MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirosoma linguale DSM 74 chromosome

Total Repeats: 125591

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013730	CGT	2	6	197671	197676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284035091
3002	NC_013730	CGG	2	6	197682	197687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284035091
3003	NC_013730	GTG	2	6	197764	197769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284035091
3004	NC_013730	CGA	2	6	197788	197793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284035091
3005	NC_013730	CTAC	2	8	197799	197806	25 %	25 %	0 %	50 %	284035091
3006	NC_013730	CT	3	6	197859	197864	0 %	50 %	0 %	50 %	284035091
3007	NC_013730	AAC	2	6	197930	197935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284035091
3008	NC_013730	CCG	2	6	197979	197984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284035091
3009	NC_013730	CGA	2	6	197992	197997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284035091
3010	NC_013730	CCTG	2	8	197999	198006	0 %	25 %	25 %	50 %	284035091
3011	NC_013730	T	6	6	198029	198034	0 %	100 %	0 %	0 %	284035091
3012	NC_013730	ATC	2	6	198056	198061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284035091
3013	NC_013730	GAAC	2	8	198067	198074	50 %	0 %	25 %	25 %	284035091
3014	NC_013730	CAA	2	6	198076	198081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284035091
3015	NC_013730	GCTC	2	8	198088	198095	0 %	25 %	25 %	50 %	284035091
3016	NC_013730	TGC	2	6	198112	198117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284035091
3017	NC_013730	GGC	2	6	198127	198132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284035091
3018	NC_013730	GGA	2	6	198157	198162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284035091
3019	NC_013730	AT	3	6	198172	198177	50 %	50 %	0 %	0 %	284035091
3020	NC_013730	TAA	2	6	198266	198271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284035092
3021	NC_013730	AG	3	6	198302	198307	50 %	0 %	50 %	0 %	284035092
3022	NC_013730	TTC	2	6	198317	198322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284035092
3023	NC_013730	GAA	2	6	198337	198342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284035092
3024	NC_013730	GTA	2	6	198397	198402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284035092
3025	NC_013730	AGT	2	6	198468	198473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284035092
3026	NC_013730	CAC	3	9	198492	198500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284035092
3027	NC_013730	GGC	2	6	198526	198531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284035092
3028	NC_013730	CCG	2	6	198600	198605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284035092
3029	NC_013730	CCTG	2	8	198633	198640	0 %	25 %	25 %	50 %	284035092
3030	NC_013730	GCT	2	6	198648	198653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284035092
3031	NC_013730	TGT	2	6	198654	198659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284035092
3032	NC_013730	TAG	2	6	198729	198734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284035092
3033	NC_013730	ACC	2	6	198763	198768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284035092
3034	NC_013730	GCA	2	6	198794	198799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284035092
3035	NC_013730	GTT	2	6	198841	198846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284035092
3036	NC_013730	GTCGTT	2	12	198878	198889	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	284035092
3037	NC_013730	GAT	2	6	198913	198918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284035092
3038	NC_013730	GTA	2	6	199147	199152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284035093
3039	NC_013730	TAA	2	6	199160	199165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284035093
3040	NC_013730	ATAGCC	2	12	199171	199182	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	284035093
3041	NC_013730	ACC	2	6	199198	199203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284035093
3042	NC_013730	AAT	2	6	199215	199220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284035093
3043	NC_013730	GTT	2	6	199255	199260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284035093
3044	NC_013730	GAT	2	6	199267	199272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284035093
3045	NC_013730	AAT	2	6	199405	199410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284035093
3046	NC_013730	CCG	2	6	199491	199496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284035093
3047	NC_013730	AGT	2	6	199532	199537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284035093
3048	NC_013730	GTT	2	6	199593	199598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284035093
3049	NC_013730	GAC	2	6	199851	199856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284035094
3050	NC_013730	GTA	2	6	199881	199886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284035094
3051	NC_013730	ATT	2	6	199948	199953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284035094
3052	NC_013730	AAG	2	6	200047	200052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284035094
3053	NC_013730	AAG	2	6	200098	200103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284035094
