MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Sebaldella termitidis ATCC 33386 plasmid pSTERM01

Total Repeats: 129

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013518	AATT	2	8	960	967	50 %	50 %	0 %	0 %	268793184
2	NC_013518	CTAA	2	8	1582	1589	50 %	25 %	0 %	25 %	268793185
3	NC_013518	ATTT	2	8	1661	1668	25 %	75 %	0 %	0 %	268793185
4	NC_013518	AATG	2	8	3244	3251	50 %	25 %	25 %	0 %	268793187
5	NC_013518	AAAT	2	8	3444	3451	75 %	25 %	0 %	0 %	268793187
6	NC_013518	CAAT	2	8	3537	3544	50 %	25 %	0 %	25 %	268793188
7	NC_013518	TAAA	2	8	3731	3738	75 %	25 %	0 %	0 %	268793188
8	NC_013518	TACA	2	8	3740	3747	50 %	25 %	0 %	25 %	268793188
9	NC_013518	ATTT	2	8	4110	4117	25 %	75 %	0 %	0 %	268793189
10	NC_013518	TTCT	2	8	4266	4273	0 %	75 %	0 %	25 %	268793189
11	NC_013518	AGAA	2	8	6289	6296	75 %	0 %	25 %	0 %	268793191
12	NC_013518	TTCT	2	8	7449	7456	0 %	75 %	0 %	25 %	268793193
13	NC_013518	AATA	2	8	7667	7674	75 %	25 %	0 %	0 %	268793193
14	NC_013518	TTTC	2	8	8060	8067	0 %	75 %	0 %	25 %	268793194
15	NC_013518	GCTT	2	8	8588	8595	0 %	50 %	25 %	25 %	268793195
16	NC_013518	ATTT	2	8	8954	8961	25 %	75 %	0 %	0 %	268793195
17	NC_013518	AACT	2	8	9401	9408	50 %	25 %	0 %	25 %	268793195
18	NC_013518	TCTT	2	8	9413	9420	0 %	75 %	0 %	25 %	268793195
19	NC_013518	CAAT	2	8	11011	11018	50 %	25 %	0 %	25 %	268793198
20	NC_013518	TATT	2	8	11454	11461	25 %	75 %	0 %	0 %	268793199
21	NC_013518	AAGA	3	12	12519	12530	75 %	0 %	25 %	0 %	268793200
22	NC_013518	ATCT	2	8	12553	12560	25 %	50 %	0 %	25 %	268793200
23	NC_013518	TTTG	2	8	12574	12581	0 %	75 %	25 %	0 %	268793200
24	NC_013518	TTAT	2	8	13270	13277	25 %	75 %	0 %	0 %	268793202
25	NC_013518	CTTT	2	8	13633	13640	0 %	75 %	0 %	25 %	268793202
26	NC_013518	AATC	2	8	13979	13986	50 %	25 %	0 %	25 %	268793202
27	NC_013518	TATC	2	8	14550	14557	25 %	50 %	0 %	25 %	268793203
28	NC_013518	TCTG	2	8	14966	14973	0 %	50 %	25 %	25 %	268793204
29	NC_013518	TTGG	2	8	14978	14985	0 %	50 %	50 %	0 %	268793204
30	NC_013518	GCTT	2	8	15099	15106	0 %	50 %	25 %	25 %	268793204
31	NC_013518	TAAA	2	8	15966	15973	75 %	25 %	0 %	0 %	268793204
32	NC_013518	CTAT	2	8	16647	16654	25 %	50 %	0 %	25 %	268793205
33	NC_013518	CTTC	2	8	16902	16909	0 %	50 %	0 %	50 %	268793206
34	NC_013518	TACT	2	8	17141	17148	25 %	50 %	0 %	25 %	268793206
35	NC_013518	AATT	2	8	17361	17368	50 %	50 %	0 %	0 %	268793207
36	NC_013518	ATAA	2	8	17396	17403	75 %	25 %	0 %	0 %	268793207
37	NC_013518	AGAA	2	8	17416	17423	75 %	0 %	25 %	0 %	268793207
38	NC_013518	AGCA	2	8	17535	17542	50 %	0 %	25 %	25 %	268793207
39	NC_013518	GATA	2	8	18276	18283	50 %	25 %	25 %	0 %	268793209
40	NC_013518	TATG	2	8	18651	18658	25 %	50 %	25 %	0 %	268793209
41	NC_013518	ATTT	2	8	18925	18932	25 %	75 %	0 %	0 %	268793210
42	NC_013518	TTTC	2	8	20648	20655	0 %	75 %	0 %	25 %	268793211
