MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirosoma linguale DSM 74 plasmid pSLIN02

Total Repeats: 2350

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_013732	G	7	7	127024	127030	0 %	0 %	100 %	0 %	284005878
2002	NC_013732	ACC	2	6	127227	127232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005878
2003	NC_013732	CAGC	2	8	127297	127304	25 %	0 %	25 %	50 %	284005878
2004	NC_013732	GGC	2	6	127321	127326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005878
2005	NC_013732	GCA	2	6	127392	127397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005878
2006	NC_013732	GCA	2	6	127401	127406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005878
2007	NC_013732	GAA	2	6	127468	127473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005878
2008	NC_013732	TCA	2	6	127491	127496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005878
2009	NC_013732	CGGAA	2	10	127499	127508	40 %	0 %	40 %	20 %	284005878
2010	NC_013732	ACG	2	6	127577	127582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005878
2011	NC_013732	TTC	2	6	127592	127597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005878
2012	NC_013732	ATA	2	6	127634	127639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284005878
2013	NC_013732	CAT	2	6	127647	127652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005878
2014	NC_013732	GAT	2	6	127654	127659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005878
2015	NC_013732	GCT	2	6	127673	127678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005878
2016	NC_013732	CAC	2	6	127768	127773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005878
2017	NC_013732	ATC	2	6	127805	127810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005878
2018	NC_013732	GATT	2	8	127883	127890	25 %	50 %	25 %	0 %	284005878
2019	NC_013732	ATCA	2	8	127969	127976	50 %	25 %	0 %	25 %	284005878
2020	NC_013732	CTG	3	9	128050	128058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005878
2021	NC_013732	TCAG	2	8	128162	128169	25 %	25 %	25 %	25 %	284005878
2022	NC_013732	GTC	2	6	128181	128186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005878
2023	NC_013732	TGT	2	6	128220	128225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284005878
2024	NC_013732	TCA	2	6	128241	128246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005878
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2026	NC_013732	CAC	2	6	128326	128331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005878
2027	NC_013732	CCA	2	6	128400	128405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005878
2028	NC_013732	TCT	2	6	128550	128555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005878
2029	NC_013732	A	6	6	128581	128586	100 %	0 %	0 %	0 %	284005878
2030	NC_013732	GCTGGT	2	12	128611	128622	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	284005878
2031	NC_013732	ATC	3	9	128684	128692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005878
2032	NC_013732	GCT	2	6	128703	128708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005878
2033	NC_013732	ATG	2	6	128723	128728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005878
2034	NC_013732	CG	3	6	128733	128738	0 %	0 %	50 %	50 %	284005878
2035	NC_013732	ACA	2	6	128742	128747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005878
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2037	NC_013732	GGC	2	6	128829	128834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005878
2038	NC_013732	GGTCG	2	10	128865	128874	0 %	20 %	60 %	20 %	284005878
2039	NC_013732	TGG	2	6	128896	128901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284005878
2040	NC_013732	GCT	2	6	128912	128917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005879
2041	NC_013732	CAGG	2	8	128945	128952	25 %	0 %	50 %	25 %	284005879
2042	NC_013732	TGA	2	6	128969	128974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005879
2043	NC_013732	GTC	2	6	129016	129021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005879
2044	NC_013732	TCA	2	6	129106	129111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005879
2045	NC_013732	GGC	2	6	129120	129125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005879
2046	NC_013732	GTC	2	6	129256	129261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005879
2047	NC_013732	GC	3	6	129289	129294	0 %	0 %	50 %	50 %	284005879
2048	NC_013732	ACC	2	6	129462	129467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005879
2049	NC_013732	GAT	2	6	129483	129488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005879
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2051	NC_013732	GTA	2	6	129664	129669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005879
2052	NC_013732	ATTG	2	8	129709	129716	25 %	50 %	25 %	0 %	284005879
2053	NC_013732	GGA	2	6	129777	129782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284005879
2054	NC_013732	TAA	2	6	129833	129838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284005879
2055	NC_013732	TGA	2	6	129849	129854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005880
2056	NC_013732	GAG	2	6	129874	129879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284005880
2057	NC_013732	CGG	2	6	129890	129895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005880
2058	NC_013732	GAC	2	6	129913	129918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005880
2059	NC_013732	TGA	2	6	129930	129935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005880
2060	NC_013732	TGC	2	6	130001	130006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005880
2061	NC_013732	ACGC	2	8	130063	130070	25 %	0 %	25 %	50 %	284005880
2062	NC_013732	TGAT	2	8	130076	130083	25 %	50 %	25 %	0 %	284005880
2063	NC_013732	CGG	2	6	130091	130096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005880
2064	NC_013732	AC	3	6	130182	130187	50 %	0 %	0 %	50 %	284005880
2065	NC_013732	CCG	2	6	130330	130335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284005880
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2085	NC_013732	TACG	2	8	131875	131882	25 %	25 %	25 %	25 %	284005882
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2087	NC_013732	GGAA	2	8	131911	131918	50 %	0 %	50 %	0 %	284005882
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2091	NC_013732	CGATG	2	10	132091	132100	20 %	20 %	40 %	20 %	284005882
2092	NC_013732	TTA	2	6	132109	132114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284005882
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2107	NC_013732	TGGT	2	8	132746	132753	0 %	50 %	50 %	0 %	284005883
2108	NC_013732	CTGG	2	8	132818	132825	0 %	25 %	50 %	25 %	284005883
2109	NC_013732	GGGT	2	8	132847	132854	0 %	25 %	75 %	0 %	284005883
2110	NC_013732	CCG	2	6	132896	132901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284005883
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2122	NC_013732	GTAC	2	8	133758	133765	25 %	25 %	25 %	25 %	284005884
2123	NC_013732	CGGG	2	8	133767	133774	0 %	0 %	75 %	25 %	284005884
2124	NC_013732	TCAT	2	8	133830	133837	25 %	50 %	0 %	25 %	284005884
2125	NC_013732	TCG	2	6	133838	133843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005884
2126	NC_013732	GATC	2	8	133851	133858	25 %	25 %	25 %	25 %	284005884
2127	NC_013732	CTG	2	6	133994	133999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005884
2128	NC_013732	A	6	6	134031	134036	100 %	0 %	0 %	0 %	284005884
2129	NC_013732	ATCA	2	8	134057	134064	50 %	25 %	0 %	25 %	284005884
2130	NC_013732	GTA	2	6	134071	134076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005884
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2134	NC_013732	AGT	2	6	134298	134303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005884
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2147	NC_013732	ATC	2	6	135154	135159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005886
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2151	NC_013732	TCGG	2	8	135480	135487	0 %	25 %	50 %	25 %	284005887
2152	NC_013732	GCTG	2	8	135563	135570	0 %	25 %	50 %	25 %	284005887
2153	NC_013732	CTGG	2	8	135647	135654	0 %	25 %	50 %	25 %	284005887
2154	NC_013732	CCA	2	6	135686	135691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005887
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2230	NC_013732	TGA	2	6	140075	140080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005891
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2232	NC_013732	TGGCC	2	10	140247	140256	0 %	20 %	40 %	40 %	284005891
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2238	NC_013732	AGCC	2	8	140764	140771	25 %	0 %	25 %	50 %	284005892
2239	NC_013732	AGT	2	6	140850	140855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005893
2240	NC_013732	GT	3	6	140877	140882	0 %	50 %	50 %	0 %	284005893
2241	NC_013732	CAG	2	6	140901	140906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005893
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.