3054	NC_013730	TGGT	2	8	200107	200114	0 %	50 %	50 %	0 %	284035094
3055	NC_013730	TGA	2	6	200132	200137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284035094
3056	NC_013730	CGCC	2	8	200143	200150	0 %	0 %	25 %	75 %	284035094
3057	NC_013730	TAC	2	6	200160	200165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284035094
3058	NC_013730	AACTGG	2	12	200173	200184	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	284035094
3059	NC_013730	A	6	6	200232	200237	100 %	0 %	0 %	0 %	284035094
3060	NC_013730	ATA	2	6	200308	200313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284035094
3061	NC_013730	GGT	2	6	200408	200413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284035094
3062	NC_013730	CAT	2	6	200435	200440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284035094
3063	NC_013730	GCC	2	6	200451	200456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284035094
3064	NC_013730	GCTG	2	8	200477	200484	0 %	25 %	50 %	25 %	284035094
3065	NC_013730	TGA	2	6	200503	200508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284035094
3066	NC_013730	AGC	2	6	200509	200514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284035094
3067	NC_013730	GAA	2	6	200598	200603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284035094
3068	NC_013730	TAC	2	6	200656	200661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284035094
3069	NC_013730	CGA	2	6	200695	200700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284035094
3070	NC_013730	TC	3	6	200828	200833	0 %	50 %	0 %	50 %	284035095
3071	NC_013730	CGGC	2	8	200841	200848	0 %	0 %	50 %	50 %	284035095
3072	NC_013730	CCCGGC	2	12	200918	200929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284035095
3073	NC_013730	GTC	2	6	201051	201056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284035095
3074	NC_013730	GTT	2	6	201089	201094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284035095
3075	NC_013730	ATG	2	6	201096	201101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284035095
3076	NC_013730	CGG	2	6	201133	201138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284035095
3077	NC_013730	CAT	2	6	201195	201200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284035095
3078	NC_013730	CAT	2	6	201263	201268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284035095
3079	NC_013730	GCA	2	6	201440	201445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284035095
3080	NC_013730	CTA	2	6	201485	201490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284035095
3081	NC_013730	TGGCC	2	10	201542	201551	0 %	20 %	40 %	40 %	284035095
3082	NC_013730	CGGG	2	8	201555	201562	0 %	0 %	75 %	25 %	284035095
3083	NC_013730	GGC	2	6	201599	201604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284035095
3084	NC_013730	CGT	2	6	201610	201615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284035095
3085	NC_013730	CTG	2	6	201642	201647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284035095
3086	NC_013730	ATC	2	6	201825	201830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284035096
3087	NC_013730	TGGC	2	8	201901	201908	0 %	25 %	50 %	25 %	284035096
3088	NC_013730	GCT	2	6	202020	202025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284035096
3089	NC_013730	TAC	2	6	202073	202078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284035096
3090	NC_013730	CGT	2	6	202120	202125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284035096
3091	NC_013730	CGG	2	6	202126	202131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284035096
3092	NC_013730	TTC	2	6	202139	202144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284035096
3093	NC_013730	GAG	2	6	202189	202194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284035096
3094	NC_013730	ATA	2	6	202200	202205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284035096
3095	NC_013730	T	6	6	202286	202291	0 %	100 %	0 %	0 %	284035097
3096	NC_013730	CAAGTT	2	12	202301	202312	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	284035097
3097	NC_013730	G	6	6	202344	202349	0 %	0 %	100 %	0 %	284035097
3098	NC_013730	GTT	2	6	202476	202481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284035097
3099	NC_013730	TTC	2	6	202587	202592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284035097
3100	NC_013730	TTCG	2	8	202716	202723	0 %	50 %	25 %	25 %	284035098
3101	NC_013730	GC	3	6	202745	202750	0 %	0 %	50 %	50 %	284035098
3102	NC_013730	CAA	2	6	202846	202851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284035098
3103	NC_013730	GTC	2	6	202927	202932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284035098
3104	NC_013730	G	6	6	203011	203016	0 %	0 %	100 %	0 %	284035098
3105	NC_013730	ATG	2	6	203036	203041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284035098
3106	NC_013730	GTC	2	6	203062	203067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284035098
3107	NC_013730	TTC	2	6	203080	203085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284035098
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3109	NC_013730	TGC	2	6	203118	203123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284035098
3110	NC_013730	TGA	2	6	203194	203199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284035099
