716	2723	50 %	50 %	0 %	0 %	284005760
9	NC_013732	TTAC	2	8	2859	2866	25 %	50 %	0 %	25 %	284005760
10	NC_013732	TTTA	2	8	3194	3201	25 %	75 %	0 %	0 %	284005761
11	NC_013732	TCGT	2	8	4085	4092	0 %	50 %	25 %	25 %	284005762
12	NC_013732	CAGC	2	8	4265	4272	25 %	0 %	25 %	50 %	284005762
13	NC_013732	CATC	2	8	4483	4490	25 %	25 %	0 %	50 %	284005763
14	NC_013732	CGGG	3	12	4502	4513	0 %	0 %	75 %	25 %	284005763
15	NC_013732	TAGG	2	8	4886	4893	25 %	25 %	50 %	0 %	284005763
16	NC_013732	TGGT	2	8	6293	6300	0 %	50 %	50 %	0 %	284005765
17	NC_013732	TTCG	2	8	6479	6486	0 %	50 %	25 %	25 %	284005765
18	NC_013732	GGCG	2	8	6495	6502	0 %	0 %	75 %	25 %	284005765
19	NC_013732	CTTG	2	8	7430	7437	0 %	50 %	25 %	25 %	284005767
20	NC_013732	GCTG	2	8	7656	7663	0 %	25 %	50 %	25 %	284005767
21	NC_013732	TGCC	2	8	8562	8569	0 %	25 %	25 %	50 %	284005767
22	NC_013732	AGCC	2	8	8998	9005	25 %	0 %	25 %	50 %	284005767
23	NC_013732	TGTT	2	8	9337	9344	0 %	75 %	25 %	0 %	284005768
24	NC_013732	GATT	2	8	9345	9352	25 %	50 %	25 %	0 %	284005768
25	NC_013732	CTGT	2	8	9525	9532	0 %	50 %	25 %	25 %	284005768
26	NC_013732	CCTG	2	8	9535	9542	0 %	25 %	25 %	50 %	284005768
27	NC_013732	TCGT	2	8	9585	9592	0 %	50 %	25 %	25 %	284005768
28	NC_013732	GCCC	2	8	9723	9730	0 %	0 %	25 %	75 %	284005768
29	NC_013732	CTGG	2	8	10378	10385	0 %	25 %	50 %	25 %	284005768
30	NC_013732	CGGT	2	8	10764	10771	0 %	25 %	50 %	25 %	284005769
31	NC_013732	AACT	2	8	11300	11307	50 %	25 %	0 %	25 %	284005770
32	NC_013732	TAAG	2	8	11576	11583	50 %	25 %	25 %	0 %	284005770
33	NC_013732	CAGC	2	8	12402	12409	25 %	0 %	25 %	50 %	284005772
34	NC_013732	CCAG	2	8	13502	13509	25 %	0 %	25 %	50 %	284005773
35	NC_013732	TACA	2	8	13881	13888	50 %	25 %	0 %	25 %	284005773
36	NC_013732	CGAA	2	8	14949	14956	50 %	0 %	25 %	25 %	284005774
37	NC_013732	TAGT	2	8	15507	15514	25 %	50 %	25 %	0 %	284005774
38	NC_013732	GCCG	2	8	15781	15788	0 %	0 %	50 %	50 %	284005775
39	NC_013732	GTAT	2	8	16982	16989	25 %	50 %	25 %	0 %	284005777
40	NC_013732	ATTG	2	8	17764	17771	25 %	50 %	25 %	0 %	284005777
41	NC_013732	GTTT	2	8	17866	17873	0 %	75 %	25 %	0 %	284005778
42	NC_013732	AAAT	2	8	18460	18467	75 %	25 %	0 %	0 %	284005778
43	NC_013732	AAAG	2	8	19796	19803	75 %	0 %	25 %	0 %	284005779
44	NC_013732	TCTT	2	8	19843	19850	0 %	75 %	0 %	25 %	284005779
45	NC_013732	TGGT	2	8	20128	20135	0 %	50 %	50 %	0 %	284005779
46	NC_013732	TAAT	2	8	20453	20460	50 %	50 %	0 %	0 %	284005779
47	NC_013732	ACGA	2	8	20632	20639	50 %	0 %	25 %	25 %	284005780
48	NC_013732	ACCA	2	8	21184	21191	50 %	0 %	0 %	50 %	284005780
49	NC_013732	TCGT	2	8	21421	21428	0 %	50 %	25 %	25 %	284005780
50	NC_013732	ACCG	2	8	21703	21710	25 %	0 %	25 %	50 %	284005781
51	NC_013732	AAAC	2	8	21813	21820	75 %	0 %	0 %	25 %	284005781
52	NC_013732	TCTA	2	8	22223	22230	25 %	50 %	0 %	25 %	284005782