43	NC_013518	TTTG	2	8	21747	21754	0 %	75 %	25 %	0 %	268793213
44	NC_013518	TTTC	2	8	21940	21947	0 %	75 %	0 %	25 %	268793213
45	NC_013518	TGCT	2	8	21980	21987	0 %	50 %	25 %	25 %	268793213
46	NC_013518	TATC	2	8	22151	22158	25 %	50 %	0 %	25 %	268793213
47	NC_013518	GTCT	2	8	22187	22194	0 %	50 %	25 %	25 %	268793213
48	NC_013518	TAAA	2	8	22368	22375	75 %	25 %	0 %	0 %	268793213
49	NC_013518	TTTC	2	8	22399	22406	0 %	75 %	0 %	25 %	268793213
50	NC_013518	AATT	2	8	22554	22561	50 %	50 %	0 %	0 %	268793213
51	NC_013518	CCCT	2	8	23003	23010	0 %	25 %	0 %	75 %	268793213
52	NC_013518	TTCT	2	8	23186	23193	0 %	75 %	0 %	25 %	268793213
53	NC_013518	TTTA	2	8	23882	23889	25 %	75 %	0 %	0 %	268793214
54	NC_013518	TTCT	2	8	24139	24146	0 %	75 %	0 %	25 %	268793214
55	NC_013518	GAAA	2	8	24248	24255	75 %	0 %	25 %	0 %	268793215
56	NC_013518	TAAA	2	8	24369	24376	75 %	25 %	0 %	0 %	268793215
57	NC_013518	TTTA	2	8	24798	24805	25 %	75 %	0 %	0 %	268793215
58	NC_013518	ATAA	2	8	25061	25068	75 %	25 %	0 %	0 %	268793216
59	NC_013518	ATTT	2	8	25731	25738	25 %	75 %	0 %	0 %	268793216
60	NC_013518	AAAT	2	8	26434	26441	75 %	25 %	0 %	0 %	268793217
61	NC_013518	ATTT	2	8	26756	26763	25 %	75 %	0 %	0 %	268793217
62	NC_013518	CTAT	2	8	26805	26812	25 %	50 %	0 %	25 %	268793217
63	NC_013518	TAAA	2	8	26877	26884	75 %	25 %	0 %	0 %	268793217
64	NC_013518	AATA	2	8	27020	27027	75 %	25 %	0 %	0 %	268793217
65	NC_013518	TTGA	2	8	27356	27363	25 %	50 %	25 %	0 %	268793217
66	NC_013518	CTTT	2	8	27420	27427	0 %	75 %	0 %	25 %	268793217
67	NC_013518	CTTT	2	8	27995	28002	0 %	75 %	0 %	25 %	268793218
68	NC_013518	TTCC	2	8	28491	28498	0 %	50 %	0 %	50 %	268793219
69	NC_013518	AATT	2	8	28865	28872	50 %	50 %	0 %	0 %	268793220
70	NC_013518	CCAT	2	8	29153	29160	25 %	25 %	0 %	50 %	268793220
71	NC_013518	ATAA	2	8	29331	29338	75 %	25 %	0 %	0 %	268793220
72	NC_013518	ACCA	2	8	29369	29376	50 %	0 %	0 %	50 %	268793220
73	NC_013518	TTAC	2	8	29380	29387	25 %	50 %	0 %	25 %	268793220
74	NC_013518	ATCT	2	8	31105	31112	25 %	50 %	0 %	25 %	268793223
75	NC_013518	TCTT	2	8	31172	31179	0 %	75 %	0 %	25 %	268793223
76	NC_013518	CTTT	2	8	31233	31240	0 %	75 %	0 %	25 %	268793223
77	NC_013518	ATTT	2	8	32172	32179	25 %	75 %	0 %	0 %	268793224
78	NC_013518	CTTT	2	8	32926	32933	0 %	75 %	0 %	25 %	268793224
79	NC_013518	TTCT	2	8	32994	33001	0 %	75 %	0 %	25 %	268793224
80	NC_013518	CTTC	2	8	33246	33253	0 %	50 %	0 %	50 %	268793224
81	NC_013518	TTAT	2	8	33489	33496	25 %	75 %	0 %	0 %	268793224
82	NC_013518	TATT	2	8	33502	33509	25 %	75 %	0 %	0 %	268793224
83	NC_013518	GTTA	2	8	33767	33774	25 %	50 %	25 %	0 %	268793224
84	NC_013518	AATT	2	8	34015	34022	50 %	50 %	0 %	0 %	268793224
85	NC_013518	ACTC	2	8	34931	34938	25 %	25 %	0 %	50 %	268793224
86	NC_013518	CATT	2	8	35365	35372	25 %	50 %	0 %	25 %	268793224