3111	NC_013730	ATCA	2	8	203223	203230	50 %	25 %	0 %	25 %	284035099
3112	NC_013730	AAAGT	2	10	203277	203286	60 %	20 %	20 %	0 %	284035099
3113	NC_013730	TGA	2	6	203370	203375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284035099
3114	NC_013730	GTT	2	6	203449	203454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284035099
3115	NC_013730	ATC	2	6	203531	203536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284035100
3116	NC_013730	ATC	2	6	203552	203557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284035100
3117	NC_013730	ATG	2	6	203577	203582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284035100
3118	NC_013730	ATTA	2	8	203654	203661	50 %	50 %	0 %	0 %	284035101
3119	NC_013730	CAT	2	6	203665	203670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284035101
3120	NC_013730	AAC	2	6	203875	203880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284035101
3121	NC_013730	CCA	2	6	204122	204127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284035101
3122	NC_013730	GGCAT	2	10	204140	204149	20 %	20 %	40 %	20 %	284035101
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3149	NC_013730	TTTA	2	8	206537	206544	25 %	75 %	0 %	0 %	284035103
3150	NC_013730	GAC	2	6	206548	206553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284035103
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3152	NC_013730	CTA	2	6	206566	206571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284035103
3153	NC_013730	TAC	2	6	206660	206665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284035103
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3225	NC_013730	TGA	2	6	210912	210917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284035108
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3230	NC_013730	TTCG	2	8	211588	211595	0 %	50 %	25 %	25 %	284035108
3231	NC_013730	ATG	2	6	211657	211662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284035108
3232	NC_013730	T	7	7	211678	211684	0 %	100 %	0 %	0 %	284035108
3233	NC_013730	TTC	2	6	211805	211810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284035109
3234	NC_013730	TTTCG	2	10	212053	212062	0 %	60 %	20 %	20 %	284035109
3235	NC_013730	T	6	6	212063	212068	0 %	100 %	0 %	0 %	284035109
3236	NC_013730	CAC	2	6	212071	212076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284035109
3237	NC_013730	TCA	2	6	212146	212151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284035109
3238	NC_013730	TTC	2	6	212297	212302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284035109
3239	NC_013730	CAT	2	6	212356	212361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284035109
3240	NC_013730	ATA	2	6	212517	212522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284035109
3241	NC_013730	CGG	2	6	212600	212605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284035110
3242	NC_013730	A	6	6	212646	212651	100 %	0 %	0 %	0 %	284035110
3243	NC_013730	TG	3	6	212696	212701	0 %	50 %	50 %	0 %	284035110
3244	NC_013730	GACAG	2	10	212920	212929	40 %	0 %	40 %	20 %	284035111
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3250	NC_013730	CAC	2	6	213192	213197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284035111
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3351	NC_013730	GA	3	6	220073	220078	50 %	0 %	50 %	0 %	284035111
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3363	NC_013730	GTT	2	6	220912	220917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284035111
3364	NC_013730	CCG	2	6	220935	220940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284035111
3365	NC_013730	GAT	2	6	220954	220959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284035111
3366	NC_013730	TTC	2	6	220973	220978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284035111
3367	NC_013730	ATG	2	6	221132	221137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284035111
3368	NC_013730	GTT	2	6	221176	221181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284035111
3369	NC_013730	ATT	2	6	221239	221244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284035111
3370	NC_013730	GAT	2	6	221248	221253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284035111
3371	NC_013730	AAC	2	6	221268	221273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284035111
3372	NC_013730	AC	3	6	221349	221354	50 %	0 %	0 %	50 %	284035111
3373	NC_013730	CATA	2	8	221369	221376	50 %	25 %	0 %	25 %	284035111
3374	NC_013730	ACC	2	6	221386	221391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284035111
3375	NC_013730	TTC	2	6	221465	221470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284035111
3376	NC_013730	GCC	2	6	221570	221575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284035111
3377	NC_013730	TGA	2	6	221610	221615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284035111
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3379	NC_013730	TTG	2	6	221675	221680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284035111
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3381	NC_013730	CAA	2	6	221835	221840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284035111
3382	NC_013730	GTA	2	6	221848	221853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284035111