53	NC_013732	ATCT	2	8	22232	22239	25 %	50 %	0 %	25 %	284005782
54	NC_013732	GAAC	2	8	22942	22949	50 %	0 %	25 %	25 %	284005783
55	NC_013732	AACG	2	8	24021	24028	50 %	0 %	25 %	25 %	284005784
56	NC_013732	CTGG	2	8	25545	25552	0 %	25 %	50 %	25 %	284005787
57	NC_013732	TCAC	2	8	25638	25645	25 %	25 %	0 %	50 %	284005787
58	NC_013732	ATGG	2	8	25834	25841	25 %	25 %	50 %	0 %	284005787
59	NC_013732	AGGC	2	8	26482	26489	25 %	0 %	50 %	25 %	284005788
60	NC_013732	GAAA	2	8	27571	27578	75 %	0 %	25 %	0 %	284005789
61	NC_013732	GAAT	2	8	27732	27739	50 %	25 %	25 %	0 %	284005789
62	NC_013732	CGGT	2	8	27921	27928	0 %	25 %	50 %	25 %	284005789
63	NC_013732	GAAC	2	8	28213	28220	50 %	0 %	25 %	25 %	284005789
64	NC_013732	GTCA	2	8	28226	28233	25 %	25 %	25 %	25 %	284005789
65	NC_013732	GAAT	2	8	28269	28276	50 %	25 %	25 %	0 %	284005789
66	NC_013732	CCCG	2	8	28640	28647	0 %	0 %	25 %	75 %	284005790
67	NC_013732	CAAT	2	8	29316	29323	50 %	25 %	0 %	25 %	284005790
68	NC_013732	CCCT	2	8	29673	29680	0 %	25 %	0 %	75 %	284005791
69	NC_013732	AACC	2	8	30006	30013	50 %	0 %	0 %	50 %	284005791
70	NC_013732	ACAT	2	8	30310	30317	50 %	25 %	0 %	25 %	284005792
71	NC_013732	TGCC	2	8	30742	30749	0 %	25 %	25 %	50 %	284005793
72	NC_013732	CTGG	2	8	31007	31014	0 %	25 %	50 %	25 %	284005793
73	NC_013732	TAAG	2	8	31247	31254	50 %	25 %	25 %	0 %	284005793
74	NC_013732	GAAT	2	8	31258	31265	50 %	25 %	25 %	0 %	284005794
75	NC_013732	GGGC	2	8	31346	31353	0 %	0 %	75 %	25 %	284005794
76	NC_013732	CGAG	2	8	31685	31692	25 %	0 %	50 %	25 %	284005794
77	NC_013732	CTGC	2	8	31743	31750	0 %	25 %	25 %	50 %	284005794
78	NC_013732	TGCC	2	8	32415	32422	0 %	25 %	25 %	50 %	284005795
79	NC_013732	CAGG	2	8	32453	32460	25 %	0 %	50 %	25 %	284005795
80	NC_013732	GCAT	2	8	33192	33199	25 %	25 %	25 %	25 %	284005795
81	NC_013732	TGCG	2	8	34183	34190	0 %	25 %	50 %	25 %	284005797
82	NC_013732	GGAA	2	8	34260	34267	50 %	0 %	50 %	0 %	284005797
83	NC_013732	GCTG	2	8	34278	34285	0 %	25 %	50 %	25 %	284005797
84	NC_013732	GACC	2	8	34326	34333	25 %	0 %	25 %	50 %	284005797
85	NC_013732	CAAT	2	8	34617	34624	50 %	25 %	0 %	25 %	284005797
86	NC_013732	ATTT	2	8	35044	35051	25 %	75 %	0 %	0 %	284005798
87	NC_013732	ACAA	2	8	35923	35930	75 %	0 %	0 %	25 %	284005799
88	NC_013732	AACC	2	8	35939	35946	50 %	0 %	0 %	50 %	284005799
89	NC_013732	TTCG	2	8	36425	36432	0 %	50 %	25 %	25 %	284005800
90	NC_013732	GTCA	2	8	36823	36830	25 %	25 %	25 %	25 %	284005800
91	NC_013732	TGGC	2	8	36994	37001	0 %	25 %	50 %	25 %	284005800
92	NC_013732	TCTT	2	8	38142	38149	0 %	75 %	0 %	25 %	284005801
93	NC_013732	ATTT	2	8	38839	38846	25 %	75 %	0 %	0 %	284005802
94	NC_013732	TCGG	2	8	38869	38876	0 %	25 %	50 %	25 %	284005802
95	NC_013732	CGAG	2	8	39002	39009	25 %	0 %	50 %	25 %	284005802
96	NC_013732	GGTT	2	8	39070	39077	0 %	50 %	50 %	0 %	284005802