87	NC_013518	TATT	2	8	35479	35486	25 %	75 %	0 %	0 %	268793224
88	NC_013518	CTTT	2	8	35494	35501	0 %	75 %	0 %	25 %	268793224
89	NC_013518	TTTC	2	8	35628	35635	0 %	75 %	0 %	25 %	268793224
90	NC_013518	ATCT	2	8	35768	35775	25 %	50 %	0 %	25 %	268793224
91	NC_013518	TTAT	2	8	35820	35827	25 %	75 %	0 %	0 %	268793224
92	NC_013518	GTCC	2	8	37183	37190	0 %	25 %	25 %	50 %	268793224
93	NC_013518	TTTA	2	8	37415	37422	25 %	75 %	0 %	0 %	268793224
94	NC_013518	TTGT	2	8	37473	37480	0 %	75 %	25 %	0 %	268793224
95	NC_013518	TTGT	2	8	37641	37648	0 %	75 %	25 %	0 %	268793224
96	NC_013518	TTAT	2	8	37674	37681	25 %	75 %	0 %	0 %	268793224
97	NC_013518	ATTA	2	8	38192	38199	50 %	50 %	0 %	0 %	268793224
98	NC_013518	TATT	2	8	38245	38252	25 %	75 %	0 %	0 %	268793224
99	NC_013518	TATT	2	8	38581	38588	25 %	75 %	0 %	0 %	268793224
100	NC_013518	CTTC	2	8	38718	38725	0 %	50 %	0 %	50 %	268793224
101	NC_013518	GCTT	2	8	39886	39893	0 %	50 %	25 %	25 %	268793225
102	NC_013518	ATCT	2	8	40886	40893	25 %	50 %	0 %	25 %	268793225
103	NC_013518	GCTC	2	8	41159	41166	0 %	25 %	25 %	50 %	268793225
104	NC_013518	GTTT	2	8	41293	41300	0 %	75 %	25 %	0 %	268793225
105	NC_013518	TTTC	2	8	41541	41548	0 %	75 %	0 %	25 %	268793225
106	NC_013518	TAAG	2	8	42048	42055	50 %	25 %	25 %	0 %	268793226
107	NC_013518	AGTT	2	8	42391	42398	25 %	50 %	25 %	0 %	268793226
108	NC_013518	AATA	2	8	42469	42476	75 %	25 %	0 %	0 %	268793226
109	NC_013518	CAAC	2	8	43004	43011	50 %	0 %	0 %	50 %	268793227
110	NC_013518	TTTA	2	8	44638	44645	25 %	75 %	0 %	0 %	268793229
111	NC_013518	ATTT	2	8	44677	44684	25 %	75 %	0 %	0 %	268793229
112	NC_013518	TACA	2	8	44808	44815	50 %	25 %	0 %	25 %	268793229
113	NC_013518	CTTC	2	8	45010	45017	0 %	50 %	0 %	50 %	268793229
114	NC_013518	GTTT	2	8	45023	45030	0 %	75 %	25 %	0 %	268793229
115	NC_013518	ATTT	2	8	45496	45503	25 %	75 %	0 %	0 %	268793230
116	NC_013518	TTTA	2	8	45767	45774	25 %	75 %	0 %	0 %	268793230
117	NC_013518	ATTA	2	8	46049	46056	50 %	50 %	0 %	0 %	268793231
118	NC_013518	TTCC	2	8	46395	46402	0 %	50 %	0 %	50 %	268793231
119	NC_013518	TCCA	2	8	46650	46657	25 %	25 %	0 %	50 %	268793231
120	NC_013518	ATGT	2	8	46770	46777	25 %	50 %	25 %	0 %	268793231
121	NC_013518	CCAT	2	8	47181	47188	25 %	25 %	0 %	50 %	268793231
122	NC_013518	AAGT	2	8	47232	47239	50 %	25 %	25 %	0 %	268793231
123	NC_013518	AATC	2	8	48813	48820	50 %	25 %	0 %	25 %	268793231
124	NC_013518	TATT	2	8	49902	49909	25 %	75 %	0 %	0 %	268793231
125	NC_013518	AAAT	2	8	50326	50333	75 %	25 %	0 %	0 %	268793231
126	NC_013518	AATT	2	8	52242	52249	50 %	50 %	0 %	0 %	268793231
127	NC_013518	GTTC	2	8	52836	52843	0 %	50 %	25 %	25 %	268793231
128	NC_013518	TATC	2	8	53079	53086	25 %	50 %	0 %	25 %	268793232
129	NC_013518	TCTT	2	8	53633	53640	0 %	75 %	0 %	25 %	268793234

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.