MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphaerobacter thermophilus DSM 20745 chromosome 2

Total Repeats: 28047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28001	NC_013524	CGA	2	6	1249500	1249505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269929423
28002	NC_013524	TCG	2	6	1249523	1249528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269929423
28003	NC_013524	GC	3	6	1249530	1249535	0 %	0 %	50 %	50 %	269929423
28004	NC_013524	CGA	2	6	1249536	1249541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269929423
28005	NC_013524	GC	3	6	1249589	1249594	0 %	0 %	50 %	50 %	269929423
28006	NC_013524	CGG	2	6	1249607	1249612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269929423
28007	NC_013524	GTC	2	6	1249627	1249632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269929423
28008	NC_013524	GTG	2	6	1249675	1249680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269929423
28009	NC_013524	CACCG	2	10	1249746	1249755	20 %	0 %	20 %	60 %	269929423
28010	NC_013524	CCG	2	6	1249818	1249823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269929423
28011	NC_013524	CGCGAG	2	12	1249834	1249845	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	269929423
28012	NC_013524	CG	3	6	1249848	1249853	0 %	0 %	50 %	50 %	269929423
28013	NC_013524	GCG	2	6	1249859	1249864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269929423
28014	NC_013524	CGA	2	6	1250045	1250050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269929424
28015	NC_013524	GTTGAG	2	12	1250052	1250063	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	269929424
28016	NC_013524	CGG	2	6	1250071	1250076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269929424
28017	NC_013524	TCG	2	6	1250128	1250133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269929424
28018	NC_013524	TCCGA	2	10	1250197	1250206	20 %	20 %	20 %	40 %	269929424
28019	NC_013524	GTGCAG	2	12	1250229	1250240	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	269929424
28020	NC_013524	GGC	2	6	1250247	1250252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269929424
28021	NC_013524	CGC	2	6	1250293	1250298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269929424
28022	NC_013524	GCC	3	9	1250361	1250369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269929424
28023	NC_013524	ACG	2	6	1250380	1250385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269929424
28024	NC_013524	GTG	2	6	1250407	1250412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269929424
28025	NC_013524	CGGCCA	2	12	1250486	1250497	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	269929424
28026	NC_013524	CAAC	2	8	1250549	1250556	50 %	0 %	0 %	50 %	269929424
28027	NC_013524	GCC	2	6	1250613	1250618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269929424
28028	NC_013524	GCA	2	6	1250661	1250666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269929424
28029	NC_013524	GCG	2	6	1250699	1250704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269929424
28030	NC_013524	GCGG	2	8	1250742	1250749	0 %	0 %	75 %	25 %	269929424
28031	NC_013524	GGC	2	6	1250793	1250798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	269929424
28032	NC_013524	GGT	2	6	1250810	1250815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	269929424
28033	NC_013524	AGA	2	6	1250867	1250872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	269929424
28034	NC_013524	CCG	2	6	1250878	1250883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269929424
28035	NC_013524	CGC	2	6	1250895	1250900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	269929424
28036	NC_013524	CGA	2	6	1250966	1250971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269929424
28037	NC_013524	GTC	2	6	1250982	1250987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269929424
28038	NC_013524	TCG	2	6	1251014	1251019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269929424
28039	NC_013524	CAG	3	9	1251042	1251050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269929424
28040	NC_013524	ACG	2	6	1251058	1251063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269929424
28041	NC_013524	GAC	2	6	1251231	1251236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269929424
28042	NC_013524	ATG	2	6	1251776	1251781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	269929425
28043	NC_013524	GC	3	6	1251876	1251881	0 %	0 %	50 %	50 %	269929425
28044	NC_013524	CCA	2	6	1251898	1251903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	269929425
28045	NC_013524	CGT	2	6	1251913	1251918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	269929425
28046	NC_013524	ACG	2	6	1252023	1252028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	269929425
28047	NC_013524	ATCGAG	2	12	1252061	1252072	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	269929425

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.