97	NC_013732	AGCC	2	8	39941	39948	25 %	0 %	25 %	50 %	284005804
98	NC_013732	CGGG	2	8	43950	43957	0 %	0 %	75 %	25 %	284005805
99	NC_013732	CCCA	2	8	44455	44462	25 %	0 %	0 %	75 %	284005805
100	NC_013732	GCCT	2	8	44870	44877	0 %	25 %	25 %	50 %	284005806
101	NC_013732	CGGG	2	8	45666	45673	0 %	0 %	75 %	25 %	284005806
102	NC_013732	TTCG	2	8	45889	45896	0 %	50 %	25 %	25 %	284005806
103	NC_013732	GAAC	2	8	46848	46855	50 %	0 %	25 %	25 %	284005807
104	NC_013732	GCGG	2	8	47232	47239	0 %	0 %	75 %	25 %	284005807
105	NC_013732	CGGG	2	8	47344	47351	0 %	0 %	75 %	25 %	284005807
106	NC_013732	GCGG	2	8	47767	47774	0 %	0 %	75 %	25 %	284005807
107	NC_013732	GGAT	2	8	47931	47938	25 %	25 %	50 %	0 %	284005807
108	NC_013732	TGAC	2	8	47966	47973	25 %	25 %	25 %	25 %	284005807
109	NC_013732	GAAG	2	8	48096	48103	50 %	0 %	50 %	0 %	284005807
110	NC_013732	AATT	2	8	48105	48112	50 %	50 %	0 %	0 %	284005807
111	NC_013732	CGGG	2	8	48963	48970	0 %	0 %	75 %	25 %	284005808
112	NC_013732	CTTA	2	8	49683	49690	25 %	50 %	0 %	25 %	284005809
113	NC_013732	ACTA	2	8	50303	50310	50 %	25 %	0 %	25 %	284005809
114	NC_013732	CTGA	2	8	50400	50407	25 %	25 %	25 %	25 %	284005809
115	NC_013732	TCTG	2	8	50492	50499	0 %	50 %	25 %	25 %	284005809
116	NC_013732	TGTC	2	8	50954	50961	0 %	50 %	25 %	25 %	284005811
117	NC_013732	GGGC	2	8	50972	50979	0 %	0 %	75 %	25 %	284005811
118	NC_013732	ATTG	2	8	51142	51149	25 %	50 %	25 %	0 %	284005811
119	NC_013732	TGGC	2	8	51811	51818	0 %	25 %	50 %	25 %	284005811
120	NC_013732	AGCG	2	8	52088	52095	25 %	0 %	50 %	25 %	284005811
121	NC_013732	GCGG	2	8	52145	52152	0 %	0 %	75 %	25 %	284005811
122	NC_013732	GGAA	2	8	53017	53024	50 %	0 %	50 %	0 %	284005811
123	NC_013732	GTCA	2	8	53540	53547	25 %	25 %	25 %	25 %	284005812
124	NC_013732	TGGC	2	8	53677	53684	0 %	25 %	50 %	25 %	284005812
125	NC_013732	CTAC	2	8	54296	54303	25 %	25 %	0 %	50 %	284005813
126	NC_013732	TCCT	2	8	54327	54334	0 %	50 %	0 %	50 %	284005813
127	NC_013732	TGGC	2	8	54355	54362	0 %	25 %	50 %	25 %	284005813
128	NC_013732	CTGG	2	8	54545	54552	0 %	25 %	50 %	25 %	284005813
129	NC_013732	CTGG	2	8	54980	54987	0 %	25 %	50 %	25 %	284005813
130	NC_013732	CGAC	2	8	55222	55229	25 %	0 %	25 %	50 %	284005813
131	NC_013732	CAAT	2	8	55307	55314	50 %	25 %	0 %	25 %	284005813
132	NC_013732	AATG	2	8	55359	55366	50 %	25 %	25 %	0 %	284005813
133	NC_013732	ATGG	2	8	56616	56623	25 %	25 %	50 %	0 %	284005815
134	NC_013732	TTTC	2	8	57273	57280	0 %	75 %	0 %	25 %	284005815
135	NC_013732	CGAA	2	8	57711	57718	50 %	0 %	25 %	25 %	284005815
136	NC_013732	ACCA	2	8	57734	57741	50 %	0 %	0 %	50 %	284005815
137	NC_013732	GAGC	2	8	57907	57914	25 %	0 %	50 %	25 %	284005815
138	NC_013732	AGCC	2	8	59245	59252	25 %	0 %	25 %	50 %	284005816
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.