3383	NC_013730	GCTG	2	8	222065	222072	0 %	25 %	50 %	25 %	284035111
3384	NC_013730	TGA	2	6	222195	222200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284035111
3385	NC_013730	ACC	2	6	222238	222243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284035111
3386	NC_013730	ACC	2	6	222284	222289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284035111
3387	NC_013730	TACCG	2	10	222436	222445	20 %	20 %	20 %	40 %	284035111
3388	NC_013730	AACCA	2	10	222451	222460	60 %	0 %	0 %	40 %	284035111
3389	NC_013730	ACA	2	6	222560	222565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284035111
3390	NC_013730	CTGT	2	8	222665	222672	0 %	50 %	25 %	25 %	284035111
3391	NC_013730	CCA	2	6	222680	222685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284035111
3392	NC_013730	CGG	2	6	222687	222692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284035111
3393	NC_013730	TTGG	2	8	222743	222750	0 %	50 %	50 %	0 %	284035111
3394	NC_013730	TCCA	2	8	222772	222779	25 %	25 %	0 %	50 %	284035111
3395	NC_013730	GGCA	2	8	222873	222880	25 %	0 %	50 %	25 %	284035111
3396	NC_013730	GTT	3	9	222887	222895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284035111
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3398	NC_013730	CCT	2	6	223040	223045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284035111
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3423	NC_013730	GTT	2	6	224894	224899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284035111
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3428	NC_013730	TGA	2	6	225132	225137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284035111
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3434	NC_013730	CGA	2	6	225301	225306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284035111
3435	NC_013730	AGA	2	6	225309	225314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284035111
3436	NC_013730	GTTACC	2	12	225428	225439	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	284035111
3437	NC_013730	GTT	2	6	225568	225573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284035111
3438	NC_013730	CTG	2	6	225578	225583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284035111
3439	NC_013730	TCG	2	6	225660	225665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284035111
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3442	NC_013730	TGA	2	6	225855	225860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284035111
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3455	NC_013730	TCG	2	6	226518	226523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284035111
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3469	NC_013730	GACG	2	8	227293	227300	25 %	0 %	50 %	25 %	284035111
3470	NC_013730	TGACGG	2	12	227325	227336	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	284035111
3471	NC_013730	GAG	2	6	227468	227473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284035111
3472	NC_013730	AGT	2	6	227508	227513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284035111
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3474	NC_013730	TGC	2	6	227918	227923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284035111
3475	NC_013730	CTA	2	6	227930	227935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284035111
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3479	NC_013730	ATA	2	6	228073	228078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284035111
3480	NC_013730	ACC	2	6	228130	228135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284035111
3481	NC_013730	ACA	2	6	228218	228223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284035111
3482	NC_013730	GGCC	2	8	228228	228235	0 %	0 %	50 %	50 %	284035111
3483	NC_013730	TGGG	2	8	228246	228253	0 %	25 %	75 %	0 %	284035111
3484	NC_013730	CGA	2	6	228351	228356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284035111
3485	NC_013730	CTG	2	6	228423	228428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284035111
3486	NC_013730	AGGT	2	8	228432	228439	25 %	25 %	50 %	0 %	284035111
3487	NC_013730	GTAG	2	8	228529	228536	25 %	25 %	50 %	0 %	284035111
3488	NC_013730	GGCA	2	8	228544	228551	25 %	0 %	50 %	25 %	284035111
3489	NC_013730	TGAGC	2	10	228618	228627	20 %	20 %	40 %	20 %	284035111
3490	NC_013730	TGGC	2	8	228632	228639	0 %	25 %	50 %	25 %	284035111
3491	NC_013730	TGG	2	6	228645	228650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284035111
3492	NC_013730	AG	3	6	228750	228755	50 %	0 %	50 %	0 %	284035111
3493	NC_013730	TCG	2	6	228756	228761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284035111
3494	NC_013730	AGA	2	6	228781	228786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284035111
3495	NC_013730	AT	3	6	228812	228817	50 %	50 %	0 %	0 %	284035111
3496	NC_013730	TGAA	2	8	228917	228924	50 %	25 %	25 %	0 %	284035111
3497	NC_013730	ATCG	2	8	228925	228932	25 %	25 %	25 %	25 %	284035111
3498	NC_013730	GCA	2	6	228934	228939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284035111
3499	NC_013730	ATG	2	6	229031	229036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284035111
3500	NC_013730	TA	3	6	229164	229169	50 %	50 %	0 %	0 %	284035111

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